; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg16853 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg16853
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionTryptophan synthase
Genome locationCarg_Chr19:310857..315047
RNA-Seq ExpressionCarg16853
SyntenyCarg16853
Gene Ontology termsGO:0000162 - tryptophan biosynthetic process (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0004834 - tryptophan synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002028 - Tryptophan synthase, alpha chain
IPR011060 - Ribulose-phosphate binding barrel
IPR013785 - Aldolase-type TIM barrel
IPR018204 - Tryptophan synthase, alpha chain, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6571482.1 Tryptophan synthase alpha chain, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.9e-167100Show/hide
Query:  MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP
        MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL
        TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL
Subjt:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL

Query:  ESFTKSLKSALS
        ESFTKSLKSALS
Subjt:  ESFTKSLKSALS

XP_022963508.1 tryptophan synthase alpha chain isoform X1 [Cucurbita moschata]2.0e-16699.68Show/hide
Query:  MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP
        MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALT SNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL
        TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL
Subjt:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL

Query:  ESFTKSLKSALS
        ESFTKSLKSALS
Subjt:  ESFTKSLKSALS

XP_022967507.1 tryptophan synthase alpha chain isoform X1 [Cucurbita maxima]1.3e-16599.36Show/hide
Query:  MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP
        MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTH RKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCP+ALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL
        TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL
Subjt:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL

Query:  ESFTKSLKSALS
        ESFTKSLKSALS
Subjt:  ESFTKSLKSALS

XP_023554752.1 tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-16192.54Show/hide
Query:  MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP
        MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIEL----
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGV GLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIEL    
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIEL----

Query:  -------------------VLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGI
                           VLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGI
Subjt:  -------------------VLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGI

Query:  IVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALESFTKSLKSALS
        IVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALESFTKSLKSALS
Subjt:  IVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALESFTKSLKSALS

XP_023554753.1 tryptophan synthase alpha chain-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-16599.36Show/hide
Query:  MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP
        MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGV GLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL
        TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL
Subjt:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL

Query:  ESFTKSLKSALS
        ESFTKSLKSALS
Subjt:  ESFTKSLKSALS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BMG6 Tryptophan synthase6.4e-15089.42Show/hide
Query:  MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP
        MD   NSS L + NKIPT L+FP HP KISV QSKR VPMA+LTAS+A+GLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS  GSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRG+ NFM+TI+DAGV GLVVPDVPLEETEILRKEAVK+NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL
        TPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGAR SVS++VQTLLEEIKE TEKPVAVGFGISKPEHVKQV++WGADGIIVGSAMVKLLGEAQ+PEEGLKAL
Subjt:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL

Query:  ESFTKSLKSALS
        E+FTKSLKSALS
Subjt:  ESFTKSLKSALS

A0A5D3E1Z9 Tryptophan synthase6.4e-15089.42Show/hide
Query:  MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP
        MD   NSS L + NKIPT L+FP HP KISV QSKR VPMA+LTAS+A+GLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS  GSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRG+ NFM+TI+DAGV GLVVPDVPLEETEILRKEAVK+NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL
        TPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGAR SVS++VQTLLEEIKE TEKPVAVGFGISKPEHVKQV++WGADGIIVGSAMVKLLGEAQ+PEEGLKAL
Subjt:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL

Query:  ESFTKSLKSALS
        E+FTKSLKSALS
Subjt:  ESFTKSLKSALS

A0A6J1CVV7 Tryptophan synthase6.4e-15089.14Show/hide
Query:  MDIAFNSSSLLRLNKIPTA-LVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGV
        MDIAFNSS LLR NKIPT  L+FP H  KISV Q+KRF PMAA+TAS A+GLSETF+KLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS +GSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSSLLRLNKIPTA-LVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRG+ENFMMTI+DAGV GLV+PDVPLEETEILRKEAVK++IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKA
        TTPTTPKDRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGAR SVS+RVQTLLEEIKE TEKPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+IVGSA+VKLLGEA++PEEGLK 
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKA

Query:  LESFTKSLKSALS
        LE+FTKSLKSALS
Subjt:  LESFTKSLKSALS

A0A6J1HHZ8 Tryptophan synthase9.8e-16799.68Show/hide
Query:  MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP
        MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALT SNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL
        TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL
Subjt:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL

Query:  ESFTKSLKSALS
        ESFTKSLKSALS
Subjt:  ESFTKSLKSALS

A0A6J1HR08 Tryptophan synthase6.3e-16699.36Show/hide
Query:  MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP
        MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTH RKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCP+ALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL
        TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL
Subjt:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL

Query:  ESFTKSLKSALS
        ESFTKSLKSALS
Subjt:  ESFTKSLKSALS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B7JUK2 Tryptophan synthase alpha chain4.9e-8359Show/hide
Query:  LSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYN
        +S+ F  L+++ + A IP+ITAGDPDL TTA+AL++L   G+D+IELGVPYSDPLADGPVIQAAATR+L RG     ++ ++KEV PE+  PI LF+YYN
Subjt:  LSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYN

Query:  PILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEAT
        PI  RGVE F+  ++ AGV GLVVPD+PLEE E L K A +  I + LL  PT+P +R++AI   S+GF+YLVS  GVTG R+ V+ RV+ LL  ++ AT
Subjt:  PILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEAT

Query:  EKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALESFTKSLKSAL
        +KP+ VGFGISKPEH  QV NWGAD +IVGSAMVK L E  TPEEGLKA+ +F + LK AL
Subjt:  EKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALESFTKSLKSAL

B8HPH2 Tryptophan synthase alpha chain2.7e-8156.44Show/hide
Query:  IGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSY
        + +S  FS L+++ + A IP+ITAGDP L  TA+AL+VL   G+D+IELGVPYSDPLADGP IQAAATR+L +GT   A++ M+  V P L  P+ LF+Y
Subjt:  IGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSY

Query:  YNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKE
        YNPI  RGVE F+  +  AGV GLVVPD+PLEE + +  +A    IEL LL  PTTP+ R+ AI E S+GF+YLVS+ GVTG R+ V  RV  LL E+++
Subjt:  YNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKE

Query:  ATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALESFTKSLKSALS
         T+KP+ VGFGIS+PEH +QV  WGAD  IVGSA VK L E  TPE+GL A+  F +SLK+AL+
Subjt:  ATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALESFTKSLKSALS

O22765 Tryptophan synthase alpha chain1.5e-11980.22Show/hide
Query:  TASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI
        T S+ +GLSETF++LK QGKVA IPYITAGDPDLSTTA+ALKVL + GSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL +GTNF++IISMLKEVIP+LSCPI
Subjt:  TASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI

Query:  ALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLL
        ALF+YYNPIL+RGVEN+M  I++AGVHGL+VPDVPLEETE LR EA K+ IELVLLTTPTTPK+RM AIVEASEGF+YLVSSVGVTG R SV+++VQ+LL
Subjt:  ALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLL

Query:  EEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALESFTKSLKSAL
        ++IKEAT KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+IVGSAMVK+LGE+++PE+GLK LE FTKSLKSAL
Subjt:  EEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALESFTKSLKSAL

P42390 Indole-3-glycerol phosphate lyase, chloroplastic5.6e-8759.77Show/hide
Query:  LSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYN
        +S+T + L  +GK AFIPYITAGDPDL+TTAEAL++L   G+D+IELGVP SDP  DGP+IQA+  R+LA GT   A++ ML+EV PELSCP+ L SYY 
Subjt:  LSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYN

Query:  PILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEAT
        PI+ R     +  +++AGVHGL+VPD+P      L  EA   N+ELVLLTTP  P+DRMK I +ASEGFVYLVS  GVTG R +V+ RV++L++E+K+ T
Subjt:  PILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEAT

Query:  EKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALESFTKSLKSAL
         KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+I+GSAMV+ LGEA +P++GL+ LE + + +K+AL
Subjt:  EKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALESFTKSLKSAL

Q42529 Tryptophan synthase alpha chain, chloroplastic1.4e-11775.97Show/hide
Query:  SVVQSKRFVPMAAL-TASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAI
        S +  KRF PMA+L T+S  +GL++TF++LK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVL   GSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSL RGTN  +I
Subjt:  SVVQSKRFVPMAAL-TASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAI

Query:  ISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGV
        + ML +V+P++SCPI+LF+YYNPILKRG+  FM +IR  GV GLVVPDVPLEETE+LRKEA+  +IELVLLTTPTTP +RMK IV+ASEGF+YLVSS+GV
Subjt:  ISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGV

Query:  TGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALESFTKSLKSAL
        TGAR+SVS +VQ+LL++IKEAT+KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+IVGSAMVKLLG+A++P EGLK LE  TKSLKSAL
Subjt:  TGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALESFTKSLKSAL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G54640.1 tryptophan synthase alpha chain9.8e-11975.97Show/hide
Query:  SVVQSKRFVPMAAL-TASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAI
        S +  KRF PMA+L T+S  +GL++TF++LK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVL   GSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSL RGTN  +I
Subjt:  SVVQSKRFVPMAAL-TASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAI

Query:  ISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGV
        + ML +V+P++SCPI+LF+YYNPILKRG+  FM +IR  GV GLVVPDVPLEETE+LRKEA+  +IELVLLTTPTTP +RMK IV+ASEGF+YLVSS+GV
Subjt:  ISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGV

Query:  TGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALESFTKSLKSAL
        TGAR+SVS +VQ+LL++IKEAT+KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+IVGSAMVKLLG+A++P EGLK LE  TKSLKSAL
Subjt:  TGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALESFTKSLKSAL

AT4G02610.1 Aldolase-type TIM barrel family protein1.0e-12080.22Show/hide
Query:  TASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI
        T S+ +GLSETF++LK QGKVA IPYITAGDPDLSTTA+ALKVL + GSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL +GTNF++IISMLKEVIP+LSCPI
Subjt:  TASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI

Query:  ALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLL
        ALF+YYNPIL+RGVEN+M  I++AGVHGL+VPDVPLEETE LR EA K+ IELVLLTTPTTPK+RM AIVEASEGF+YLVSSVGVTG R SV+++VQ+LL
Subjt:  ALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLL

Query:  EEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALESFTKSLKSAL
        ++IKEAT KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+IVGSAMVK+LGE+++PE+GLK LE FTKSLKSAL
Subjt:  EEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALESFTKSLKSAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACATTGCTTTCAATTCTTCGTCGTTACTTCGATTGAACAAGATTCCCACTGCCCTTGTCTTTCCCACTCATCCTCGTAAGATTTCAGTCGTCCAATCCAAGCGGTT
TGTTCCAATGGCGGCCCTTACAGCCTCCAATGCTATAGGACTGTCGGAAACATTCAGCAAATTGAAGGAACAGGGCAAGGTCGCATTTATCCCCTACATAACTGCTGGTG
ATCCTGATCTTTCCACCACGGCTGAGGCATTGAAGGTTCTTTCCAACCATGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTCCATATTCAGATCCCTTGGCAGATGGCCCTGTT
ATACAGGCTGCAGCGACTCGGTCCTTGGCTAGGGGGACAAACTTTAGTGCAATCATTTCTATGCTGAAGGAGGTTATTCCTGAACTGTCTTGCCCAATTGCCCTTTTTTC
ATACTATAACCCAATTCTTAAGCGTGGCGTCGAGAACTTCATGATGACAATAAGAGATGCTGGTGTACATGGGCTTGTTGTTCCGGACGTTCCTCTGGAAGAGACTGAAA
TTTTGAGAAAAGAAGCTGTAAAGTACAACATCGAGCTGGTACTCTTAACTACACCGACCACGCCTAAAGATAGGATGAAAGCGATCGTTGAAGCTTCAGAGGGATTTGTG
TATCTTGTGAGCTCCGTAGGAGTTACCGGTGCACGTACATCAGTGAGTGATCGAGTTCAAACTCTCCTTGAGGAAATCAAAGAGGCAACAGAAAAACCAGTGGCAGTAGG
TTTCGGTATATCAAAGCCCGAGCACGTGAAACAGGTGGCCAACTGGGGGGCTGATGGGATCATAGTTGGTAGTGCTATGGTGAAGCTGTTGGGAGAAGCTCAGACTCCTG
AAGAAGGATTGAAGGCACTAGAAAGCTTCACCAAATCCTTAAAATCTGCTCTCTCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATAATCCAGCCGCCAAAATTTCTCGCGCAGCTGTCCTTCATTTTTCGGACAGAACGAGGTCGATGCGCCGGAGAGATTTCTTCATTTTTGATGCAGCCATTGGATATCG
AAACTGAACTTCTCAGGTTCAAGTGAACTCCCGACCGTCATTTACCCCAAATGGACATTGCTTTCAATTCTTCGTCGTTACTTCGATTGAACAAGATTCCCACTGCCCTT
GTCTTTCCCACTCATCCTCGTAAGATTTCAGTCGTCCAATCCAAGCGGTTTGTTCCAATGGCGGCCCTTACAGCCTCCAATGCTATAGGACTGTCGGAAACATTCAGCAA
ATTGAAGGAACAGGGCAAGGTCGCATTTATCCCCTACATAACTGCTGGTGATCCTGATCTTTCCACCACGGCTGAGGCATTGAAGGTTCTTTCCAACCATGGATCAGATA
TAATTGAACTTGGTGTTCCATATTCAGATCCCTTGGCAGATGGCCCTGTTATACAGGCTGCAGCGACTCGGTCCTTGGCTAGGGGGACAAACTTTAGTGCAATCATTTCT
ATGCTGAAGGAGGTTATTCCTGAACTGTCTTGCCCAATTGCCCTTTTTTCATACTATAACCCAATTCTTAAGCGTGGCGTCGAGAACTTCATGATGACAATAAGAGATGC
TGGTGTACATGGGCTTGTTGTTCCGGACGTTCCTCTGGAAGAGACTGAAATTTTGAGAAAAGAAGCTGTAAAGTACAACATCGAGCTGGTACTCTTAACTACACCGACCA
CGCCTAAAGATAGGATGAAAGCGATCGTTGAAGCTTCAGAGGGATTTGTGTATCTTGTGAGCTCCGTAGGAGTTACCGGTGCACGTACATCAGTGAGTGATCGAGTTCAA
ACTCTCCTTGAGGAAATCAAAGAGGCAACAGAAAAACCAGTGGCAGTAGGTTTCGGTATATCAAAGCCCGAGCACGTGAAACAGGTGGCCAACTGGGGGGCTGATGGGAT
CATAGTTGGTAGTGCTATGGTGAAGCTGTTGGGAGAAGCTCAGACTCCTGAAGAAGGATTGAAGGCACTAGAAAGCTTCACCAAATCCTTAAAATCTGCTCTCTCCTAAT
CAAATTTTGATGGAATAAGAGGTCAGCTAGCTCTATCACTGAAGCCTGCTAGTGTTTTACAGTCATCTTTAAATGATACTTAAAACATTTCTCTTTCTTTTTAGCTGAAT
AAGACTGTCAGTTTAGTTCTGTTTAAGGATATTGCTTGGTGTTTTAGCTAATATAAGTTTTGTTCTTTCTGGTTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDIAFNSSSLLRLNKIPTALVFPTHPRKISVVQSKRFVPMAALTASNAIGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNHGSDIIELGVPYSDPLADGPV
IQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIRDAGVHGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFV
YLVSSVGVTGARTSVSDRVQTLLEEIKEATEKPVAVGFGISKPEHVKQVANWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALESFTKSLKSALS