; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg17999 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg17999
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description1,3-beta-glucan synthase
Genome locationCarg_Chr11:3952502..3957004
RNA-Seq ExpressionCarg17999
SyntenyCarg17999
Gene Ontology termsGO:0006075 - (1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process (biological process)
GO:0008360 - regulation of cell shape (biological process)
GO:0071555 - cell wall organization (biological process)
GO:0000148 - 1,3-beta-D-glucan synthase complex (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0003843 - 1,3-beta-D-glucan synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR023175 - Vta1/Callose synthase, N-terminal domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6588163.1 Callose synthase 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.1e-79100Show/hide
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KAG7022058.1 Callose synthase 9 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.1e-79100Show/hide
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XP_022929574.1 LOW QUALITY PROTEIN: callose synthase 9-like [Cucurbita moschata]6.0e-7999.35Show/hide
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XP_022966547.1 LOW QUALITY PROTEIN: callose synthase 9-like [Cucurbita maxima]7.9e-7999.35Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4DYC5 1,3-beta-glucan synthase2.8e-7492.9Show/hide
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A0A5A7TJV3 Callose synthase 92.8e-7492.9Show/hide
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A0A6J1DST9 1,3-beta-glucan synthase1.8e-7695.48Show/hide
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A0A6J1EP57 1,3-beta-glucan synthase2.9e-7999.35Show/hide
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A0A6J1HN98 1,3-beta-glucan synthase3.8e-7999.35Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9AUE0 Callose synthase 12.0e-0838.3Show/hide
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Q9LXT9 Callose synthase 38.9e-0938.3Show/hide
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Q9SFU6 Callose synthase 91.5e-5978.43Show/hide
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Q9SJM0 Callose synthase 106.3e-4762.66Show/hide
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Q9SL03 Callose synthase 22.0e-0838.3Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G05570.1 callose synthase 11.4e-0938.3Show/hide
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AT2G36850.1 glucan synthase-like 84.5e-4862.66Show/hide
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AT3G07160.1 glucan synthase-like 101.0e-6078.43Show/hide
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AT5G13000.1 glucan synthase-like 126.3e-1038.3Show/hide
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AT5G13000.2 glucan synthase-like 126.3e-1038.3Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACACAAGTTGAGGAGTTATGGGAACGCTTAGTTCGAGCTGCCTTAAGAAGAGATAGAATTGGCATTGATGCATATGGACGCCCTGAAAGTGGCATTGCTGGA
AATGTACCATCTTCACTTGCAAACAATAGGGATATTGATGAAATCTTGAGAGCTGCAGATGAAATCCAAGATGAAGATCCCAATGTTGCGAGAATATTATGTGAG
CATGCATATTCGCTTGCGCAAAACCTGGATCCGAATAGTGAAGGGAGAGGTGTTTTGCAATTCAAAACTGGTTTGATGTCTGTAATTAAGCAAAAGCTAGCCAAG
AGGGAGGGTGGAATAATAGATAGAAGGCAGGACGTTACTCGGTTACAAGAGTTCTACAGACTATACCGAGAGAAAAATAATGTAGATAAGCTTCGAGAAGATGAA
ATGAAATTGAGGGAATCTGGTGCTTTCAGTGGTAACCTTGGAGAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TAAGATTTTTCGTCTCCGCGTACGCGTCAATTAAAGACCTAAACCCCGTCACCGGTCATACCCGGTGATTTACTTTTTCCACTTCCCAGTTCCCACCGCACTGCG
TTCTATTCTTTCTCCTTTCCTTTTGCCTTTCTTCCCGTCTTTCCCGCTCCCATCTCTGAATCTACACAGCTTCAGCAACCCGAACAGCCCTTCCAAGCTCAATTC
CATTTCCGGGATTTTACTCCTCCTGGTCTTTCTATCTGTAGCGTTTTGCTCCATTTAATCAGAGAATGACACAAGTTGAGGAGTTATGGGAACGCTTAGTTCGAG
CTGCCTTAAGAAGAGATAGAATTGGCATTGATGCATATGGACGCCCTGAAAGTGGCATTGCTGGAAATGTACCATCTTCACTTGCAAACAATAGGGATATTGATG
AAATCTTGAGAGCTGCAGATGAAATCCAAGATGAAGATCCCAATGTTGCGAGAATATTATGTGAGCATGCATATTCGCTTGCGCAAAACCTGGATCCGAATAGTG
AAGGGAGAGGTGTTTTGCAATTCAAAACTGGTTTGATGTCTGTAATTAAGCAAAAGCTAGCCAAGAGGGAGGGTGGAATAATAGATAGAAGGCAGGACGTTACTC
GGTTACAAGAGTTCTACAGACTATACCGAGAGAAAAATAATGTAGATAAGCTTCGAGAAGATGAAATGAAATTGAGGGAATCTGGTGCTTTCAGTGGTAACCTTG
GAGAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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REGGIIDRRQDVTRLQEFYRLYREKNNVDKLREDEMKLRESGAFSGNLGE