CuGenDBv2

Gene ID	Carg19251
Organism	Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description	ras-related protein Rab11D-like
Genome location	Carg_Chr19:8593960..8597089
RNA-Seq Expression	Carg19251
Synteny	Carg19251
Gene Ontology terms	GO:0005768 - endosome (cellular component) GO:0003924 - GTPase activity (molecular function) GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domains	IPR001806 - Small GTPase IPR005225 - Small GTP-binding protein domain IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0031553.1 ras-related protein Rab11D [Cucumis melo var. makuwa]

6.9e-113

95.43

Show/hide

Query:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
        MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSL+IDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRR T
Subjt:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST

Query:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
        FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDG+SFAERESLYFMETSALDATNVE+AFTEVLSQIYRIVSKRSVEA D GSAS+TLP+KGQ
Subjt:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ

Query:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS
        TIDVKDDSS+L+RIGCCSS
Subjt:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS

XP_004136835.1 ras-related protein Rab11D [Cucumis sativus]

9.0e-113

95.43

Show/hide

Query:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
        MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSL+IDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRR T
Subjt:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST

Query:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
        FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDG+SFAERESLYFMETSALDATNVE+AFTEVLSQIYRIVSKRSVEA D GSAS TLP+KGQ
Subjt:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ

Query:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS
        TIDVKDDSS+L+RIGCCSS
Subjt:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS

XP_022953053.1 ras-related protein Rab11D-like [Cucurbita moschata]

2.7e-117

100

Show/hide

Query:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
        MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
Subjt:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST

Query:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
        FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
Subjt:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ

Query:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS
        TIDVKDDSSILRRIGCCSS
Subjt:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS

XP_022969259.1 ras-related protein Rab11D-like [Cucurbita maxima]

5.1e-116

98.63

Show/hide

Query:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
        MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
Subjt:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST

Query:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
        FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVL+QIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLP+KG+
Subjt:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ

Query:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS
        TIDVKDDSSILRRIGCCSS
Subjt:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS

XP_023553765.1 ras-related protein Rab11D-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.9e-115

98.17

Show/hide

Query:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
        MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
Subjt:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST

Query:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
        FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASD GSAS+TLP+KGQ
Subjt:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ

Query:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS
        TIDVKDDSSILR+IGCCSS
Subjt:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0K737 Small GTP-binding protein

4.4e-113

95.43

Show/hide

Query:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
        MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSL+IDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRR T
Subjt:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST

Query:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
        FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDG+SFAERESLYFMETSALDATNVE+AFTEVLSQIYRIVSKRSVEA D GSAS TLP+KGQ
Subjt:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ

Query:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS
        TIDVKDDSS+L+RIGCCSS
Subjt:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS

A0A1S3C059 ras-related protein Rab11D

2.8e-112

94.52

Show/hide

Query:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
        MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSL+IDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRR T
Subjt:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST

Query:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
        FENAARWLKELR+HTDPNMVVMLIGNKCDLRHL+LVPTEDG+SFAERESLYFMETSALDATNVE+AFTEVLSQIYRIVSKRSVEA D GSAS+TLP KGQ
Subjt:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ

Query:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS
        TIDVKDDSS+L+RIGCCSS
Subjt:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS

A0A5A7SMX1 Ras-related protein Rab11D

3.3e-113

95.43

Show/hide

Query:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
        MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSL+IDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRR T
Subjt:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST

Query:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
        FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDG+SFAERESLYFMETSALDATNVE+AFTEVLSQIYRIVSKRSVEA D GSAS+TLP+KGQ
Subjt:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ

Query:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS
        TIDVKDDSS+L+RIGCCSS
Subjt:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS

A0A6J1GMB1 ras-related protein Rab11D-like

1.3e-117

100

Show/hide

Query:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
        MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
Subjt:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST

Query:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
        FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
Subjt:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ

Query:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS
        TIDVKDDSSILRRIGCCSS
Subjt:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS

A0A6J1I228 ras-related protein Rab11D-like

2.5e-116

98.63

Show/hide

Query:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
        MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
Subjt:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST

Query:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
        FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVL+QIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLP+KG+
Subjt:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ

Query:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS
        TIDVKDDSSILRRIGCCSS
Subjt:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

P28185 Ras-related protein RABA1a

7.2e-97

Show/hide

Query:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
        MAGY+  +EYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFT+N+FNLESKSTIGVEFATK+  ++GKV+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALL+YDVTR +T
Subjt:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST

Query:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
        FENAARWL+ELR HTDPN+VVMLIGNKCDLRHL+ V TE+ ++FAERESLYFMETSALDATNVE AFTEVL+QI++IVSKRSV   D G  S  LP KG+
Subjt:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ

Query:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS
        TI+VK+D S+L+R+GCCS+
Subjt:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS

Q01111 Ras-related protein YPT3

2.6e-94

78.08

Show/hide

Query:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
        MAGY+  DEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFT+N+FNLESKSTIGVEFATKSL+ID KVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTR  T
Subjt:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST

Query:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
        +EN  RWLKELRDHTDPN+VVMLIGNK DLRHL+ V T++ +  AERE LYFMETSAL+ATNVE AFTE L+QIYRIVSK++VEA D G+ S + P KG+
Subjt:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ

Query:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS
        TI++KD+ S  ++ GCCSS
Subjt:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS

Q39222 Ras-related protein RABA1b

1.7e-93

76.71

Show/hide

Query:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
        MAGY+  D+YDYLFK+VLIGDSGVGKSNLLSRFT+N+FNLESKSTIGVEFAT++L +DGKV+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRR+T
Subjt:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST

Query:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
        FEN  RWLKEL++HTDPN+VVML+GNK DLRHL+ VPTEDG+S+AE+ESL FMETSAL+ATNVE AF EVL+QIYRI SK+ VEA + G+ASV    KG+
Subjt:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ

Query:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS
         I+VK+D S L+++GCCS+
Subjt:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS

Q40194 Ras-related protein Rab11D

1.0e-103

85.39

Show/hide

Query:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
        M GY+  DEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFT+N+FNLESKSTIGVEFATK+L++D KV+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRR+T
Subjt:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST

Query:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
        FENAARWLKELRDHTDPN+VVMLIGNK DLRHL+ VPTEDG+SFAERESLYFMETSAL+ATNVE AFTEVL+QIYRIVSKR+VEA DSGS+S  LP+KGQ
Subjt:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ

Query:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS
        TI+VK+DSS+L+R GCCS+
Subjt:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS

Q40195 Ras-related protein Rab11E

7.7e-99

83.11

Show/hide

Query:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
        MAGYK  DEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRN+FNLESKSTIGVEFATKSL+IDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTR +T
Subjt:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST

Query:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
        FE A RWLKELRDHTDPN+VVMLIGNK DLRHL+ V TEDG++FAE+ESLYFMETSAL+ATNVE AF+EVL+QIYRIVSKR+VEA D  S SV +P++GQ
Subjt:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ

Query:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS
        TI+V +DSS+L R  CCS+
Subjt:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G06400.1 Ras-related small GTP-binding family protein

5.1e-98

Show/hide

Query:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
        MAGY+  +EYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFT+N+FNLESKSTIGVEFATK+  ++GKV+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALL+YDVTR +T
Subjt:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST

Query:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
        FENAARWL+ELR HTDPN+VVMLIGNKCDLRHL+ V TE+ ++FAERESLYFMETSALDATNVE AFTEVL+QI++IVSKRSV   D G  S  LP KG+
Subjt:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ

Query:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS
        TI+VK+D S+L+R+GCCS+
Subjt:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS

AT1G16920.1 RAB GTPase homolog A1B

1.2e-94

76.71

Show/hide

Query:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
        MAGY+  D+YDYLFK+VLIGDSGVGKSNLLSRFT+N+FNLESKSTIGVEFAT++L +DGKV+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRR+T
Subjt:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST

Query:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
        FEN  RWLKEL++HTDPN+VVML+GNK DLRHL+ VPTEDG+S+AE+ESL FMETSAL+ATNVE AF EVL+QIYRI SK+ VEA + G+ASV    KG+
Subjt:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ

Query:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS
         I+VK+D S L+++GCCS+
Subjt:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS

AT4G18800.1 RAB GTPase homolog A1D

1.8e-90

74.89

Show/hide

Query:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
        MAGY+  D+YDYLFK+VLIGDSGVGKSNLLSRFTRN+F+LESKSTIGVEFAT+SL+++ KVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTR ST
Subjt:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST

Query:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
        FEN  RWL+ELRDHTDPN+VVML+GNK DLRHL+ V TED +SFAE ESLYFMETSAL++TNVE AF+EVL+QIY +VSK+++EA   G  S  +P+KG+
Subjt:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ

Query:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS
         IDV  D S +++ GCCS+
Subjt:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS

AT5G45750.1 RAB GTPase homolog A1C

4.6e-91

74.89

Show/hide

Query:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
        MAGY+  DEYDYLFK+VLIGDSGVGKSNLLSRFT+N+F+LESKSTIGVEFAT+SL++D KVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTR ST
Subjt:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST

Query:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
        FEN   WLKELR+HTDPN+VVML+GNK DLRHL+ V TED +SFAE+ESLYFMETSAL+ATNVE AF EVL+QI+ IVSK+++EA+   S S  +P+KG 
Subjt:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ

Query:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS
         ID+  D S +++ GCCS+
Subjt:  TIDVKDDSSILRRIGCCSS

AT5G60860.1 RAB GTPase homolog A1F

1.8e-87

71.95

Show/hide

Query:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST
        MA Y+  DEYDYLFK+VLIGDSGVGKSNLLSRFTRN+F+LESKSTIGVEFAT+S+ +D K++KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTR  T
Subjt:  MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRST

Query:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ
        FEN  RWLKELRDHTD N+V+M +GNK DLRHL  V TED ++FAERE+ +FMETSAL++ NVE AFTEVLSQIYR+VS+++++  D  +A   LP KGQ
Subjt:  FENAARWLKELRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQ

Query:  TIDV--KDDSSILRRIGCCSS
        TI+V  KDD S ++++GCCS+
Subjt:  TIDV--KDDSSILRRIGCCSS

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGGGTTATAAGGGCCATGATGAATATGATTACTTGTTTAAGCTGGTTTTGATCGGTGATTCTGGGGTAGGCAAATCAAACCTGCTCTCGAGGTTTACCAGGAACCA
ATTTAATTTAGAATCGAAGTCTACGATTGGGGTTGAGTTTGCTACCAAGAGTTTGGATATTGATGGGAAGGTAATCAAGGCTCAGATTTGGGATACTGCGGGACAAGAAA
GGTACCGAGCGATAACCAGCGCTTACTACCGAGGTGCAGTAGGTGCTTTGCTCGTGTACGATGTCACTCGACGTTCAACGTTTGAAAATGCAGCAAGATGGTTAAAGGAA
TTGAGGGATCACACAGATCCAAACATGGTAGTAATGCTCATTGGCAACAAATGTGATTTACGCCACCTTATTCTTGTTCCAACAGAAGATGGACAATCCTTTGCTGAGAG
GGAGTCTTTGTACTTCATGGAGACCTCTGCACTCGATGCAACAAACGTCGAAACCGCTTTCACCGAGGTGCTCTCTCAAATATATCGAATCGTAAGCAAGAGATCAGTCG
AGGCAAGCGATAGCGGAAGTGCTTCAGTGACCCTCCCAACAAAAGGCCAGACAATAGATGTCAAGGACGACTCATCGATTCTGAGGAGGATCGGATGTTGCTCCAGCTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

GTTAAAATTAGTGACGAATTCATTAATATTAAACGGAGATTAAAAATTTAATGGTTTATTTAAGGTTTTATGTTCTAAATGGATGGAAGTTTCAGGTACAGTGCAAAATT
CAAATTCACTGTTCTATGCTTTACTTTTCCATAGCTCCCGACCAAAGAACTCCACTAAAACGGAGGGAATAGTTTTACCTTATATATATATAAATGCTTTTGGCATACTC
TCCTTCTTGGAGTTCCAAATTTTCTTCGGTTCGAAGAACGAAGTGGGAGGCTTAGAGGAAGTCTTATGGCGGGTTATAAGGGCCATGATGAATATGATTACTTGTTTAAG
CTGGTTTTGATCGGTGATTCTGGGGTAGGCAAATCAAACCTGCTCTCGAGGTTTACCAGGAACCAATTTAATTTAGAATCGAAGTCTACGATTGGGGTTGAGTTTGCTAC
CAAGAGTTTGGATATTGATGGGAAGGTAATCAAGGCTCAGATTTGGGATACTGCGGGACAAGAAAGGTACCGAGCGATAACCAGCGCTTACTACCGAGGTGCAGTAGGTG
CTTTGCTCGTGTACGATGTCACTCGACGTTCAACGTTTGAAAATGCAGCAAGATGGTTAAAGGAATTGAGGGATCACACAGATCCAAACATGGTAGTAATGCTCATTGGC
AACAAATGTGATTTACGCCACCTTATTCTTGTTCCAACAGAAGATGGACAATCCTTTGCTGAGAGGGAGTCTTTGTACTTCATGGAGACCTCTGCACTCGATGCAACAAA
CGTCGAAACCGCTTTCACCGAGGTGCTCTCTCAAATATATCGAATCGTAAGCAAGAGATCAGTCGAGGCAAGCGATAGCGGAAGTGCTTCAGTGACCCTCCCAACAAAAG
GCCAGACAATAGATGTCAAGGACGACTCATCGATTCTGAGGAGGATCGGATGTTGCTCCAGCTAAGAAAAATAAGCTTCGAGCCTGACTCGGAATTACAGCAAGCAACAT
TTCTTCTGTGTATATAGTTGTATTGTATCACTTTCTGTAGATTAAGAGCTCGATCGTTCGTGATGGTTGTTTCAAAGGCGCCTTCCATATAAGTGTGGAGTTTGCTCTTC
TTTCAATTCGAACATTTGAAACCTGAAATTTACCGTTGTCATGTTTACTCTTTGGTATCAAACCTCCAAAGCGAAAAAGAAATTATTAATTTCGTATATATCTTTGG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAGYKGHDEYDYLFKLVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNQFNLESKSTIGVEFATKSLDIDGKVIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRRSTFENAARWLKE
LRDHTDPNMVVMLIGNKCDLRHLILVPTEDGQSFAERESLYFMETSALDATNVETAFTEVLSQIYRIVSKRSVEASDSGSASVTLPTKGQTIDVKDDSSILRRIGCCSS

Carg19251 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome