; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg19423 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg19423
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionSplicing factor YJU2
Genome locationCarg_Chr16:10238244..10241340
RNA-Seq ExpressionCarg19423
SyntenyCarg19423
Gene Ontology termsGO:0000349 - generation of catalytic spliceosome for first transesterification step (biological process)
GO:0071006 - U2-type catalytic step 1 spliceosome (cellular component)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR007590 - Saf4/Yju2 protein
IPR043701 - Splicing factor Yju2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6577830.1 Splicing factor YJU2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.5e-17598.78Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
        MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED    TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV

Query:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
        ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
Subjt:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF

Query:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV
        NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV
Subjt:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV

Query:  ENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED
        ENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED
Subjt:  ENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED

KAG7015867.1 Coiled-coil domain-containing protein 94-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.6e-177100Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKEDTYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTVESGA
        MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKEDTYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTVESGA
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKEDTYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTVESGA

Query:  TRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVFNKSN
        TRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVFNKSN
Subjt:  TRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVFNKSN

Query:  NYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARVENKQ
        NYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARVENKQ
Subjt:  NYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARVENKQ

Query:  SLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED
        SLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED
Subjt:  SLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED

XP_022923549.1 coiled-coil domain-containing protein 94 homolog [Cucurbita moschata]4.7e-17498.18Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
        MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED    TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV

Query:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
        ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSML ALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
Subjt:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF

Query:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV
        NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVL+ALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV
Subjt:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV

Query:  ENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED
        ENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED
Subjt:  ENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED

XP_022965295.1 coiled-coil domain-containing protein 94 homolog [Cucurbita maxima]1.5e-17297.26Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
        MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED    TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV

Query:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
        ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSML+ALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
Subjt:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF

Query:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV
        N SNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHST+NDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHAL GEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV
Subjt:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV

Query:  ENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED
        ENKQSLEVQ SDTNTGLESLCQYYASDED
Subjt:  ENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED

XP_023552633.1 coiled-coil domain-containing protein 94 homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.2e-17598.48Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
        MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED    TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV

Query:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
        ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
Subjt:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF

Query:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV
        NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV
Subjt:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV

Query:  ENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED
        ENKQSLEVQ SDTNTGLESLCQYYASDED
Subjt:  ENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1E3A4 Splicing factor YJU28.7e-14282.67Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
        MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQ+ VRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED    TYLGIQ+FRFYFKCTRCSAELTIKTDP+NSDY V
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV

Query:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
        ESGATRNFEPWR+EDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
Subjt:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF

Query:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV
        N S +YVRRI DDEFDD +HFV   TNND+T    AKKQK+ EE PHDPT+TSTKA +L++LT EG+D +VGTS  ++FVSKSL ++VSIIKKPELT  V
Subjt:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV

Query:  ENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED
        +N+     QT D NTGL SLCQ Y SDED
Subjt:  ENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED

A0A6J1E6Q8 Splicing factor YJU22.3e-17498.18Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
        MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED    TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV

Query:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
        ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSML ALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
Subjt:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF

Query:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV
        NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVL+ALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV
Subjt:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV

Query:  ENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED
        ENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED
Subjt:  ENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED

A0A6J1EW00 Splicing factor YJU22.2e-14583.28Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
        MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQ+ VRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED    TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDP+NSDY V
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV

Query:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
        ESGATRNFEPWR+EDE SEKEKHKR+AEEMGD MKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSML+ALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
Subjt:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF

Query:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV
        N SNNYV+RISDD+FDD++   Q STNND+T +  AKKQK+SEE PHD   T+TK A+LH+LTGEG DGN  TS  +K +SKSL ++VSIIKKPELT RV
Subjt:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV

Query:  ENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED
        E KQ LEVQ  DTN GLESLCQ Y SDED
Subjt:  ENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED

A0A6J1HNB0 Splicing factor YJU27.3e-17397.26Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
        MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED    TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV

Query:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
        ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSML+ALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
Subjt:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF

Query:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV
        N SNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHST+NDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHAL GEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV
Subjt:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV

Query:  ENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED
        ENKQSLEVQ SDTNTGLESLCQYYASDED
Subjt:  ENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED

A0A6J1HYT1 Splicing factor YJU24.9e-14583.28Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
        MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQ+ VRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED    TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDP+NSDY V
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV

Query:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
        ESGATRNFEPWR+EDE SEKEKHKRNAEEMGD MKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSML+ALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
Subjt:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF

Query:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV
        N SNNYVRRISDD+FD ++   Q STNND+T +  AKKQK+SEE PHD   T+ K  +LH+LTGEG DGN  TSS +KF+SKSL ++VSIIKKPELT RV
Subjt:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARV

Query:  ENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED
        E KQ LEVQ  DTN GLESLCQ Y S+ED
Subjt:  ENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A8WHR3 Splicing factor YJU28.0e-5243.29Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKE----DTYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
        M ERKVLNKYYPPDFDPSK+P+++ PK++Q  VR+M P ++RC TCG YIYKG KFN+RKE    + YLG+ +FRFY KCTRC AE+T KTDP+N+DY +
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKE----DTYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV

Query:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
        E GATRNF+  +  +E  +K + +R  EE+ +PMK LENRT DSK EM++L  L E+K +  R A V  + ML   ++    ++++ +EEDE   K ++ 
Subjt:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF

Query:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHD--PTNTSTKAAVLHALTG--EGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKP
              V+R+ D            S + +E  + + + +K   + P D   T+TST +  L +     +  D +VG  SV K    SL VR    KKP
Subjt:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHD--PTNTSTKAAVLHALTG--EGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKP

Q54WR5 Splicing factor YJU23.9e-5439.4Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKE----DTYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
        MGERKV++KYYPPDFDPSK+ +++  +     V  MLPMSIRCNTCG YI +GTKFN++KE    + YLGI+++RF+ +C +C+AELTIKTDPKNS+Y  
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKE----DTYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV

Query:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
        ESGATRN+EPW++ DE       K   EE  D M +LENRTL+SKREM++L AL+E+KS+ SR++ +  + +L    Q    +EK  +EED+ L+KSI  
Subjt:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF

Query:  NKSNNYVRRISDDEFDDNN---HFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELT
        NK+   + +I+D+   +NN   + ++   N+D+  D      K +  F ++  N      +++      ++ N+ T+S+S  +  +              
Subjt:  NKSNNYVRRISDDEFDDNN---HFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELT

Query:  ARVENKQSLEVQTSDTNT---GLESLCQYYASDED
          V NKQ   +  ++ N+      S    Y+ DE+
Subjt:  ARVENKQSLEVQTSDTNT---GLESLCQYYASDED

Q9BW85 Splicing factor YJU22.1e-5249.53Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKE----DTYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
        M ERKVLNKYYPPDFDPSK+P+++ PK++Q  VR+M P ++RC TCG YIYKG KFN+RKE    + YLG+ +FRFY KCTRC AE+T KTDP+N+DYT+
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKE----DTYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV

Query:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
        E GATRNF+  +  +E  ++ + +R  EE+ +PMK LENRT DSK EM++L  L E+K +  R A V  ++ML   + +  E+ ++ +EEDE    +++ 
Subjt:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF

Query:  NKSNNYVRRISDDE
              +   SD E
Subjt:  NKSNNYVRRISDDE

Q9D6J3 Splicing factor YJU22.8e-5249.31Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKE----DTYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
        M ERKVLNKYYPPDFDPSK+P+++ PK++Q  VR+M P ++RC TCG YIYKG KFN+RKE    + YLG+ +FRFY KCTRC AE+T KTDP+N+DYT+
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKE----DTYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV

Query:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
        E GATRNF+  +  +E  ++ + +R  EE+ +PMK LENRT DSK EM++L  L E+K +  R A V  ++ML   + +  + +++ EEEDE    +++ 
Subjt:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF

Query:  NKSNNYVRRISDDEFDD
         +   + R + D E +D
Subjt:  NKSNNYVRRISDDEFDD

Q9P7C5 Splicing factor YJU21.6e-4445.33Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQ-----QMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKEDT---YLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNS
        M ERKVLNKY PPD+DPS  P  ++ K Q     ++ VR+M P S+RC+TCG YIYKG KFN+RKE T   Y  I + RFY +CTRC+AE+T  TDPK++
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQ-----QMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKEDT---YLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNS

Query:  DYTVESGATRNFEPWRDE--DEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTA--------AEKEKK
        DY  ESGA+RN+EPW ++   E  E E  +RN     D M+ LE +TLD+KR+M I  ALDE++   +R + V+ID  +  L++ A        ++K K 
Subjt:  DYTVESGATRNFEPWRDE--DEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTA--------AEKEKK

Query:  LEEEDEALIKSIVFNKSNNYVRRIS
         EEE +   KS+  ++    +RR++
Subjt:  LEEEDEALIKSIVFNKSNNYVRRIS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G17130.1 Family of unknown function (DUF572)3.2e-9659.36Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
        MGERKVLNKYYPPDFDP+KL R+RRPKNQQ+ VRMMLPMS+RC TCGNYIYKGTKFNSRKED    TYLGIQ+FRFYFKCT+CSAELT+KTDP+NSDY V
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV

Query:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
        ESGA+RN+EPWR EDE  +K+K KR+AEEMGD MKSLENRTLDSKREMDI+AALDEMKSMKSRHATVS+D+ML ALQ+T AEK K++EEEDEA+IKSI F
Subjt:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF

Query:  NKSNNYVRRISDDEFDDN------NHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKP
         K    +RRI+D+E DD+      + +         +    +KK+K +E  P +PT+  T ++  +    +         ++SK   KS+ ++V I K+P
Subjt:  NKSNNYVRRISDDEFDDN------NHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKP

Query:  ELT-------ARVENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED
        + T       A+ E K+S        NT L SL Q Y SDED
Subjt:  ELT-------ARVENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED

AT1G17130.2 Family of unknown function (DUF572)2.1e-9558.17Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED-----------TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDP
        MGERKVLNKYYPPDFDP+KL R+RRPKNQQ+ VRMMLPMS+RC TCGNYIYKGTKFNSRKED           TYLGIQ+FRFYFKCT+CSAELT+KTDP
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED-----------TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDP

Query:  KNSDYTVESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEA
        +NSDY VESGA+RN+EPWR EDE  +K+K KR+AEEMGD MKSLENRTLDSKREMDI+AALDEMKSMKSRHATVS+D+ML ALQ+T AEK K++EEEDEA
Subjt:  KNSDYTVESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEA

Query:  LIKSIVFNKSNNYVRRISDDEFDDN------NHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVR
        +IKSI F K    +RRI+D+E DD+      + +         +    +KK+K +E  P +PT+  T ++  +    +         ++SK   KS+ ++
Subjt:  LIKSIVFNKSNNYVRRISDDEFDDN------NHFVQHSTNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVR

Query:  VSIIKKPELT-------ARVENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED
        V I K+P+ T       A+ E K+S        NT L SL Q Y SDED
Subjt:  VSIIKKPELT-------ARVENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED

AT2G29430.1 Family of unknown function (DUF572)1.3e-1753.16Show/hide
Query:  NVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTVESGATRNFEP
        N  + LPM ++CN C N + KGTKF SR ED    TYLGI++FRF  +CT  S E+  +TDPKN+D+ +ESGATR   P
Subjt:  NVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTVESGATRNFEP

AT2G32050.1 Family of unknown function (DUF572)1.4e-5956.22Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKE----DTYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
        MGERK LNKYYPP+FDP ++PR+R+PKNQQ  +R M+P+ IRCNTCGNY+ +GTK N R+E    +TYLGI++ RFYFKC++C  EL +KTDPKNS Y  
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKE----DTYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV

Query:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
        ESGAT  ++   +E++          AE+ GD M SLE RTL SKRE+D++AALDEMKSMKSR  +VS+DSML  L +   E+E+  +EED ALIKS  F
Subjt:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF

Query:  NKSNNYVRRISDDEFDD
         K     RRI D+E D+
Subjt:  NKSNNYVRRISDDEFDD

AT3G43250.1 Family of unknown function (DUF572)1.9e-5652.92Show/hide
Query:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV
        MGERK LNKYYPPDFDP K+ R+++PKNQQ  +R MLP+ +RCNTCGNY+ +GTKFN R+ED    TYLG+++ RFY KCT+C AELTIKTDPKN  YTV
Subjt:  MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKED----TYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTV

Query:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF
        ESGA+  +    D +E  EK+K   NA      ++SLENRT+ SKRE++++A+LDE+KSMKSR A++S+D ML  L +   ++E+ +EE  E LIKSI F
Subjt:  ESGATRNFEPWRDEDEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVF

Query:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQK
         K      RI  DE    N+         E FD + KK+K
Subjt:  NKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQHSTNNDETFDFRAKKQK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAGAGAGGAAGGTGCTCAACAAATACTATCCACCGGATTTTGATCCATCAAAGCTACCAAGGGTTCGTAGGCCCAAAAACCAACAAATGAACGTCCGTATGATGCT
TCCTATGAGTATCCGGTGCAATACTTGTGGTAATTACATATACAAGGGCACCAAGTTCAATTCCCGCAAGGAGGACACATATTTGGGAATCCAATTGTTTAGATTCTACT
TCAAATGTACTCGATGTTCGGCTGAGCTCACCATCAAAACAGACCCCAAAAATTCAGATTATACTGTAGAATCTGGTGCCACTCGTAATTTTGAACCATGGCGTGATGAA
GATGAAGCTTCAGAGAAGGAGAAACACAAAAGGAACGCTGAAGAGATGGGGGACCCAATGAAATCCTTGGAGAATAGAACCTTGGATTCTAAGCGCGAAATGGACATCCT
TGCTGCTTTGGATGAGATGAAATCTATGAAGTCCAGACATGCAACTGTGAGTATTGATTCAATGCTTATGGCTTTGCAACAAACTGCTGCCGAGAAGGAAAAGAAGTTAG
AGGAAGAGGATGAGGCGTTGATAAAATCAATTGTCTTCAATAAATCAAACAATTATGTTAGAAGAATTTCGGACGATGAATTTGATGATAACAATCATTTTGTACAACAT
TCGACCAACAATGATGAAACATTTGACTTTCGTGCAAAGAAGCAAAAGATTTCTGAAGAATTTCCTCATGACCCTACCAATACTTCAACGAAAGCTGCTGTTCTCCATGC
CCTCACGGGTGAAGGAAGCGATGGCAACGTTGGCACCTCTAGTGTTTCGAAGTTTGTTTCTAAATCTTTGCCAGTTAGGGTTTCTATTATAAAGAAACCAGAATTGACTG
CTCGGGTGGAGAATAAACAGAGCTTGGAAGTTCAAACCAGTGATACGAACACTGGACTCGAGTCCTTGTGCCAATACTATGCCAGTGATGAGGACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGAGAGAGGAAGGTGCTCAACAAATACTATCCACCGGATTTTGATCCATCAAAGCTACCAAGGGTTCGTAGGCCCAAAAACCAACAAATGAACGTCCGTATGATGCT
TCCTATGAGTATCCGGTGCAATACTTGTGGTAATTACATATACAAGGGCACCAAGTTCAATTCCCGCAAGGAGGACACATATTTGGGAATCCAATTGTTTAGATTCTACT
TCAAATGTACTCGATGTTCGGCTGAGCTCACCATCAAAACAGACCCCAAAAATTCAGATTATACTGTAGAATCTGGTGCCACTCGTAATTTTGAACCATGGCGTGATGAA
GATGAAGCTTCAGAGAAGGAGAAACACAAAAGGAACGCTGAAGAGATGGGGGACCCAATGAAATCCTTGGAGAATAGAACCTTGGATTCTAAGCGCGAAATGGACATCCT
TGCTGCTTTGGATGAGATGAAATCTATGAAGTCCAGACATGCAACTGTGAGTATTGATTCAATGCTTATGGCTTTGCAACAAACTGCTGCCGAGAAGGAAAAGAAGTTAG
AGGAAGAGGATGAGGCGTTGATAAAATCAATTGTCTTCAATAAATCAAACAATTATGTTAGAAGAATTTCGGACGATGAATTTGATGATAACAATCATTTTGTACAACAT
TCGACCAACAATGATGAAACATTTGACTTTCGTGCAAAGAAGCAAAAGATTTCTGAAGAATTTCCTCATGACCCTACCAATACTTCAACGAAAGCTGCTGTTCTCCATGC
CCTCACGGGTGAAGGAAGCGATGGCAACGTTGGCACCTCTAGTGTTTCGAAGTTTGTTTCTAAATCTTTGCCAGTTAGGGTTTCTATTATAAAGAAACCAGAATTGACTG
CTCGGGTGGAGAATAAACAGAGCTTGGAAGTTCAAACCAGTGATACGAACACTGGACTCGAGTCCTTGTGCCAATACTATGCCAGTGATGAGGACTGATATGTTATATTA
CGTCGGTTTGGGCGCATACCATCTCCATGAGCTTTAATGTATATACTATGTAACTTGTTCATAATGGCTTGCTTCGTTTTATACGAATTAATATTTTCTTGTTACGGTTT
TGTTTCCTCTGAAAAACCTGTCTGATTGGTTTCTCTCGGATACATTCCATCGATTGAAGAGATATTTTGTACAATAGAACAGAGTGATTATTGTTAACCCTTTTATAATA
GATTTTTCGAACTTGTACTAAAAGTATCTTATATTTGTCTAGTTTCTCGTCTTTATTACATGATTACTATACTCAAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMNVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKEDTYLGIQLFRFYFKCTRCSAELTIKTDPKNSDYTVESGATRNFEPWRDE
DEASEKEKHKRNAEEMGDPMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLMALQQTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVFNKSNNYVRRISDDEFDDNNHFVQH
STNNDETFDFRAKKQKISEEFPHDPTNTSTKAAVLHALTGEGSDGNVGTSSVSKFVSKSLPVRVSIIKKPELTARVENKQSLEVQTSDTNTGLESLCQYYASDED