; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg18378 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg18378
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptiontranscription factor MYB44-like
Genome locationCarg_Chr04:747878..748720
RNA-Seq ExpressionCarg18378
SyntenyCarg18378
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
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InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017930 - Myb domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6599987.1 Transcription factor MYB73, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.5e-15498.94Show/hide
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XP_023526760.1 transcription factor MYB73-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.5e-14996.83Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KQJ2 Uncharacterized protein4.1e-11678.35Show/hide
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A0A1S4E069 transcription factor MYB44-like5.1e-11477.74Show/hide
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A0A5D3E3D2 Transcription factor MYB44-like5.1e-11477.74Show/hide
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A0A6J1FN37 transcription factor MYB44-like8.2e-157100Show/hide
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A0A6J1K8B1 transcription factor MYB44-like1.8e-15197.5Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04192 Transcription factor MYB251.7e-3766.02Show/hide
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        RR+
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O23160 Transcription factor MYB731.5e-4342.21Show/hide
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        +  N  RIKG WSP+ED  L +LV++HGPRNWSLIS  IPGRSGKSCRLRWCNQLSP V+HR F+  ED  I++AHA  GNKW+TI+RLL GRTDNAIKN
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        HWNSTL+R+     +  DF  +                       ST     P    S S SD  + S G      F   V         GE P T L L
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Query:  SLP--GEVVVPAACVKVKEEVTVD----SEENDGRRHVTVAATAEEKGNRKREMDESCMATIMQRMIAREVRNYIDSLRAH--GGLSIG
        SLP   E V     V++ +   +D    +E    R+   V    EE            M T++Q MI  EVR+Y+  L+    GG S G
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Q42575 Transcription factor MYB13.7e-3766.99Show/hide
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        RRR
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Q9FDW1 Transcription factor MYB447.2e-4138.1Show/hide
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        RIKG WSP+ED  L +LV ++GPRNW++IS  IPGRSGKSCRLRWCNQLSP V+HRPF+  ED  I +AHA  GNKW+TIARLL GRTDNA+KNHWNSTL
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Query:  RRR------RDADFSSDS---------------TAFMKRPSCEVSRSASDDDD----DSEGSFK--RRCFGMAVERNGGGEGEGEGPETSLRLSLPGEVV
        +R+      R  D S D                T     P        SD        S   FK   R   + +          + P TSL LSLPG   
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Query:  VPAACVKVKEEVTVDSEENDGRRHVTVAATAEEKGNRKREMDESCMA---------TIMQRMIAREVRNYIDSLRAHGGLSIGPNIGPGLDSGV
        V     +  E   +++  +    H    +     G  +  ++E   +          ++Q MI  EVR+Y+  ++ + G   G  +G  +D+G+
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Q9SN12 Transcription factor MYB772.9e-4239.48Show/hide
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        R+KG WS +ED  L ++VE++GPRNWS IS  IPGRSGKSCRLRWCNQLSP V+HRPF+P ED  IV A A  GNKW+TIARLL GRTDNA+KNHWNSTL
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Query:  RR-----------------------RRDADFSS-----DSTAFMKRPS---CEVSRSASDDDDDS-----------EGSFKRRCFGMAVERNGGGEGEGE
        +R                       RR   F S     D+  +M   S    +VS S++     S            G F      + VE +       E
Subjt:  RR-----------------------RRDADFSS-----DSTAFMKRPS---CEVSRSASDDDDDS-----------EGSFKRRCFGMAVERNGGGEGEGE

Query:  GPETSLRLSLPGEVVVPAACVKVKEEVTVDSEENDG------RRHVTVAATAEEKGNRKREMDESCMATIMQRMIAREVRNYIDSL-RAHGGLSIGPNIG
         P TSL LSLPG             E T  S  N+       R    +    EE+G  +R        T++Q MI  EVR+Y+  + +  GG  +G    
Subjt:  GPETSLRLSLPGEVVVPAACVKVKEEVTVDSEENDG------RRHVTVAATAEEKGNRKREMDESCMATIMQRMIAREVRNYIDSL-RAHGGLSIGPNIG

Query:  PGLDSGVQD
         G + G +D
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G23290.1 myb domain protein 702.9e-4541.92Show/hide
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        RIKG WSP+ED  L  LV++HGPRNWSLIS  IPGRSGKSCRLRWCNQLSP V+HR FT  ED  I+ AHA  GNKW+TIARLL GRTDNAIKNHWNSTL
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Query:  RRR-----------RDADFS---------SDSTAFMKRPS--------CEVSRSASDDDDDSEGS------------FK--RRCFGMAVERNGGGEGEGE
        +R+           +  DF          +D     +R S          +S + SD  + S+ S            FK   R  G+ +E +   E E +
Subjt:  RRR-----------RDADFS---------SDSTAFMKRPS--------CEVSRSASDDDDDSEGS------------FK--RRCFGMAVERNGGGEGEGE

Query:  GPETSLRLSLP--GEVVVPAACVKVKEEVTVDSEENDGRRHVTVAATAEEKGNRKREMDESCMATIMQRMIAREVRNYIDSLRAHGGLSIG
         P T LRLSLP   E   P     VK E     EE +  R ++                     T++Q MI  EVR+Y+  L+   G   G
Subjt:  GPETSLRLSLP--GEVVVPAACVKVKEEVTVDSEENDGRRHVTVAATAEEKGNRKREMDESCMATIMQRMIAREVRNYIDSLRAHGGLSIG

AT3G50060.1 myb domain protein 772.1e-4339.48Show/hide
Query:  RIKGSWSPQEDATLIKLVEEHGPRNWSLISTGIPGRSGKSCRLRWCNQLSPAVQHRPFTPAEDSLIVQAHAVHGNKWSTIARLLPGRTDNAIKNHWNSTL
        R+KG WS +ED  L ++VE++GPRNWS IS  IPGRSGKSCRLRWCNQLSP V+HRPF+P ED  IV A A  GNKW+TIARLL GRTDNA+KNHWNSTL
Subjt:  RIKGSWSPQEDATLIKLVEEHGPRNWSLISTGIPGRSGKSCRLRWCNQLSPAVQHRPFTPAEDSLIVQAHAVHGNKWSTIARLLPGRTDNAIKNHWNSTL

Query:  RR-----------------------RRDADFSS-----DSTAFMKRPS---CEVSRSASDDDDDS-----------EGSFKRRCFGMAVERNGGGEGEGE
        +R                       RR   F S     D+  +M   S    +VS S++     S            G F      + VE +       E
Subjt:  RR-----------------------RRDADFSS-----DSTAFMKRPS---CEVSRSASDDDDDS-----------EGSFKRRCFGMAVERNGGGEGEGE

Query:  GPETSLRLSLPGEVVVPAACVKVKEEVTVDSEENDG------RRHVTVAATAEEKGNRKREMDESCMATIMQRMIAREVRNYIDSL-RAHGGLSIGPNIG
         P TSL LSLPG             E T  S  N+       R    +    EE+G  +R        T++Q MI  EVR+Y+  + +  GG  +G    
Subjt:  GPETSLRLSLPGEVVVPAACVKVKEEVTVDSEENDG------RRHVTVAATAEEKGNRKREMDESCMATIMQRMIAREVRNYIDSL-RAHGGLSIGPNIG

Query:  PGLDSGVQD
         G + G +D
Subjt:  PGLDSGVQD

AT3G55730.1 myb domain protein 1093.0e-4270.87Show/hide
Query:  RIKGSWSPQEDATLIKLVEEHGPRNWSLISTGIPGRSGKSCRLRWCNQLSPAVQHRPFTPAEDSLIVQAHAVHGNKWSTIARLLPGRTDNAIKNHWNSTL
        ++KG WS +EDA L KLV + GPRNWSLI+ GIPGRSGKSCRLRWCNQL P ++ +PF+  ED +I+ AHAVHGNKW+ IA+LL GRTDNAIKNHWNSTL
Subjt:  RIKGSWSPQEDATLIKLVEEHGPRNWSLISTGIPGRSGKSCRLRWCNQLSPAVQHRPFTPAEDSLIVQAHAVHGNKWSTIARLLPGRTDNAIKNHWNSTL

Query:  RRR
        RR+
Subjt:  RRR

AT4G37260.1 myb domain protein 731.1e-4442.21Show/hide
Query:  SNSNSVRIKGSWSPQEDATLIKLVEEHGPRNWSLISTGIPGRSGKSCRLRWCNQLSPAVQHRPFTPAEDSLIVQAHAVHGNKWSTIARLLPGRTDNAIKN
        +  N  RIKG WSP+ED  L +LV++HGPRNWSLIS  IPGRSGKSCRLRWCNQLSP V+HR F+  ED  I++AHA  GNKW+TI+RLL GRTDNAIKN
Subjt:  SNSNSVRIKGSWSPQEDATLIKLVEEHGPRNWSLISTGIPGRSGKSCRLRWCNQLSPAVQHRPFTPAEDSLIVQAHAVHGNKWSTIARLLPGRTDNAIKN

Query:  HWNSTLRRR-----RDADFSSD-----------------------STAFMKRPSCEVSRSASDDDDDSEGSFKRRCFGMAVERNGGGEGEGEGPETSLRL
        HWNSTL+R+     +  DF  +                       ST     P    S S SD  + S G      F   V         GE P T L L
Subjt:  HWNSTLRRR-----RDADFSSD-----------------------STAFMKRPSCEVSRSASDDDDDSEGSFKRRCFGMAVERNGGGEGEGEGPETSLRL

Query:  SLP--GEVVVPAACVKVKEEVTVD----SEENDGRRHVTVAATAEEKGNRKREMDESCMATIMQRMIAREVRNYIDSLRAH--GGLSIG
        SLP   E V     V++ +   +D    +E    R+   V    EE            M T++Q MI  EVR+Y+  L+    GG S G
Subjt:  SLP--GEVVVPAACVKVKEEVTVD----SEENDGRRHVTVAATAEEKGNRKREMDESCMATIMQRMIAREVRNYIDSLRAH--GGLSIG

AT5G67300.1 myb domain protein r15.1e-4238.1Show/hide
Query:  RIKGSWSPQEDATLIKLVEEHGPRNWSLISTGIPGRSGKSCRLRWCNQLSPAVQHRPFTPAEDSLIVQAHAVHGNKWSTIARLLPGRTDNAIKNHWNSTL
        RIKG WSP+ED  L +LV ++GPRNW++IS  IPGRSGKSCRLRWCNQLSP V+HRPF+  ED  I +AHA  GNKW+TIARLL GRTDNA+KNHWNSTL
Subjt:  RIKGSWSPQEDATLIKLVEEHGPRNWSLISTGIPGRSGKSCRLRWCNQLSPAVQHRPFTPAEDSLIVQAHAVHGNKWSTIARLLPGRTDNAIKNHWNSTL

Query:  RRR------RDADFSSDS---------------TAFMKRPSCEVSRSASDDDD----DSEGSFK--RRCFGMAVERNGGGEGEGEGPETSLRLSLPGEVV
        +R+      R  D S D                T     P        SD        S   FK   R   + +          + P TSL LSLPG   
Subjt:  RRR------RDADFSSDS---------------TAFMKRPSCEVSRSASDDDD----DSEGSFK--RRCFGMAVERNGGGEGEGEGPETSLRLSLPGEVV

Query:  VPAACVKVKEEVTVDSEENDGRRHVTVAATAEEKGNRKREMDESCMA---------TIMQRMIAREVRNYIDSLRAHGGLSIGPNIGPGLDSGV
        V     +  E   +++  +    H    +     G  +  ++E   +          ++Q MI  EVR+Y+  ++ + G   G  +G  +D+G+
Subjt:  VPAACVKVKEEVTVDSEENDGRRHVTVAATAEEKGNRKREMDESCMA---------TIMQRMIAREVRNYIDSLRAHGGLSIGPNIGPGLDSGV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTTCTAATCGGAATTCCCCTCGCAAATCGAACCAGCAACAGTAACAGTGTTCGAATTAAAGGATCGTGGAGTCCTCAAGAGGACGCTACCTTAATCAAATTGGTGGA
GGAACACGGCCCCAGAAATTGGTCTTTGATCAGTACTGGAATTCCTGGTCGCTCTGGCAAATCCTGCCGTTTGCGCTGGTGTAATCAGCTCAGTCCGGCGGTTCAGCACC
GTCCGTTCACGCCGGCGGAGGACTCTCTGATTGTTCAGGCGCACGCCGTCCACGGTAACAAGTGGTCCACGATTGCTCGACTCTTGCCTGGTCGGACCGACAATGCGATT
AAGAATCACTGGAACTCGACGCTCAGGCGCCGCCGCGATGCCGATTTTTCTTCCGATTCCACGGCGTTTATGAAGCGGCCGAGTTGTGAAGTTTCGAGATCGGCGTCGGA
TGATGATGATGATTCGGAAGGATCGTTCAAACGGAGGTGCTTTGGAATGGCTGTGGAGCGGAACGGCGGCGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGACCGGAGACGTCGCTGAGGC
TGTCATTGCCGGGGGAGGTGGTGGTGCCGGCGGCGTGTGTCAAGGTGAAAGAGGAGGTGACAGTGGATAGCGAGGAGAACGATGGACGGCGTCATGTGACGGTGGCGGCG
ACGGCGGAGGAGAAAGGGAACCGGAAAAGGGAAATGGACGAGAGTTGTATGGCAACGATAATGCAGAGGATGATTGCTCGGGAGGTCCGAAATTACATAGACAGTTTACG
GGCCCATGGTGGGCTTTCAATTGGGCCTAATATTGGGCCTGGGCTGGATTCAGGAGTCCAAGATACTGAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTTCTAATCGGAATTCCCCTCGCAAATCGAACCAGCAACAGTAACAGTGTTCGAATTAAAGGATCGTGGAGTCCTCAAGAGGACGCTACCTTAATCAAATTGGTGGA
GGAACACGGCCCCAGAAATTGGTCTTTGATCAGTACTGGAATTCCTGGTCGCTCTGGCAAATCCTGCCGTTTGCGCTGGTGTAATCAGCTCAGTCCGGCGGTTCAGCACC
GTCCGTTCACGCCGGCGGAGGACTCTCTGATTGTTCAGGCGCACGCCGTCCACGGTAACAAGTGGTCCACGATTGCTCGACTCTTGCCTGGTCGGACCGACAATGCGATT
AAGAATCACTGGAACTCGACGCTCAGGCGCCGCCGCGATGCCGATTTTTCTTCCGATTCCACGGCGTTTATGAAGCGGCCGAGTTGTGAAGTTTCGAGATCGGCGTCGGA
TGATGATGATGATTCGGAAGGATCGTTCAAACGGAGGTGCTTTGGAATGGCTGTGGAGCGGAACGGCGGCGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGACCGGAGACGTCGCTGAGGC
TGTCATTGCCGGGGGAGGTGGTGGTGCCGGCGGCGTGTGTCAAGGTGAAAGAGGAGGTGACAGTGGATAGCGAGGAGAACGATGGACGGCGTCATGTGACGGTGGCGGCG
ACGGCGGAGGAGAAAGGGAACCGGAAAAGGGAAATGGACGAGAGTTGTATGGCAACGATAATGCAGAGGATGATTGCTCGGGAGGTCCGAAATTACATAGACAGTTTACG
GGCCCATGGTGGGCTTTCAATTGGGCCTAATATTGGGCCTGGGCTGGATTCAGGAGTCCAAGATACTGAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVLIGIPLANRTSNSNSVRIKGSWSPQEDATLIKLVEEHGPRNWSLISTGIPGRSGKSCRLRWCNQLSPAVQHRPFTPAEDSLIVQAHAVHGNKWSTIARLLPGRTDNAI
KNHWNSTLRRRRDADFSSDSTAFMKRPSCEVSRSASDDDDDSEGSFKRRCFGMAVERNGGGEGEGEGPETSLRLSLPGEVVVPAACVKVKEEVTVDSEENDGRRHVTVAA
TAEEKGNRKREMDESCMATIMQRMIAREVRNYIDSLRAHGGLSIGPNIGPGLDSGVQDTE