; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg17850 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg17850
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionE3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X2
Genome locationCarg_Chr10:4423694..4426556
RNA-Seq ExpressionCarg17850
SyntenyCarg17850
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0004842 - ubiquitin-protein transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_008450319.1 PREDICTED: E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X2 [Cucumis melo]1.5e-29100Show/hide
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XP_022961100.1 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X1 [Cucurbita moschata]1.5e-29100Show/hide
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A0A6J1H987 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X37.2e-30100Show/hide
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A0A6J1HB23 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X17.2e-30100Show/hide
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A0A6J1JGF2 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X37.2e-30100Show/hide
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A0A6J1JKS1 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X17.2e-30100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2HIJ8 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHB1A2.9e-0448.65Show/hide
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Q4TU14 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A4.7e-1059.18Show/hide
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Q8LE94 E3 ubiquitin-protein ligase At3g022905.0e-0444.12Show/hide
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Q9ZT42 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A1.5e-2486.21Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G00335.1 RING-H2 finger B1A2.1e-0548.65Show/hide
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AT4G14220.1 RING-H2 group F1A3.3e-1159.18Show/hide
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AT5G22000.1 RING-H2 group F2A1.1e-2586.21Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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