| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6597486.1 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 3.3e-127 | 98.4 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR+ FERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRN GARGEYYSPARSRSISQSCFP
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
Query: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
HDKRDYS SPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
Subjt: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
|
|
| KAG7028947.1 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 4.2e-130 | 100 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
Query: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
Subjt: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
|
|
| XP_022939180.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita moschata] | 3.0e-128 | 99.2 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTS SSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRN GARGEYYSPARSRSISQSCFP
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
Query: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
Subjt: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
|
|
| XP_022973749.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita maxima] | 6.0e-121 | 94.8 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
M RYRSRSRSYSPRRRSRSPPR+RKRYDD+DDSR+RYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
RFSEDAIEAKQQLN TVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGE+YSPARSRSISQS FP
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
Query: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIA SGSR PR+ SRS SGSRSRS+SPR
Subjt: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
|
|
| XP_023539925.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 2.1e-121 | 96.4 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRY DDD SRDRYHESRSYRDRRSPA SGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
RFSEDAIEAKQQLN TVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRN GARGEYYSPARSRSISQS FP
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
Query: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSR PRAVSRS SGSRSRS+SPR
Subjt: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3AXW0 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 1.4e-102 | 84.8 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPR RKRY DDD RDRY ESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
RF+EDA EAKQQLN TVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMR TSRSSGRSYRRRSP RSPRRR RSYSRSPSPARHDSR+ GAR EY SPARSRSIS S P
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
Query: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
D++DYS+SP PK+NGRS REV+ A S SR P+ SRS SGSRSRS+SPR
Subjt: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
|
|
| A0A6J1C7W4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 5.3e-107 | 88 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPR RKRY DDD RDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
RF+EDA EAKQQLN TVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMR TSRSSGRSYRRRSP RSPRRR RSYSRSPSPARHDSRN GAR EY SPARSRSIS+S P
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
Query: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
HD+RDYS+SP PKENGRS REV+I S SR RA SRS SGSRS+S+SPR
Subjt: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
|
|
| A0A6J1FLY4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 1.4e-128 | 99.2 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTS SSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRN GARGEYYSPARSRSISQSCFP
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
Query: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
Subjt: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
|
|
| A0A6J1IFJ5 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 2.9e-121 | 94.8 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
M RYRSRSRSYSPRRRSRSPPR+RKRYDD+DDSR+RYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
RFSEDAIEAKQQLN TVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGE+YSPARSRSISQS FP
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
Query: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIA SGSR PR+ SRS SGSRSRS+SPR
Subjt: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
|
|
| A0A6J1IQ05 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 3.6e-103 | 85.6 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPR RKRY DDD RDRY ESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
RF+EDA EAKQQLN TVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMR TSRSSGRS RRRSP RSPRRR SYSRSPSPARHDSR+ GAR EY SPARSRSIS+S P
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
Query: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
D+RDYS+SP PKENGRS R V+IA S SR PRA SRS SGSRSRS+SPR
Subjt: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q1PDV2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 1.6e-60 | 60.71 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MAR RSRSRSYSPR R RSPPR+RK YDD +R E S RD S PSGLL+RNLPLDARP DLR FERFGP+KD+YLP+NYYTGEPRGFGFVK+
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGR--SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGAR-GEYYSP-ARSRSISQ
R++EDA EA +++N VIGGREI IVFAEENRKTPQEMR+T+ +SGR Y+R S RSPRRR RS+SRS SP R +SR+ R + YSP RSRSIS+
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGR--SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGAR-GEYYSP-ARSRSISQ
Query: SCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHS
S P ++R+Y N RS RE + SR LS SRSRS S
Subjt: SCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHS
|
|
| Q8L3X8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30 | 8.7e-30 | 41.38 | Show/hide |
Query: YRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFS
Y R Y R RS PP R+ Y RR + LLVRN+PLD RPE+LR PFERFGPV+DVY+P++YY+G+PRGF FV+F +
Subjt: YRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFS
Query: EDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGR---SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
DA EA++ +N+ GREI +V A E+RK P+EMR +R+ R R RS GRS R+RS SRS SP R R YSPA R
Subjt: EDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGR---SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFP
Query: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGS---------------RGPRAVSRSLSGSRSRS
D+ +S P G ++ + +G RG RAVSRS SGSRSRS
Subjt: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGS---------------RGPRAVSRSLSGSRSRS
|
|
| Q8WXF0 Serine/arginine-rich splicing factor 12 | 6.9e-19 | 38.5 | Show/hide |
Query: PAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSR---SS
P + L +RN+ RPEDLR F R+GP+ DVY+P ++YT PRGF +V+F DA +A LN+ + GR+I I FA+ +RKTP +M+S R S
Subjt: PAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSR---SS
Query: GRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEY-YSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKEN----GRS------SREVNIACSGSRGPRA
R RSP + R R+RS S + R DS + YS ++SRS S P QS P+ N GRS R +I S S P+
Subjt: GRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEY-YSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKEN----GRS------SREVNIACSGSRGPRA
Query: VSRSLSGSRSRSH
++ SG++SRSH
Subjt: VSRSLSGSRSRSH
|
|
| Q9LHP2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A | 3.1e-35 | 46.37 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
R RSY+P SPPR R R R+ SR S P+ LLVRNL D R EDLR PFE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGF++F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
Query: IEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDK---
EAK Q++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR+ R GRS R + RSP R YSRSP P R +RG Y SP R S+S P D+
Subjt: IEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDK---
Query: --RDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSP
R YS+SP + S S SR PR RS+S ++RS++P
Subjt: --RDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSP
|
|
| Q9SEU4 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 6.4e-33 | 45.02 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
R RSY+P SPPR R R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
Query: IEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDY
+AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR+ R GR RR R R YSRS SP R+ G+YYSP R +S P ++R
Subjt: IEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDY
Query: SQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRG-----PRAVSRSLSGS--RSRSHSPR
+GR S + A GSRG R SRSLS S RS S SPR
Subjt: SQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRG-----PRAVSRSLSGS--RSRSHSPR
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 4.6e-34 | 45.02 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
R RSY+P SPPR R R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
Query: IEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDY
+AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR+ R GR RR R R YSRS SP R+ G+YYSP R +S P ++R
Subjt: IEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDY
Query: SQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRG-----PRAVSRSLSGS--RSRSHSPR
+GR S + A GSRG R SRSLS S RS S SPR
Subjt: SQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRG-----PRAVSRSLSGS--RSRSHSPR
|
|
| AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 33 | 5.0e-33 | 43.8 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
R RSY+P SPPR R R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
Query: IEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDY
+AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR+ R GR RR R R YSRS SP R+ G+YYSP R +S P ++R
Subjt: IEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDY
Query: SQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHS
+GR S + A GSRG RSL+ R +S S
Subjt: SQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHS
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 2.8e-31 | 42.59 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTG------------EPRG
R RSY+P SPPR R R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG +PRG
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTG------------EPRG
Query: FGFVKFRFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSI
FGFV+F DA +AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR+ R G +R R R R YSRS SP R+ G+YYSP R
Subjt: FGFVKFRFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSI
Query: SQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRG-----PRAVSRSLSGS--RSRSHSPR
+S P ++R +GR S + A GSRG R SRSLS S RS S SPR
Subjt: SQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRG-----PRAVSRSLSGS--RSRSHSPR
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 2.2e-36 | 46.37 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
R RSY+P SPPR R R R+ SR S P+ LLVRNL D R EDLR PFE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGF++F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
Query: IEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDK---
EAK Q++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR+ R GRS R + RSP R YSRSP P R +RG Y SP R S+S P D+
Subjt: IEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDK---
Query: --RDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSP
R YS+SP + S S SR PR RS+S ++RS++P
Subjt: --RDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSP
|
|
| AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 28 | 1.2e-61 | 60.71 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MAR RSRSRSYSPR R RSPPR+RK YDD +R E S RD S PSGLL+RNLPLDARP DLR FERFGP+KD+YLP+NYYTGEPRGFGFVK+
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGR--SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGAR-GEYYSP-ARSRSISQ
R++EDA EA +++N VIGGREI IVFAEENRKTPQEMR+T+ +SGR Y+R S RSPRRR RS+SRS SP R +SR+ R + YSP RSRSIS+
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGR--SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGAR-GEYYSP-ARSRSISQ
Query: SCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHS
S P ++R+Y N RS RE + SR LS SRSRS S
Subjt: SCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHS
|
|
