; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg17301 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg17301
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptiont-SNARE coiled-coil homology domain-containing protein
Genome locationCarg_Chr18:10644607..10647090
RNA-Seq ExpressionCarg17301
SyntenyCarg17301
Gene Ontology termsGO:0015031 - protein transport (biological process)
GO:0061025 - membrane fusion (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0031201 - SNARE complex (cellular component)
GO:0005484 - SNAP receptor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000727 - Target SNARE coiled-coil homology domain
IPR044766 - NPSN/SNAP25-like, N-terminal SNARE domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6574050.1 SNAP25-likeous protein SNAP33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.7e-16699.06Show/hide
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KAG7013111.1 SNAP25-likeous protein SNAP33 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-169100Show/hide
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XP_022945438.1 putative SNAP25 homologous protein SNAP30 [Cucurbita moschata]8.6e-16598.74Show/hide
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XP_022968314.1 putative SNAP25 homologous protein SNAP30 [Cucurbita maxima]7.1e-15995.9Show/hide
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XP_023542548.1 putative SNAP25 homologous protein SNAP30 [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.2e-16799.05Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BF13 putative SNAP25 homologous protein SNAP307.2e-13383.33Show/hide
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A0A6J1G0W1 putative SNAP25 homologous protein SNAP304.2e-16598.74Show/hide
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A0A6J1H000 putative SNAP25 homologous protein SNAP303.8e-13482.97Show/hide
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A0A6J1HWW0 putative SNAP25 homologous protein SNAP303.4e-15995.9Show/hide
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A0A6J1J9F6 putative SNAP25 homologous protein SNAP301.8e-13684.23Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P36977 Synaptosomal-associated protein 25-A3.1e-1630.62Show/hide
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Q17QQ3 Synaptosomal-associated protein 252.0e-1529.33Show/hide
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Q9LMG8 Putative SNAP25 homologous protein SNAP306.3e-8658.23Show/hide
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Q9S7P9 SNAP25 homologous protein SNAP333.3e-9061.32Show/hide
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         YKN+FRDSGG ENQSVQELE YAVYKAEETT SV  CLK+AEDIRSDATRTL MLH QGEQI RTH  A ++D DLS+GEKLL +LGGMFSK WKPKKT
Subjt:  GYKNDFRDSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTNSVNNCLKIAEDIRSDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKT

Query:  KEITGPLITADNSSGRTENNKEEREKLGLSTGKK-QSATRTPPSESYGAMQKVEDEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVD
        + I GP++T D+S  R  N+ E+REKLGL++  + QS TR P  ES  A Q+VE EK KQDD LSDLS+ILG+LKNMAVDMGSE+++QNK LDHL DDVD
Subjt:  KEITGPLITADNSSGRTENNKEEREKLGLSTGKK-QSATRTPPSESYGAMQKVEDEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVD

Query:  ELNSRVKGANQRARRLLG
        ELN RV+ +NQR RRLLG
Subjt:  ELNSRVKGANQRARRLLG

Q9SD96 SNAP25 homologous protein SNAP298.1e-5751.74Show/hide
Query:  SISANPFDDDDDDDDGFVGRRGTATSSASKNGYKNATSSASKNGYKNDFRDSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTNSVNNCLKIAEDIRSDATRTLDMLH
        S S NPFDDDDDD                K   K  TSS          + SGG ENQ+VQELE+YAVY +EETT +V  CLK+AE+IR DA++TL ML+
Subjt:  SISANPFDDDDDDDDGFVGRRGTATSSASKNGYKNATSSASKNGYKNDFRDSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTNSVNNCLKIAEDIRSDATRTLDMLH

Query:  QQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTKEITGPLITADNSSGRTENNKEEREKLGLSTGKKQSATRTPPSESYGAMQKVEDEKE
        +QG+QI RTH+   D+D  LS+GEK+L  LGG+FS+ WKPKK++ ITGP+IT  +S  R   + + REKLGL+   K  +   P  E+  A QK   +  
Subjt:  QQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTKEITGPLITADNSSGRTENNKEEREKLGLSTGKKQSATRTPPSESYGAMQKVEDEKE

Query:  KQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARRLL
        KQD+AL+DLS +LG+LKNMAVDMG+ ++RQ   LDHL D+ DELN RVK +NQRAR LL
Subjt:  KQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARRLL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G13890.1 soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor adaptor protein 304.5e-8758.23Show/hide
Query:  MFSFMKSPVKVSKQNSVDTGLDGSGTNPFDSDTEPETNHTLNPARRTSSEPALVIPNSISANPFDDDDDDDDGFVGRRGTATSSASKNGYKNATSSASKN
        MF F KSP                G N   +++      T+   RRTSSEP L+ P+      FDDDD                                
Subjt:  MFSFMKSPVKVSKQNSVDTGLDGSGTNPFDSDTEPETNHTLNPARRTSSEPALVIPNSISANPFDDDDDDDDGFVGRRGTATSSASKNGYKNATSSASKN

Query:  GYKNDFRDSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTNSVNNCLKIAEDIRSDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKT
         YKN F DSGG ++Q+ +ELE YAVYKAEETT  VNNCLKIAEDIRSD  RTL+MLHQQGEQI RTH MA DMDKDLS+GEKLLNNLGGMFSKPWKPKKT
Subjt:  GYKNDFRDSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTNSVNNCLKIAEDIRSDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKT

Query:  KEITGPLITADNSSGRTENNKEEREKLGLSTGKKQSATRTPPSESYGAMQKVEDEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDE
        K ITGP+IT D  S ++EN+KEEREKLGL   K +S+++    +   A+QKVE EK KQDD LSDLS+ILGDLK+MAVDMGSE+D+QNKALDHL DDVDE
Subjt:  KEITGPLITADNSSGRTENNKEEREKLGLSTGKKQSATRTPPSESYGAMQKVEDEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDE

Query:  LNSRVKGANQRARRLL
        LNSRV+GANQRAR LL
Subjt:  LNSRVKGANQRARRLL

AT3G45280.1 syntaxin of plants 722.8e-0436.99Show/hide
Query:  ESYGAMQKVEDEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARRLL
        ES    Q+ E  ++KQD+ L  +S  L  LKN+A DM  ELD+Q   ++ +   VD   S +K  N R ++ L
Subjt:  ESYGAMQKVEDEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARRLL

AT5G07880.1 synaptosomal-associated protein SNAP25-like 295.7e-5851.74Show/hide
Query:  SISANPFDDDDDDDDGFVGRRGTATSSASKNGYKNATSSASKNGYKNDFRDSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTNSVNNCLKIAEDIRSDATRTLDMLH
        S S NPFDDDDDD                K   K  TSS          + SGG ENQ+VQELE+YAVY +EETT +V  CLK+AE+IR DA++TL ML+
Subjt:  SISANPFDDDDDDDDGFVGRRGTATSSASKNGYKNATSSASKNGYKNDFRDSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTNSVNNCLKIAEDIRSDATRTLDMLH

Query:  QQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTKEITGPLITADNSSGRTENNKEEREKLGLSTGKKQSATRTPPSESYGAMQKVEDEKE
        +QG+QI RTH+   D+D  LS+GEK+L  LGG+FS+ WKPKK++ ITGP+IT  +S  R   + + REKLGL+   K  +   P  E+  A QK   +  
Subjt:  QQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTKEITGPLITADNSSGRTENNKEEREKLGLSTGKKQSATRTPPSESYGAMQKVEDEKE

Query:  KQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARRLL
        KQD+AL+DLS +LG+LKNMAVDMG+ ++RQ   LDHL D+ DELN RVK +NQRAR LL
Subjt:  KQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARRLL

AT5G61210.1 soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor adaptor protein 332.3e-9161.32Show/hide
Query:  MFSFMKSPVKVSKQNSVDTGLDGSGTNPFDSDTEPETNHTLNPARRTSSEPALVIPNSISANPFDDDDDDDDGFVGRRGTATSSASKNGYKNATSSASKN
        MF   KSP  + K NSVD  L  S  NPFDSD E +  HTLNP++RT+SEP+L    +   NPF        G   ++G ++SS      K +  S SK 
Subjt:  MFSFMKSPVKVSKQNSVDTGLDGSGTNPFDSDTEPETNHTLNPARRTSSEPALVIPNSISANPFDDDDDDDDGFVGRRGTATSSASKNGYKNATSSASKN

Query:  GYKNDFRDSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTNSVNNCLKIAEDIRSDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKT
         YKN+FRDSGG ENQSVQELE YAVYKAEETT SV  CLK+AEDIRSDATRTL MLH QGEQI RTH  A ++D DLS+GEKLL +LGGMFSK WKPKKT
Subjt:  GYKNDFRDSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTNSVNNCLKIAEDIRSDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKT

Query:  KEITGPLITADNSSGRTENNKEEREKLGLSTGKK-QSATRTPPSESYGAMQKVEDEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVD
        + I GP++T D+S  R  N+ E+REKLGL++  + QS TR P  ES  A Q+VE EK KQDD LSDLS+ILG+LKNMAVDMGSE+++QNK LDHL DDVD
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Query:  ELNSRVKGANQRARRLLG
        ELN RV+ +NQR RRLLG
Subjt:  ELNSRVKGANQRARRLLG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTAGTTTCATGAAATCCCCCGTGAAAGTTTCTAAGCAGAATTCTGTTGATACTGGATTAGACGGATCGGGTACTAATCCTTTTGATTCAGATACTGAACCTGAAAC
CAACCACACTCTTAATCCTGCAAGAAGAACTTCTTCCGAGCCTGCGCTTGTTATTCCGAACTCCATTTCCGCCAATCCTTTTGATGATGATGATGATGATGATGATGGTT
TTGTTGGAAGAAGAGGTACTGCAACTTCTTCAGCCTCTAAAAACGGATACAAAAATGCAACTTCTTCAGCCTCTAAAAATGGATACAAAAATGATTTTCGCGACTCGGGA
GGATTTGAGAACCAGAGTGTGCAGGAATTGGAGAACTATGCCGTATATAAAGCTGAGGAGACCACAAATTCTGTTAATAACTGCCTGAAGATCGCTGAGGACATAAGGAG
TGATGCTACCAGGACCCTTGACATGTTGCATCAGCAAGGTGAGCAAATTGAGAGGACCCACAGGATGGCTGCTGATATGGATAAAGACCTAAGTAAGGGAGAGAAACTTC
TGAATAATCTTGGAGGCATGTTTTCTAAGCCATGGAAGCCAAAGAAAACCAAAGAAATTACAGGCCCTCTCATAACAGCAGATAATTCATCTGGGAGAACTGAAAACAAC
AAGGAGGAAAGGGAAAAACTGGGTTTATCTACGGGTAAAAAGCAGTCGGCTACTCGAACACCGCCTTCTGAATCATATGGCGCAATGCAAAAAGTCGAGGATGAGAAGGA
AAAGCAAGATGATGCACTCTCAGATTTAAGTAATATCTTGGGTGATCTGAAGAATATGGCCGTGGACATGGGAAGCGAGCTTGACAGGCAAAATAAAGCTCTGGATCATC
TAAGCGACGATGTCGACGAGCTGAATTCTAGAGTGAAAGGCGCCAATCAACGAGCTCGCCGTTTGCTTGGGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACGGTCTAAATTTGTAGGGCAGGAGAACGAATTTCAAAATATTTCTTATGTTTTAAGCGAGTGGGGAGCGTACAGTTTTCTGCTTTTCGGCGTCGCCTCCCATCGATCT
GTTTCGCCATTTTCAATTCTATCTGCGTTAAAGGATTGAACGCACTGAAAACCTCAAGAACACGATCCATTATTTCACTTTCCTTTCAATTTTTCTTCCTGCTTCGGGTT
TTCAGGTACCAGCTATACTCACCAGATCCCTTGTTTTAGAGCCGCTTAGCTAATAGTTCATTAAAATTCAAGTCTCTTTGTACATCCAGGATGTTTAGTTTCATGAAATC
CCCCGTGAAAGTTTCTAAGCAGAATTCTGTTGATACTGGATTAGACGGATCGGGTACTAATCCTTTTGATTCAGATACTGAACCTGAAACCAACCACACTCTTAATCCTG
CAAGAAGAACTTCTTCCGAGCCTGCGCTTGTTATTCCGAACTCCATTTCCGCCAATCCTTTTGATGATGATGATGATGATGATGATGGTTTTGTTGGAAGAAGAGGTACT
GCAACTTCTTCAGCCTCTAAAAACGGATACAAAAATGCAACTTCTTCAGCCTCTAAAAATGGATACAAAAATGATTTTCGCGACTCGGGAGGATTTGAGAACCAGAGTGT
GCAGGAATTGGAGAACTATGCCGTATATAAAGCTGAGGAGACCACAAATTCTGTTAATAACTGCCTGAAGATCGCTGAGGACATAAGGAGTGATGCTACCAGGACCCTTG
ACATGTTGCATCAGCAAGGTGAGCAAATTGAGAGGACCCACAGGATGGCTGCTGATATGGATAAAGACCTAAGTAAGGGAGAGAAACTTCTGAATAATCTTGGAGGCATG
TTTTCTAAGCCATGGAAGCCAAAGAAAACCAAAGAAATTACAGGCCCTCTCATAACAGCAGATAATTCATCTGGGAGAACTGAAAACAACAAGGAGGAAAGGGAAAAACT
GGGTTTATCTACGGGTAAAAAGCAGTCGGCTACTCGAACACCGCCTTCTGAATCATATGGCGCAATGCAAAAAGTCGAGGATGAGAAGGAAAAGCAAGATGATGCACTCT
CAGATTTAAGTAATATCTTGGGTGATCTGAAGAATATGGCCGTGGACATGGGAAGCGAGCTTGACAGGCAAAATAAAGCTCTGGATCATCTAAGCGACGATGTCGACGAG
CTGAATTCTAGAGTGAAAGGCGCCAATCAACGAGCTCGCCGTTTGCTTGGGTAGTAAAATCAGACACTCTAATTCTTCCCTTCTCTTTGTTTCTAGCTGGAATCATTTCG
TTCAAACATTCTTTAATTGTTGGTGTACTTCTGTTCTTTTCTCATGTGATTTTTTAGTTCATAATAAGTACATTGCTTCTATTATTTCAAGGAAAAAGCCTGTTCCTTCA
TCTTGTTGAAGATAGATAGCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFSFMKSPVKVSKQNSVDTGLDGSGTNPFDSDTEPETNHTLNPARRTSSEPALVIPNSISANPFDDDDDDDDGFVGRRGTATSSASKNGYKNATSSASKNGYKNDFRDSG
GFENQSVQELENYAVYKAEETTNSVNNCLKIAEDIRSDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTKEITGPLITADNSSGRTENN
KEEREKLGLSTGKKQSATRTPPSESYGAMQKVEDEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARRLLG