; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg18750 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg18750
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptiontranscription factor bHLH87-like
Genome locationCarg_Chr08:4088823..4089851
RNA-Seq ExpressionCarg18750
SyntenyCarg18750
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6593500.1 Transcription factor basic helix-loop-helix 87, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.7e-18599.42Show/hide
Query:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSEDMDAIAPYGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNS
        MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATS+DMDAIAPYGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNS
Subjt:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSEDMDAIAPYGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNS

Query:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
        NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
Subjt:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC

Query:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
Subjt:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE

Query:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQFPPKLN
        NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQ+PPKLN
Subjt:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQFPPKLN

KAG7025846.1 Transcription factor bHLH87, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.3e-186100Show/hide
Query:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSEDMDAIAPYGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNS
        MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSEDMDAIAPYGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNS
Subjt:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSEDMDAIAPYGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNS

Query:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
        NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
Subjt:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC

Query:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
Subjt:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE

Query:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQFPPKLN
        NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQFPPKLN
Subjt:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQFPPKLN

XP_022964394.1 transcription factor bHLH87-like [Cucurbita moschata]5.4e-18198.82Show/hide
Query:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSEDMDAIAPYGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNS
        MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATS+DMDAIA YGFDDGKSTSVTPCSL+SLDCLLSATNS
Subjt:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSEDMDAIAPYGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNS

Query:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
        NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
Subjt:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC

Query:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
Subjt:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE

Query:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQFP
        NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQ+P
Subjt:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQFP

XP_023000369.1 transcription factor bHLH87-like [Cucurbita maxima]4.8e-17796.75Show/hide
Query:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSEDMDAIAPYGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNS
        MDY NRDGY SRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLP+SPPLTSFATS+DMDAIAPYGFDDGKSTSVT CSLESLDCLLSATNS
Subjt:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSEDMDAIAPYGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNS

Query:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
        NTDTSVEDNDGSV MILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQEST+YSVFSNTIKNLS+STSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
Subjt:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC

Query:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKN+RISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGG+KMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
Subjt:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE

Query:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQFP
        NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSH+QFP
Subjt:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQFP

XP_023514891.1 transcription factor bHLH87-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.8e-18399.7Show/hide
Query:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSEDMDAIAPYGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNS
        MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATS+DMDAIAPYGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNS
Subjt:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSEDMDAIAPYGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNS

Query:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
        NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
Subjt:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC

Query:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
Subjt:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE

Query:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQFP
        NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQFP
Subjt:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQFP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K9P0 BHLH domain-containing protein2.0e-13372.97Show/hide
Query:  MDYSNRDGYGSRVA---TTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNS-NSHFFNSVQDLPI-------------------SPPLTSFATSEDMDAIA-----P
        MD+ N +GYGSRVA   T + TS  SFWSNYQQGVEERF+IS+S NS+FFNSVQD PI                   SP LTSF TS +MD +       
Subjt:  MDYSNRDGYGSRVA---TTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNS-NSHFFNSVQDLPI-------------------SPPLTSFATSEDMDAIA-----P

Query:  YGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAA------------TTKRTHQE----STEYSVFSNTIKNLSDS
         G +  KS +VT CSLESLDCLLSATNSNTDTSVED DGSVSM+LTDYTNLWNFG NAA            +TKR+H++    + +YS+FSN I NLSDS
Subjt:  YGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAA------------TTKRTHQE----STEYSVFSNTIKNLSDS

Query:  TSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRR
        TS+SGGFRIITD + PK KKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAA RPVNLG+E IEKPKRKNVRIS+DPQTVAARQRR
Subjt:  TSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRR

Query:  ERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQF
        ERISERIRVLQRLVPGG+KMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQK+ESLNCP TS+AFSFNPSFPIQ+SS  SHN F
Subjt:  ERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQF

A0A1S3CGV3 transcription factor bHLH872.6e-13674.02Show/hide
Query:  MDYSNRDGYGSRVA---TTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNS-NSHFFNSVQDLPI-------------------SPPLTSFATSEDMDAIA-----P
        MD+ N +GYGSRVA   T + TS  SFWSNYQQGVEERFMIS+S NS+FFNSVQD PI                   SPPLTSF TS +MD +       
Subjt:  MDYSNRDGYGSRVA---TTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNS-NSHFFNSVQDLPI-------------------SPPLTSFATSEDMDAIA-----P

Query:  YGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAA------------TTKRTHQE----STEYSVFSNTIKNLSDS
        +G +  KS +VT CSLESLDCLLSATNSNTDTSVED DGSVSM+LTDYTNLWNFG NAA            +TKR+H++    + +YS+FSN I NLSDS
Subjt:  YGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAA------------TTKRTHQE----STEYSVFSNTIKNLSDS

Query:  TSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRR
        TS+SGGFRIITD N PK KKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAA RPVNLG+E IEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRR
Subjt:  TSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRR

Query:  ERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQF
        ERISERIRVLQRLVPGG+KMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQK+ESLNCP TS+AFSFNPSFPIQ+SS  SHN F
Subjt:  ERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQF

A0A5D3BVW0 Transcription factor bHLH872.6e-13674.02Show/hide
Query:  MDYSNRDGYGSRVA---TTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNS-NSHFFNSVQDLPI-------------------SPPLTSFATSEDMDAIA-----P
        MD+ N +GYGSRVA   T + TS  SFWSNYQQGVEERFMIS+S NS+FFNSVQD PI                   SPPLTSF TS +MD +       
Subjt:  MDYSNRDGYGSRVA---TTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNS-NSHFFNSVQDLPI-------------------SPPLTSFATSEDMDAIA-----P

Query:  YGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAA------------TTKRTHQE----STEYSVFSNTIKNLSDS
        +G +  KS +VT CSLESLDCLLSATNSNTDTSVED DGSVSM+LTDYTNLWNFG NAA            +TKR+H++    + +YS+FSN I NLSDS
Subjt:  YGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAA------------TTKRTHQE----STEYSVFSNTIKNLSDS

Query:  TSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRR
        TS+SGGFRIITD N PK KKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAA RPVNLG+E IEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRR
Subjt:  TSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRR

Query:  ERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQF
        ERISERIRVLQRLVPGG+KMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQK+ESLNCP TS+AFSFNPSFPIQ+SS  SHN F
Subjt:  ERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQF

A0A6J1HKP2 transcription factor bHLH87-like2.6e-18198.82Show/hide
Query:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSEDMDAIAPYGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNS
        MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATS+DMDAIA YGFDDGKSTSVTPCSL+SLDCLLSATNS
Subjt:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSEDMDAIAPYGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNS

Query:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
        NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
Subjt:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC

Query:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
Subjt:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE

Query:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQFP
        NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQ+P
Subjt:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQFP

A0A6J1KJP9 transcription factor bHLH87-like2.3e-17796.75Show/hide
Query:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSEDMDAIAPYGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNS
        MDY NRDGY SRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLP+SPPLTSFATS+DMDAIAPYGFDDGKSTSVT CSLESLDCLLSATNS
Subjt:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSEDMDAIAPYGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNS

Query:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
        NTDTSVEDNDGSV MILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQEST+YSVFSNTIKNLS+STSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
Subjt:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC

Query:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKN+RISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGG+KMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
Subjt:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE

Query:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQFP
        NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSH+QFP
Subjt:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQFP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0A0P0WQ90 Transcription factor LATE FLOWERING1.7e-3139.21Show/hide
Query:  FFNSVQDLPISPPLTSFATSEDMDAIAPYGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYS
        F +SV  LP+  P  + AT +D   +  + F +   T  T     + +   S  +SNT      + G  +     YT + +     +TT  T    T   
Subjt:  FFNSVQDLPISPPLTSFATSEDMDAIAPYGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYS

Query:  VFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCI-------DQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGI----
             +         S   +  T       ++        SS+I F   C    +           EPD EAIAQ+KEMIYRAAA+RPV LG        
Subjt:  VFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCI-------DQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGI----

Query:  --------EKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLG
                ++P+RKNVRIS+DPQTVAAR RRER+SER+RVLQRLVPGG+KMDTA+MLDEAA+YLKFLKSQ++ALE LG
Subjt:  --------EKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLG

Q8S3D2 Transcription factor bHLH872.7e-5849.17Show/hide
Query:  KSTSVTPCSLESLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVF--------------------------SNTIKN
        +++S+ P    SLDCLLSAT+++ +TS ED++G +S++ +D   LW+FG  ++      + +TE +                             +  +N
Subjt:  KSTSVTPCSLESLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVF--------------------------SNTIKN

Query:  LSDST------------SNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKP-PSSSNINFQQSCSSGSSCIDQ--EPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPK
          D T            S  GGF++I D+NQ KSKKPR+EK    SSNI+FQ      S+C+    EPD EAIAQMKEMIYRAAA RPVN G+E +EKPK
Subjt:  LSDST------------SNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKP-PSSSNINFQQSCSSGSSCIDQ--EPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPK

Query:  RKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFS---FNPSF-PIQSSSSLS
        RKNV+ISTDPQTVAARQRRERISE+IRVLQ LVPGG KMDTASMLDEAANYLKFL++Q+KALENL  K++  N   +S   S   F+PSF P+Q+ + + 
Subjt:  RKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFS---FNPSF-PIQSSSSLS

Query:  H
        H
Subjt:  H

Q9FHA7 Transcription factor HEC13.8e-2867.03Show/hide
Query:  IAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        +A M+EMI+R A ++P+++  E ++ PKR+NVRIS DPQ+VAAR RRERISERIR+LQRLVPGG KMDTASMLDEA +Y+KFLK Q+++LE
Subjt:  IAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE

Q9LXD8 Transcription factor HEC31.7e-2857.26Show/hide
Query:  SEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDP-EAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMD
        S  PP SS++      S      + E +P E +  MKEM+Y+ AA++ V++    ++KPKR+NVRIS DPQ+VAAR RRERISERIR+LQRLVPGG KMD
Subjt:  SEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDP-EAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMD

Query:  TASMLDEAANYLKFLKSQIKALEN
        TASMLDEA  Y+KFLK QI+ L N
Subjt:  TASMLDEAANYLKFLKSQIKALEN

Q9SND4 Transcription factor HEC27.7e-2956.56Show/hide
Query:  PPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQE---PDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDT
        P     +NF+ + S  SS  ++     D   +A M+EMI+R A ++P+++  E ++ PKRKNVRIS DPQ+VAAR RRERISERIR+LQRLVPGG KMDT
Subjt:  PPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQE---PDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDT

Query:  ASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        ASMLDEA +Y+KFLK Q+++LE
Subjt:  ASMLDEAANYLKFLKSQIKALE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G21330.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.9e-5949.17Show/hide
Query:  KSTSVTPCSLESLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVF--------------------------SNTIKN
        +++S+ P    SLDCLLSAT+++ +TS ED++G +S++ +D   LW+FG  ++      + +TE +                             +  +N
Subjt:  KSTSVTPCSLESLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVF--------------------------SNTIKN

Query:  LSDST------------SNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKP-PSSSNINFQQSCSSGSSCIDQ--EPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPK
          D T            S  GGF++I D+NQ KSKKPR+EK    SSNI+FQ      S+C+    EPD EAIAQMKEMIYRAAA RPVN G+E +EKPK
Subjt:  LSDST------------SNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKP-PSSSNINFQQSCSSGSSCIDQ--EPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPK

Query:  RKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFS---FNPSF-PIQSSSSLS
        RKNV+ISTDPQTVAARQRRERISE+IRVLQ LVPGG KMDTASMLDEAANYLKFL++Q+KALENL  K++  N   +S   S   F+PSF P+Q+ + + 
Subjt:  RKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFS---FNPSF-PIQSSSSLS

Query:  H
        H
Subjt:  H

AT3G50330.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein5.5e-3056.56Show/hide
Query:  PPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQE---PDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDT
        P     +NF+ + S  SS  ++     D   +A M+EMI+R A ++P+++  E ++ PKRKNVRIS DPQ+VAAR RRERISERIR+LQRLVPGG KMDT
Subjt:  PPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQE---PDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDT

Query:  ASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        ASMLDEA +Y+KFLK Q+++LE
Subjt:  ASMLDEAANYLKFLKSQIKALE

AT4G00120.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.8e-2560.61Show/hide
Query:  DQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        D+E D E +  MKEM Y  A ++PV++    + KP R+NVRIS DPQTV AR+RRERISE+IR+L+R+VPGG KMDTASMLDEA  Y KFLK Q++ L+
Subjt:  DQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE

AT5G09750.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.2e-2957.26Show/hide
Query:  SEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDP-EAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMD
        S  PP SS++      S      + E +P E +  MKEM+Y+ AA++ V++    ++KPKR+NVRIS DPQ+VAAR RRERISERIR+LQRLVPGG KMD
Subjt:  SEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDP-EAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMD

Query:  TASMLDEAANYLKFLKSQIKALEN
        TASMLDEA  Y+KFLK QI+ L N
Subjt:  TASMLDEAANYLKFLKSQIKALEN

AT5G67060.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.7e-2967.03Show/hide
Query:  IAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        +A M+EMI+R A ++P+++  E ++ PKR+NVRIS DPQ+VAAR RRERISERIR+LQRLVPGG KMDTASMLDEA +Y+KFLK Q+++LE
Subjt:  IAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATTATTCGAACCGGGATGGATACGGGTCGAGAGTTGCAACGACAAACATGACGTCGCCGGTGTCGTTTTGGAGCAATTACCAACAAGGAGTTGAAGAAAGGTTCAT
GATATCCAATTCAAATTCTCACTTCTTCAACTCAGTTCAAGATCTCCCAATCAGCCCTCCATTGACAAGCTTTGCAACATCCGAAGACATGGATGCTATTGCGCCCTATG
GATTCGACGACGGTAAATCGACGTCGGTTACACCGTGCTCTCTCGAGTCATTGGACTGCTTGCTTTCAGCTACAAATAGCAACACAGACACATCAGTTGAAGACAATGAT
GGATCAGTGTCAATGATCTTAACAGATTACACAAATTTATGGAACTTTGGAAGCAATGCAGCAACTACAAAGAGAACCCATCAAGAATCTACAGAGTACTCTGTTTTTTC
CAACACCATCAAGAATCTCTCTGATTCAACTTCAAACAGTGGAGGGTTTAGGATCATAACAGATCAAAATCAACCAAAATCAAAGAAACCCAGATCAGAAAAGCCACCAA
GTTCATCAAACATCAACTTCCAGCAATCATGTTCATCAGGATCATCATGTATTGATCAAGAACCTGACCCAGAAGCCATAGCACAGATGAAGGAAATGATATACAGAGCA
GCAGCTTTGAGGCCAGTGAATTTGGGGGTAGAAGGGATAGAAAAGCCCAAAAGGAAGAACGTGAGGATCTCAACAGACCCACAAACAGTAGCAGCAAGGCAAAGGAGAGA
GAGAATCAGTGAAAGAATTAGGGTTTTGCAAAGGCTTGTTCCTGGTGGGAACAAGATGGATACTGCATCAATGCTTGATGAAGCTGCAAATTATCTCAAGTTCTTGAAGT
CTCAGATCAAAGCTTTAGAGAATCTTGGGCAAAAGATTGAATCTTTGAACTGCCCTTCAACTAGCTTAGCCTTTTCTTTCAACCCATCTTTTCCCATACAATCATCTTCA
TCATTATCCCATAACCAATTTCCCCCAAAACTGAACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATTATTCGAACCGGGATGGATACGGGTCGAGAGTTGCAACGACAAACATGACGTCGCCGGTGTCGTTTTGGAGCAATTACCAACAAGGAGTTGAAGAAAGGTTCAT
GATATCCAATTCAAATTCTCACTTCTTCAACTCAGTTCAAGATCTCCCAATCAGCCCTCCATTGACAAGCTTTGCAACATCCGAAGACATGGATGCTATTGCGCCCTATG
GATTCGACGACGGTAAATCGACGTCGGTTACACCGTGCTCTCTCGAGTCATTGGACTGCTTGCTTTCAGCTACAAATAGCAACACAGACACATCAGTTGAAGACAATGAT
GGATCAGTGTCAATGATCTTAACAGATTACACAAATTTATGGAACTTTGGAAGCAATGCAGCAACTACAAAGAGAACCCATCAAGAATCTACAGAGTACTCTGTTTTTTC
CAACACCATCAAGAATCTCTCTGATTCAACTTCAAACAGTGGAGGGTTTAGGATCATAACAGATCAAAATCAACCAAAATCAAAGAAACCCAGATCAGAAAAGCCACCAA
GTTCATCAAACATCAACTTCCAGCAATCATGTTCATCAGGATCATCATGTATTGATCAAGAACCTGACCCAGAAGCCATAGCACAGATGAAGGAAATGATATACAGAGCA
GCAGCTTTGAGGCCAGTGAATTTGGGGGTAGAAGGGATAGAAAAGCCCAAAAGGAAGAACGTGAGGATCTCAACAGACCCACAAACAGTAGCAGCAAGGCAAAGGAGAGA
GAGAATCAGTGAAAGAATTAGGGTTTTGCAAAGGCTTGTTCCTGGTGGGAACAAGATGGATACTGCATCAATGCTTGATGAAGCTGCAAATTATCTCAAGTTCTTGAAGT
CTCAGATCAAAGCTTTAGAGAATCTTGGGCAAAAGATTGAATCTTTGAACTGCCCTTCAACTAGCTTAGCCTTTTCTTTCAACCCATCTTTTCCCATACAATCATCTTCA
TCATTATCCCATAACCAATTTCCCCCAAAACTGAACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSEDMDAIAPYGFDDGKSTSVTPCSLESLDCLLSATNSNTDTSVEDND
GSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRA
AALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSS
SLSHNQFPPKLN