; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg19138 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg19138
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionmultiprotein bridging factor 1B
Genome locationCarg_Chr11:12558736..12562291
RNA-Seq ExpressionCarg19138
SyntenyCarg19138
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001387 - Cro/C1-type helix-turn-helix domain
IPR010982 - Lambda repressor-like, DNA-binding domain superfamily
IPR013729 - Multiprotein bridging factor 1, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022148069.1 multiprotein-bridging factor 1a [Momordica charantia]6.6e-6495.77Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIETLKKSNAGTNKAASS TSLNTRKLDDETENL+H++VPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

XP_022930773.1 multiprotein-bridging factor 1a [Cucurbita moschata]4.1e-66100Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

XP_022952433.1 multiprotein-bridging factor 1b-like [Cucurbita moschata]4.3e-6394.37Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPISQDWEP+VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETL+KSNAGTNKAASS TSLNTRKLDDETENL+H++VPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

XP_023532017.1 multiprotein-bridging factor 1a [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.2e-6699.3Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

XP_038888605.1 multiprotein-bridging factor 1b [Benincasa hispida]1.5e-6395.77Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASS TSLNTRKLDDETENL+H++VPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1D2X2 multiprotein-bridging factor 1a3.2e-6495.77Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIETLKKSNAGTNKAASS TSLNTRKLDDETENL+H++VPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

A0A6J1EWB8 multiprotein-bridging factor 1a2.0e-66100Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

A0A6J1GKJ7 multiprotein-bridging factor 1b-like2.1e-6394.37Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPISQDWEP+VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETL+KSNAGTNKAASS TSLNTRKLDDETENL+H++VPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

A0A6J1HZG6 multiprotein-bridging factor 1b-like7.8e-6394.37Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIET +KSNAGTNKAASS TSLNTRKLDDETENL+H++VPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

A0A6J1JEK2 multiprotein-bridging factor 1a2.0e-66100Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6GPQ6 Endothelial differentiation-related factor 1 homolog7.9e-2854.14Show/hide
Query:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLAQLINEK
        DW+ V V+RKK P AA  K ++A+ AA+R G E+ET KK +AG NK  +   + NT KLD ETE L H++VP E+ K I Q R  K +TQ  LA  INEK
Subjt:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLAQLINEK

Query:  PQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK
        PQ+I +YE GKAIPN Q++ K+ER +G KLRGK
Subjt:  PQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK

Q6PBY3 Endothelial differentiation-related factor 1 homolog1.3e-2755.3Show/hide
Query:  DWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLAQLINEKP
        DW+ V + +K  +AA  K ++AV AA+R G  +ET KK  AG NK      + NT KLD ETE LSH++VP E+ K I Q R +K LTQ  LA  INEKP
Subjt:  DWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLAQLINEKP

Query:  QIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK
        QII EYE GKAIPN Q++ K+ERA+G KLRGK
Subjt:  QIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK

Q9LV58 Multiprotein-bridging factor 1c2.7e-2847.48Show/hide
Query:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGT--SLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLA
        G ++QDWEPVV+ K    +   +D KAVNAA R G  ++T+KK +AG+NK   S     +NT+KL++ETE  + ++V  E++  I +AR +KK++Q+ LA
Subjt:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGT--SLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLA

Query:  QLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK
        + INE+ Q++QEYE+GKA+PNQ ++ K+E+ LG KLRGK
Subjt:  QLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK

Q9LXT3 Multiprotein-bridging factor 1b6.0e-6084.51Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPI+QDWEPVVIRK+APNAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K NAG+NKAASSGTSLNT+KLDD+TENLSH++VPTELKKAIMQAR +KKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LA LINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQI++KLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

Q9SJI8 Multiprotein-bridging factor 1a3.5e-6085.21Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPI+QDWEPVVIRKK  NAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K NAGTNKAASSGTSLNT+ LDD+TENL+HE+VPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQ+INEKPQ+IQEYESGKAIPNQQI++KLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42680.1 multiprotein bridging factor 1A2.5e-6185.21Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPI+QDWEPVVIRKK  NAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K NAGTNKAASSGTSLNT+ LDD+TENL+HE+VPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQ+INEKPQ+IQEYESGKAIPNQQI++KLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

AT3G24500.1 multiprotein bridging factor 1C1.9e-2947.48Show/hide
Query:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGT--SLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLA
        G ++QDWEPVV+ K    +   +D KAVNAA R G  ++T+KK +AG+NK   S     +NT+KL++ETE  + ++V  E++  I +AR +KK++Q+ LA
Subjt:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGT--SLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLA

Query:  QLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK
        + INE+ Q++QEYE+GKA+PNQ ++ K+E+ LG KLRGK
Subjt:  QLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK

AT3G24500.2 multiprotein bridging factor 1C7.6e-1040.45Show/hide
Query:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGT--SLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQAR
        G ++QDWEPVV+ K    +   +D KAVNAA R G  ++T+KK +AG+NK   S     +NT+KL++ETE  + ++V  E++  + + R
Subjt:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGT--SLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQAR

AT3G58680.1 multiprotein bridging factor 1B4.2e-6184.51Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPI+QDWEPVVIRK+APNAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K NAG+NKAASSGTSLNT+KLDD+TENLSH++VPTELKKAIMQAR +KKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LA LINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQI++KLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTGGAATTGGACCCATTTCACAGGATTGGGAACCTGTTGTCATCAGGAAGAAGGCTCCCAACGCCGCCGCCAAGAAGGACGAGAAAGCTGTAAACGCCGCCCGCCG
CGCCGGTGCCGAGATCGAAACCTTAAAGAAATCTAATGCTGGAACAAATAAAGCTGCCTCTAGCGGTACCAGTTTGAATACCAGGAAGTTGGATGATGAGACAGAAAATC
TCTCTCATGAAAAGGTACCAACTGAGCTGAAGAAGGCCATTATGCAGGCTCGAACAGATAAGAAGCTCACTCAGTCTCAGCTTGCTCAATTGATCAATGAGAAGCCACAA
ATCATTCAGGAGTACGAATCTGGCAAAGCCATTCCAAATCAACAAATAATCACCAAGCTTGAGAGAGCTCTTGGAACTAAGCTTCGTGGAAAAAAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTCTATTTACTTTTCCCACTCATCTTCTAACCCTAAAGCTCGGCGGCAAATATTTTCATACCGCACAGAGAGTTGCAGAAACAGGTAGAGGAGACGAAAATGTCTGGAA
TTGGACCCATTTCACAGGATTGGGAACCTGTTGTCATCAGGAAGAAGGCTCCCAACGCCGCCGCCAAGAAGGACGAGAAAGCTGTAAACGCCGCCCGCCGCGCCGGTGCC
GAGATCGAAACCTTAAAGAAATCTAATGCTGGAACAAATAAAGCTGCCTCTAGCGGTACCAGTTTGAATACCAGGAAGTTGGATGATGAGACAGAAAATCTCTCTCATGA
AAAGGTACCAACTGAGCTGAAGAAGGCCATTATGCAGGCTCGAACAGATAAGAAGCTCACTCAGTCTCAGCTTGCTCAATTGATCAATGAGAAGCCACAAATCATTCAGG
AGTACGAATCTGGCAAAGCCATTCCAAATCAACAAATAATCACCAAGCTTGAGAGAGCTCTTGGAACTAAGCTTCGTGGAAAAAAGTAGGAGGGCTTATTATTAGGCCCT
TTGGTTATTATGTAAGTGGTGAATTTGGCTATAACAAGAGCTTTTGGCTTCAGATATTGTGTAGTGTGAATTGGCTTTACTTTGATTTCTCATGAACACACTTACATTTT
CAAGTCGTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSGTSLNTRKLDDETENLSHEKVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLAQLINEKPQ
IIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK