; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg18697 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg18697
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionSiroheme synthase
Genome locationCarg_Chr17:7401787..7404476
RNA-Seq ExpressionCarg18697
SyntenyCarg18697
Gene Ontology termsGO:0019354 - siroheme biosynthetic process (biological process)
GO:0032259 - methylation (biological process)
GO:0004851 - uroporphyrin-III C-methyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000878 - Tetrapyrrole methylase
IPR003043 - Uroporphiryn-III C-methyltransferase, conserved site
IPR006366 - Uroporphyrin-III C-methyltransferase
IPR014776 - Tetrapyrrole methylase, subdomain 2
IPR014777 - Tetrapyrrole methylase, subdomain 1
IPR035996 - Tetrapyrrole methylase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6575668.1 hypothetical protein SDJN03_26307, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.4e-197100Show/hide
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KAG7014220.1 cysG, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.4e-197100Show/hide
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XP_022991905.1 uncharacterized protein LOC111488402 [Cucurbita maxima]2.3e-19097.78Show/hide
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XP_023548332.1 uncharacterized protein LOC111807000 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.2e-19298.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KBI8 TP_methylase domain-containing protein2.8e-18192.24Show/hide
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A0A1S3CDT8 uroporphyrinogen-III C-methyltransferase8.6e-18392.8Show/hide
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A0A5D3CGZ0 Uroporphyrinogen-III C-methyltransferase6.6e-17590.3Show/hide
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A0A6J1GQM1 uncharacterized protein LOC1114566043.7e-19498.35Show/hide
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A0A6J1JU84 uncharacterized protein LOC1114884021.1e-19097.78Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0KP37 Siroheme synthase 22.1e-6152.82Show/hide
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B8GUD3 Siroheme synthase2.5e-6249.6Show/hide
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        EK   +G D    G G VFLVG GPGDP+LLT +A++++Q AD+++YD LVS  +++LV  DA ++Y GK    H+  QEEI++LL+  A+ G  V+RLK
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        G+ PD P A +E+GTT  QR++   L  + D +K  ++  PTLII+G+VV L
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Q0VQ05 Siroheme synthase1.2e-6150.21Show/hide
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        G V+LVG GPGDP+LLT +A++++Q AD++LYDRLV   ++DL   DA L+YVGK    H+  Q+ I+ELL+++A+ G  V RLKGGDP +FGRGGEE+D
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Query:  FLQQQGIQVKIVPGITAASGIAAELGIPLTHRGVATSVRFLTGHSRQGGTDPLFVAENAADPDSTLVVYMGLSTLPSLALKLMHHGLPPDTPAAAIERGT
         +  +GI  ++VPGITAASG A+  GIPLTHR  A SVRF+TGH + G  D     ++      T+V YMGL  L  +  +L+ HG   DTP A + RGT
Subjt:  FLQQQGIQVKIVPGITAASGIAAELGIPLTHRGVATSVRFLTGHSRQGGTDPLFVAENAADPDSTLVVYMGLSTLPSLALKLMHHGLPPDTPAAAIERGT

Query:  TPQQRIVFAELKDLADEIKAAELVSPTLIIIGKVVSLSP
        T  Q ++   L  L D+I+  E+ +PTLII+G VVSL P
Subjt:  TPQQRIVFAELKDLADEIKAAELVSPTLIIIGKVVSLSP

Q42606 S-adenosyl-L-methionine-dependent uroporphyrinogen III methyltransferase, chloroplastic2.1e-14678.67Show/hide
Query:  SNFKPICSFHCSSSSSSSSPFTEKHSVKRYQRDDWLYKNQADESSVASSCSIPSDSESIRQNDIALQLPELKKLLQVLREKRPSSGGDDGKCGPGNVFLV
        +N  PIC  H +++SSSSSPFTEKHSV+RYQRD WLYK          S S   D   +R+NDIA QLPELKKLL VL+EKR   G   G CGPG+V+LV
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Query:  GTGPGDPELLTLKAVKVIQSADLLLYDRLVSNDVLDLVGSDARLLYVGKTAGFHSRTQEEIHELLLNFAEAGATVVRLKGGDPLVFGRGGEEMDFLQQQG
        GTGPGDPELLTLKAV+VIQSADLLLYDRLVSNDVL+LV  DARLLYVGKTAG+HSRTQEEIHELLLNFAEAGATVVRLKGGDPLVFGRGGEEMDFLQQQG
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Query:  IQVKIVPGITAASGIAAELGIPLTHRGVATSVRFLTGHSRQGGTDPLFVAENAADPDSTLVVYMGLSTLPSLALKLMHHGLPPDTPAAAIERGTTPQQRI
        I+V+++PGITAASGIAAELGIPLTHRGVATSVRFLTGHSR+GGTDPLFVAENAADPD+TLVVYMGL TLPSLA KLM HGLP DTPA A+ERGTTP QR 
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Query:  VFAELKDLADEIKAAELVSPTLIIIGKVVSLSPHWSLSSKEASSLVE
        VFAELKD A EI++A LVSPTLIIIGKVV LSP W   +KE+S LVE
Subjt:  VFAELKDLADEIKAAELVSPTLIIIGKVVSLSPHWSLSSKEASSLVE

Q6F8G6 Siroheme synthase2.1e-6152.32Show/hide
Query:  GNVFLVGTGPGDPELLTLKAVKVIQSADLLLYDRLVSNDVLDLVGSDARLLYVGKTAGFHSRTQEEIHELLLNFAEAGATVVRLKGGDPLVFGRGGEEMD
        G V+LVG GPGDPELLTLKA++++Q AD+++YDRLVS  +L+L   DA  +YVGK    HS  QE I+ LL+ +A+AG  V RLKGGDP +FGRGGEE+ 
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Query:  FLQQQGIQVKIVPGITAASGIAAELGIPLTHRGVATSVRFLTGHSRQGGTDPLFVAENAADPDSTLVVYMGLSTLPSLALKLMHHGLPPDTPAAAIERGT
         L   GI  ++VPGITAASG +A  GIPLTHR  A SVRFLTGH ++G   P          + TLV+YMGL  L  +  +L+ HG  PD P A + +GT
Subjt:  FLQQQGIQVKIVPGITAASGIAAELGIPLTHRGVATSVRFLTGHSRQGGTDPLFVAENAADPDSTLVVYMGLSTLPSLALKLMHHGLPPDTPAAAIERGT

Query:  TPQQRIVFAELKDLADEIKAAELVSPTLIIIGKVVSL
        TP+Q++V   L ++A +I   ++ +PTL IIG+VVSL
Subjt:  TPQQRIVFAELKDLADEIKAAELVSPTLIIIGKVVSL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G40850.1 urophorphyrin methylase 11.5e-14778.67Show/hide
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        +N  PIC  H +++SSSSSPFTEKHSV+RYQRD WLYK          S S   D   +R+NDIA QLPELKKLL VL+EKR   G   G CGPG+V+LV
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Query:  GTGPGDPELLTLKAVKVIQSADLLLYDRLVSNDVLDLVGSDARLLYVGKTAGFHSRTQEEIHELLLNFAEAGATVVRLKGGDPLVFGRGGEEMDFLQQQG
        GTGPGDPELLTLKAV+VIQSADLLLYDRLVSNDVL+LV  DARLLYVGKTAG+HSRTQEEIHELLLNFAEAGATVVRLKGGDPLVFGRGGEEMDFLQQQG
Subjt:  GTGPGDPELLTLKAVKVIQSADLLLYDRLVSNDVLDLVGSDARLLYVGKTAGFHSRTQEEIHELLLNFAEAGATVVRLKGGDPLVFGRGGEEMDFLQQQG

Query:  IQVKIVPGITAASGIAAELGIPLTHRGVATSVRFLTGHSRQGGTDPLFVAENAADPDSTLVVYMGLSTLPSLALKLMHHGLPPDTPAAAIERGTTPQQRI
        I+V+++PGITAASGIAAELGIPLTHRGVATSVRFLTGHSR+GGTDPLFVAENAADPD+TLVVYMGL TLPSLA KLM HGLP DTPA A+ERGTTP QR 
Subjt:  IQVKIVPGITAASGIAAELGIPLTHRGVATSVRFLTGHSRQGGTDPLFVAENAADPDSTLVVYMGLSTLPSLALKLMHHGLPPDTPAAAIERGTTPQQRI

Query:  VFAELKDLADEIKAAELVSPTLIIIGKVVSLSPHWSLSSKEASSLVE
        VFAELKD A EI++A LVSPTLIIIGKVV LSP W   +KE+S LVE
Subjt:  VFAELKDLADEIKAAELVSPTLIIIGKVVSLSPHWSLSSKEASSLVE

AT5G40850.2 urophorphyrin methylase 17.5e-13176.66Show/hide
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        +N  PIC  H +++SSSSSPFTEKHSV+RYQRD WLYK          S S   D   +R+NDIA QLPELKKLL VL+EKR   G   G CGPG+V+LV
Subjt:  SNFKPICSFHCSSSSSSSSPFTEKHSVKRYQRDDWLYKNQADESSVASSCSIPSDSESIRQNDIALQLPELKKLLQVLREKRPSSGGDDGKCGPGNVFLV

Query:  GTGPGDPELLTLKAVKVIQSADLLLYDRLVSNDVLDLVGSDARLLYVGKTAGFHSRTQEEIHELLLNFAEAGATVVRLKGGDPLVFGRGGEEMDFLQQQG
        GTGPGDPELLTLKAV+VIQSADLLLYDRLVSNDVL+LV  DARLLYVGKTAG+HSRTQEEIHELLLNFAEAGATVVRLKGGDPLVFGRGGEEMDFLQQQG
Subjt:  GTGPGDPELLTLKAVKVIQSADLLLYDRLVSNDVLDLVGSDARLLYVGKTAGFHSRTQEEIHELLLNFAEAGATVVRLKGGDPLVFGRGGEEMDFLQQQG

Query:  IQVKIVPGITAASGIAAELGIPLTHRGVATSVRFLTGHSRQGGTDPLFVAENAADPDSTLVVYMGLSTLPSLALKLMHHGLPPDTPAAAIERGTTPQQRI
        I+V+++PGITAASGIAAELGIPLTHRGVATSVRFLTGHSR+GGTDPLFVAENAADPD+TLVVYMGL TLPSLA KLM HGLP DTPA A+ERGTTP QR 
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Query:  VFAELKDLADEIKAAEL
         F  L      +K  +L
Subjt:  VFAELKDLADEIKAAEL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
TCGCTATTTTCGTCTCGCCCAACAATACCCAGATCCTCAAATTTCAAACCCATTTGTTCTTTTCACTGCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGCCATTTACAGAGAAACA
TTCCGTGAAGAGATACCAAAGAGACGATTGGCTGTACAAGAACCAAGCGGATGAAAGTTCTGTTGCTTCATCGTGTTCTATTCCGTCTGATTCTGAGTCTATACGGCAGA
ATGACATTGCCTTGCAGTTGCCGGAGCTGAAGAAATTGCTGCAGGTGCTGAGGGAAAAGAGGCCAAGTAGTGGTGGCGATGATGGGAAATGTGGGCCGGGGAACGTGTTT
TTGGTGGGGACTGGCCCTGGAGATCCAGAGCTTTTGACATTGAAGGCGGTGAAAGTGATTCAGAGTGCTGATTTGCTTTTGTATGATCGATTGGTGTCTAATGATGTGTT
GGATTTGGTGGGTTCTGATGCTAGGCTTCTCTATGTGGGGAAGACGGCTGGTTTCCATAGCAGAACCCAGGAGGAGATTCATGAGTTACTTCTGAACTTTGCTGAAGCTG
GAGCTACAGTTGTGAGGCTTAAAGGAGGAGACCCTCTTGTGTTTGGAAGGGGTGGGGAGGAGATGGATTTCTTGCAACAGCAAGGGATTCAAGTCAAAATTGTTCCTGGG
ATAACTGCTGCTTCAGGTATAGCTGCTGAATTGGGAATTCCTTTGACACATAGGGGCGTTGCGACAAGTGTCAGGTTCCTCACTGGTCACTCCAGACAGGGTGGAACCGA
TCCTCTATTTGTCGCAGAGAATGCAGCTGATCCAGATTCAACTCTGGTGGTATACATGGGTCTATCAACTCTTCCATCTCTGGCCCTTAAGTTGATGCATCATGGTCTGC
CCCCTGATACCCCAGCTGCTGCTATTGAACGAGGGACAACACCCCAACAAAGAATAGTTTTTGCAGAACTGAAGGATCTTGCAGATGAAATCAAAGCAGCAGAGTTGGTT
TCACCTACTTTAATTATAATTGGAAAAGTGGTTTCTCTCTCACCACATTGGTCACTTTCTTCCAAAGAAGCCTCCAGTTTGGTGGAGGCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCGCTATTTTCGTCTCGCCCAACAATACCCAGATCCTCAAATTTCAAACCCATTTGTTCTTTTCACTGCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGCCATTTACAGAGAAACA
TTCCGTGAAGAGATACCAAAGAGACGATTGGCTGTACAAGAACCAAGCGGATGAAAGTTCTGTTGCTTCATCGTGTTCTATTCCGTCTGATTCTGAGTCTATACGGCAGA
ATGACATTGCCTTGCAGTTGCCGGAGCTGAAGAAATTGCTGCAGGTGCTGAGGGAAAAGAGGCCAAGTAGTGGTGGCGATGATGGGAAATGTGGGCCGGGGAACGTGTTT
TTGGTGGGGACTGGCCCTGGAGATCCAGAGCTTTTGACATTGAAGGCGGTGAAAGTGATTCAGAGTGCTGATTTGCTTTTGTATGATCGATTGGTGTCTAATGATGTGTT
GGATTTGGTGGGTTCTGATGCTAGGCTTCTCTATGTGGGGAAGACGGCTGGTTTCCATAGCAGAACCCAGGAGGAGATTCATGAGTTACTTCTGAACTTTGCTGAAGCTG
GAGCTACAGTTGTGAGGCTTAAAGGAGGAGACCCTCTTGTGTTTGGAAGGGGTGGGGAGGAGATGGATTTCTTGCAACAGCAAGGGATTCAAGTCAAAATTGTTCCTGGG
ATAACTGCTGCTTCAGGTATAGCTGCTGAATTGGGAATTCCTTTGACACATAGGGGCGTTGCGACAAGTGTCAGGTTCCTCACTGGTCACTCCAGACAGGGTGGAACCGA
TCCTCTATTTGTCGCAGAGAATGCAGCTGATCCAGATTCAACTCTGGTGGTATACATGGGTCTATCAACTCTTCCATCTCTGGCCCTTAAGTTGATGCATCATGGTCTGC
CCCCTGATACCCCAGCTGCTGCTATTGAACGAGGGACAACACCCCAACAAAGAATAGTTTTTGCAGAACTGAAGGATCTTGCAGATGAAATCAAAGCAGCAGAGTTGGTT
TCACCTACTTTAATTATAATTGGAAAAGTGGTTTCTCTCTCACCACATTGGTCACTTTCTTCCAAAGAAGCCTCCAGTTTGGTGGAGGCTTAATTGAGTTAAAGAGTCTA
CAAAAGGTTACAGGAATAGTTCTTCATTCTGTCACTTAAAAAGCTCTGGACGTCGAGTTCTTCCACAAGATCTTGTCGATTTTGTGGAGAAAACATTGAAACCATGACAG
AGCGGAAAAGGAAGAATAGGGGCCTCGTCTTTCTATTCTGCATTTTATTGGTCTGCCCATTGCCTTCAAATGGCTGGACTCGGGTTTTCTGCGAAGGACGGGAGTGATGC
AGTGGTTTTCCTCCTTGGATGCTACTACCGGAGCACGGTGAGCAGCATCTCCTCATACCATTTCTTGCATTGATTCAAATAGAACCTCCAAACTTCAATTTTTTCTTAGT
TCATGTTCATGAGGCCTCTGGTGCAATGAGATTACTTTATCACCAACCAATGTATTGTAGAATTGTCTTTTGAGTAGAACTTCTACAAATAACAAAGAAATACAGACTAT
GAACGGCAAGCTCGTAAATATTGTATTACTTCACCTCAAATATGACGCAGTCTGGGATTTGTGAATAATAAGGTTTCACTCCAAATGTCACGAAAAAAAGCATATATACG
AGAATGCTAATCAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
SLFSSRPTIPRSSNFKPICSFHCSSSSSSSSPFTEKHSVKRYQRDDWLYKNQADESSVASSCSIPSDSESIRQNDIALQLPELKKLLQVLREKRPSSGGDDGKCGPGNVF
LVGTGPGDPELLTLKAVKVIQSADLLLYDRLVSNDVLDLVGSDARLLYVGKTAGFHSRTQEEIHELLLNFAEAGATVVRLKGGDPLVFGRGGEEMDFLQQQGIQVKIVPG
ITAASGIAAELGIPLTHRGVATSVRFLTGHSRQGGTDPLFVAENAADPDSTLVVYMGLSTLPSLALKLMHHGLPPDTPAAAIERGTTPQQRIVFAELKDLADEIKAAELV
SPTLIIIGKVVSLSPHWSLSSKEASSLVEA