; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg16576 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg16576
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionC2H2-type domain-containing protein
Genome locationCarg_Chr14:13002826..13003386
RNA-Seq ExpressionCarg16576
SyntenyCarg16576
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR036236 - Zinc finger C2H2 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6582365.1 Transcriptional regulator SUPERMAN, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.2e-9598.92Show/hide
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KAG7018776.1 Transcriptional regulator SUPERMAN, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.0e-97100Show/hide
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XP_022924639.1 zinc finger protein 11-like [Cucurbita moschata]2.0e-8993.01Show/hide
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XP_022979614.1 transcriptional regulator SUPERMAN-like [Cucurbita maxima]1.2e-8491.89Show/hide
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XP_023526745.1 zinc finger protein 11-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-8793.55Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L9Y8 C2H2-type domain-containing protein7.6e-5061.79Show/hide
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        ME+NCLRT  RTSLTTMNT+  GGG                    AN +VKSQRNKVCR  AA EEDFINGISWPPRSYTCNFCKREFRSAQALGGHMNV
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        HRRDRALLYSPPAD   FTNLNLNL HNP PN           R    L+++        KPN        K  KF IGLDIEI+TT++T  +LT+S KK
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A0A1S3AWP0 transcriptional regulator SUPERMAN-like1.1e-4858.88Show/hide
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        ME+NCLRT  RTSLT+MNT+  GGG                    AN +VKSQRNKVCR  AA EEDFINGISWPPRSYTCNFCKREFRSAQALGGHMNV
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        HRRDRALLYSPPAD   FTNLNLNL HNP PN    + +                      AKPN        K  KF IGLDIEI+TT++T  L     
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        K DIDLELRLGYST
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A0A5A7U0H2 Transcriptional regulator SUPERMAN-like3.1e-4363.95Show/hide
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        GG AN +VKSQRNKVCR  AA EEDFINGISWPPRSYTCNFCKREFRSAQALGGHMNVHRRDRALLYSPPAD   FTNLNLNL HNP PN    + +   
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                           AKPN        K  KF IGLDIEI+TT++T  L     K DIDLELRLGYST
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A0A6J1E9R8 zinc finger protein 11-like9.8e-9093.01Show/hide
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A0A6J1IX36 transcriptional regulator SUPERMAN-like5.6e-8591.89Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80942 Zinc finger protein 102.9e-1465.52Show/hide
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        KS +       A AE+D   G  WPPRSYTC+FC+REF+SAQALGGHMNVHRRDRA L
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Q38895 Transcriptional regulator SUPERMAN6.9e-1650.57Show/hide
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        + D++ G SWPPRSYTC+FCKREFRSAQALGGHMNVHRRDRA   L  SP +  T            P PN  +  +  + P  + P
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Q9LHS9 Probable transcriptional regulator RABBIT EARS5.5e-1372.55Show/hide
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        RA A+AEE     G  WPPRSY+C+FC REF+SAQALGGHMNVHRRDRA L
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Q9SLB8 Zinc finger protein 115.0e-1441.07Show/hide
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        I WPP++YTC+FC+REFRSAQALGGHMNVHRRDRA L   P+       HT   N N N   +   +     LE +  N   +  P      D+  +TT+
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Query:  NTATLLTESKKK
            ++   K K
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Q9SR34 Transcriptional regulator TAC14.5e-0775Show/hide
Query:  RSYTCNFCKREFRSAQALGGHMNVHRRDRALL
        RSY C+FC R F +AQALGGHMN+HRRDRA L
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37740.1 zinc-finger protein 102.1e-1565.52Show/hide
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        KS +       A AE+D   G  WPPRSYTC+FC+REF+SAQALGGHMNVHRRDRA L
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AT2G42410.1 zinc finger protein 113.5e-1541.07Show/hide
Query:  ISWPPRSYTCNFCKREFRSAQALGGHMNVHRRDRALLYSPPA------DHTHFTNLNLNLHHNPFPNRPFKALEIAKPN---RNKPHKFIGLDIEINTTN
        I WPP++YTC+FC+REFRSAQALGGHMNVHRRDRA L   P+       HT   N N N   +   +     LE +  N   +  P      D+  +TT+
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Query:  NTATLLTESKKK
            ++   K K
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AT3G23130.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein4.9e-1750.57Show/hide
Query:  EEDFINGISWPPRSYTCNFCKREFRSAQALGGHMNVHRRDRA---LLYSPPADHTHFTNLNLNLHHNPFPNRPFKALEIAKPNRNKP
        + D++ G SWPPRSYTC+FCKREFRSAQALGGHMNVHRRDRA   L  SP +  T            P PN  +  +  + P  + P
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AT4G17810.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein5.4e-1689.47Show/hide
Query:  INGISWPPRSYTCNFCKREFRSAQALGGHMNVHRRDRA
        I+G +WPPRSYTCNFC+REFRSAQALGGHMNVHRRDRA
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AT5G06070.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein3.9e-1472.55Show/hide
Query:  RAAAAAEE-DFINGISWPPRSYTCNFCKREFRSAQALGGHMNVHRRDRALL
        RA A+AEE     G  WPPRSY+C+FC REF+SAQALGGHMNVHRRDRA L
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGAGGAACTGTCTACGCACTGCCTGTCGTACGAGTTTAACAACAATGAACACCACCATCAGCGGCGGAGGAGCACCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGAGGAGGAGG
AGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAACAGCCAACGCGGCAGTGAAAAGCCAGAGAAACAAGGTGTGCAGGGCAGCGGCGGCGGCAGAGGAGGATTTCATAAATGGGATTTCAT
GGCCACCAAGAAGTTACACGTGCAACTTCTGCAAAAGGGAATTCAGATCGGCTCAAGCACTTGGCGGCCACATGAATGTCCACCGGAGAGATAGAGCCTTACTCTACTCT
CCCCCTGCTGATCATACCCACTTCACAAATCTCAACCTTAACCTTCACCATAACCCTTTCCCTAATCGCCCCTTCAAAGCCTTGGAGATTGCCAAACCTAATAGGAACAA
GCCCCACAAATTCATTGGTTTGGACATTGAAATCAACACTACCAATAACACTGCCACCCTACTTACTGAATCCAAGAAAAAGGACATTGATTTGGAGCTTCGATTAGGGT
ACTCAACTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGAGGAACTGTCTACGCACTGCCTGTCGTACGAGTTTAACAACAATGAACACCACCATCAGCGGCGGAGGAGCACCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGAGGAGGAGG
AGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAACAGCCAACGCGGCAGTGAAAAGCCAGAGAAACAAGGTGTGCAGGGCAGCGGCGGCGGCAGAGGAGGATTTCATAAATGGGATTTCAT
GGCCACCAAGAAGTTACACGTGCAACTTCTGCAAAAGGGAATTCAGATCGGCTCAAGCACTTGGCGGCCACATGAATGTCCACCGGAGAGATAGAGCCTTACTCTACTCT
CCCCCTGCTGATCATACCCACTTCACAAATCTCAACCTTAACCTTCACCATAACCCTTTCCCTAATCGCCCCTTCAAAGCCTTGGAGATTGCCAAACCTAATAGGAACAA
GCCCCACAAATTCATTGGTTTGGACATTGAAATCAACACTACCAATAACACTGCCACCCTACTTACTGAATCCAAGAAAAAGGACATTGATTTGGAGCTTCGATTAGGGT
ACTCAACTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MERNCLRTACRTSLTTMNTTISGGGAPAAAAAAGGGGGGGGGGGTANAAVKSQRNKVCRAAAAAEEDFINGISWPPRSYTCNFCKREFRSAQALGGHMNVHRRDRALLYS
PPADHTHFTNLNLNLHHNPFPNRPFKALEIAKPNRNKPHKFIGLDIEINTTNNTATLLTESKKKDIDLELRLGYST