; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg19434 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg19434
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionDirigent protein
Genome locationCarg_Chr16:10173730..10174305
RNA-Seq ExpressionCarg19434
SyntenyCarg19434
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0048046 - apoplast (cellular component)
GO:0004659 - prenyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR004265 - Dirigent protein
IPR044859 - Allene oxide cyclase/Dirigent protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6577817.1 Dirigent protein 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.2e-102100Show/hide
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KAG7015856.1 Dirigent protein 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.2e-102100Show/hide
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XP_022923245.1 dirigent protein 19-like [Cucurbita moschata]7.9e-9797.88Show/hide
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XP_023007642.1 dirigent protein 19-like [Cucurbita maxima]5.1e-9697.84Show/hide
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XP_023551883.1 dirigent protein 11-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.2e-9895.43Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2N9EIH7 Dirigent protein2.2e-6871.98Show/hide
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        + +   +L +LLS  A +  +  HH HH H H  L+SLHFSLFQHETINKTGY IV GVAGP  SQTTTPFGT+F F DP+T   +R+SKLVG +EGTSI
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A0A5D3CJJ8 Dirigent protein1.7e-8184.49Show/hide
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        SL+LSS+FTL   SLLS  ++   A+    HH HH HRHLRSLHFSLFQHETINKTGYFIVPGV GPGVSQTTTPFGTMF FHDPLTT  DR SKLVGTS
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        EGTSITSS DGL+S+SIAKISLRLR+HTGSLSIVGGTHNVKPSNHPIVGGTGDFLFVQGYVTSSPVDLVGITVVYKLEFH+YWPPYA
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A0A6J1EB83 Dirigent protein3.8e-9797.88Show/hide
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A0A6J1KZ97 Dirigent protein2.5e-9697.84Show/hide
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A0A7N2R780 Dirigent protein3.7e-6872.47Show/hide
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        + T++L +LLS  A +  ++ HH HH H+ L+SLHFSLFQHETIN+TGY IV GVAGPGVSQTTTPFGT+F F DP+T   +R SKLVG +EGTSITS L
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
I1JNN8 Pterocarpan synthase 11.9e-0529.81Show/hide
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        L LS LF+L+ ++  SS  P L         H        LHF  F H+ +      +V      G ++   PFGT+    DPLT  P++ SKLVG ++G
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           + S + +  + +  ++    +  GS   V G + +         IVGGTG F F +GY
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Q67YM6 Dirigent protein 113.9e-0622.78Show/hide
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        L+L  +F+ +L  L  +   ++P +   P   ++  +  H   + H+ I+      +     PG + + T FG + +   P+T  P+ +SK VG ++G  
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         ++ +       +           GS + + G + +  +    PI+GGTGDF F +GY       +V I  V  +E++++
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Q9C523 Dirigent protein 191.8e-0628.22Show/hide
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        S  L S  TL L  +  +    E N  H     H+  +  HF ++ H+ +       V  +  P      T FG M +  +PLT  P  +SK+VG ++G 
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           +S + +  L     ++    + GS   V G ++V  K    P++GG+G F F +GYV +S
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Q9FIG6 Dirigent protein 17.9e-0723.98Show/hide
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        +LSS+L         +   P+  ++  +  H   + H+ I+      V        +     FG + +  DPLT  PD +SK VG ++G   ++++  + 
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           +           GS   V G +++  K    PI+GGTG F F +GY       +VG+  V  +E++++
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Q9FIG7 Dirigent protein 23.5e-0724.44Show/hide
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        L+L  L T++L S+  S   +E  +   P   ++  +  H   + H+ I+      V        + +   FG + +  DPLT  PD +SK VG ++G  
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Query:  ITSSLDGLRSLSIAKISLRLRNHTGSLSIVGGTHNV--KPSNHPIVGGTGDFLFVQGYVTSSPVDLVGITVVYKLEFHIY
          +++  +    +  ++       GS   + G + +  K    PI+GGTG F F +GY  +    +VG+  V  +E++++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G22900.1 Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein2.8e-0722.78Show/hide
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        L+L  +F+ +L  L  +   ++P +   P   ++  +  H   + H+ I+      +     PG + + T FG + +   P+T  P+ +SK VG ++G  
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         ++ +       +           GS + + G + +  +    PI+GGTGDF F +GY       +V I  V  +E++++
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AT1G58170.1 Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein1.2e-0728.22Show/hide
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        S  L S  TL L  +  +    E N  H     H+  +  HF ++ H+ +       V  +  P      T FG M +  +PLT  P  +SK+VG ++G 
Subjt:  SLILSSLFTLILSSLLSSPALAEPNAAHHPHHPHRHLRSLHFSLFQHETINKTGYFIVPGVAGPGVSQTTTPFGTMFVFHDPLTTAPDRASKLVGTSEGT

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           +S + +  L     ++    + GS   V G ++V  K    P++GG+G F F +GYV +S
Subjt:  SITSSLDGLRSLSIAKISLRLRNHTGSLSIVGGTHNV--KPSNHPIVGGTGDFLFVQGYVTSS

AT5G42500.1 Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein2.5e-0824.44Show/hide
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        L+L  L T++L S+  S   +E  +   P   ++  +  H   + H+ I+      V        + +   FG + +  DPLT  PD +SK VG ++G  
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          +++  +    +  ++       GS   + G + +  K    PI+GGTG F F +GY  +    +VG+  V  +E++++
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AT5G42510.1 Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein5.6e-0823.98Show/hide
Query:  ILSSLLSSPALAEPNAAHHPHHPHRHLRSLHFSLFQHETINKTGYFIVPGVAGPGVSQTTTPFGTMFVFHDPLTTAPDRASKLVGTSEGTSITSSLDGLR
        +LSS+L         +   P+  ++  +  H   + H+ I+      V        +     FG + +  DPLT  PD +SK VG ++G   ++++  + 
Subjt:  ILSSLLSSPALAEPNAAHHPHHPHRHLRSLHFSLFQHETINKTGYFIVPGVAGPGVSQTTTPFGTMFVFHDPLTTAPDRASKLVGTSEGTSITSSLDGLR

Query:  SLSIAKISLRLRNHTGSLSIVGGTHNV--KPSNHPIVGGTGDFLFVQGYVTSSPVDLVGITVVYKLEFHIY
           +           GS   V G +++  K    PI+GGTG F F +GY       +VG+  V  +E++++
Subjt:  SLSIAKISLRLRNHTGSLSIVGGTHNV--KPSNHPIVGGTGDFLFVQGYVTSSPVDLVGITVVYKLEFHIY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCACCACCACCACCACCCTCTCTCATTCTCTCTTCCCTTTTCACTCTAATTCTCTCCTCCCTCTTATCTTCGCCGGCGCTGGCCGAGCCCAACGCCGCCCACCATCC
CCACCATCCCCACCGCCACCTCCGGTCACTCCACTTCTCCCTCTTCCAGCACGAAACAATCAACAAAACCGGCTACTTCATCGTGCCGGGGGTGGCTGGCCCAGGAGTGA
GCCAAACCACCACCCCATTTGGCACCATGTTTGTATTTCACGACCCTTTGACCACAGCGCCCGACCGAGCATCGAAGCTGGTCGGCACGTCGGAGGGAACCTCCATAACC
TCTAGCCTCGATGGCTTGCGAAGCCTTAGCATAGCGAAGATCAGCTTGCGTTTGAGGAACCATACCGGTTCCCTCTCCATCGTGGGTGGGACCCATAATGTTAAACCGTC
GAACCACCCCATTGTCGGAGGGACCGGAGATTTCTTGTTCGTACAAGGCTACGTGACGTCATCTCCGGTGGATCTGGTCGGAATCACGGTGGTTTACAAGTTGGAATTTC
ATATTTACTGGCCGCCCTACGCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCACCACCACCACCACCCTCTCTCATTCTCTCTTCCCTTTTCACTCTAATTCTCTCCTCCCTCTTATCTTCGCCGGCGCTGGCCGAGCCCAACGCCGCCCACCATCC
CCACCATCCCCACCGCCACCTCCGGTCACTCCACTTCTCCCTCTTCCAGCACGAAACAATCAACAAAACCGGCTACTTCATCGTGCCGGGGGTGGCTGGCCCAGGAGTGA
GCCAAACCACCACCCCATTTGGCACCATGTTTGTATTTCACGACCCTTTGACCACAGCGCCCGACCGAGCATCGAAGCTGGTCGGCACGTCGGAGGGAACCTCCATAACC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SSLDGLRSLSIAKISLRLRNHTGSLSIVGGTHNVKPSNHPIVGGTGDFLFVQGYVTSSPVDLVGITVVYKLEFHIYWPPYA