; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg19254 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg19254
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionFibrous sheath-interacting protein
Genome locationCarg_Chr03:9637370..9638258
RNA-Seq ExpressionCarg19254
SyntenyCarg19254
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601602.1 hypothetical protein SDJN03_06835, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.5e-86100Show/hide
Query:  MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
        MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
Subjt:  MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG

Query:  RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE
        RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE
Subjt:  RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE

KAG7034705.1 hypothetical protein SDJN02_04435, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.7e-87100Show/hide
Query:  MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
        MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
Subjt:  MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG

Query:  RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPEVIIP
        RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPEVIIP
Subjt:  RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPEVIIP

XP_022956497.1 uncharacterized protein LOC111458218 [Cucurbita moschata]9.5e-86100Show/hide
Query:  MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
        MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
Subjt:  MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG

Query:  RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE
        RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE
Subjt:  RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE

XP_022998631.1 uncharacterized protein LOC111493214 [Cucurbita maxima]2.8e-8599.4Show/hide
Query:  MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
        MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTR RGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
Subjt:  MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG

Query:  RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE
        RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE
Subjt:  RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE

XP_023527821.1 uncharacterized protein LOC111790920 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.6e-8095.18Show/hide
Query:  MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
        MAASRTVLRSATIFLTEPSRP+LVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCI+ NTR  GF FPKRTVLTCSYDETQSTS SN DDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
Subjt:  MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG

Query:  RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE
        RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE
Subjt:  RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DC16 uncharacterized protein LOC111019651 isoform X13.0e-6984.94Show/hide
Query:  MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
        MAASRTVLRSA+IFL EP RPV   RASSS +LGT R+FTHRL C     R RGF F KRTVL CS+DETQSTSSSNQD QGPPQEAVLKAISEVSKTEG
Subjt:  MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG

Query:  RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE
        RVGHTTNMV+GGTVTDDS+NEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQ+PIPE
Subjt:  RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE

A0A6J1FZV2 uncharacterized protein LOC1114494011.5e-6883.83Show/hide
Query:  MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRA-SSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTE
        MAASR VLRSA+IFLTEPSRP    RA SSSF+LGTRR+FTHRL C  W++R RGF FP+RT L CS DETQ TSSS+QD QGPPQEAVLKAISEVSKTE
Subjt:  MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRA-SSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTE

Query:  GRVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE
        GRVGHTTNMVLGGTVTDDS+NEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGG DFVQSMVVAVESV+Q+PIPE
Subjt:  GRVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE

A0A6J1GWI1 uncharacterized protein LOC1114582184.6e-86100Show/hide
Query:  MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
        MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
Subjt:  MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG

Query:  RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE
        RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE
Subjt:  RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE

A0A6J1HTC4 uncharacterized protein LOC1114664081.9e-6883.23Show/hide
Query:  MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRA-SSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTE
        MAASR VLRSA+IFLTEPSRP    RA SSSF+LGTRR+F HRL C  W++R RGF FP+RTVL CS D+TQ TSSS+QD QGPPQEAVLKAISEVSKTE
Subjt:  MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRA-SSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTE

Query:  GRVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE
        GRVGHTTNMVLGGTVTDDS+NEWI LDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESV+Q+PIPE
Subjt:  GRVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE

A0A6J1KAN5 uncharacterized protein LOC1114932141.3e-8599.4Show/hide
Query:  MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
        MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTR RGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
Subjt:  MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEG

Query:  RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE
        RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE
Subjt:  RVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G27385.1 unknown protein1.3e-3551.14Show/hide
Query:  ASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTF----------THRLYCISWNTRVRGFL-FPKR-TVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLK
        A +T+LRS  +F++E  R           + G RR F           H L+    +    GF   P+R T L CS+++        Q DQGPPQEAVLK
Subjt:  ASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTF----------THRLYCISWNTRVRGFL-FPKR-TVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLK

Query:  AISEVSKTEGRVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE
        AISEVSKT+GRVG TTNM++GGTV DDS+ +W+ LDQKVN+YP  RGFTAIGTGG+DFV +MVVAVESV+ + IPE
Subjt:  AISEVSKTEGRVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE

AT1G27385.2 unknown protein1.2e-3350.57Show/hide
Query:  ASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTF----------THRLYCISWNTRVRGFL-FPKR-TVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLK
        A +T+LRS  +F++E  R           + G RR F           H L+    +    GF   P+R T L CS+++        Q DQGPPQEAVLK
Subjt:  ASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTF----------THRLYCISWNTRVRGFL-FPKR-TVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLK

Query:  AISEVSKTEGRVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE
        AIS VSKT+GRVG TTNM++GGTV DDS+ +W+ LDQKVN+YP  RGFTAIGTGG+DFV +MVVAVESV+ + IPE
Subjt:  AISEVSKTEGRVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE

AT1G27385.3 unknown protein1.3e-3551.14Show/hide
Query:  ASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTF----------THRLYCISWNTRVRGFL-FPKR-TVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLK
        A +T+LRS  +F++E  R           + G RR F           H L+    +    GF   P+R T L CS+++        Q DQGPPQEAVLK
Subjt:  ASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTF----------THRLYCISWNTRVRGFL-FPKR-TVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLK

Query:  AISEVSKTEGRVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE
        AISEVSKT+GRVG TTNM++GGTV DDS+ +W+ LDQKVN+YP  RGFTAIGTGG+DFV +MVVAVESV+ + IPE
Subjt:  AISEVSKTEGRVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE

AT1G27385.4 unknown protein1.2e-3350.57Show/hide
Query:  ASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTF----------THRLYCISWNTRVRGFL-FPKR-TVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLK
        A +T+LRS  +F++E  R           + G RR F           H L+    +    GF   P+R T L CS+++        Q DQGPPQEAVLK
Subjt:  ASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTF----------THRLYCISWNTRVRGFL-FPKR-TVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLK

Query:  AISEVSKTEGRVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE
        AIS VSKT+GRVG TTNM++GGTV DDS+ +W+ LDQKVN+YP  RGFTAIGTGG+DFV +MVVAVESV+ + IPE
Subjt:  AISEVSKTEGRVGHTTNMVLGGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGCTAGCCGGACTGTGTTGCGTTCTGCCACAATATTCTTAACGGAGCCATCGCGGCCCGTTCTCGTCGGCCGTGCTTCTTCCTCCTTCTCGCTCGGAACCAGGCG
AACGTTCACTCACAGATTGTATTGCATTTCGTGGAACACTAGGGTTCGAGGATTTCTCTTTCCGAAACGAACTGTTCTGACTTGCTCCTATGATGAAACTCAATCGACGT
CGTCGTCTAATCAGGACGACCAGGGCCCTCCTCAGGAGGCTGTTTTGAAGGCAATTTCAGAGGTATCCAAGACAGAAGGGAGGGTTGGCCATACCACAAATATGGTACTT
GGAGGAACAGTGACTGACGATTCTTCCAATGAGTGGATCGCTTTGGATCAAAAGGTGAACTCGTACCCGGGCGTTAGAGGTTTTACGGCAATTGGAACTGGGGGAGATGA
TTTTGTGCAGTCTATGGTTGTTGCTGTGGAGTCTGTCCTCCAAAAGCCAATTCCTGAGGTGATTATTCCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCGCTAGCCGGACTGTGTTGCGTTCTGCCACAATATTCTTAACGGAGCCATCGCGGCCCGTTCTCGTCGGCCGTGCTTCTTCCTCCTTCTCGCTCGGAACCAGGCG
AACGTTCACTCACAGATTGTATTGCATTTCGTGGAACACTAGGGTTCGAGGATTTCTCTTTCCGAAACGAACTGTTCTGACTTGCTCCTATGATGAAACTCAATCGACGT
CGTCGTCTAATCAGGACGACCAGGGCCCTCCTCAGGAGGCTGTTTTGAAGGCAATTTCAGAGGTATCCAAGACAGAAGGGAGGGTTGGCCATACCACAAATATGGTACTT
GGAGGAACAGTGACTGACGATTCTTCCAATGAGTGGATCGCTTTGGATCAAAAGGTGAACTCGTACCCGGGCGTTAGAGGTTTTACGGCAATTGGAACTGGGGGAGATGA
TTTTGTGCAGTCTATGGTTGTTGCTGTGGAGTCTGTCCTCCAAAAGCCAATTCCTGAGGTGATTATTCCATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAASRTVLRSATIFLTEPSRPVLVGRASSSFSLGTRRTFTHRLYCISWNTRVRGFLFPKRTVLTCSYDETQSTSSSNQDDQGPPQEAVLKAISEVSKTEGRVGHTTNMVL
GGTVTDDSSNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQKPIPEVIIP