| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6575671.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 1.1e-133 | 100 | Show/hide |
Query: MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
Subjt: MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_022954328.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita moschata] | 1.6e-132 | 99.22 | Show/hide |
Query: MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQ LSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAE AVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
Subjt: MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_022954329.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X2 [Cucurbita moschata] | 1.6e-132 | 99.22 | Show/hide |
Query: MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQ LSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAE AVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
Subjt: MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_022991923.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like [Cucurbita maxima] | 3.2e-133 | 99.61 | Show/hide |
Query: MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAE AVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
Subjt: MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_023548333.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 5.1e-131 | 98.44 | Show/hide |
Query: MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
MASISSILTPANLI SSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKR TRLFAVAE AVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
Subjt: MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVST+TLKNF
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7UYL6 30S ribosomal protein 2 | 3.1e-110 | 85.99 | Show/hide |
Query: MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
MASISSILTP NLIH+S KPTEI Q LS+QFLRPISFHP + LLR+SP A + TRLFAVAE A Q SSVA RKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
+EHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTV+DANA IEKLN+TEVGGR IKVNITEKP+VNTVD+S+LQA+ESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A6J1DHV7 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 8.2e-111 | 85.71 | Show/hide |
Query: MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
MAS+SSIL+P NLIHSS KPTE P LS QFLRPISFH R LLR+S LQTSA K RLFAVAE AV+ QDPSS AAR+LYIGNIPRNV NE+LTRIV
Subjt: MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNT--VDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLK
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLN+TEV GRTIKVNITEKPLV T VD+SLLQA+ESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLK
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNT--VDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLK
Query: NFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKG VLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVE AISSFNNALLEGQ IRVNKA
Subjt: NFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A6J1GQT6 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X1 | 7.6e-133 | 99.22 | Show/hide |
Query: MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQ LSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAE AVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
Subjt: MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A6J1GSN8 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X2 | 7.6e-133 | 99.22 | Show/hide |
Query: MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQ LSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAE AVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
Subjt: MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A6J1JXN0 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like | 1.5e-133 | 99.61 | Show/hide |
Query: MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAE AVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
Subjt: MASISSILTPANLIHSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P19684 33 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 2.8e-31 | 37.97 | Show/hide |
Query: DPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPL--VNTVDMSLLQ
+ SV +LY+GN+P ++ + +L+ I E G V E++YD+ + RSR FAFVTM +V++A I + ++VGGRT+KVN E P V + ++
Subjt: DPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPL--VNTVDMSLLQ
Query: ADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
+ F+DSP+K+YV N+S ++++ L++ F+++ +SAKV + +S G+GF+TFSS E + +A+ + N LEG+P+R+N A
Subjt: ADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| P82277 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 1.5e-72 | 59 | Show/hide |
Query: MASISSILTPANLI-HSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSS---VAARKLYIGNIPRNVGNEEL
MA+ISSIL L+ H S + S+Q L + L++ + T+ + R E + S SS AR+LY+GNIPRN+ N+EL
Subjt: MASISSILTPANLI-HSSIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSPGLQTSAGKRRTRLFAVAEVAVSVQDPSS---VAARKLYIGNIPRNVGNEEL
Query: TRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTET
IVEEHGA+E AEVMYDKYSGRSRRF FVTMKTV+DANAVIEKLNDTE+GGR IKVNITEKPL +D++ QA++SQF++SPYKVY+GN++ TV+ E
Subjt: TRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTET
Query: LKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
LK+FFSEKGKVL AKV R PGTSKS+G+GFV+FSSEEEVEAAI + NN++LEGQ IRVNKA
Subjt: LKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| Q39061 RNA-binding protein CP33, chloroplastic | 2.1e-31 | 37.43 | Show/hide |
Query: KLYIGNIPRNVGNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPL--VNTVDMSLLQADESQFID
+LY+GN+P + + EL++I E G V +++YDK + RSR F FVTM ++++A ++ N +++GGRT+KVN E P N V + ++ + ++D
Subjt: KLYIGNIPRNVGNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPL--VNTVDMSLLQADESQFID
Query: SPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
SP+KVY GN+ ++++ LK+ F ++ VL AKV T +S G+GF++F S E V++A+++ N +EG+ +R+N A
Subjt: SPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| Q8VYM4 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 6.5e-73 | 60.48 | Show/hide |
Query: SIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSP-----GLQTSAGKRRTRLFAVAEV--AVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIVEEHGAVEKA
SIKPT + ++ P+ H R + P G + + + R +AV E + DPSS AAR++YIGNIPR V NE+LT++VEEHGAVEK
Subjt: SIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSP-----GLQTSAGKRRTRLFAVAEV--AVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIVEEHGAVEKA
Query: EVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLS
+VMYDKYSGRSRRF F TMK+V+DANAV+EKLN V GR IKVNITEKP+ ++ D+S+LQ+++S F+DSPYKVYVGN++ TV+ E L+N FSEKGKV+S
Subjt: EVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLS
Query: AKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
AKVSRVPGTSKS+G+GFVTFSSEE+VEAAI + NN+LLEGQ IRVNKA
Subjt: AKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| Q9ZUU4 RNA-binding protein CP29B, chloroplastic | 5.4e-27 | 38 | Show/hide |
Query: QDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQA
++ S A KL++GN+P NV + +L ++ E G VE EV+YDK +GRSR F FVTM +V + A ++ N E+ GR ++VN P S +
Subjt: QDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQA
Query: DESQF--------------IDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
S F S +VYVGN+S V L++ FSE+GKV+ A+V + +S G+GFVT+ S +EV+ AI S + A L+G+ IRV++A
Subjt: DESQF--------------IDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G60000.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.0e-33 | 41.58 | Show/hide |
Query: AVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMS
A +V DP + KLY GN+P NV + L +I+++ E EV+Y++ +G+SR FAFVTM V+D N +I+ L+ TE GR +KVN +KP N
Subjt: AVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMS
Query: LLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
E + ++ +K++VGN+S TV++E+L F E G V+ A+V T +S GYGFV +SS+ E+E A+ S + LEG+ IRVN A
Subjt: LLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| AT2G37220.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.8e-28 | 38 | Show/hide |
Query: QDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQA
++ S A KL++GN+P NV + +L ++ E G VE EV+YDK +GRSR F FVTM +V + A ++ N E+ GR ++VN P S +
Subjt: QDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQA
Query: DESQF--------------IDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
S F S +VYVGN+S V L++ FSE+GKV+ A+V + +S G+GFVT+ S +EV+ AI S + A L+G+ IRV++A
Subjt: DESQF--------------IDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| AT3G52150.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 4.6e-74 | 60.48 | Show/hide |
Query: SIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSP-----GLQTSAGKRRTRLFAVAEV--AVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIVEEHGAVEKA
SIKPT + ++ P+ H R + P G + + + R +AV E + DPSS AAR++YIGNIPR V NE+LT++VEEHGAVEK
Subjt: SIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSP-----GLQTSAGKRRTRLFAVAEV--AVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIVEEHGAVEKA
Query: EVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLS
+VMYDKYSGRSRRF F TMK+V+DANAV+EKLN V GR IKVNITEKP+ ++ D+S+LQ+++S F+DSPYKVYVGN++ TV+ E L+N FSEKGKV+S
Subjt: EVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLS
Query: AKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
AKVSRVPGTSKS+G+GFVTFSSEE+VEAAI + NN+LLEGQ IRVNKA
Subjt: AKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| AT3G52150.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 4.6e-74 | 60.48 | Show/hide |
Query: SIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSP-----GLQTSAGKRRTRLFAVAEV--AVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIVEEHGAVEKA
SIKPT + ++ P+ H R + P G + + + R +AV E + DPSS AAR++YIGNIPR V NE+LT++VEEHGAVEK
Subjt: SIKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPRYTLLRVSP-----GLQTSAGKRRTRLFAVAEV--AVSVQDPSSVAARKLYIGNIPRNVGNEELTRIVEEHGAVEKA
Query: EVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLS
+VMYDKYSGRSRRF F TMK+V+DANAV+EKLN V GR IKVNITEKP+ ++ D+S+LQ+++S F+DSPYKVYVGN++ TV+ E L+N FSEKGKV+S
Subjt: EVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPLVNTVDMSLLQADESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLS
Query: AKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
AKVSRVPGTSKS+G+GFVTFSSEE+VEAAI + NN+LLEGQ IRVNKA
Subjt: AKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| AT3G52380.1 chloroplast RNA-binding protein 33 | 1.5e-32 | 37.43 | Show/hide |
Query: KLYIGNIPRNVGNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPL--VNTVDMSLLQADESQFID
+LY+GN+P + + EL++I E G V +++YDK + RSR F FVTM ++++A ++ N +++GGRT+KVN E P N V + ++ + ++D
Subjt: KLYIGNIPRNVGNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAVIEKLNDTEVGGRTIKVNITEKPL--VNTVDMSLLQADESQFID
Query: SPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
SP+KVY GN+ ++++ LK+ F ++ VL AKV T +S G+GF++F S E V++A+++ N +EG+ +R+N A
Subjt: SPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
