; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg17973 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg17973
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionprotein mago nashi homolog
Genome locationCarg_Chr11:4147300..4150043
RNA-Seq ExpressionCarg17973
SyntenyCarg17973
Gene Ontology termsGO:0008380 - RNA splicing (biological process)
GO:0035145 - exon-exon junction complex (cellular component)
InterPro domainsIPR004023 - Mago nashi protein
IPR036605 - Mago nashi superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7022084.1 Protein mago nashi-like 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.5e-112100Show/hide
Query:  MQKSSHVLHAPSSPRRYLLRFSSSAAPSSSAILLYIRDIFESLRLRGRERRFTAGAMAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNS
        MQKSSHVLHAPSSPRRYLLRFSSSAAPSSSAILLYIRDIFESLRLRGRERRFTAGAMAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNS
Subjt:  MQKSSHVLHAPSSPRRYLLRFSSSAAPSSSAILLYIRDIFESLRLRGRERRFTAGAMAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNS

Query:  NYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGNEHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLIS
        NYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGNEHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLIS
Subjt:  NYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGNEHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLIS

Query:  LHYKIKPI
        LHYKIKPI
Subjt:  LHYKIKPI

KAG7028477.1 Protein mago nashi-like 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.4e-8393.33Show/hide
Query:  RLRGRERRFTAGAMAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPD
        R  G+E R  A AM+ ED+ENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPD
Subjt:  RLRGRERRFTAGAMAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPD

Query:  RVGRQELEIVMGNEHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        RVGRQELEIVMGNEHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLH+KIKPI
Subjt:  RVGRQELEIVMGNEHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

XP_004133764.1 protein mago nashi homolog [Cucumis sativus]6.6e-8198.68Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        MAAED+ENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLH+KIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

XP_008437772.1 PREDICTED: protein mago nashi homolog [Cucumis melo]1.5e-8098.03Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        M+AED+ENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLH+KIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

XP_022933981.1 protein mago nashi homolog [Cucurbita moschata]1.0e-81100Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L898 Uncharacterized protein3.2e-8198.68Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        MAAED+ENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLH+KIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

A0A1S3AVD6 protein mago nashi homolog7.1e-8198.03Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        M+AED+ENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLH+KIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

A0A5A7TYX4 Protein mago nashi-like protein7.1e-8198.03Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        M+AED+ENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLH+KIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

A0A6J1F0J2 protein mago nashi homolog4.9e-82100Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

A0A6J1HTH0 protein mago nashi homolog4.9e-82100Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0A0P0XB70 Protein mago nashi homolog 16.9e-7390.97Show/hide
Query:  GEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGNEHISFTTS
        GEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYK DTMIRKEV+++P+VLRE  RII +SEIMKEDD+NWPEPDRVGRQELEIVMGNEHISFTTS
Subjt:  GEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGNEHISFTTS

Query:  KIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        KIGSLVDVQ+SKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLI+LH+KIKPI
Subjt:  KIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

O23676 Protein mago nashi homolog9.0e-7387.5Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        MAAE  E  EFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFR DGKLRYANNSNYKNDT+IRKEV+LTPAVL+EC+RI+S+SEI+KEDDNNWPEPDRVG+QELEIV+GN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISF TSKIGSLVD QSS DPEGLRIFYYLVQDLKC VFSLISLH+KIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

O65806 Protein mago nashi homolog3.7e-7491.78Show/hide
Query:  ENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGNEHISFT
        E+ EFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEV+LTPAVL+ECRRII++SEIMKEDD NWP PDRVGRQELEIVMGNE+ISFT
Subjt:  ENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGNEHISFT

Query:  TSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        TSKIGSLVDVQ SKDPEGLRIFYYLV DLKCFVFSLISLH+KIKPI
Subjt:  TSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

P49030 Protein mago nashi homolog 23.0e-7687.82Show/hide
Query:  TAGAMAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEI
        T GA   +    GEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEV+++P+VLRE RRII +SEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEI
Subjt:  TAGAMAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEI

Query:  VMGNEHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        VMGNEHISFTTSKIGSLVDVQ+SKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLI+LH+KIKPI
Subjt:  VMGNEHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

Q566Y8 Protein mago nashi homolog8.2e-6680.95Show/hide
Query:  MENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGNEHISF
        M   +FYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKND MIRKE Y+  +V+ E +RII DSEI KEDD  WP PDRVGRQELEIV+G+EHISF
Subjt:  MENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGNEHISF

Query:  TTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        TTSKIGSL+DV  SKDPEGLR+FYYLVQDLKC VFSLI LH+KIKPI
Subjt:  TTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02140.1 mago nashi family protein6.4e-7487.5Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        MAAE  E  EFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFR DGKLRYANNSNYKNDT+IRKEV+LTPAVL+EC+RI+S+SEI+KEDDNNWPEPDRVG+QELEIV+GN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISF TSKIGSLVD QSS DPEGLRIFYYLVQDLKC VFSLISLH+KIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAAAATCCTCGCACGTGCTCCACGCACCTTCTTCCCCACGCCGTTACCTCCTCCGTTTCAGCAGCTCAGCGGCGCCATCGTCGTCGGCAATTCTCCTATATATAAG
GGATATATTCGAGTCGCTGAGGCTGCGCGGGAGAGAAAGAAGGTTTACTGCGGGTGCCATGGCGGCCGAGGATATGGAGAATGGTGAGTTTTACTTGAGATATTATGTAG
GGCACAAAGGAAAATTTGGGCACGAGTTCTTGGAGTTCGAATTCCGACCTGATGGCAAGCTTCGCTACGCTAACAACTCCAATTACAAGAACGATACGATGATTCGCAAG
GAAGTCTACCTCACTCCTGCTGTCCTCCGGGAATGCCGTCGAATCATCTCTGATAGCGAGATAATGAAGGAAGATGACAATAATTGGCCAGAACCTGATCGGGTTGGACG
ACAGGAGCTGGAGATTGTGATGGGAAACGAGCATATCTCCTTTACTACATCTAAGATTGGATCTCTTGTTGATGTGCAAAGCAGCAAGGATCCTGAAGGATTGCGGATAT
TCTATTATCTTGTTCAGGATCTGAAATGCTTTGTATTTTCTCTCATTTCACTCCACTACAAGATCAAGCCAATTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAAAAATCCTCGCACGTGCTCCACGCACCTTCTTCCCCACGCCGTTACCTCCTCCGTTTCAGCAGCTCAGCGGCGCCATCGTCGTCGGCAATTCTCCTATATATAAG
GGATATATTCGAGTCGCTGAGGCTGCGCGGGAGAGAAAGAAGGTTTACTGCGGGTGCCATGGCGGCCGAGGATATGGAGAATGGTGAGTTTTACTTGAGATATTATGTAG
GGCACAAAGGAAAATTTGGGCACGAGTTCTTGGAGTTCGAATTCCGACCTGATGGCAAGCTTCGCTACGCTAACAACTCCAATTACAAGAACGATACGATGATTCGCAAG
GAAGTCTACCTCACTCCTGCTGTCCTCCGGGAATGCCGTCGAATCATCTCTGATAGCGAGATAATGAAGGAAGATGACAATAATTGGCCAGAACCTGATCGGGTTGGACG
ACAGGAGCTGGAGATTGTGATGGGAAACGAGCATATCTCCTTTACTACATCTAAGATTGGATCTCTTGTTGATGTGCAAAGCAGCAAGGATCCTGAAGGATTGCGGATAT
TCTATTATCTTGTTCAGGATCTGAAATGCTTTGTATTTTCTCTCATTTCACTCCACTACAAGATCAAGCCAATTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQKSSHVLHAPSSPRRYLLRFSSSAAPSSSAILLYIRDIFESLRLRGRERRFTAGAMAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRK
EVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGNEHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI