; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg17849 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg17849
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionE3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X2
Genome locationCarg_Chr10:4418534..4420572
RNA-Seq ExpressionCarg17849
SyntenyCarg17849
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0004842 - ubiquitin-protein transferase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6590151.1 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.0e-6099.27Show/hide
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XP_022961103.1 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X4 [Cucurbita moschata]9.0e-6298.57Show/hide
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A0A6J1H9E6 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X24.4e-6298.57Show/hide
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A0A6J1HB23 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X14.4e-6298.57Show/hide
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A0A6J1HD02 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X44.4e-6298.57Show/hide
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A0A6J1JIT2 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X44.1e-6095Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q4TU14 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A1.0e-0735.25Show/hide
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Q9ZT42 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A2.0e-2754.29Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAGCCCTTAGAATTTATTAGTCATGAATTAATATTGTTGCCCCCCACCTTTGTTTGGAGATCTTCCAGTCAATCCATGCCCAATAGTCAAGATAGGGCCGGACCATC
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AAAAGTAGCAGTCCTGAGTCCAGTAATGCAGCAGGGGATAGTAGCCCAGTTTCAGAATCAAATAACAGACAGATACCAGAGAATGGAGGAAACAATCCTTTGAGTGACAC
AAATGAAAAAGGGCCACGCCCTGCAGAATCCAGTTCAAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAGCTTTTAAAAACTACATTTTCTTTTTTTTAGTTTTTAAAATAATAATCATAATAATAAAAATCAAACATTTCTCTAAGAATTGTAAAAAACATAAAGAATTTGTA
GTTGTATGACTACTTGTCGGATCTCAGTTGGGCAAAAAACCTTGCAATAAAGTTGTGTATTATTTCTACATTAAAAGGAAGTTTGCTCTGTTGAGGTATTGACCGGAATT
TGAATTGGAATGGTTCAAGCATGTTTATTTTGTTCATTTAAATAGGTGTCAGAGAAGCTCCCAATGCCCTATGTGTTGGCAACCTATTAGTCTGAAGGATCCAACCAGCC
AGGAGTTGCTCGAAGGTGTAGAACAAGAGAGAAGTTTTAGACTTAATCCAGCTAGAAATTCAACAATATTTCGCCATCCCACTCTTGGTGACTTCGAGTTACAGCATCTA
CCAGCTGGTGCTAATGATGCTGATCTTGAAGAGCGTATACTCCAACACCTAGCTGCAGCAGCTGCCATGGGACGAGCACGCCATGGTGCTAGAAGGGAAGGCCACAGAAA
TCGGTCAGGAGTTCATGGCCGTCCCCAGTTCTTGGTGTTCTCTTCCCATCCCAATTCTTCGTCGACCTCTCCACCTCATGGTGACAATCGAGAGGGTGAAACAGCCCCAA
GAATCATGGTAGCTGCTGTATCCCCACCTCCACCTGCAGGAGAAGAGTCCCCACAACTCAACACATCAGTATCTCCCATACAAACTGACCAGTCTTCTCCTTCCGTGCCT
CAATCCAGTTTACATTCTTCTAGTCAACTTGGATCTCCTTCGAGGGATAGGTATTCGTCTATCATTGGATTTATAGAACATGCCATTGTATGCAGCCCTTAGAATTTATT
AGTCATGAATTAATATTGTTGCCCCCCACCTTTGTTTGGAGATCTTCCAGTCAATCCATGCCCAATAGTCAAGATAGGGCCGGACCATCAGAGTTACAATCATTCTCGGA
TTCGCTGAAGTCTCGATTTAATGCAATGTCAATGAGGTACAAAGATTCAATCACAAAGAGCACAAAAGGTTGGAGGGAAAAATTGTTCTCCCGCAACACTTCAATGTCAG
ATATTGGCTCTGAAGTTAAAAGAGAGGTCAATGCAGGGATAGAAACGGTATCGCGCATGATGGAACGTCTCGAAACAAGAGATGCTAGAAAAAGTAGCAGTCCTGAGTCC
AGTAATGCAGCAGGGGATAGTAGCCCAGTTTCAGAATCAAATAACAGACAGATACCAGAGAATGGAGGAAACAATCCTTTGAGTGACACAAATGAAAAAGGGCCACGCCC
TGCAGAATCCAGTTCAAGTTGAACAGTCCCAGAATTGGCTTCACTCAAAGGCTCACATCTTATAAAAGGTGACTACTGCAATTAATTGTTTTACCTCTTCCATATGTACA
AGAAATGCATGGAGTTGACGGATGTTTTAAAATTTGAAGAAAAAAAAAAAAGAGAAACTAAAAAATATTCACAAAAGTGTCTCAAGTTTTAGTTTATTTTATGATTAGTT
AGAGTATATTTATATATTAGTCGGTATTTCATTTAAACCTGTAATAAAATAGCTTATTTACTCGTAAGTTAAAAGGCCATATTCTGCTTTTTCCCATCTATCAAGTTGTG
GTAGGCTTCTTCACCTTTACTACCGTCCTAATTTGGTAGTCTCATGTGAGTTCCCACGTCGGTTGGAGAGGGGAATGAAACATTCAAGTATGTGGAAACCTTTTTCTAAT
AGGCTCGTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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