; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg18464 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg18464
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionmultiprotein bridging factor 1B
Genome locationCarg_Chr20:1008834..1010364
RNA-Seq ExpressionCarg18464
SyntenyCarg18464
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001387 - Cro/C1-type helix-turn-helix domain
IPR010982 - Lambda repressor-like, DNA-binding domain superfamily
IPR013729 - Multiprotein bridging factor 1, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004149278.1 multiprotein-bridging factor 1b [Cucumis sativus]1.6e-6295.77Show/hide
Query:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPL+QDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIET+KKS AGSNKSASSST+LNTRKLDEETENL+HDRVPTELKKAIM ARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

XP_008448251.1 PREDICTED: multiprotein-bridging factor 1b [Cucumis melo]7.3e-6396.48Show/hide
Query:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPL+QDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIET+KKS AGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENL+HDRVPTELKKAIM ARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

XP_022149711.1 multiprotein-bridging factor 1b-like [Momordica charantia]1.6e-6295.07Show/hide
Query:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPL+QDWEPVV+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIET+KKS AGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENL+HDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQ+YE+GKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

XP_022943574.1 multiprotein-bridging factor 1b [Cucurbita moschata]4.5e-65100Show/hide
Query:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

XP_023533868.1 multiprotein-bridging factor 1b-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-6296.48Show/hide
Query:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGI PL+QDWEPVV+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIET+KKS AGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KGV6 HTH cro/C1-type domain-containing protein7.8e-6395.77Show/hide
Query:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPL+QDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIET+KKS AGSNKSASSST+LNTRKLDEETENL+HDRVPTELKKAIM ARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

A0A1S3BIN6 multiprotein-bridging factor 1b3.5e-6396.48Show/hide
Query:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPL+QDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIET+KKS AGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENL+HDRVPTELKKAIM ARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

A0A5A7V8Z5 Multiprotein-bridging factor 1b3.5e-6396.48Show/hide
Query:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPL+QDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIET+KKS AGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENL+HDRVPTELKKAIM ARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

A0A6J1FUR1 multiprotein-bridging factor 1b2.2e-65100Show/hide
Query:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

A0A6J1JEZ7 multiprotein-bridging factor 1b2.2e-65100Show/hide
Query:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5ZMC0 Endothelial differentiation-related factor 1 homolog2.1e-2857.14Show/hide
Query:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLAQLINEK
        DW+ V V+RKK P+AA  K ++AV AA+R G ++ET KK  AG NK      + NT KLD ETE L HDRVP E+ K I Q R  K +TQ  LA  INEK
Subjt:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLAQLINEK

Query:  PQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK
        PQVI +YESG+AIPN Q++ K+ERA+G KLRGK
Subjt:  PQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK

Q6GPQ6 Endothelial differentiation-related factor 1 homolog2.1e-2856.39Show/hide
Query:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLAQLINEK
        DW+ V V+RKK P AA  K ++A+ AA+R G E+ET KK +AG NK    + + NT KLD ETE L HDRVP E+ K I Q R  K +TQ  LA  INEK
Subjt:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLAQLINEK

Query:  PQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK
        PQVI +YE GKAIPN Q++ K+ER +G KLRGK
Subjt:  PQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK

Q9LV58 Multiprotein-bridging factor 1c2.9e-3053.24Show/hide
Query:  GPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSST--SLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLA
        G +TQDWEPVV+ K    +   +D KAVNAA R G  ++TVKK  AGSNK   S+    +NT+KL+EETE    DRV  E++  I +AR EKK++Q+ LA
Subjt:  GPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSST--SLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLA

Query:  QLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK
        + INE+ QV+QEYE+GKA+PNQ ++ K+E+ LG KLRGK
Subjt:  QLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK

Q9LXT3 Multiprotein-bridging factor 1b7.8e-6086.62Show/hide
Query:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGP+TQDWEPVVIRK+APNAAAK+DEK VNAARR+GA+IETV+K  AGSNK+ASS TSLNT+KLD++TENL+HDRVPTELKKAIMQAR EKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LA LINEKPQVIQEYESGKAIPNQQI++KLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

Q9SJI8 Multiprotein-bridging factor 1a1.9e-5884.51Show/hide
Query:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGP+TQDWEPVVIRKK  NAAAK+DEK VNAARR+GA+IETV+K  AG+NK+ASS TSLNT+ LD++TENLTH+RVPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQ+INEKPQVIQEYESGKAIPNQQI++KLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42680.1 multiprotein bridging factor 1A1.4e-5984.51Show/hide
Query:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGP+TQDWEPVVIRKK  NAAAK+DEK VNAARR+GA+IETV+K  AG+NK+ASS TSLNT+ LD++TENLTH+RVPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQ+INEKPQVIQEYESGKAIPNQQI++KLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

AT3G24500.1 multiprotein bridging factor 1C2.1e-3153.24Show/hide
Query:  GPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSST--SLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLA
        G +TQDWEPVV+ K    +   +D KAVNAA R G  ++TVKK  AGSNK   S+    +NT+KL+EETE    DRV  E++  I +AR EKK++Q+ LA
Subjt:  GPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSST--SLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLA

Query:  QLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK
        + INE+ QV+QEYE+GKA+PNQ ++ K+E+ LG KLRGK
Subjt:  QLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK

AT3G24500.2 multiprotein bridging factor 1C1.1e-1147.19Show/hide
Query:  GPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSST--SLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQAR
        G +TQDWEPVV+ K    +   +D KAVNAA R G  ++TVKK  AGSNK   S+    +NT+KL+EETE    DRV  E++  + + R
Subjt:  GPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSST--SLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQAR

AT3G58680.1 multiprotein bridging factor 1B5.5e-6186.62Show/hide
Query:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGP+TQDWEPVVIRK+APNAAAK+DEK VNAARR+GA+IETV+K  AGSNK+ASS TSLNT+KLD++TENL+HDRVPTELKKAIMQAR EKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LA LINEKPQVIQEYESGKAIPNQQI++KLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGGAATCGGACCGCTTACACAGGATTGGGAGCCGGTGGTCATCAGGAAGAAGGCACCCAACGCGGCCGCGAAGAAGGATGAGAAAGCTGTCAATGCCGCACGGCG
AGCCGGGGCGGAGATTGAGACTGTAAAGAAATCTACTGCTGGCTCCAACAAATCTGCTTCGAGCAGTACTTCTTTGAACACTAGGAAGCTTGACGAAGAGACTGAGAACC
TTACACATGATCGTGTACCAACTGAGCTGAAGAAAGCAATTATGCAAGCACGAACAGAGAAGAAGCTTACTCAGTCTCAGCTTGCTCAACTTATTAATGAGAAGCCTCAA
GTTATCCAGGAATACGAATCTGGTAAAGCTATTCCAAATCAACAAATCATTACCAAACTTGAGAGAGCTCTTGGGGCAAAACTGCGTGGGAAGAAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGATTTTTTTATGTACCCCGACTAGAAACCCTAATTCTGATTCTGCGTATTACCGAGCGAGGAACCTCTTCGAAGGGAGAACACAAGAAAGTTGAGATGGCTGGAATCGG
ACCGCTTACACAGGATTGGGAGCCGGTGGTCATCAGGAAGAAGGCACCCAACGCGGCCGCGAAGAAGGATGAGAAAGCTGTCAATGCCGCACGGCGAGCCGGGGCGGAGA
TTGAGACTGTAAAGAAATCTACTGCTGGCTCCAACAAATCTGCTTCGAGCAGTACTTCTTTGAACACTAGGAAGCTTGACGAAGAGACTGAGAACCTTACACATGATCGT
GTACCAACTGAGCTGAAGAAAGCAATTATGCAAGCACGAACAGAGAAGAAGCTTACTCAGTCTCAGCTTGCTCAACTTATTAATGAGAAGCCTCAAGTTATCCAGGAATA
CGAATCTGGTAAAGCTATTCCAAATCAACAAATCATTACCAAACTTGAGAGAGCTCTTGGGGCAAAACTGCGTGGGAAGAAATAAAGAGATGTGGAAAGTTAAGTATGAG
TTCTGCACAAGCTTTTGTTTGAACCATGCACAAAAGTTTATTTCCTACCGTGGTTTCAATGTGTAATTATATGCGACCATCCTTGTGTGCTTTTATAACCACTGTTGCAA
TGTCTTTGTAAGTTCTTACCTGGAAATAAATGAATATCATGACTGTTATGTTGCGTTAGTTTCCAGATGTTTTGGCTGTACTTTTCACATCAGAATTAAATGGCTGCACC
CATGACCATTAATAAGTTAGAACTTTGTATTGAGAGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGIGPLTQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETVKKSTAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLTHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLAQLINEKPQ
VIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK