; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg16752 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg16752
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionRho-GAP domain-containing protein
Genome locationCarg_Chr16:1045446..1050234
RNA-Seq ExpressionCarg16752
SyntenyCarg16752
Gene Ontology termsGO:0007165 - signal transduction (biological process)
InterPro domainsIPR000198 - Rho GTPase-activating protein domain
IPR008936 - Rho GTPase activation protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6576817.1 putative Rho GTPase-activating protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.3e-103100Show/hide
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KAG7014840.1 putative Rho GTPase-activating protein [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.3e-103100Show/hide
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XP_022922739.1 uncharacterized Rho GTPase-activating protein At5g61530 isoform X1 [Cucurbita moschata]2.8e-10299.47Show/hide
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XP_022985483.1 uncharacterized Rho GTPase-activating protein At5g61530 [Cucurbita maxima]4.0e-10198.41Show/hide
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XP_023552138.1 uncharacterized Rho GTPase-activating protein At5g61530 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.9e-9997.35Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KXL2 Rho-GAP domain-containing protein9.3e-9689.95Show/hide
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A0A5A7TNG6 Putative Rho GTPase-activating protein1.1e-9388.89Show/hide
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A0A5D3D0A1 Putative Rho GTPase-activating protein1.1e-9388.89Show/hide
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A0A6J1E4A2 uncharacterized Rho GTPase-activating protein At5g61530 isoform X11.3e-10299.47Show/hide
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A0A6J1JDQ9 uncharacterized Rho GTPase-activating protein At5g615301.9e-10198.41Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F1LQX4 Rho GTPase-activating protein 441.9e-0832.71Show/hide
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P34288 GTPase-activating protein pac-16.4e-0938.71Show/hide
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Q3E875 Uncharacterized Rho GTPase-activating protein At5g615301.7e-6263.3Show/hide
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Q5SSM3 Rho GTPase-activating protein 441.4e-0832.71Show/hide
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Q9VDS5 Rho GTPase-activating protein 92B1.7e-0932.17Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G61530.1 small G protein family protein / RhoGAP family protein1.2e-6363.3Show/hide
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AT5G61530.2 small G protein family protein / RhoGAP family protein4.9e-5759.57Show/hide
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AT5G61530.3 small G protein family protein / RhoGAP family protein1.2e-6363.3Show/hide
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        W+ D RPE YRE+W   S+S      +N   T + WD+LS+E +  DASS IPLDD   VDF A+EV+QCLI+HHN +FTDA ET+WR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTATAATCAAGATCCCAATGCCCCCATACCTGAGGGTACAAATCCAGTTGATGTAGCAGCTCTAGCTAAATGTTACCTGGCCAGTCTTCCTGAGCCACTAGTCACGTT
TGAGCTTTACAATGAGATCAGAGGTGCACATACAAACTTAAATGCCCTGCGAAACATTCTAAAAAAACTTCCCAACGTGAACTACATGACCTTGGAGTTTACTACTGCAC
TATTTCTCCGCATTAGCCAAAAAGCACTGCTCAATAAGATGGATGCTGGTAGCCTTGCTATGGAGATGACTCCTATAATAATGTGGCAAAACGACAAGCGCCCAGAGTTC
TATCGGGAATTTTGGGATTATCATTCTAAAAGTTCTTCTGCAAAGTCCTTAAATAATACACCGCCTACTTACAGTGCATGGGACGTGCTTTCAGAAGAGAGTGATGACAC
AGATGCTTCCTCTCACATTCCTTTGGATGATGCCGTGTCAGTTGACTTCAGTGCCATCGAGGTCATTCAGTGCCTCATAGATCATCACAATGAAGTTTTTACTGATGCTA
ATGAAACAATTTGGAGATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TAGCGCGCTTCTTTTTGCCTTTTGGGAATCGGAGGGTTCTTGTGCGATTTTTTTCTTCGGGTTTCTCGAGAAAATTCTCGTGCGATTCTAGGTGTTTTCTGCTTTGTTGG
TATTCGATTACGACTGCGAGCCAGAATTCTTTACAGGCTTAATCTTACACATCTTTAAGACGATTCCGGTTTTATTGTTGGTTCAATGCCTTCTGTTAATTCTTCTCAGT
GGCAGGAGAAGGCTAGTGGTTTTTTTTCTTCATCAGGAGTAAAGCTGAAAGAAGCTGGACAATCAGCTGGAACTTTTGTTGGGGGAGTTGCGAAGGATGCAAAAGGAAAT
GCTGCTGATGTTGCTGAACGGGTTGGTTCTTTGTTTAAGAGTCGATGGGCCCTCCTTCAGCAGCCAGCTACAAGACATGCTGTGCAAGAACGTCTAATATGTGCTGCTGC
TACTACTGGCACATTCCTCAGAAAAGGTGTGACGGAGACAAAGGACAAGGTTGTCGTGGGGAAAGTTAAAGTTGAAGAGGTTGCAAAAAAAACTGCTCAAAAGAGCAAGA
CAATTTTGACAGATATTGAGCGATGGCAGAAGGTAATAGTCCTCCTATACAGTTCCCCTCACTTTATATATTATACCCGACGTTTAACTCCTGTTTGTTTACCATTTTTC
AGGGGGTTGCCAGTACTGATCGTAAGTTTCTGAAGTTTGTCCATTTAGTTTATTTAATGTTATTGAGTATTTACATGTCTGATCTCTCTGCAAAATCTTCTTGCTCAGGT
CTGTATTATTATGTTTATTTTTTTCTTATTATGTGACTGTAGTATTTGGAGTTCAAATTGAGGTAACCGTACAAAAACAACAGTCAAGCAGGGTCATTCCACATATTTTG
GTTAGGTGTGCCGATTATCTCGTCTTGTCAGGGCTAAACTCACCATGCTTATTCAAATCTGACGGAGATGAAAGGGTTCTTCAGCGGTTGGTATCAATGTATAATCAAGA
TCCCAATGCCCCCATACCTGAGGGTACAAATCCAGTTGATGTAGCAGCTCTAGCTAAATGTTACCTGGCCAGTCTTCCTGAGCCACTAGTCACGTTTGAGCTTTACAATG
AGATCAGAGGTGCACATACAAACTTAAATGCCCTGCGAAACATTCTAAAAAAACTTCCCAACGTGAACTACATGACCTTGGAGTTTACTACTGCACTATTTCTCCGCATT
AGCCAAAAAGCACTGCTCAATAAGATGGATGCTGGTAGCCTTGCTATGGAGATGACTCCTATAATAATGTGGCAAAACGACAAGCGCCCAGAGTTCTATCGGGAATTTTG
GGATTATCATTCTAAAAGTTCTTCTGCAAAGTCCTTAAATAATACACCGCCTACTTACAGTGCATGGGACGTGCTTTCAGAAGAGAGTGATGACACAGATGCTTCCTCTC
ACATTCCTTTGGATGATGCCGTGTCAGTTGACTTCAGTGCCATCGAGGTCATTCAGTGCCTCATAGATCATCACAATGAAGTTTTTACTGATGCTAATGAAACAATTTGG
AGATAAATCAGCAGCACTTATTTCCTCAGGCGCCAATTATTCTTGGATGGATTCTGATACAAGTCTATCTCTTTGACGCAGATTTACATCTGAGAGTAGTTTTCTTAGTT
TGTTTGACCAGGTAGGTAAGTTAAACTTGACATTTATTCGGACGCAAGCAGTTAGAACAGTGAAAGAAACTACAGTGCGATGCACAGAATAGAGCACATTTAGGATGCTT
TGGTCAATGTTTTCAAGGTTTATTGTAATAACCTACCCGGATTTGCATGGGTTTCAATCTACTGATCTGAAGTAGATATTTCCGTTGTACATACAACTAAAACTGCTATT
ATATTGAGCGTGTGAATAACAATTCTACTTACAAGTGAAGAATTGACATTACTTCTTTCTTCTTCGCATAAGATCGGGTTTCTCTGATTGTGACCAATGGGAGAGGCACT
TGACTACGTTGAACACTCAAACTTGTATAGGAATTTCTTACTGCACAGCATAATATTTCTTTGGGATGCCGAAGAAACTATAAGTAGATCCTGGTCTTATCTAACCATAT
GCATTCTTATCTCAAAAACAATATATACACCTCATTATAACATTACTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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YREFWDYHSKSSSAKSLNNTPPTYSAWDVLSEESDDTDASSHIPLDDAVSVDFSAIEVIQCLIDHHNEVFTDANETIWR