; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg17564 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg17564
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionProtein FANTASTIC FOUR 1
Genome locationCarg_Chr12:10398963..10399709
RNA-Seq ExpressionCarg17564
SyntenyCarg17564
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR021410 - The fantastic four family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6586281.1 Protein FANTASTIC FOUR 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-134100Show/hide
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XP_011648796.1 protein FANTASTIC FOUR 4 [Cucumis sativus]2.1e-8165.93Show/hide
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XP_022937985.1 uncharacterized protein LOC111444206 [Cucurbita moschata]6.0e-12997.58Show/hide
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XP_022965897.1 uncharacterized protein LOC111465645 [Cucurbita maxima]1.2e-12194.76Show/hide
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XP_023521579.1 uncharacterized protein LOC111785403 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.9e-13098.39Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJH1 Uncharacterized protein1.0e-8165.93Show/hide
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A0A5A7V610 Protein FANTASTIC FOUR 16.7e-7861.4Show/hide
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                              EEEE+  E+EE E +G VKEG++EFRRCVE++N QRR EHHR    HHH++LDVWRQHCVTTS
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A0A5D3D496 Protein FANTASTIC FOUR 12.6e-7761.05Show/hide
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                              EEEE+  E+EE E +G VKEG++EFRRCVE++N QRR EHHR    HHH++LDVWRQHCVTTS
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A0A6J1FID2 uncharacterized protein LOC1114442062.9e-12997.58Show/hide
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A0A6J1HLJ7 uncharacterized protein LOC1114656455.8e-12294.76Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6NMR8 Protein FANTASTIC FOUR 31.0e-0633.15Show/hide
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        L  CTE+LG ES  +    DE+  ++    N G++     T++ R+R V     PPPLT++   G     +R  R++GRL +T      R    +A R +
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Query:  GRLRLHLIKDED---EEEEDGIEEEEVE--EDGFVKEGQVEFRRCVEVVNHQRRREHHRG-HHHRNLDVWRQHCVTTS
        GRLRL ++KD +   E EE+ IE EE E  E+   +E   +    + + N Q  R   +G   +R L  W   CV TS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G22110.1 structural constituent of ribosome3.4e-0526.5Show/hide
Query:  LKSAPSAADADAAAAEHPLLGLGLISDNNLTQFKSPNILESSSVLKPLCSSPATPRQDPGGVGFLDAVGGGVDGLMSCTESLGFESSDERLVNDEMMGVE
        ++ A S++D+ ++ A      L + SD       SP +  +SS+L    SS ++            AVG  + G  SC + L  +  ++ +V+     V+
Subjt:  LKSAPSAADADAAAAEHPLLGLGLISDNNLTQFKSPNILESSSVLKPLCSSPATPRQDPGGVGFLDAVGGGVDGLMSCTESLGFESSDERLVNDEMMGVE

Query:  NGGDSGGGCTVRVRRRRVVVRRFPPPLTSLNQHGH-----PNFYLRSVRKDGRLELTEVKIERTEILRACREDGRLRLHLI----------------KDE
        +    GG        R    R FPPP+  L Q G+     P    R V  DGRL L E K+   E  RA R +GRL LHL+                + +
Subjt:  NGGDSGGGCTVRVRRRRVVVRRFPPPLTSLNQHGH-----PNFYLRSVRKDGRLELTEVKIERTEILRACREDGRLRLHLI----------------KDE

Query:  DEEEEDGIEEEEVEEDGFVKEGQVEFRRCVEVVN
        DEE++D  ++E+  +D   +E + +     + +N
Subjt:  DEEEEDGIEEEEVEEDGFVKEGQVEFRRCVEVVN

AT1G54740.1 Protein of unknown function (DUF3049)1.4e-1947.15Show/hide
Query:  GLMSCTESLGFESSDERLVNDEMMGVENGGDSGGGCTVRVRRRR----VVV----RRFPPPLTSLNQHGHPNFYLRSVRKDGRLELTEVKIERTEILRAC
        GLM CTE LGFES D R+ ++E+              V  +RR+    VVV    ++FPPPL+SLN  G   FYLR VRKDGRLELT+V ++R EI    
Subjt:  GLMSCTESLGFESSDERLVNDEMMGVENGGDSGGGCTVRVRRRR----VVV----RRFPPPLTSLNQHGHPNFYLRSVRKDGRLELTEVKIERTEILRAC

Query:  REDGRLRLHLIKDEDEEEEDGIE
        R DGRLRLH +        DG+E
Subjt:  REDGRLRLHLIKDEDEEEEDGIE

AT5G19260.1 Protein of unknown function (DUF3049)7.3e-0833.15Show/hide
Query:  LMSCTESLGFESSDERLVNDEMMGVE----NGGDSGGGC-TVRVRRRRVVVRRFPPPLTSLNQHGHPNFYLRSVRKDGRLELTEVKI-ERTEILRACRED
        L  CTE+LG ES  +    DE+  ++    N G++     T++ R+R V     PPPLT++   G     +R  R++GRL +T      R    +A R +
Subjt:  LMSCTESLGFESSDERLVNDEMMGVE----NGGDSGGGC-TVRVRRRRVVVRRFPPPLTSLNQHGHPNFYLRSVRKDGRLELTEVKI-ERTEILRACRED

Query:  GRLRLHLIKDED---EEEEDGIEEEEVE--EDGFVKEGQVEFRRCVEVVNHQRRREHHRG-HHHRNLDVWRQHCVTTS
        GRLRL ++KD +   E EE+ IE EE E  E+   +E   +    + + N Q  R   +G   +R L  W   CV TS
Subjt:  GRLRLHLIKDED---EEEEDGIEEEEVE--EDGFVKEGQVEFRRCVEVVNHQRRREHHRG-HHHRNLDVWRQHCVTTS

AT5G22390.1 Protein of unknown function (DUF3049)1.4e-1138.17Show/hide
Query:  LMSCTESLGFES---SDERLVNDEMMGVEN-----GGDSGGGCTVRVRRRRVVVRRFPPPLTSLNQHGHPNFYLRSVRKDGRLELTEVKIERTEILRACR
        L  CTE LG ES    ++  VN +  G ++     G D+G         RR   + +PP +T ++         ++ RK+GRL L EV+I R E LRA R
Subjt:  LMSCTESLGFES---SDERLVNDEMMGVEN-----GGDSGGGCTVRVRRRRVVVRRFPPPLTSLNQHGHPNFYLRSVRKDGRLELTEVKIERTEILRACR

Query:  EDGRLRLHLIKDED--EEEEDGIEEEEVEED
        EDGRLRL L++ ED  +EEE+  +++ V+ED
Subjt:  EDGRLRLHLIKDED--EEEEDGIEEEEVEED


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCTTCGCCGACACCTTCTCTCTCAAATCCGCCCCCTCCGCCGCCGACGCCGACGCCGCCGCCGCCGAACATCCCCTTCTCGGGTTGGGCTTGATTTCCGACAACAA
TCTCACCCAATTCAAATCCCCCAATATTCTCGAATCCTCCTCTGTTTTGAAGCCTCTCTGTTCCTCGCCGGCGACCCCACGACAGGATCCCGGCGGAGTTGGTTTCCTCG
ACGCCGTTGGCGGTGGCGTTGATGGGTTGATGTCGTGTACCGAGAGCCTCGGATTTGAAAGCTCCGATGAACGATTGGTTAATGATGAGATGATGGGTGTGGAAAATGGG
GGAGATAGTGGTGGTGGGTGTACGGTTCGGGTGCGGCGGAGGAGGGTGGTGGTGAGGAGGTTTCCGCCGCCGTTGACGTCGTTGAATCAACATGGTCATCCTAATTTTTA
TCTCCGGTCGGTTAGGAAGGATGGGAGGTTGGAACTGACTGAGGTGAAGATCGAACGGACGGAGATTCTTCGCGCGTGTCGCGAAGATGGACGGTTGAGATTGCATCTTA
TAAAGGACGAGGACGAGGAAGAGGAGGATGGGATTGAAGAGGAAGAGGTAGAAGAAGATGGGTTTGTGAAAGAAGGGCAGGTGGAATTCCGGCGGTGTGTTGAGGTGGTG
AACCACCAGCGCCGCCGTGAGCACCACCGTGGCCACCACCACCGGAATTTGGATGTGTGGAGGCAGCACTGCGTGACAACGAGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCCTTCGCCGACACCTTCTCTCTCAAATCCGCCCCCTCCGCCGCCGACGCCGACGCCGCCGCCGCCGAACATCCCCTTCTCGGGTTGGGCTTGATTTCCGACAACAA
TCTCACCCAATTCAAATCCCCCAATATTCTCGAATCCTCCTCTGTTTTGAAGCCTCTCTGTTCCTCGCCGGCGACCCCACGACAGGATCCCGGCGGAGTTGGTTTCCTCG
ACGCCGTTGGCGGTGGCGTTGATGGGTTGATGTCGTGTACCGAGAGCCTCGGATTTGAAAGCTCCGATGAACGATTGGTTAATGATGAGATGATGGGTGTGGAAAATGGG
GGAGATAGTGGTGGTGGGTGTACGGTTCGGGTGCGGCGGAGGAGGGTGGTGGTGAGGAGGTTTCCGCCGCCGTTGACGTCGTTGAATCAACATGGTCATCCTAATTTTTA
TCTCCGGTCGGTTAGGAAGGATGGGAGGTTGGAACTGACTGAGGTGAAGATCGAACGGACGGAGATTCTTCGCGCGTGTCGCGAAGATGGACGGTTGAGATTGCATCTTA
TAAAGGACGAGGACGAGGAAGAGGAGGATGGGATTGAAGAGGAAGAGGTAGAAGAAGATGGGTTTGTGAAAGAAGGGCAGGTGGAATTCCGGCGGTGTGTTGAGGTGGTG
AACCACCAGCGCCGCCGTGAGCACCACCGTGGCCACCACCACCGGAATTTGGATGTGTGGAGGCAGCACTGCGTGACAACGAGTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSFADTFSLKSAPSAADADAAAAEHPLLGLGLISDNNLTQFKSPNILESSSVLKPLCSSPATPRQDPGGVGFLDAVGGGVDGLMSCTESLGFESSDERLVNDEMMGVENG
GDSGGGCTVRVRRRRVVVRRFPPPLTSLNQHGHPNFYLRSVRKDGRLELTEVKIERTEILRACREDGRLRLHLIKDEDEEEEDGIEEEEVEEDGFVKEGQVEFRRCVEVV
NHQRRREHHRGHHHRNLDVWRQHCVTTS