; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg17784 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg17784
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCarg_Chr10:3902273..3904318
RNA-Seq ExpressionCarg17784
SyntenyCarg17784
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6590083.1 hypothetical protein SDJN03_15506, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.1e-21699.51Show/hide
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KAG7023753.1 hypothetical protein SDJN02_14779 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.0e-218100Show/hide
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A0A6J1JIH1 uncharacterized protein LOC111484754 isoform X22.8e-16695.78Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G65090.1 unknown protein1.3e-0931.35Show/hide
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AT1G65090.2 unknown protein3.4e-1526.88Show/hide
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Query:  NGGVDHVREL-------EISMEDEKPSDSVEKSVLGLLNEVDSAAVYPHADDRTSEGVGSAKSSDETNAIT-TLTNKATKSEEAEQLPKVTMIDVIES--
        N   + V+E        E   E E  +  +E S      E+ S      A      G    K++ +    T    N+  K             D++E   
Subjt:  NGGVDHVREL-------EISMEDEKPSDSVEKSVLGLLNEVDSAAVYPHADDRTSEGVGSAKSSDETNAIT-TLTNKATKSEEAEQLPKVTMIDVIES--

Query:  -------DEGLSISAMTIEHKVEANSPHKDHRMSSNEELSGEVKIREKIASMKKIVGYKATPLGTYLDEVNALYAFIG-VEPPSPMKDSANDD--DINLL
                  ++ SA+++    EA+       M  N ++  E ++ E + +++K+VGY      T  +E+ ALY F G VEPP   + S N D  DI  L
Subjt:  -------DEGLSISAMTIEHKVEANSPHKDHRMSSNEELSGEVKIREKIASMKKIVGYKATPLGTYLDEVNALYAFIG-VEPPSPMKDSANDD--DINLL

Query:  NQKLQFLMSIVGV
          +L+FLMS++G+
Subjt:  NQKLQFLMSIVGV

AT1G65090.3 unknown protein7.4e-1827.65Show/hide
Query:  MEEQLSSGDGLSSEKICSAVQKGCSLGKKLLLTGLAISSVPVVLPPLVIMSAFGIAASIPYGVFLASYACTETIMSVWLPIPPALKLDSADEEIVEEDIY
        MEE  S+    S +K      K  S+GKK+L  G+ +SS P+++P L + S     +S+P+ +FLA+YACT+ +MS  LP       D+ +   V ++  
Subjt:  MEEQLSSGDGLSSEKICSAVQKGCSLGKKLLLTGLAISSVPVVLPPLVIMSAFGIAASIPYGVFLASYACTETIMSVWLPIPPALKLDSADEEIVEEDIY

Query:  EDEEKHMMETAKRGGNLDDFDIDVVVVQGDEEGETDIGSKGLAAIEVTNVEFEGNGDIGDEEEEEEELKETRGLLERIRDEGRRDNGFVDANGGVDHVRE
        +D+E    E +K G                 EG   +G   L   +   +  +        +E+EE  KE+  LLE+IRDEGR D               
Subjt:  EDEEKHMMETAKRGGNLDDFDIDVVVVQGDEEGETDIGSKGLAAIEVTNVEFEGNGDIGDEEEEEEELKETRGLLERIRDEGRRDNGFVDANGGVDHVRE

Query:  LEISMEDEKPSDSVEKSVLGLLNEVDSAAVYPHADDRTSEGVGSAKSSDETNAITTLTNKATKSEEAEQLPKVTMIDVIESDEGLSISAMTIEHKVEANS
         E +++D+K S                               G+AKS +             +  E  + P+       E + G +        K+E ++
Subjt:  LEISMEDEKPSDSVEKSVLGLLNEVDSAAVYPHADDRTSEGVGSAKSSDETNAITTLTNKATKSEEAEQLPKVTMIDVIESDEGLSISAMTIEHKVEANS

Query:  PHKDHRMSSNEELSGEVKIREKIASMKKIVGYKATPLGTYLDEVNALYAFIG-VEPPSPMKDSANDD--DINLLNQKLQFLMSIVGV
           D  +SSNE  S E ++ E + +++K+VGY      T  +E+ ALY F G VEPP   + S N D  DI  L  +L+FLMS++G+
Subjt:  PHKDHRMSSNEELSGEVKIREKIASMKKIVGYKATPLGTYLDEVNALYAFIG-VEPPSPMKDSANDD--DINLLNQKLQFLMSIVGV

AT5G36100.1 unknown protein3.4e-1525.61Show/hide
Query:  QKGCSLGKKLLLTGLAISSVPVVLPPLVIMSAFGIAASIPYGVFLASYACTETIMSVWLPIPPALKLDSADEEIVEEDIYEDEEKHMMETAKRGGNLDDF
        +KG S+GKK+L     + S P ++P LV+ S   + +S+PY  FL SY CTE +M   LP          D E+V   +++++  H        G++ D 
Subjt:  QKGCSLGKKLLLTGLAISSVPVVLPPLVIMSAFGIAASIPYGVFLASYACTETIMSVWLPIPPALKLDSADEEIVEEDIYEDEEKHMMETAKRGGNLDDF

Query:  DIDVVVVQGDEEGETDIGSKGLAAIEVTNVEFEGNGDIGDEEEEEEEL-KETRGLLERIRDEGRRDNGFVDANGGVDHVRELEISMEDEKPSDSVEKSVL
         +  V +                  E   V+ E    I     E+E++ KE +  LE IRDEG+ +                                  
Subjt:  DIDVVVVQGDEEGETDIGSKGLAAIEVTNVEFEGNGDIGDEEEEEEEL-KETRGLLERIRDEGRRDNGFVDANGGVDHVRELEISMEDEKPSDSVEKSVL

Query:  GLLNEVDSAAVYPHADDRTSEGVGSAKSSDETNAITTLTNKATKSEEAEQLPKVTMIDVI-ESDEGLSISAMTIEHKVEANSPHKDHRMSSNEELSGEVK
                             GV   K  +E +   ++  +  KSE      +  + D++ +  E ++I    +E      S  KD  +SS   L  E +
Subjt:  GLLNEVDSAAVYPHADDRTSEGVGSAKSSDETNAITTLTNKATKSEEAEQLPKVTMIDVI-ESDEGLSISAMTIEHKVEANSPHKDHRMSSNEELSGEVK

Query:  IREKIASMKKIVGYKATPLGTYLDEVNALYAFIGVEPPSPMKDSANDDDINLLNQKLQFLMSIVGVK
        I  KI +++K+VGY  T   TY +E+ ALY F GVE P+    +  + DI  +++ L FLMS++G+K
Subjt:  IREKIASMKKIVGYKATPLGTYLDEVNALYAFIGVEPPSPMKDSANDDDINLLNQKLQFLMSIVGVK

AT5G36100.2 unknown protein6.1e-0425.93Show/hide
Query:  QKGCSLGKKLLLTGLAISSVPVVLPPLVIMSAFGIAASIPYGVFLASYACTETIMSVWLPIPPALKLDSADEEIVEEDIYEDEEKHMMETAKRGGNLDDF
        +KG S+GKK+L     + S P ++P LV+ S   + +S+PY  FL SY CTE +M   LP          D E+V   +++++  H        G++ D 
Subjt:  QKGCSLGKKLLLTGLAISSVPVVLPPLVIMSAFGIAASIPYGVFLASYACTETIMSVWLPIPPALKLDSADEEIVEEDIYEDEEKHMMETAKRGGNLDDF

Query:  DIDVVVVQGDEEGETDIGSKGLAAIEVTNVEFEGNGDIGDEEEEEEEL-KETRGLLERIRDEGRRD----NGFVDANGGVDHVRELEISMEDEKPSDSVE
         +  V +                  E   V+ E    I     E+E++ KE +  LE IRDEG+ +     G +   G  +  ++  I   D K S++V 
Subjt:  DIDVVVVQGDEEGETDIGSKGLAAIEVTNVEFEGNGDIGDEEEEEEEL-KETRGLLERIRDEGRRD----NGFVDANGGVDHVRELEISMEDEKPSDSVE

Query:  KSVLGLLNEVDSAAVYPHADDRTSEGVGSAKSSDETNAITTLT
          +  LL +    +V  H  +  S    +++  D   + TT++
Subjt:  KSVLGLLNEVDSAAVYPHADDRTSEGVGSAKSSDETNAITTLT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGATGAACCACCTGAGTTCATCAGGATGGAGGGCTATCGCAGCATAGACTGGAATATGGAAGAACAACTGTCCTCCGGTGATGGCCTGAGCAGTGAAAAGATATG
CTCCGCCGTGCAAAAGGGTTGCAGTCTGGGGAAGAAGCTTCTCCTCACTGGTTTAGCCATATCCTCTGTTCCTGTGGTTCTTCCTCCATTGGTTATCATGTCAGCCTTTG
GAATTGCAGCCTCAATTCCCTATGGGGTTTTCCTCGCCTCTTATGCTTGTACTGAGACGATCATGAGTGTTTGGCTTCCGATTCCCCCGGCCCTGAAGCTCGACAGCGCT
GACGAAGAGATTGTGGAGGAAGACATCTATGAAGATGAAGAAAAACATATGATGGAAACAGCTAAGAGAGGTGGGAATTTGGATGATTTCGATATCGATGTGGTAGTCGT
TCAGGGGGACGAAGAGGGCGAAACCGACATTGGAAGCAAAGGTCTGGCAGCAATTGAAGTGACCAATGTGGAATTTGAAGGAAATGGAGATATTGGAGATGAGGAGGAAG
AGGAAGAAGAGTTGAAGGAAACTAGAGGTTTACTCGAAAGAATCCGGGATGAGGGACGAAGAGACAATGGTTTTGTTGATGCGAATGGCGGTGTTGATCATGTTCGAGAG
CTCGAGATTTCAATGGAGGACGAGAAACCAAGTGATTCTGTCGAAAAAAGTGTTCTAGGTTTGTTGAATGAAGTTGACTCTGCTGCTGTTTATCCTCATGCAGACGATAG
AACTTCTGAAGGGGTCGGGTCGGCGAAATCTAGTGATGAAACAAATGCAATAACGACATTGACAAACAAGGCAACCAAGTCTGAAGAAGCTGAGCAACTTCCTAAAGTAA
CAATGATTGATGTGATAGAATCTGATGAGGGTTTGTCTATATCAGCTATGACTATTGAACACAAAGTTGAGGCAAATTCTCCACATAAAGATCATAGGATGTCTTCCAAT
GAGGAACTATCAGGAGAGGTAAAGATAAGAGAAAAGATTGCTTCGATGAAGAAGATCGTAGGATACAAGGCTACCCCCCTCGGAACATACTTAGACGAAGTGAACGCTCT
ATATGCCTTCATCGGAGTCGAGCCACCTTCCCCGATGAAAGATTCTGCTAATGATGATGATATCAATCTACTTAACCAGAAGTTGCAGTTTCTCATGTCCATAGTAGGGG
TCAAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTTAACTTGGTGGCAGGCTTCTGCAGGCATTCCTTTTCCTCTGCACAATCTACCACCGCCTTCCCTTGCATTCTCTTCAACAGCAGCTATTCTCTCTCCCTCTCTCTCT
ATCCGCCATGGAAGAAGAGCTTGTTTGATCATGGCCGATGAACCACCTGAGTTCATCAGGATGGAGGGCTATCGCAGCATAGACTGGAATATGGAAGAACAACTGTCCTC
CGGTGATGGCCTGAGCAGTGAAAAGATATGCTCCGCCGTGCAAAAGGGTTGCAGTCTGGGGAAGAAGCTTCTCCTCACTGGTTTAGCCATATCCTCTGTTCCTGTGGTTC
TTCCTCCATTGGTTATCATGTCAGCCTTTGGAATTGCAGCCTCAATTCCCTATGGGGTTTTCCTCGCCTCTTATGCTTGTACTGAGACGATCATGAGTGTTTGGCTTCCG
ATTCCCCCGGCCCTGAAGCTCGACAGCGCTGACGAAGAGATTGTGGAGGAAGACATCTATGAAGATGAAGAAAAACATATGATGGAAACAGCTAAGAGAGGTGGGAATTT
GGATGATTTCGATATCGATGTGGTAGTCGTTCAGGGGGACGAAGAGGGCGAAACCGACATTGGAAGCAAAGGTCTGGCAGCAATTGAAGTGACCAATGTGGAATTTGAAG
GAAATGGAGATATTGGAGATGAGGAGGAAGAGGAAGAAGAGTTGAAGGAAACTAGAGGTTTACTCGAAAGAATCCGGGATGAGGGACGAAGAGACAATGGTTTTGTTGAT
GCGAATGGCGGTGTTGATCATGTTCGAGAGCTCGAGATTTCAATGGAGGACGAGAAACCAAGTGATTCTGTCGAAAAAAGTGTTCTAGGTTTGTTGAATGAAGTTGACTC
TGCTGCTGTTTATCCTCATGCAGACGATAGAACTTCTGAAGGGGTCGGGTCGGCGAAATCTAGTGATGAAACAAATGCAATAACGACATTGACAAACAAGGCAACCAAGT
CTGAAGAAGCTGAGCAACTTCCTAAAGTAACAATGATTGATGTGATAGAATCTGATGAGGGTTTGTCTATATCAGCTATGACTATTGAACACAAAGTTGAGGCAAATTCT
CCACATAAAGATCATAGGATGTCTTCCAATGAGGAACTATCAGGAGAGGTAAAGATAAGAGAAAAGATTGCTTCGATGAAGAAGATCGTAGGATACAAGGCTACCCCCCT
CGGAACATACTTAGACGAAGTGAACGCTCTATATGCCTTCATCGGAGTCGAGCCACCTTCCCCGATGAAAGATTCTGCTAATGATGATGATATCAATCTACTTAACCAGA
AGTTGCAGTTTCTCATGTCCATAGTAGGGGTCAAGTAGGGGTGTTAAAAGTTTGGCATTGAATAAGTTGCCATTTGTGCACTTTTGTTTGCCAATGGCAATATTTCCTTA
TGTTTGAGCTATGCACAGTTTGGTTTTGAAATTATGTACCAAATTTTGAACAGTTTATCTACTTTTTTCCCTCTTTCTGTTCAGTTCTTTTCATCCACAAGGGTTCTTGA
ATCACTCATGGGTGTTAGGAAGTGAAAAATCCAAGAGATCTATGAAATTTATAGCTTAAATGATGAAGAGTGATCGGACAAAATTGTAGAACATTCAATTAACTGAAGTG
AGAATCAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MADEPPEFIRMEGYRSIDWNMEEQLSSGDGLSSEKICSAVQKGCSLGKKLLLTGLAISSVPVVLPPLVIMSAFGIAASIPYGVFLASYACTETIMSVWLPIPPALKLDSA
DEEIVEEDIYEDEEKHMMETAKRGGNLDDFDIDVVVVQGDEEGETDIGSKGLAAIEVTNVEFEGNGDIGDEEEEEEELKETRGLLERIRDEGRRDNGFVDANGGVDHVRE
LEISMEDEKPSDSVEKSVLGLLNEVDSAAVYPHADDRTSEGVGSAKSSDETNAITTLTNKATKSEEAEQLPKVTMIDVIESDEGLSISAMTIEHKVEANSPHKDHRMSSN
EELSGEVKIREKIASMKKIVGYKATPLGTYLDEVNALYAFIGVEPPSPMKDSANDDDINLLNQKLQFLMSIVGVK