; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg18842 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg18842
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionprotein RALF-like 33
Genome locationCarg_Chr08:7483300..7483683
RNA-Seq ExpressionCarg18842
SyntenyCarg18842
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6593968.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.9e-63100Show/hide
Query:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG
        MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG
Subjt:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG

Query:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
Subjt:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

XP_022138421.1 protein RALF-like 33 [Momordica charantia]1.6e-4882.68Show/hide
Query:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG
        MEISRV S LAA AI AAH LLSSA A DFSG  KLL+VPA+S+CRGSIAEC LAGD  DS FG EFEMDSEINRRILA  RY+SYGALKRNSVPCSRRG
Subjt:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG

Query:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        ASYYNCQPGAQANPY RGC+AITRCRS
Subjt:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

XP_022930438.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita moschata]6.5e-6399.21Show/hide
Query:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG
        MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILA+SRYLSYGALKRNSVPCSRRG
Subjt:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG

Query:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
Subjt:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

XP_023000591.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita maxima]5.5e-6298.43Show/hide
Query:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG
        MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAM VDFSG DKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG
Subjt:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG

Query:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
Subjt:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

XP_038875155.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]4.4e-5182.68Show/hide
Query:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG
        M ISRV S LAA AI+AAHFL+SSA AVDFSG  KLLFVP +S+CRGSIAECFLAG+D+DSAFGMEF MDSEINRRILA +RY+SYGAL+RN+VPCSRRG
Subjt:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG

Query:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        ASYYNC+PGAQANPY RGCNAITRCRS
Subjt:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1C9N4 protein RALF-like 337.5e-4982.68Show/hide
Query:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG
        MEISRV S LAA AI AAH LLSSA A DFSG  KLL+VPA+S+CRGSIAEC LAGD  DS FG EFEMDSEINRRILA  RY+SYGALKRNSVPCSRRG
Subjt:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG

Query:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        ASYYNCQPGAQANPY RGC+AITRCRS
Subjt:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

A0A6J1EV64 protein RALF-like 333.1e-6399.21Show/hide
Query:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG
        MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILA+SRYLSYGALKRNSVPCSRRG
Subjt:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG

Query:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
Subjt:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

A0A6J1H3W7 protein RALF-like 339.8e-4975.59Show/hide
Query:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG
        M ISRV + +AA A++AAHFL+ SA A+DFSG +++LF P +S+CRGSIAECFLAG+D+DS FGMEFEMDSEINRRILA +RY+SYGAL+RN+VPCSRRG
Subjt:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG

Query:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        ASYYNC+PGAQANPY RGC+AITRCRS
Subjt:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

A0A6J1KG89 protein RALF-like 332.7e-6298.43Show/hide
Query:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG
        MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAM VDFSG DKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG
Subjt:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG

Query:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
Subjt:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

A0A6J1KVY0 protein RALF-like 336.4e-4874.8Show/hide
Query:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG
        M ISRV + +AA A++AAHFL+SSA A+DFSG +++LF P +S+CRGSI ECFLAG+ +DS FGMEFEMDSEINRRILA +RY+SYGAL+RN+VPCSRRG
Subjt:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRG

Query:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        ASYYNC+PGAQANPY RGC+AITRCRS
Subjt:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 336.2e-3264.6Show/hide
Query:  AIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQAN
        AI+  HFL   A     S GD   FVP ESKC G+IAEC L+  +       EFEMDSEINRRILA ++Y+SYGAL+RN+VPCSRRGASYYNC+ GAQAN
Subjt:  AIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQAN

Query:  PYRRGCNAITRCR
        PY RGC+AITRCR
Subjt:  PYRRGCNAITRCR

Q945T0 Rapid alkalinization factor4.1e-2855.75Show/hide
Query:  IIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQANP
        ++   F +S A A D    D ++   +   C+GSI EC    +        EFE+DSE NRRILA  +Y+SYGAL++NSVPCSRRGASYYNC+PGAQANP
Subjt:  IIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQANP

Query:  YRRGCNAITRCRS
        Y RGC+AITRCRS
Subjt:  YRRGCNAITRCRS

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 237.5e-3055.81Show/hide
Query:  SFLAASAIIAAH--FLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLA---GDDND-----SAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCS
        +  A   I+A H   +  S+ + +F+G     F P E++CRG+IAEC ++   GD  D        G EFEMDSEINRRILA  RY+SYGAL+RN++PCS
Subjt:  SFLAASAIIAAH--FLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLA---GDDND-----SAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCS

Query:  RRGASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCR
        RRGASYYNC+ GAQANPY RGC+AITRCR
Subjt:  RRGASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCR

Q9MA62 Protein RALF-like 226.6e-2655.37Show/hide
Query:  AASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESK-----CRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYN
        A  A+IA   ++ SA+      GD L FV A S      C GSIAEC    +        E E DS+I+RRILA  +Y+SYGA++RNSVPCSRRGASYYN
Subjt:  AASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESK-----CRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYN

Query:  CQPGAQANPYRRGCNAITRCR
        CQ GAQANPY RGC+ ITRCR
Subjt:  CQPGAQANPYRRGCNAITRCR

Q9SRY3 Protein RALF-like 13.3e-2568.24Show/hide
Query:  SKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        S C GSIAEC  A ++         EMDSEINRRILA ++Y+SY +LKRNSVPCSRRGASYYNCQ GAQANPY RGC+ I RCRS
Subjt:  SKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 12.3e-2668.24Show/hide
Query:  SKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        S C GSIAEC  A ++         EMDSEINRRILA ++Y+SY +LKRNSVPCSRRGASYYNCQ GAQANPY RGC+ I RCRS
Subjt:  SKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

AT2G33775.1 ralf-like 191.2e-1759.15Show/hide
Query:  GDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASR-YLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRC
        G+D +    +++ MDSE NRR LAA R Y+SYGAL++N+VPCSRRG SYY+C+   +ANPYRRGC+ IT C
Subjt:  GDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASR-YLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRC

AT3G05490.1 ralf-like 224.7e-2755.37Show/hide
Query:  AASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESK-----CRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYN
        A  A+IA   ++ SA+      GD L FV A S      C GSIAEC    +        E E DS+I+RRILA  +Y+SYGA++RNSVPCSRRGASYYN
Subjt:  AASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESK-----CRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYN

Query:  CQPGAQANPYRRGCNAITRCR
        CQ GAQANPY RGC+ ITRCR
Subjt:  CQPGAQANPYRRGCNAITRCR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 235.3e-3155.81Show/hide
Query:  SFLAASAIIAAH--FLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLA---GDDND-----SAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCS
        +  A   I+A H   +  S+ + +F+G     F P E++CRG+IAEC ++   GD  D        G EFEMDSEINRRILA  RY+SYGAL+RN++PCS
Subjt:  SFLAASAIIAAH--FLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLA---GDDND-----SAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCS

Query:  RRGASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCR
        RRGASYYNC+ GAQANPY RGC+AITRCR
Subjt:  RRGASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCR

AT4G15800.1 ralf-like 334.4e-3364.6Show/hide
Query:  AIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQAN
        AI+  HFL   A     S GD   FVP ESKC G+IAEC L+  +       EFEMDSEINRRILA ++Y+SYGAL+RN+VPCSRRGASYYNC+ GAQAN
Subjt:  AIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQAN

Query:  PYRRGCNAITRCR
        PY RGC+AITRCR
Subjt:  PYRRGCNAITRCR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAATCTCACGCGTTTTTTCCTTCCTCGCGGCCTCCGCCATTATCGCCGCTCACTTTCTGCTCTCATCGGCGATGGCCGTCGATTTCTCCGGCGGTGACAAACTCCT
CTTCGTTCCGGCTGAGTCCAAGTGCAGAGGCTCTATCGCTGAATGCTTTCTCGCCGGAGATGACAATGATTCCGCCTTCGGAATGGAGTTCGAGATGGACTCTGAGATCA
ATCGCCGAATTCTAGCGGCTTCTCGCTACCTGAGCTATGGCGCTTTGAAAAGGAACAGCGTTCCTTGCTCTCGCCGCGGTGCTTCTTACTACAACTGCCAGCCTGGCGCT
CAGGCCAATCCTTACAGACGCGGTTGCAACGCCATTACTCGCTGCCGGAGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAATCTCACGCGTTTTTTCCTTCCTCGCGGCCTCCGCCATTATCGCCGCTCACTTTCTGCTCTCATCGGCGATGGCCGTCGATTTCTCCGGCGGTGACAAACTCCT
CTTCGTTCCGGCTGAGTCCAAGTGCAGAGGCTCTATCGCTGAATGCTTTCTCGCCGGAGATGACAATGATTCCGCCTTCGGAATGGAGTTCGAGATGGACTCTGAGATCA
ATCGCCGAATTCTAGCGGCTTCTCGCTACCTGAGCTATGGCGCTTTGAAAAGGAACAGCGTTCCTTGCTCTCGCCGCGGTGCTTCTTACTACAACTGCCAGCCTGGCGCT
CAGGCCAATCCTTACAGACGCGGTTGCAACGCCATTACTCGCTGCCGGAGTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILAASRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGA
QANPYRRGCNAITRCRS