; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg16861 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg16861
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionhistone H1-like
Genome locationCarg_Chr19:363016..364837
RNA-Seq ExpressionCarg16861
SyntenyCarg16861
Gene Ontology termsGO:0006334 - nucleosome assembly (biological process)
GO:0016584 - nucleosome positioning (biological process)
GO:0030261 - chromosome condensation (biological process)
GO:0045910 - negative regulation of DNA recombination (biological process)
GO:0000786 - nucleosome (cellular component)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003690 - double-stranded DNA binding (molecular function)
GO:0008168 - methyltransferase activity (molecular function)
GO:0031492 - nucleosomal DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR005818 - Linker histone H1/H5, domain H15
IPR005819 - Linker histone H1/H5
IPR036388 - Winged helix-like DNA-binding domain superfamily
IPR036390 - Winged helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6571489.1 Histone H1.2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.2e-11598.47Show/hide
Query:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL
        MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL
Subjt:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL

Query:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP
        LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP
Subjt:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP

Query:  KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKS
        KAAAKTKA+PKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKK ++
Subjt:  KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKS

XP_022145924.1 histone H1 [Momordica charantia]4.6e-9884.67Show/hide
Query:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL
        MATEEPV+ VESAAEP +AE A E+P  KAAKSKKSKE KEKKPAAP++ RNPPTHPPYEEMI DAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQK LP NFKKLL
Subjt:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL

Query:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP
        LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKL PAK A  KP SPAKKKP AAKPKPKAA KTKAVAK  AKPK AAKPKPKTAAKPKAA  PKPKPAPAK+KSSAVAKP
Subjt:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP

Query:  KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK
        KAA KTKAAPKPKAKE PAKVARTSTR+SPG +AP PKP  KKAP AKKAPAKSVK+KKVKSPA+KAPA+RG+K
Subjt:  KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK

XP_022963684.1 histone H1-like [Cucurbita moschata]9.2e-123100Show/hide
Query:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL
        MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL
Subjt:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL

Query:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP
        LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP
Subjt:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP

Query:  KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK
        KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK
Subjt:  KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK

XP_022967411.1 histone H1-like [Cucurbita maxima]2.5e-12098.54Show/hide
Query:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL
        MATEEPV+AVESAAEPANAEPAGESPVKKA KSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL
Subjt:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL

Query:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP
        LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP
Subjt:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP

Query:  KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK
        KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKP VKKAPVAKKA AKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK
Subjt:  KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK

XP_023554323.1 histone H1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.7e-12299.64Show/hide
Query:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL
        MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL
Subjt:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL

Query:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP
        LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP
Subjt:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP

Query:  KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK
        KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKP VKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK
Subjt:  KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BL93 histone H12.1e-9684.31Show/hide
Query:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL
        MATEEPV+ VESAAEP NAE A E+P  KAAKSKKSKE KEKKPAAP++ RNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLP NFKKLL
Subjt:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL

Query:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP
        LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKL PAK A  KPASPAKKKPVAAKPK KA  K KAVAK  AKPK AAKPKPKT AKPKAA  PKPK AP K+KSSAVAKP
Subjt:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP

Query:  KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK
        KAAAKTKAAPKPKAKE PAK ARTSTR+SPG KAP PKPVVKKAP AKKAP+KSVK+KKVKS A+KAP++RG K
Subjt:  KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK

A0A5A7UQL0 Histone H12.1e-9684.31Show/hide
Query:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL
        MATEEPV+ VESAAEP NAE A E+P  KAAKSKKSKE KEKKPAAP++ RNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLP NFKKLL
Subjt:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL

Query:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP
        LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKL PAK A  KPASPAKKKPVAAKPK KA  K KAVAK  AKPK AAKPKPKT AKPKAA  PKPK AP K+KSSAVAKP
Subjt:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP

Query:  KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK
        KAAAKTKAAPKPKAKE PAK ARTSTR+SPG KAP PKPVVKKAP AKKAP+KSVK+KKVKS A+KAP++RG K
Subjt:  KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK

A0A6J1CWP2 histone H12.2e-9884.67Show/hide
Query:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL
        MATEEPV+ VESAAEP +AE A E+P  KAAKSKKSKE KEKKPAAP++ RNPPTHPPYEEMI DAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQK LP NFKKLL
Subjt:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL

Query:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP
        LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKL PAK A  KP SPAKKKP AAKPKPKAA KTKAVAK  AKPK AAKPKPKTAAKPKAA  PKPKPAPAK+KSSAVAKP
Subjt:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP

Query:  KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK
        KAA KTKAAPKPKAKE PAKVARTSTR+SPG +AP PKP  KKAP AKKAPAKSVK+KKVKSPA+KAPA+RG+K
Subjt:  KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK

A0A6J1HKX3 histone H1-like4.5e-123100Show/hide
Query:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL
        MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL
Subjt:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL

Query:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP
        LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP
Subjt:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP

Query:  KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK
        KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK
Subjt:  KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK

A0A6J1HRY8 histone H1-like1.2e-12098.54Show/hide
Query:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL
        MATEEPV+AVESAAEPANAEPAGESPVKKA KSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL
Subjt:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL

Query:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP
        LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP
Subjt:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKP

Query:  KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK
        KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKP VKKAPVAKKA AKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK
Subjt:  KAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P08283 Histone H12.9e-4756.03Show/hide
Query:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPA---------GESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQ
        MATEEP++AVE+  EP   EP           E P  +  K+KK+K SK KK + P   RNP +HP YEEMIKDAIV+LKE+ GSSQYAI KFIEEKQKQ
Subjt:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPA---------GESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQ

Query:  LPPNFKKLLLFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAV-AKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPA
        LP NFKKLLL +LKK VASGKL+KVK SFKL           S A KKP  AKPK K A K K+V AKPAAKPK  A  KPK A+K KA    KPK A A
Subjt:  LPPNFKKLLLFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAV-AKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPA

Query:  KAKSSAVAKPKAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRG
        K K+ A      AAK KA  KPK+K  PAKVA+TS +++PG K    K V      AKK P KSVK+K VKSP +K   +RG
Subjt:  KAKSSAVAKPKAAAKTKAAPKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRG

P23444 Histone H14.6e-3251.09Show/hide
Query:  TEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQK-QLPPNFKKLLL
        TE P   V++A E     PA  +    AAK+KK+         APK+ R  PTH PY EM+ +AI +LKERTGSS YAI KF+E+K K +LPPNF+KLL 
Subjt:  TEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQK-QLPPNFKKLLL

Query:  FHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKPK
          LKKLVA GKL KVK+S+KL  A     KP + A KKP     KPKAA K K  AK  AK KPA KPKP  AAKPKA  KPK  PA  KAK +A AKPK
Subjt:  FHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKPK

Query:  AAAKTKAAPKPKAKE-NPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK
         A    A PKP AK+   AK A+TS + +PG          KKAP  K AP     SKK  +P RKAP+R+ +K
Subjt:  AAAKTKAAPKPKAKE-NPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK

P26568 Histone H1.14.6e-3251.14Show/hide
Query:  SAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKK--PAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLLLFHLKKLVA
        +A  P       + P  K  K+K  KE KEKK   AAPK+ R   +HP YEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAI KFIEEK+K+LPP F+KLLL +LK+LVA
Subjt:  SAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKK--PAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLLLFHLKKLVA

Query:  SGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKK-PVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKPKAAAKTKA
        SGKLVKVK+SFKL  A   AS P + A+K  P   KP   A  K K     A+K K     KPKTAA  K   K K KP P            AA K KA
Subjt:  SGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKK-PVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKPKAAAKTKA

Query:  A-PKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKS-VKSKKVKSPARKAPAR
           KPKAK  PAK A+T+  +SP  KA      V      KK P K  VK K VKSPA++A +R
Subjt:  A-PKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKS-VKSKKVKSPARKAPAR

P26569 Histone H1.21.8e-4156.62Show/hide
Query:  VESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESK-EKKP---AAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLLLFHLK
        V+S A     +   + P  K  KSKK+  +K  KKP   AAP + +   +HP YEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAI KFIEEK K LPP F+KLLL +LK
Subjt:  VESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESK-EKKP---AAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLLLFHLK

Query:  KLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAAS-KPASPAKKK-PVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKPKAA
        +LVAS KLVKVK+SFK+  A+ AA+ KPA+P KKK  V AKPK K A    A AK  A  K   KP  K  AK K   KPK K   AK KS +VA   A 
Subjt:  KLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAAS-KPASPAKKK-PVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKPKAA

Query:  AKTKA-APKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK
        +KTKA A KPKAKE PAK +RTSTR+SPG K   P    KK  V KKAPAKSV   KVKSPA++A  R+ +K
Subjt:  AKTKA-APKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK

P37218 Histone H13.1e-4959.18Show/hide
Query:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL
        MATEEPV+  E   E A  E   +     A   K  KE+K KKPAAP++    PTHPPY EMIKDAIVTLKERTGSSQ+AITKFIEEKQK LP NFKKLL
Subjt:  MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLL

Query:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAK----PKPKAAVKTK----AVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKP--KAAPKPKPKP-AP
        L  LKK VAS KLVKVK+S+K LP+    +  A PAKKKP AAK     KPKAAVK K    A AKPAAK KPAAK KP   AKP  KA P  K KP A 
Subjt:  LFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAK----PKPKAAVKTK----AVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKP--KAAPKPKPKP-AP

Query:  AKAKSSAVAKPKAA-------AKTKAAPKP--KAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK
        AK K++A AKPKAA       AKTKAA KP  KAK   AKVA+T+TR++P  KA        KA  AKK P K   +K VKSPA+KA  +RGRK
Subjt:  AKAKSSAVAKPKAA-------AKTKAAPKP--KAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06760.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein3.2e-3351.14Show/hide
Query:  SAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKK--PAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLLLFHLKKLVA
        +A  P       + P  K  K+K  KE KEKK   AAPK+ R   +HP YEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAI KFIEEK+K+LPP F+KLLL +LK+LVA
Subjt:  SAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKK--PAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLLLFHLKKLVA

Query:  SGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKK-PVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKPKAAAKTKA
        SGKLVKVK+SFKL  A   AS P + A+K  P   KP   A  K K     A+K K     KPKTAA  K   K K KP P            AA K KA
Subjt:  SGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKK-PVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKPKAAAKTKA

Query:  A-PKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKS-VKSKKVKSPARKAPAR
           KPKAK  PAK A+T+  +SP  KA      V      KK P K  VK K VKSPA++A +R
Subjt:  A-PKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKS-VKSKKVKSPARKAPAR

AT2G18050.1 histone H1-32.3e-0739.77Show/hide
Query:  KKPAAPKRSRNP--PTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQ-LPPNFKKLLLFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKK
        KK  A K+ R P   THPPY +MIK+A++ LKE+ GSS YAI K IEEK K  LP +F+K L   LK  VA GKLVK+++S+KL       ++      K
Subjt:  KKPAAPKRSRNP--PTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQ-LPPNFKKLLLFHLKKLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKK

Query:  KPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPA-PAKAKSSAVAKPKAAAKTKA
        K +  + K      TK     + +PK       KT +  K   K K K A   K+  S+V K KA   + A
Subjt:  KPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPA-PAKAKSSAVAKPKAAAKTKA

AT2G30620.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein1.3e-4256.62Show/hide
Query:  VESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESK-EKKP---AAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLLLFHLK
        V+S A     +   + P  K  KSKK+  +K  KKP   AAP + +   +HP YEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAI KFIEEK K LPP F+KLLL +LK
Subjt:  VESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESK-EKKP---AAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLLLFHLK

Query:  KLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAAS-KPASPAKKK-PVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKPKAA
        +LVAS KLVKVK+SFK+  A+ AA+ KPA+P KKK  V AKPK K A    A AK  A  K   KP  K  AK K   KPK K   AK KS +VA   A 
Subjt:  KLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAAS-KPASPAKKK-PVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKPKAA

Query:  AKTKA-APKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK
        +KTKA A KPKAKE PAK +RTSTR+SPG K   P    KK  V KKAPAKSV   KVKSPA++A  R+ +K
Subjt:  AKTKA-APKPKAKENPAKVARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK

AT2G30620.2 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein1.6e-2452.55Show/hide
Query:  VESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESK-EKKP---AAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLLLFHLK
        V+S A     +   + P  K  KSKK+  +K  KKP   AAP + +   +HP YEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAI KFIEEK K LPP F+KLLL +LK
Subjt:  VESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESK-EKKP---AAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLLLFHLK

Query:  KLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAAS-KPASPAKKK-PVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAK
        +LVAS KLVKVK+SFK+  A+ AA+ KPA+P KKK  V AKPK   A +T     P    K  A P  K A   KA  K     +PAK  S+  AK
Subjt:  KLVASGKLVKVKSSFKLLPAKLAAS-KPASPAKKK-PVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTACTGAGGAGCCAGTTTTGGCGGTGGAGTCTGCGGCAGAGCCGGCCAACGCCGAACCAGCCGGAGAAAGTCCTGTGAAAAAGGCCGCGAAGTCGAAGAAATCCAA
AGAATCGAAAGAGAAGAAGCCTGCTGCGCCTAAAAGATCTAGAAATCCCCCAACTCATCCTCCATATGAAGAGATGATTAAGGATGCGATTGTCACGTTGAAGGAGAGGA
CTGGTTCGAGTCAGTATGCGATTACGAAATTCATTGAGGAGAAGCAGAAGCAACTTCCTCCGAACTTTAAGAAGCTTTTGTTATTCCATTTGAAGAAACTTGTTGCTTCC
GGGAAGCTGGTGAAGGTTAAGAGCTCGTTCAAGCTTCTCCCAGCGAAATTGGCAGCTTCGAAGCCTGCTTCTCCTGCGAAGAAGAAGCCTGTTGCTGCCAAGCCGAAACC
TAAAGCGGCGGTGAAGACCAAGGCTGTGGCTAAGCCGGCAGCAAAGCCGAAACCGGCAGCGAAGCCGAAGCCCAAGACGGCTGCTAAACCCAAGGCTGCTCCTAAACCTA
AACCGAAACCTGCTCCCGCCAAGGCAAAGAGCAGTGCGGTTGCGAAGCCGAAAGCTGCAGCGAAGACTAAAGCTGCTCCCAAGCCGAAAGCCAAGGAGAATCCCGCCAAG
GTTGCTAGGACATCCACGAGATCCTCACCAGGGAATAAGGCACCTGTTCCCAAACCGGTGGTGAAGAAAGCACCGGTGGCCAAGAAGGCTCCGGCGAAAAGTGTTAAGTC
TAAGAAAGTGAAATCGCCGGCGAGAAAGGCTCCGGCAAGAAGAGGAAGGAAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GATGAACATGACAAGCCGACTATTTAAGCCTAAACATTTTAGCCAAACCCACTCAACGAAATTACCAGTAACATTTCATATAGCTCTCTCGTTTCTCTAGATCCCAATTT
TTGTTCCGATCATCTTTCCATTTCTGAATTCTACTTCTGGTTTGTGGAATTTGATCTTGTTTCTACATCAATGGCTACTGAGGAGCCAGTTTTGGCGGTGGAGTCTGCGG
CAGAGCCGGCCAACGCCGAACCAGCCGGAGAAAGTCCTGTGAAAAAGGCCGCGAAGTCGAAGAAATCCAAAGAATCGAAAGAGAAGAAGCCTGCTGCGCCTAAAAGATCT
AGAAATCCCCCAACTCATCCTCCATATGAAGAGATGATTAAGGATGCGATTGTCACGTTGAAGGAGAGGACTGGTTCGAGTCAGTATGCGATTACGAAATTCATTGAGGA
GAAGCAGAAGCAACTTCCTCCGAACTTTAAGAAGCTTTTGTTATTCCATTTGAAGAAACTTGTTGCTTCCGGGAAGCTGGTGAAGGTTAAGAGCTCGTTCAAGCTTCTCC
CAGCGAAATTGGCAGCTTCGAAGCCTGCTTCTCCTGCGAAGAAGAAGCCTGTTGCTGCCAAGCCGAAACCTAAAGCGGCGGTGAAGACCAAGGCTGTGGCTAAGCCGGCA
GCAAAGCCGAAACCGGCAGCGAAGCCGAAGCCCAAGACGGCTGCTAAACCCAAGGCTGCTCCTAAACCTAAACCGAAACCTGCTCCCGCCAAGGCAAAGAGCAGTGCGGT
TGCGAAGCCGAAAGCTGCAGCGAAGACTAAAGCTGCTCCCAAGCCGAAAGCCAAGGAGAATCCCGCCAAGGTTGCTAGGACATCCACGAGATCCTCACCAGGGAATAAGG
CACCTGTTCCCAAACCGGTGGTGAAGAAAGCACCGGTGGCCAAGAAGGCTCCGGCGAAAAGTGTTAAGTCTAAGAAAGTGAAATCGCCGGCGAGAAAGGCTCCGGCAAGA
AGAGGAAGGAAGTAAATGAGATAGAAGGAAAACTAGCGGCGGTCCTGTAAATCCGTTATCCTTGTGTGGGTGTACAGAGCCTTACATCCCATGCTATAGAGGAGTTTACT
TCAGACTTTTCGAGTTTCTTTTACTTGTTTACTTGTAGACCTTTTTCCCAAGTTGATGTATCACTCAGCTTAGTTTTTAATGGAAATTCTGTGATCAATTAGGAGCGTCA
ATTTCAGTTTTCAACCCATGATTTCTACGGCCAGTCCGACTGCATCAATTATCTGGAAACGTTCCGTATCTCTTACGCTAGAAATGGATATGGATTGCTTAATCGAAGTT
TGAAGCTTGGTTGCTAAGCTTGGTAAATCTCGATCTTTCTTGTACTTCTCGCCCTCATATCTGTCTACGATGATTTCAAAGCGTATTTAATTCATTAGCTAGCTGTATTT
GGTCATTGCTTAGATAGGTTGATTGGTTGATAGAGTTTGATCATACCCGTTCATCCCTTTTGCGATATGATTTATCATCTTTCTCATTATGTTTGGTATAATCTACTGAT
GTTTGCATTATTTCTCCCTTACAGATTGTTAGGTTTTTCGTGCTTGGATAGGTCACTGAGTGAGAAGCTATCATTATCGTATAAAATCATGAAGGTTATAAGACTGCTTA
ATAAATCTATTTGGGTATTTGTTGAGGATGGTTGGGAGGGAGTCACACGAATTTAGAAGTAAGGAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATEEPVLAVESAAEPANAEPAGESPVKKAAKSKKSKESKEKKPAAPKRSRNPPTHPPYEEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEEKQKQLPPNFKKLLLFHLKKLVAS
GKLVKVKSSFKLLPAKLAASKPASPAKKKPVAAKPKPKAAVKTKAVAKPAAKPKPAAKPKPKTAAKPKAAPKPKPKPAPAKAKSSAVAKPKAAAKTKAAPKPKAKENPAK
VARTSTRSSPGNKAPVPKPVVKKAPVAKKAPAKSVKSKKVKSPARKAPARRGRK