; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg18923 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg18923
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionFMN-binding split barrel
Genome locationCarg_Chr17:5642891..5647797
RNA-Seq ExpressionCarg18923
SyntenyCarg18923
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR012349 - FMN-binding split barrel
IPR037119 - Haem oxygenase HugZ-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6575391.1 F-box/kelch-repeat protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.4e-208100Show/hide
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KAG7013929.1 hypothetical protein SDJN02_24098 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.4e-211100Show/hide
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XP_022992307.1 uncharacterized protein LOC111488659 [Cucurbita maxima]3.7e-20798.93Show/hide
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XP_023549204.1 uncharacterized protein LOC111807632 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.6e-21099.46Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAK0 Uncharacterized protein4.0e-19190.24Show/hide
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A0A1S3CGC6 uncharacterized protein LOC1035006161.9e-19391.29Show/hide
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A0A5A7UTT3 Uncharacterized protein1.7e-18991.42Show/hide
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A0A6J1JPF6 uncharacterized protein LOC1114886591.8e-20798.93Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G51560.1 Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein6.2e-14473.33Show/hide
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        IRVRQGAQF +QR++FE  H VETLEEAK AL K+I KG + N Q
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AT3G03890.1 FMN binding5.2e-1828.5Show/hide
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        +C ++S    + +GYP GS+VDFA D+ G PI + S LA+HT++LLA+P+C++++        +  R+T+ GD   + E  Q      Y+AKH +     
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        +G+F + R++    + ++ G  T          +EY+A + D IA     Q  K + +  +K  +E   A         V+ A ++ +DS G +++   Q
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Query:  GAQFNVQ
        G  F ++
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AT3G03890.2 FMN binding5.2e-1828.5Show/hide
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        +C ++S    + +GYP GS+VDFA D+ G PI + S LA+HT++LLA+P+C++++        +  R+T+ GD   + E  Q      Y+AKH +     
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Query:  WGNFYYFRMQDISDIYFIGGFGTV----AWVDVKEYEALQPDKIAVDGGEQSLKELNAMFSKPLKELLSA------ESEVDDAALISIDSKGIDIRVR-Q
        +G+F + R++    + ++ G  T          +EY+A + D IA     Q  K + +  +K  +E   A         V+ A ++ +DS G +++   Q
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Query:  GAQFNVQ
        G  F ++
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AT3G21140.1 Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein2.3e-13871.43Show/hide
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        F N   +T F  LR+++ ++  GLR    L  E       +N FG F  +  S  +++L  + SN + ++  + V+ASL  P  G G RAGLFRTPISGG
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Query:  VQSATSAHGLPRPALAVRNLMEQARFAHLCTVMSRMHHRRQGYPFGSLVDFATDSMGHPIFSFSPLAIHTRNLLADPRCTIVVQIPGWSGLSNARVTIFG
        VQ+ATSAH LPRPALAVRNL+EQARFAHLCTVMS+MHHRR+GYPFGSLVDFA D MGHPIF FSPLAIHTRNLL +PRC++VVQIPGWSGLSNARVT+FG
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        D+YPL ED+QEWAHKQYIAKH  GPS+QWGNF+YFRMQ+ISDIYFIGGFGTVAWVDVKEYE LQPDKIAVDGGE++LKELNA+FSKPL+ELLS ESEVDD
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Query:  AALISIDSKGIDIRVRQGAQFNVQRISFEGGHAVETLEEAKVALRKLINK
        AALISIDSKGID+RVRQGAQFN+QR++FE GH VETLEEAK AL K++ K
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGCGCTAGCAAGCTCTGTGACCATTCCCAAGTTTCCAGAGGCATACACTCCTTCTTTGTTCAGGAACCCGACCAAGCGAACTGGTTTTCTCAGAATCAACGATTC
TACTACTTTTGGTGGCCTTCGTGCTCTCTCTGGCGAAGCTGAAGAGGCTAAACCATCTGATAATAGATTTGGACTCTTTTCCGAAGAAGATGTATCTTTTCCCGAGGATG
AACTAAATTTTACACAAAGCAATGAAAAGAATGCAAATGAGCGTTTAAAGGTGGATGCATCTCTTACTGCTCCATCTGGCAGTGGAACTAGAGCTGGTCTTTTCAGAACA
CCAATATCGGGTGGTGTGCAGAGTGCAACCTCAGCGCATGGTCTACCCAGACCGGCCTTAGCTGTCCGCAATCTCATGGAACAGGCCAGATTTGCTCATTTGTGCACTGT
GATGTCTCGGATGCACCACCGCAGACAAGGATACCCATTTGGTTCTTTGGTAGATTTTGCAACTGACTCCATGGGCCATCCAATTTTTTCTTTTTCACCTCTGGCCATTC
ATACCCGGAATTTGTTGGCAGACCCAAGATGCACCATTGTTGTGCAGATACCTGGATGGAGTGGCTTGTCAAATGCCAGAGTGACTATTTTTGGTGATATATACCCTCTT
CCAGAGGATCAACAGGAATGGGCTCACAAGCAATACATAGCTAAGCATCAACAAGGACCTTCTCAACAGTGGGGAAATTTTTACTACTTCAGGATGCAAGACATCAGTGA
CATTTATTTCATCGGAGGCTTCGGGACTGTTGCGTGGGTGGATGTGAAGGAGTACGAGGCCCTTCAACCTGATAAGATTGCAGTTGACGGAGGCGAGCAAAGCCTTAAGG
AATTAAACGCGATGTTCTCGAAACCTCTGAAAGAGCTGCTATCAGCTGAAAGCGAGGTAGACGATGCCGCCTTAATATCAATAGACAGCAAGGGAATCGATATTCGAGTC
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AGTATGCAATTTTCAAACATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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ATTAACGTTTATACGTCGATTTCCTGCTACTGCCCGTATCCTCTGTGATTTCTCCATGGAAGCGCTAGCAAGCTCTGTGACCATTCCCAAGTTTCCAGAGGCATACACTC
CTTCTTTGTTCAGGAACCCGACCAAGCGAACTGGTTTTCTCAGAATCAACGATTCTACTACTTTTGGTGGCCTTCGTGCTCTCTCTGGCGAAGCTGAAGAGGCTAAACCA
TCTGATAATAGATTTGGACTCTTTTCCGAAGAAGATGTATCTTTTCCCGAGGATGAACTAAATTTTACACAAAGCAATGAAAAGAATGCAAATGAGCGTTTAAAGGTGGA
TGCATCTCTTACTGCTCCATCTGGCAGTGGAACTAGAGCTGGTCTTTTCAGAACACCAATATCGGGTGGTGTGCAGAGTGCAACCTCAGCGCATGGTCTACCCAGACCGG
CCTTAGCTGTCCGCAATCTCATGGAACAGGCCAGATTTGCTCATTTGTGCACTGTGATGTCTCGGATGCACCACCGCAGACAAGGATACCCATTTGGTTCTTTGGTAGAT
TTTGCAACTGACTCCATGGGCCATCCAATTTTTTCTTTTTCACCTCTGGCCATTCATACCCGGAATTTGTTGGCAGACCCAAGATGCACCATTGTTGTGCAGATACCTGG
ATGGAGTGGCTTGTCAAATGCCAGAGTGACTATTTTTGGTGATATATACCCTCTTCCAGAGGATCAACAGGAATGGGCTCACAAGCAATACATAGCTAAGCATCAACAAG
GACCTTCTCAACAGTGGGGAAATTTTTACTACTTCAGGATGCAAGACATCAGTGACATTTATTTCATCGGAGGCTTCGGGACTGTTGCGTGGGTGGATGTGAAGGAGTAC
GAGGCCCTTCAACCTGATAAGATTGCAGTTGACGGAGGCGAGCAAAGCCTTAAGGAATTAAACGCGATGTTCTCGAAACCTCTGAAAGAGCTGCTATCAGCTGAAAGCGA
GGTAGACGATGCCGCCTTAATATCAATAGACAGCAAGGGAATCGATATTCGAGTCCGCCAAGGAGCTCAGTTCAATGTCCAAAGGATATCCTTTGAAGGAGGGCATGCCG
TGGAAACGCTGGAGGAAGCCAAGGTTGCTCTTCGGAAGCTAATAAACAAAGGGGGAGTATGCAATTTTCAAACATAAGTTGGGTGCCAAAATAAAAGCATGTTGATGTTT
TATTTAGCAATAGATAGTCTTGATTAGCAGCAATAAGCCATTGTAGAGTTCTTGATGATGTTTTGTTACGTTCTTCCCTTACTACATATCTGGTTTTTATTGCATAAGTT
AATGTGACATCGCAAGAAGCGTGTTGAAAATGACTCAATAAATGTTCTGCAACAACTATTCGATGGCTCCTGATGCCATTTAATTTGTATTAGATTAGTGAAATTTAATA
TCATTATCTAAGTATTTACTTTCTTTTTCAAGTATATAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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PISGGVQSATSAHGLPRPALAVRNLMEQARFAHLCTVMSRMHHRRQGYPFGSLVDFATDSMGHPIFSFSPLAIHTRNLLADPRCTIVVQIPGWSGLSNARVTIFGDIYPL
PEDQQEWAHKQYIAKHQQGPSQQWGNFYYFRMQDISDIYFIGGFGTVAWVDVKEYEALQPDKIAVDGGEQSLKELNAMFSKPLKELLSAESEVDDAALISIDSKGIDIRV
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