; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg16667 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg16667
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionAgamous-like MADS-box protein
Genome locationCarg_Chr15:8437266..8441205
RNA-Seq ExpressionCarg16667
SyntenyCarg16667
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6579468.1 Agamous-like MADS-box protein AGL19, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.8e-10499.07Show/hide
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KAG7016937.1 Agamous-like MADS-box protein AGL19, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.1e-106100Show/hide
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XP_023549984.1 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.9e-10599.07Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3AT26 agamous-like MADS-box protein AGL194.0e-8785.45Show/hide
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A0A6J1E382 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X24.0e-10398.14Show/hide
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A0A6J1E6F6 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X12.5e-10599.07Show/hide
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A0A6J1I258 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X11.5e-10599.07Show/hide
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A0A6J1I349 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X24.0e-10398.14Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O64645 MADS-box protein SOC14.3e-5458.1Show/hide
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O82743 Agamous-like MADS-box protein AGL197.2e-5762.26Show/hide
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Q38838 Agamous-like MADS-box protein AGL142.5e-5459.91Show/hide
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Q9FIS1 MADS-box protein AGL421.0e-5058.85Show/hide
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Q9XJ60 MADS-box transcription factor 507.7e-5155.66Show/hide
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        KLE LE  KRKLLG  LD CSI+EL  LE +LERSL  IR RK ++L+E++ KL+E+E  L ++N  L+ K   +           + E   R+ +   D
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         MDVETELFIGLP R  ++ G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G45660.1 AGAMOUS-like 203.1e-5558.1Show/hide
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        VET+LFIGLP
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AT4G11880.1 AGAMOUS-like 141.8e-5559.91Show/hide
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AT4G22950.1 AGAMOUS-like 195.1e-5862.26Show/hide
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