; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg18058 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg18058
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionfasciclin-like arabinogalactan protein 7
Genome locationCarg_Chr11:11887215..11887988
RNA-Seq ExpressionCarg18058
SyntenyCarg18058
Gene Ontology termsGO:0009834 - plant-type secondary cell wall biogenesis (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR000782 - FAS1 domain
IPR036378 - FAS1 domain superfamily
IPR045003 - Fasciclin-like arabinogalactan protein, group A


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6589121.1 Fasciclin-like arabinogalactan protein 7, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.4e-135100Show/hide
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XP_022989455.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Cucurbita maxima]3.5e-13297.67Show/hide
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XP_023529774.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.9e-13499.22Show/hide
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A0A6J1C1K1 fasciclin-like arabinogalactan protein 72.7e-12290.66Show/hide
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A0A6J1EXB2 fasciclin-like arabinogalactan protein 72.1e-135100Show/hide
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A0A6J1GKL2 fasciclin-like arabinogalactan protein 74.3e-12089.49Show/hide
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A0A6J1I0D1 fasciclin-like arabinogalactan protein 74.3e-12089.49Show/hide
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A0A6J1JME9 fasciclin-like arabinogalactan protein 71.7e-13297.67Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8LEE9 Fasciclin-like arabinogalactan protein 121.6e-3140.95Show/hide
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Q8LEJ6 Fasciclin-like arabinogalactan protein 111.2e-2335.43Show/hide
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        NP+ T AG    G++ LN T     ++I +G  +  V++SV+S   +AVYQVD++LLP A+FG+ +    APAPAP+   + +  S S   DG  +  S 
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Q9SIL7 Fasciclin-like arabinogalactan protein 62.7e-2638.79Show/hide
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        +   L   NP+ T A    GG + LNFT    S  +++ +G   T++++++    P+AVY VD +LLPE +FGT   PT APAP    + +  ADSP+AD
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Q9SJ81 Fasciclin-like arabinogalactan protein 79.4e-8070.25Show/hide
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        PAPAPAP I  AP +DSPS ADS+G ++P S  K S    ++
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Q9ZWA8 Fasciclin-like arabinogalactan protein 98.1e-2335.04Show/hide
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        T+   LL+ +   A   TA P      PAP PA   +NLT +L   G F TF+  L  T+V      Q N++ EG+T+F P D+AF   K  +L+ L+ D
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            L+L+H  P YYS+ +   LS+ NP+ T A G+    Y LNFT  +  I++ +G+  T++S+S+    P+AVY VD +LLP  +FG       APAP
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                T DS S     K A S   K  S  + +  G  + +++ +   FLF
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G04780.1 FASCICLIN-like arabinoogalactan 76.7e-8170.25Show/hide
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        M+LS IF    AL++ S+S   AKTASP  P+L PTPAPAPAP+ VNLT+LL+VAGPFHTFL YL ST VIETFQNQANNTEEG+TIFVPKD AF AQK 
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        PAPAPAP I  AP +DSPS ADS+G ++P S  K S    ++
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AT2G04780.2 FASCICLIN-like arabinoogalactan 76.7e-8170.25Show/hide
Query:  MELSMIFTVCSALLLLSSSPADAKTASP--PLLSPTPAPAPAPDFVNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIETFQNQANNTEEGVTIFVPKDSAFSAQKK
        M+LS IF    AL++ S+S   AKTASP  P+L PTPAPAPAP+ VNLT+LL+VAGPFHTFL YL ST VIETFQNQANNTEEG+TIFVPKD AF AQK 
Subjt:  MELSMIFTVCSALLLLSSSPADAKTASP--PLLSPTPAPAPAPDFVNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIETFQNQANNTEEGVTIFVPKDSAFSAQKK

Query:  PSLSNLTEDQLKSLMLFHGLPHYYSLAEFRNLSLQNPISTLAGGQYSLNFTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDRILLPEAIFGTDIPPT
        P LSNLT+DQLK L+LFH LPHYYSL+EF+NLS   P+ST AGGQYSL FTDVSGT+ I S WT TKVSSSV S+DPVAVYQV+R+LLPEAIFGTD+PP 
Subjt:  PSLSNLTEDQLKSLMLFHGLPHYYSLAEFRNLSLQNPISTLAGGQYSLNFTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDRILLPEAIFGTDIPPT

Query:  PAPAPAPDIAIAPTADSPS-ADSDGKAAPSSQPKPSSSHRII
        PAPAPAP I  AP +DSPS ADS+G ++P S  K S    ++
Subjt:  PAPAPAPDIAIAPTADSPS-ADSDGKAAPSSQPKPSSSHRII

AT2G20520.1 FASCICLIN-like arabinogalactan 61.9e-2738.79Show/hide
Query:  PPLLSPTPAPAPAPDF--VNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIETFQNQANNTEEGVTIFVPKDSAFSAQKKPSLSNLTEDQLKSLMLFHGLPHYYSLA
        P + S   APAP  +   +NLT +L     F T +  L +T+V      Q N++++G+TIF P D+AF+  K  +L++LT  Q   LML+H +P YYSL+
Subjt:  PPLLSPTPAPAPAPDF--VNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIETFQNQANNTEEGVTIFVPKDSAFSAQKKPSLSNLTEDQLKSLMLFHGLPHYYSLA

Query:  EFRNLSLQNPISTLA----GGQYSLNFTD--VSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDRILLPEAIFGTDIPPTPAPAPAPDIAIAPTADSPSAD
        +   L   NP+ T A    GG + LNFT    S  +++ +G   T++++++    P+AVY VD +LLPE +FGT   PT APAP    + +  ADSP+AD
Subjt:  EFRNLSLQNPISTLA----GGQYSLNFTD--VSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDRILLPEAIFGTDIPPTPAPAPAPDIAIAPTADSPSAD

Query:  SDGKAAPSSQPKPS
         + K+A SS  + S
Subjt:  SDGKAAPSSQPKPS

AT5G03170.1 FASCICLIN-like arabinogalactan-protein 118.9e-2535.43Show/hide
Query:  APAPAPDF-VNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIETFQNQAN-NTEEGVTIFVPKDSAFSAQKKPSLSNLTEDQLKSLMLFHGLPHYYSLAEFRNLSLQ
        APAP P    N+T +L  AG F  F+  L+ST+  +    Q N ++  G+T+F P D+AF++ K  +L++L++ Q   L+ FH LP   ++ +F+ +S  
Subjt:  APAPAPDF-VNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIETFQNQAN-NTEEGVTIFVPKDSAFSAQKKPSLSNLTEDQLKSLMLFHGLPHYYSLAEFRNLSLQ

Query:  NPISTLAG----GQYSLNFTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDRILLPEAIFGTDIPPTPAPAPAPDIAIAPTADSPSADSDGKAAPSSQ
        NP+ T AG    G++ LN T     ++I +G  +  V++SV+S   +AVYQVD++LLP A+FG+ +    APAPAP+   + +  S S   DG  +  S 
Subjt:  NPISTLAG----GQYSLNFTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDRILLPEAIFGTDIPPTPAPAPAPDIAIAPTADSPSADSDGKAAPSSQ

Query:  PKPSSSHRIINWGILIHVVLAIS
            +      +GI I  V AI+
Subjt:  PKPSSSHRIINWGILIHVVLAIS

AT5G60490.1 FASCICLIN-like arabinogalactan-protein 121.2e-3240.95Show/hide
Query:  MELSMIFTVCSALLLLSSSPADAKTASPPLLSPTPAPAPAPDF-VNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIETFQNQANNTEEGVTIFVPKDSAFSAQKKP
        ME S+I  + + LLLL+++P         L  P+PA APAP    N+T +L  AG F  F+  L+ST V      Q NN++ G+TIF P DS+F+  K  
Subjt:  MELSMIFTVCSALLLLSSSPADAKTASPPLLSPTPAPAPAPDF-VNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIETFQNQANNTEEGVTIFVPKDSAFSAQKKP

Query:  SLSNLTEDQLKSLMLFHGLPHYYSLAEFRNLSLQNPISTLAG----GQYSLNFTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDRILLPEAIFGTDI
        +L++LT++Q   L+ FH +P Y S + F+ +S  NP+ T AG    G + LN T    T++I SG TNT VS +V+S   +AVYQVD++LLP+ +F    
Subjt:  SLSNLTEDQLKSLMLFHGLPHYYSLAEFRNLSLQNPISTLAG----GQYSLNFTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDRILLPEAIFGTDI

Query:  PPTPAPAPAPDIAIAPTADSPSADSDGKAAPS
        PP PAPAP+   +     DS S+  D  A  S
Subjt:  PPTPAPAPAPDIAIAPTADSPSADSDGKAAPS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAATTGTCCATGATTTTCACTGTTTGTAGTGCATTGTTGCTTCTGAGCTCTTCACCTGCAGATGCCAAAACAGCCAGCCCCCCGTTGCTTAGCCCGACCCCAGCACC
GGCGCCAGCCCCGGATTTTGTTAACCTCACAGATCTGCTCACTGTAGCAGGTCCATTTCATACCTTCCTCAGCTACCTCCAGTCTACCAAAGTTATTGAGACCTTCCAAA
ACCAAGCCAATAACACAGAAGAAGGAGTGACCATCTTTGTCCCGAAAGACAGTGCGTTCTCGGCACAAAAGAAACCGTCTCTCTCGAACCTCACTGAGGATCAGCTCAAA
TCTCTTATGCTATTTCATGGCTTGCCACATTACTATTCTCTTGCTGAATTCAGGAACCTCAGCCTGCAGAACCCAATCTCGACGTTAGCGGGTGGACAATACAGTTTGAA
CTTCACAGACGTTTCAGGGACCATCCACATTGGCTCAGGTTGGACCAACACAAAAGTGAGTAGCAGTGTGCATTCAAGTGATCCTGTTGCAGTTTACCAAGTTGACAGAA
TTCTGCTGCCTGAGGCGATCTTCGGAACCGATATCCCCCCAACCCCAGCCCCCGCACCAGCTCCCGATATCGCTATCGCTCCCACGGCAGATTCTCCTTCAGCTGACAGT
GATGGAAAGGCTGCTCCATCTTCACAACCAAAGCCATCATCTTCCCATAGGATCATCAACTGGGGGATTTTGATTCACGTTGTTTTGGCAATTTCATGTGGATTTTTGTT
TTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GGCGCCAGCCCCGGATTTTGTTAACCTCACAGATCTGCTCACTGTAGCAGGTCCATTTCATACCTTCCTCAGCTACCTCCAGTCTACCAAAGTTATTGAGACCTTCCAAA
ACCAAGCCAATAACACAGAAGAAGGAGTGACCATCTTTGTCCCGAAAGACAGTGCGTTCTCGGCACAAAAGAAACCGTCTCTCTCGAACCTCACTGAGGATCAGCTCAAA
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CTTCACAGACGTTTCAGGGACCATCCACATTGGCTCAGGTTGGACCAACACAAAAGTGAGTAGCAGTGTGCATTCAAGTGATCCTGTTGCAGTTTACCAAGTTGACAGAA
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GATGGAAAGGCTGCTCCATCTTCACAACCAAAGCCATCATCTTCCCATAGGATCATCAACTGGGGGATTTTGATTCACGTTGTTTTGGCAATTTCATGTGGATTTTTGTT
TTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SLMLFHGLPHYYSLAEFRNLSLQNPISTLAGGQYSLNFTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDRILLPEAIFGTDIPPTPAPAPAPDIAIAPTADSPSADS
DGKAAPSSQPKPSSSHRIINWGILIHVVLAISCGFLF