; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg17469 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg17469
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionProtein of unknown function (DUF1068)
Genome locationCarg_Chr12:11103409..11107612
RNA-Seq ExpressionCarg17469
SyntenyCarg17469
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR010471 - Protein of unknown function DUF1068


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022938183.1 uncharacterized protein LOC111444344 [Cucurbita moschata]2.6e-91100Show/hide
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XP_022965983.1 uncharacterized protein LOC111465703 [Cucurbita maxima]3.8e-9098.83Show/hide
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XP_038890751.1 uncharacterized protein LOC120080238 [Benincasa hispida]2.4e-8491.81Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LG38 Uncharacterized protein3.9e-8592.4Show/hide
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A0A1S3C6L6 uncharacterized protein LOC1034970631.8e-8592.98Show/hide
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A0A5A7VC79 DUF1068 domain-containing protein1.8e-8592.98Show/hide
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A0A6J1FI57 uncharacterized protein LOC1114443441.3e-91100Show/hide
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A0A6J1HQJ7 uncharacterized protein LOC1114657031.8e-9098.83Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G05070.1 Protein of unknown function (DUF1068)2.7e-3043.37Show/hide
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        R  A L+  L    +  A  + GP L+W   +AL    S +SC  C C+C    S + I   L+N S  DC  +DP++  + EK + +LLTEELKL+EA 
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        + E  +  ++ + EAK+  S YQ+EA+KC S  ETCEEARE+AE    +++KLTS WE RARQ GW
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AT2G24290.1 Protein of unknown function (DUF1068)2.6e-6570.11Show/hide
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        M+RRSG C+R CLV F+VVSAL VCGPAL+W+  K   +G ++++   C PC+CD PPPLSLL+IAPGLANLS+T CG +DP+LK EMEK FVDLLTEEL
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        KLQEAVA EH+RHMN+T+ EAKR ASQYQ+EAEKC +ATE CE ARERA+AL +KERK+T LWERRARQ+GW+G
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AT2G32580.1 Protein of unknown function (DUF1068)2.6e-3346.01Show/hide
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        A L+  L   A+     + GP L+W   +AL +  S TSC+ C+CDC   L LL I  GL+N S TDC   DP++  + EK + +LLTEELK +EA + E
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          + ++  + EAK+  S YQ+EA+KC S  ETCEEARE+AE   ++++KLTS+WE+RARQ G+
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AT4G04360.1 Protein of unknown function (DUF1068)6.3e-2741.18Show/hide
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        M+RR     +   V   +     + GP+L+W   +   + DS  +SC PC+CDC     LL I  GL+N S  DC  ++ +   E E  F +++ EELKL
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        +EA A E     +  + +AK+AASQYQ+EA+KC    ETCE ARE+AEA   ++R+L+ +WE RARQ GW
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AT4G30996.1 Protein of unknown function (DUF1068)1.0e-6974.57Show/hide
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        LQEAVA EH+RHMN+T+ EAKR ASQYQ+EAEKC +ATE CE ARERAEAL IKERK+TSLWE+RARQ GW+G
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCACGCCGATCTGGGGCTTGCCTGCGCTGTTGTCTCGTGTTCTTCGCTGTAGTTTCTGCTTTGGCTGTTTGTGGACCGGCTTTGTTCTGGCGATTCAAGAAGGCTTT
GCATTTGGGCGATTCCAAAACCTCCTGCGCTCCTTGCATCTGCGATTGTCCGCCCCCATTATCCCTTTTGAAGATCGCCCCCGGTCTGGCCAATCTCTCTGTAACAGACT
GTGGAGGAAATGACCCAGATCTCAAGCGGGAGATGGAAAAGCAATTTGTGGACCTTTTGACAGAGGAATTGAAGCTTCAAGAAGCAGTTGCTGGCGAACATACTCGCCAT
ATGAACATCACTGTATTTGAAGCAAAAAGGGCAGCTTCTCAGTATCAAAGGGAGGCTGAAAAGTGCATTTCTGCAACCGAAACTTGTGAAGAGGCTCGAGAACGCGCCGA
GGCATTGACGATCAAGGAGAGGAAGCTTACATCATTATGGGAGCGACGAGCCCGCCAAATGGGTTGGGATGGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAGGAAAAAATGGAAACTTTTTTTCTTTTAATGTTCATACACACCCACTTAATATTTACACCCACTTCTCCAAGAACAAATTGTAGCTACAGCTAAAGTTTTGTTTGTTT
TTTTCTCTCTTTTTCTCCCCATTCATAGGTTTCAAACTTCCACAGCTGCAATTAGATCTCACTTCCTCAGTTTCTCACTAACACGCAAAGAAAACAAGAACCAAAACGGA
AATTGGAAGATCTGGGTGCGCAATGTCACGCCGATCTGGGGCTTGCCTGCGCTGTTGTCTCGTGTTCTTCGCTGTAGTTTCTGCTTTGGCTGTTTGTGGACCGGCTTTGT
TCTGGCGATTCAAGAAGGCTTTGCATTTGGGCGATTCCAAAACCTCCTGCGCTCCTTGCATCTGCGATTGTCCGCCCCCATTATCCCTTTTGAAGATCGCCCCCGGTCTG
GCCAATCTCTCTGTAACAGACTGTGGAGGAAATGACCCAGATCTCAAGCGGGAGATGGAAAAGCAATTTGTGGACCTTTTGACAGAGGAATTGAAGCTTCAAGAAGCAGT
TGCTGGCGAACATACTCGCCATATGAACATCACTGTATTTGAAGCAAAAAGGGCAGCTTCTCAGTATCAAAGGGAGGCTGAAAAGTGCATTTCTGCAACCGAAACTTGTG
AAGAGGCTCGAGAACGCGCCGAGGCATTGACGATCAAGGAGAGGAAGCTTACATCATTATGGGAGCGACGAGCCCGCCAAATGGGTTGGGATGGGTAATAACTCTATCAT
TTCAAAGACCCATCTCTTAGTCCAACTAGTCGTCAAGCCTTCAACCCCACGAGATCAAACGAGCGAAGTGCTCGGTTCATCAATTTCTCAAGGCATAATGTTCTCTCTTT
TCTCCATTACTTGTGTTGCACTGTTCCTGAAAACATGTCAATTCTACGTCATAATTCATACATGACAATGTTATAGATCCCACTCTTCTGCATATGCTACATGACCTGTT
CTTGAGCATGTCTAATCCGTTCATGAACTTGGAATAGATCGTGTTTTTCTCGTATCGAAAAAACTGAGCTGTTCTCAGTTCTGGCACCAGGTTATTTCTAAGTGTTAACG
ACTAAAAAGAAAGTAACGATACTTCAAAACGACGGTATTAATCGAAATGGAACCGGGCGAGGATTTCATACGTAGAAGAATAGAACGAGTTCTCCTGTCATTATTCTAAA
AACAAATCAACCAGGCAAGAAAAATAGCTAATGATAAGAGAACTACATCATCAAAGAAACATGAAGATACAGTGTTGGGATTCTGTTCTAAAAATCATTCCCCTTTTCCA
ATCATTCAGCAGCAGCAAGAGTCTTCATA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSRRSGACLRCCLVFFAVVSALAVCGPALFWRFKKALHLGDSKTSCAPCICDCPPPLSLLKIAPGLANLSVTDCGGNDPDLKREMEKQFVDLLTEELKLQEAVAGEHTRH
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