; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg16396 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg16396
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionAdenine phosphoribosyltransferase
Genome locationCarg_Chr12:3573551..3577547
RNA-Seq ExpressionCarg16396
SyntenyCarg16396
Gene Ontology termsGO:0006166 - purine ribonucleoside salvage (biological process)
GO:0006168 - adenine salvage (biological process)
GO:0044209 - AMP salvage (biological process)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
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InterPro domainsIPR000836 - Phosphoribosyltransferase domain
IPR005764 - Adenine phosphoribosyl transferase
IPR029057 - Phosphoribosyltransferase-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6585702.1 Adenine phosphoribosyltransferase 1, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-13499.61Show/hide
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XP_023002126.1 adenine phosphoribosyltransferase 1-like [Cucurbita maxima]2.8e-12997.28Show/hide
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XP_023521338.1 adenine phosphoribosyltransferase 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.3e-13197.66Show/hide
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XP_023521838.1 adenine phosphoribosyltransferase 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.9e-13298.05Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1BRN2 Adenine phosphoribosyltransferase8.2e-11184.41Show/hide
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A0A6J1GHJ3 Adenine phosphoribosyltransferase2.1e-135100Show/hide
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A0A6J1HEI1 Adenine phosphoribosyltransferase7.9e-11486.33Show/hide
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A0A6J1KCC0 Adenine phosphoribosyltransferase2.1e-11185.16Show/hide
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A0A6J1KKF5 Adenine phosphoribosyltransferase1.3e-12997.28Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P31166 Adenine phosphoribosyltransferase 1, chloroplastic7.7e-8282.26Show/hide
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Q43199 Adenine phosphoribosyltransferase 13.7e-7680.46Show/hide
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Q9LFP0 Adenine phosphoribosyltransferase 56.1e-6368.6Show/hide
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        G D++EMHVGAVE  ER ++IDDL+ATGGTL AA+ LLE  G +VVECACVI L  +KG+ +L  KPL+VLV
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Q9SU38 Adenine phosphoribosyltransferase 43.2e-7275.42Show/hide
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        M+  +V+DPRI  I   IRV+PDFPK GI+FQDITTLLLD KAF+DTIDLFVERYR  +I+VVAGIEARGFIFG PIALAIGAKFVP+RKPKKLPG++I 
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Q9SUW2 Adenine phosphoribosyltransferase 37.7e-7479.77Show/hide
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        EDPRI  I   IRV+PDFPK GI+FQDITT+LLD KAF+DTIDLFVERYR K+I+VVAGIEARGF+FGPPIALAIGAKFVP+RKPKKLPGE I EEY LE
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        YG D++EMH+GAVEAG+RALV+DDLIATGGTLCAAI LLERVG +VVECACVIEL  LKGR+RL  KPL +LV
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G27450.1 adenine phosphoribosyl transferase 15.4e-8382.26Show/hide
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        D EMA+ DV+DPRIAKIA +IRVIPDFPKPGI+FQDITTLLLDT+AF+DTI LFV+RY+ K I+VVAG+EARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPG+
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AT1G27450.2 adenine phosphoribosyl transferase 11.0e-8182.51Show/hide
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AT1G27450.3 adenine phosphoribosyl transferase 18.1e-7972.51Show/hide
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        D EMA+ DV+DPRIAKIA +IRVIPDFPKPGI+FQDITTLLLDT+AF+DTI LFV+RY+ K I+VVAG+EARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPG 
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Query:  ------------------------EVISEEYSLEYGTDKIEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLCAAIRLLERVGVDVVECACVIELHGLKGRERLGD
                                +VISEEYSLEYGTD IEMHVGAVE GERA++IDDLIATGGTL AAIRLLERVGV +VECACVIEL  LKG+E+LG+
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          LFVLV +AA
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AT4G12440.2 adenine phosphoribosyl transferase 42.3e-7375.42Show/hide
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        M+  +V+DPRI  I   IRV+PDFPK GI+FQDITTLLLD KAF+DTIDLFVERYR  +I+VVAGIEARGFIFG PIALAIGAKFVP+RKPKKLPG++I 
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Query:  EEYSLEYGTDKIEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLCAAIRLLERVGVDVVECACVIELHGLKGRERLGDKPLFVLV
        EEY LEYG+D++EMHV AV++G+RALV+DDLIATGGTLCAA+ LL+RVG +V+ECACVIEL  LKGRERL  KPL+VLV
Subjt:  EEYSLEYGTDKIEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLCAAIRLLERVGVDVVECACVIELHGLKGRERLGDKPLFVLV

AT4G22570.1 adenine phosphoribosyl transferase 35.5e-7579.77Show/hide
Query:  EDPRIAKIAKAIRVIPDFPKPGILFQDITTLLLDTKAFRDTIDLFVERYRGKDITVVAGIEARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSLE
        EDPRI  I   IRV+PDFPK GI+FQDITT+LLD KAF+DTIDLFVERYR K+I+VVAGIEARGF+FGPPIALAIGAKFVP+RKPKKLPGE I EEY LE
Subjt:  EDPRIAKIAKAIRVIPDFPKPGILFQDITTLLLDTKAFRDTIDLFVERYRGKDITVVAGIEARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSLE

Query:  YGTDKIEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLCAAIRLLERVGVDVVECACVIELHGLKGRERLGDKPLFVLV
        YG D++EMH+GAVEAG+RALV+DDLIATGGTLCAAI LLERVG +VVECACVIEL  LKGR+RL  KPL +LV
Subjt:  YGTDKIEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLCAAIRLLERVGVDVVECACVIELHGLKGRERLGDKPLFVLV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGCAGCCTCGAATCTCAGTTCCTCACTTCCCCTTTCGCCGTCGCACCACAGGACCACCGCCGTCTTAACTCGTCTTCAGCGGATCGCTTCTTTATCCACAGCCGC
CGCCGGAGCCCTCCCGTCGTGTCGTACACATTTGACTCGCCTTCATCAGCGTCGATCCGCGATTTTGCCTCTACGTTGCAATGTGAGGGAGACGGTGGCAGATCAAGAAA
TGGCGTCTATTGATGTAGAAGACCCACGCATAGCCAAAATCGCCAAGGCCATTCGAGTTATCCCTGATTTTCCCAAACCAGGGATTTTGTTTCAGGACATTACGACGTTG
CTTCTTGATACCAAGGCCTTCAGGGACACTATTGATTTGTTCGTGGAGAGGTACAGAGGGAAAGATATCACTGTGGTTGCAGGGATTGAGGCGAGGGGTTTCATTTTTGG
ACCTCCCATAGCTCTGGCTATTGGTGCAAAATTTGTTCCCATGAGAAAACCCAAGAAGTTGCCTGGTGAAGTCATTTCAGAAGAGTACTCTTTAGAGTATGGAACAGATA
AAATTGAGATGCATGTAGGAGCTGTTGAAGCTGGAGAACGCGCTCTTGTGATAGATGATCTCATTGCAACTGGGGGAACCTTGTGTGCAGCAATAAGACTACTTGAGCGA
GTTGGCGTGGATGTGGTCGAGTGTGCTTGTGTGATTGAGCTGCACGGACTAAAGGGTCGTGAAAGATTGGGAGACAAACCTCTGTTTGTTCTAGTTAACGCAGCAGCATG
A
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TAAACGAGTCAAGATTCAATTTATTTCTCCTTCATTTTGGTTTCTAGTTCCGATCACAGCCGGCGATGGAAGCAGCCTCGAATCTCAGTTCCTCACTTCCCCTTTCGCCG
TCGCACCACAGGACCACCGCCGTCTTAACTCGTCTTCAGCGGATCGCTTCTTTATCCACAGCCGCCGCCGGAGCCCTCCCGTCGTGTCGTACACATTTGACTCGCCTTCA
TCAGCGTCGATCCGCGATTTTGCCTCTACGTTGCAATGTGAGGGAGACGGTGGCAGATCAAGAAATGGCGTCTATTGATGTAGAAGACCCACGCATAGCCAAAATCGCCA
AGGCCATTCGAGTTATCCCTGATTTTCCCAAACCAGGGATTTTGTTTCAGGACATTACGACGTTGCTTCTTGATACCAAGGCCTTCAGGGACACTATTGATTTGTTCGTG
GAGAGGTACAGAGGGAAAGATATCACTGTGGTTGCAGGGATTGAGGCGAGGGGTTTCATTTTTGGACCTCCCATAGCTCTGGCTATTGGTGCAAAATTTGTTCCCATGAG
AAAACCCAAGAAGTTGCCTGGTGAAGTCATTTCAGAAGAGTACTCTTTAGAGTATGGAACAGATAAAATTGAGATGCATGTAGGAGCTGTTGAAGCTGGAGAACGCGCTC
TTGTGATAGATGATCTCATTGCAACTGGGGGAACCTTGTGTGCAGCAATAAGACTACTTGAGCGAGTTGGCGTGGATGTGGTCGAGTGTGCTTGTGTGATTGAGCTGCAC
GGACTAAAGGGTCGTGAAAGATTGGGAGACAAACCTCTGTTTGTTCTAGTTAACGCAGCAGCATGATCGCAGAGCCTTCTTCTGTAACACGACGTGTTCGGTAATGACAA
TATTATCACGCACCGCTGCTAGAAGTTGAAGTTTTAAAGTAATGCATAATTTTGAAGCCGAGAGTGTTGCTAGAAATAAAAGGGATGGTATTAATTTTGAGTATCTGCAG
AAACTTCTTTATTTTGAAGTTAAGTAGTTTATATGTCTCTCTTTCTCTGAATATACCTTATTTGAATGAGTTTATAATGATTACTCTTTTCCTAAGCCAATGTGGAACCG
TGTATGTACTCCTAGCAATCTTCCCCTTGAAGGTAGTACCTTTTTAGGCTTCTTTGTCGACTTGATCCGACCAATATCTTGTACGATTGCAAATCACATTGTGGGATATT
CCCTAATGGTGACGATGACGATCACCTATCGCATCATCTACCTCCTCCCCTCGAACGAAGATCTACTCCTCTATCGGGGAGTTATTGATGGGTTATTACTTGCTTGTCAC
CCAAATCACTTTTTGTTTGATGAGGGACCATCTCAATGTTTTAGGAATATAAAGCGGCAACAGTCCAAGCCTAACACTAACAGATATTATTTGTTTTGGCCTGTTATGTA
TC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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LLDTKAFRDTIDLFVERYRGKDITVVAGIEARGFIFGPPIALAIGAKFVPMRKPKKLPGEVISEEYSLEYGTDKIEMHVGAVEAGERALVIDDLIATGGTLCAAIRLLER
VGVDVVECACVIELHGLKGRERLGDKPLFVLVNAAA