| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6607892.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 4.5e-73 | 88.52 | Show/hide |
Query: ATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAP-KKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSE
A A SCFALPSKF NLSLNASSS +P+S SS L+SLSFSSN+SVSAFSNGCLS+S AQRP RYSVVCEAAP KKADSAAKRARQAEKRR YNKARKSE
Subjt: ATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAP-KKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSE
Query: IKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
I+TRMKK MEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEA+SVIDKAVKVGTLHRNTAA RKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: IKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| XP_022935732.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like [Cucurbita moschata] | 6.7e-85 | 99.46 | Show/hide |
Query: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSM LSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
Subjt: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
Query: EIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
EIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: EIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| XP_022976587.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like [Cucurbita maxima] | 4.6e-86 | 100 | Show/hide |
Query: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
Subjt: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
Query: EIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
EIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: EIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| XP_023534903.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 5.1e-85 | 98.37 | Show/hide |
Query: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
MAATA+ISCF+LPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
Subjt: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
Query: EIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
EIKTRMKKVMEALDDLKKKPE QSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: EIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| XP_038899721.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic [Benincasa hispida] | 2.4e-74 | 89.19 | Show/hide |
Query: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPK-KADSAAKRARQAEKRRVYNKARK
MAATA +SCF+LPSKFRNLSLNASSS +P SPSS TLRSLSFSSN SVSAFSNGCL++SKAQRP RYSVVCEAAPK KADSAAKR RQAEKRR+YNKARK
Subjt: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPK-KADSAAKRARQAEKRRVYNKARK
Query: SEIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
SEIKTR+KKV+EALD LKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEA+SVIDKAV+VGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTP SPAAA
Subjt: SEIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A6J1CG14 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 2.4e-72 | 86.89 | Show/hide |
Query: ATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAP-KKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSE
A A I+CF++ SKFRNLSLNASSSS P S SSSTL+SL+FSSN+S AFSNGCLS+S+AQRP RYSVVCEAAP KK DSAAKRARQAEKRR+YNKARKSE
Subjt: ATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAP-KKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSE
Query: IKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
IKTRMKKV+EALDDLKKKPEAQSEEVL IEKLIAEA+SVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWY PASPAAA
Subjt: IKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| A0A6J1F6F1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like | 3.2e-85 | 99.46 | Show/hide |
Query: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSM LSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
Subjt: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
Query: EIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
EIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: EIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| A0A6J1FKZ1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 8.3e-73 | 87.98 | Show/hide |
Query: ATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAP-KKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSE
A A SCFALPSKF NLSLNAS S +P+S SS L+SLSFSSN+SVSAFSNGCLS+S AQRP RYSVVCEAAP KKADSAAKRARQAEKRR YNKARKSE
Subjt: ATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAP-KKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSE
Query: IKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
I+TRMKK MEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEA+SVIDKAVKVGTLHRNTAA RKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: IKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| A0A6J1IG57 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like | 2.2e-86 | 100 | Show/hide |
Query: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
Subjt: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
Query: EIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
EIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: EIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| A0A6J1IVC5 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like | 3.7e-73 | 88.52 | Show/hide |
Query: ATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAP-KKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSE
A A SCFALPSKF NLSLNASSS +P+S SS LRSLSFSSNVSVSAFS+GCLS+S AQRP RYSVVCEAAP KKADSAAKRARQAEKRR YNKARKSE
Subjt: ATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAP-KKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSE
Query: IKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
I+TRMKK MEALDDLKKKPEAQSEEVLP+EKLIAEA+SVIDKAVKVGTLHRNTAA RKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: IKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| B0C2C8 30S ribosomal protein S20 | 4.8e-09 | 48.31 | Show/hide |
Query: SAAKRARQAEKRRVYNKARKSEIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKA
SA KR AE+ R+ NKA KS IKT K+ A+DD K P +++ I+ ++ +S IDKAVKVG HRNT AR+K+ LAR KA
Subjt: SAAKRARQAEKRRVYNKARKSEIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKA
|
|
| P62661 30S ribosomal protein S20 | 2.1e-09 | 47.92 | Show/hide |
Query: VCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSEIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARR
+ + PK+ SA KR RQ+ KRR+ NKA+KS IKT KK ++ E ++EE L K++ +A S+IDKA K TLH+N AARRKSRL R+
Subjt: VCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSEIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARR
|
|
| P80380 30S ribosomal protein S20 | 2.1e-09 | 47.92 | Show/hide |
Query: VCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSEIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARR
+ + PK+ SA KR RQ+ KRR+ NKA+KS IKT KK ++ E ++EE L K++ +A S+IDKA K TLH+N AARRKSRL R+
Subjt: VCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSEIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARR
|
|
| P82130 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 1.3e-43 | 63.95 | Show/hide |
Query: CFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAP-KKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSEIKTRMK
C ++ SK NLS SS+ P +S+L+ L+FS+N+S FS GC S+ QR +SVVCE A KKADSAAKR RQAE RR+ NKARKSE+KTRM+
Subjt: CFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAP-KKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSEIKTRMK
Query: KVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPA
KV EALD LKKK A +EE++PI+ LIAEA+S IDKAV GTLHRNTAARRKSRLAR KK VEIHHGWYTP+
Subjt: KVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPA
|
|
| Q9ASV6 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 3.5e-44 | 63.1 | Show/hide |
Query: SCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSP------SSSTL-RSLSFSSNVS-VSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAA--PKKADSAAKRARQAEKRRVYNKA
SC L S+F+ LSL S S P S +S+TL SLSFS +VS AFS G L + Q+P R +VCEAA KKADSAAKRARQAEKRRVYNK+
Subjt: SCFALPSKFRNLSLNASSSSMPLSP------SSSTL-RSLSFSSNVS-VSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAA--PKKADSAAKRARQAEKRRVYNKA
Query: RKSEIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
+KSE +TRMKKV+EAL+ LKKK +AQ++E++ +EKLI EA+S IDKAVKV LH+NT ARRKSRLARRKKAVEIHHGWY P + AAA
Subjt: RKSEIKTRMKKVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
