; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg19104 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg19104
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionSecretory carrier-associated membrane protein
Genome locationCarg_Chr11:12377700..12381577
RNA-Seq ExpressionCarg19104
SyntenyCarg19104
Gene Ontology termsGO:0015031 - protein transport (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0030658 - transport vesicle membrane (cellular component)
GO:0032588 - trans-Golgi network membrane (cellular component)
GO:0055038 - recycling endosome membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR007273 - SCAMP


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6589201.1 Secretory carrier-associated membrane protein 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.5e-12799.57Show/hide
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KAG7022901.1 Secretory carrier-associated membrane protein 1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.0e-147100Show/hide
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XP_022930790.1 secretory carrier-associated membrane protein 1-like [Cucurbita moschata]3.5e-12799.57Show/hide
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XP_022988881.1 secretory carrier-associated membrane protein 1-like [Cucurbita maxima]2.3e-12698.72Show/hide
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XP_023530612.1 secretory carrier-associated membrane protein 1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.5e-12799.57Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K2A3 Secretory carrier-associated membrane protein1.6e-11791.88Show/hide
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A0A1S3C095 Secretory carrier-associated membrane protein1.4e-11691.03Show/hide
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A0A6J1D2M9 Secretory carrier-associated membrane protein1.4e-11891.88Show/hide
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A0A6J1ERX1 Secretory carrier-associated membrane protein1.7e-12799.57Show/hide
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A0A6J1JIH4 Secretory carrier-associated membrane protein1.1e-12698.72Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2YMP7 Putative secretory carrier-associated membrane protein 11.8e-8968.9Show/hide
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Q7F613 Secretory carrier-associated membrane protein 21.2e-9072.15Show/hide
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        FFP+IH+DI+NEIPIHLQ +QY+AF++LLGL  CL WNIIA T AWI G G  IW LAIIY ISGVPGAYV WYRPLY A RT+SALKFGWFFL Y IHI
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         FC++SAVAPP  FKGKSL GILPAID++ +NA+VG+
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Q9LR68 Secretory carrier-associated membrane protein 23.5e-9373.31Show/hide
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        M+R+D NPF D+++NPF+N  +  V PA  S L PLP E YDRGAT+DIPLD+  DL+AKE ELQAKE ELK++EQELKRREDAIAR G+VIEEKNWP F
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        FPLIH+DI NEIPIHLQ +QYVAFTTLLGLV CL WNI+AVT AWI GEGPTIW L+IIY ++GVPGAYV WYRPLYRATRTDSALKFG FF  Y  HI+
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        FC F+AVAPP+IF+GKSLTG LPAI+LL++NA VG+
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Q9M5P2 Secretory carrier-associated membrane protein 35.0e-9273.33Show/hide
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        +RYD NPF  +++VNPF+N  A GV PA  SRLSPLP E   +D G T+DIPLD A  +DLK KEKELQAKEAELK+REQ+LKR+EDA ARAGIVIE KN
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        +HI+FCVF+AVAPP++FKGKSL GILPAID+LS  A+VG+
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Q9SKT3 Secretory carrier-associated membrane protein 14.1e-10279.15Show/hide
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        MSRY S+ FDD ++NPF+N  +  V  A S+LSPLP E YDRGAT+DIPLD+ KDLKAKEKEL+ KEAELK+REQE+KR+EDAIA+AGIVIEEKNWPPFF
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        PLIH+DI+NEIPIHLQ +QYVAFT++LGLVVCL WNI+AVTTAWI GEGPTIWFLAIIY ISGVPGAYV WYRPLYRA RTDSALKFGWFF  Y  HI+F
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        CVF+AVAPPIIFKGKSLTGILPAID+LS N LVG+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G03550.1 Secretory carrier membrane protein (SCAMP) family protein2.5e-9473.31Show/hide
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        M+R+D NPF D+++NPF+N  +  V PA  S L PLP E YDRGAT+DIPLD+  DL+AKE ELQAKE ELK++EQELKRREDAIAR G+VIEEKNWP F
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        FPLIH+DI NEIPIHLQ +QYVAFTTLLGLV CL WNI+AVT AWI GEGPTIW L+IIY ++GVPGAYV WYRPLYRATRTDSALKFG FF  Y  HI+
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        FC F+AVAPP+IF+GKSLTG LPAI+LL++NA VG+
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AT1G11180.1 Secretory carrier membrane protein (SCAMP) family protein1.2e-8568.75Show/hide
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        RYD N FD  D+VNPF+N G+     + SRLSPLP E   +  G T+DIPLD     A+DLK KEKELQAKEA+L++REQ+LKR++DA ARAGIVIE KN
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        WP FFPLIH+DIANEI + LQ +QY+AF T LGLV+ L WNIIAVTTAWI GEG TIW LA+IY ISGVPG YV WYRPLYRA R+DSA  FGWFFL Y 
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        +HI FC+F+AVAPPI+FKGKSL GILPAID+LS+ ALVG+
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AT1G61250.1 secretory carrier 33.5e-9373.33Show/hide
Query:  SRYDSNPF--DDDVNPFSNSGAGGVQPAP-SRLSPLPHET--YDRGATIDIPLDTA--KDLKAKEKELQAKEAELKKREQELKRREDAIARAGIVIEEKN
        +RYD NPF  +++VNPF+N  A GV PA  SRLSPLP E   +D G T+DIPLD A  +DLK KEKELQAKEAELK+REQ+LKR+EDA ARAGIVIE KN
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Query:  WPPFFPLIHNDIANEIPIHLQNVQYVAFTTLLGLVVCLSWNIIAVTTAWINGEGPTIWFLAIIYLISGVPGAYVGWYRPLYRATRTDSALKFGWFFLVYS
        WPPFFPLIH+DIANEIP+HLQ +QYV F T LGLV+CL WNIIAVTTAWI GEG TIW LA+IY I+GVPG YV WYRPLYRA RTDSAL FGWFFL Y 
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Query:  IHISFCVFSAVAPPIIFKGKSLTGILPAIDLLSSNALVGV
        +HI+FCVF+AVAPP++FKGKSL GILPAID+LS  A+VG+
Subjt:  IHISFCVFSAVAPPIIFKGKSLTGILPAIDLLSSNALVGV

AT1G61250.2 secretory carrier 33.5e-9373.33Show/hide
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        +RYD NPF  +++VNPF+N  A GV PA  SRLSPLP E   +D G T+DIPLD A  +DLK KEKELQAKEAELK+REQ+LKR+EDA ARAGIVIE KN
Subjt:  SRYDSNPF--DDDVNPFSNSGAGGVQPAP-SRLSPLPHET--YDRGATIDIPLDTA--KDLKAKEKELQAKEAELKKREQELKRREDAIARAGIVIEEKN

Query:  WPPFFPLIHNDIANEIPIHLQNVQYVAFTTLLGLVVCLSWNIIAVTTAWINGEGPTIWFLAIIYLISGVPGAYVGWYRPLYRATRTDSALKFGWFFLVYS
        WPPFFPLIH+DIANEIP+HLQ +QYV F T LGLV+CL WNIIAVTTAWI GEG TIW LA+IY I+GVPG YV WYRPLYRA RTDSAL FGWFFL Y 
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Query:  IHISFCVFSAVAPPIIFKGKSLTGILPAIDLLSSNALVGV
        +HI+FCVF+AVAPP++FKGKSL GILPAID+LS  A+VG+
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AT2G20840.1 Secretory carrier membrane protein (SCAMP) family protein2.9e-10379.15Show/hide
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        MSRY S+ FDD ++NPF+N  +  V  A S+LSPLP E YDRGAT+DIPLD+ KDLKAKEKEL+ KEAELK+REQE+KR+EDAIA+AGIVIEEKNWPPFF
Subjt:  MSRYDSNPFDD-DVNPFSNSGAGGVQPAPSRLSPLPHETYDRGATIDIPLDTAKDLKAKEKELQAKEAELKKREQELKRREDAIARAGIVIEEKNWPPFF

Query:  PLIHNDIANEIPIHLQNVQYVAFTTLLGLVVCLSWNIIAVTTAWINGEGPTIWFLAIIYLISGVPGAYVGWYRPLYRATRTDSALKFGWFFLVYSIHISF
        PLIH+DI+NEIPIHLQ +QYVAFT++LGLVVCL WNI+AVTTAWI GEGPTIWFLAIIY ISGVPGAYV WYRPLYRA RTDSALKFGWFF  Y  HI+F
Subjt:  PLIHNDIANEIPIHLQNVQYVAFTTLLGLVVCLSWNIIAVTTAWINGEGPTIWFLAIIYLISGVPGAYVGWYRPLYRATRTDSALKFGWFFLVYSIHISF

Query:  CVFSAVAPPIIFKGKSLTGILPAIDLLSSNALVGV
        CVF+AVAPPIIFKGKSLTGILPAID+LS N LVG+
Subjt:  CVFSAVAPPIIFKGKSLTGILPAIDLLSSNALVGV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTCGATACGATTCCAATCCTTTTGACGATGACGTTAATCCATTTTCTAATTCTGGAGCTGGAGGTGTTCAACCCGCACCCTCCAGGCTCTCACCTCTTCCCCATGA
AACTTACGATCGTGGTGCAACGATTGACATTCCTCTCGATACTGCAAAGGATTTGAAAGCTAAGGAGAAGGAGCTTCAAGCCAAAGAAGCTGAATTAAAGAAGAGGGAAC
AGGAATTAAAACGGAGGGAAGATGCTATTGCAAGAGCTGGAATTGTTATAGAGGAGAAAAATTGGCCACCATTTTTTCCCCTTATCCATAATGATATTGCAAATGAAATA
CCGATCCATCTACAGAACGTCCAGTATGTTGCCTTCACAACATTGTTGGGTTTGGTTGTGTGCCTTTCGTGGAACATTATAGCAGTTACTACTGCTTGGATCAATGGTGA
AGGTCCAACAATATGGTTTCTTGCTATTATCTACCTCATATCAGGTGTACCTGGAGCATATGTCGGGTGGTATCGTCCTCTCTATCGTGCTACAAGGACTGATAGTGCTC
TGAAGTTCGGGTGGTTTTTCCTAGTTTACTCGATTCATATTAGCTTCTGCGTCTTTTCTGCAGTTGCTCCTCCCATTATATTTAAGGGGAAATCTCTTACAGGGATCTTA
CCGGCTATAGACTTGTTGAGTTCTAATGCTTTGGTTGGGGTAGGTTCTATTCGAGTTTGCATTTCTGTGTGTGTTTTGAAATGTCACATATTTTGTAAGATTACCCAATA
TATAGGTGTTCTAAATTATAACCTAGCATTCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTCATTAGTTTTTCCTTTTTTTCTTTCAGATAATTTGTTTAGATCTTCTTCACAATGAGTCGATACGATTCCAATCCTTTTGACGATGACGTTAATCCATTTTCTAATTC
TGGAGCTGGAGGTGTTCAACCCGCACCCTCCAGGCTCTCACCTCTTCCCCATGAAACTTACGATCGTGGTGCAACGATTGACATTCCTCTCGATACTGCAAAGGATTTGA
AAGCTAAGGAGAAGGAGCTTCAAGCCAAAGAAGCTGAATTAAAGAAGAGGGAACAGGAATTAAAACGGAGGGAAGATGCTATTGCAAGAGCTGGAATTGTTATAGAGGAG
AAAAATTGGCCACCATTTTTTCCCCTTATCCATAATGATATTGCAAATGAAATACCGATCCATCTACAGAACGTCCAGTATGTTGCCTTCACAACATTGTTGGGTTTGGT
TGTGTGCCTTTCGTGGAACATTATAGCAGTTACTACTGCTTGGATCAATGGTGAAGGTCCAACAATATGGTTTCTTGCTATTATCTACCTCATATCAGGTGTACCTGGAG
CATATGTCGGGTGGTATCGTCCTCTCTATCGTGCTACAAGGACTGATAGTGCTCTGAAGTTCGGGTGGTTTTTCCTAGTTTACTCGATTCATATTAGCTTCTGCGTCTTT
TCTGCAGTTGCTCCTCCCATTATATTTAAGGGGAAATCTCTTACAGGGATCTTACCGGCTATAGACTTGTTGAGTTCTAATGCTTTGGTTGGGGTAGGTTCTATTCGAGT
TTGCATTTCTGTGTGTGTTTTGAAATGTCACATATTTTGTAAGATTACCCAATATATAGGTGTTCTAAATTATAACCTAGCATTCTAGCGAGATGGGCCGTAAGAAATGA
TA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSRYDSNPFDDDVNPFSNSGAGGVQPAPSRLSPLPHETYDRGATIDIPLDTAKDLKAKEKELQAKEAELKKREQELKRREDAIARAGIVIEEKNWPPFFPLIHNDIANEI
PIHLQNVQYVAFTTLLGLVVCLSWNIIAVTTAWINGEGPTIWFLAIIYLISGVPGAYVGWYRPLYRATRTDSALKFGWFFLVYSIHISFCVFSAVAPPIIFKGKSLTGIL
PAIDLLSSNALVGVGSIRVCISVCVLKCHIFCKITQYIGVLNYNLAF