; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg19496 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg19496
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionwound-induced protein 1
Genome locationCarg_Chr03:3910668..3911217
RNA-Seq ExpressionCarg19496
SyntenyCarg19496
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7033737.1 hypothetical protein SDJN02_03462, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.5e-85100Show/hide
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XP_022949814.1 wound-induced protein 1 [Cucurbita moschata]4.9e-1239.75Show/hide
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XP_022978301.1 wound-induced protein 1 [Cucurbita maxima]1.7e-1240.37Show/hide
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XP_023544894.1 wound-induced protein 1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.8e-1340.99Show/hide
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XP_038883007.1 wound-induced protein 1 [Benincasa hispida]2.3e-0934.54Show/hide
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        +S   P PKH         P  ++         LKHSEITHS   +  +  A    LYKSLAAGRTD   V       + W    P H       LTGES
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        SH EF     SI  +   ++  +   G+            GL+    +             PAW+EVRHD   V +  P DL HRSLPAI+LAL
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L1G7 Uncharacterized protein1.1e-0635.8Show/hide
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        LKH++I  S TE R     A    LYKSLA GRT        P   + W    P H       LTG+SSH EF     SI  +   ++  +   G+    
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                GL+    +             PAWEE+RHD   V    P DLFHRSLPAI+LAL
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A0A1S3CLI3 wound-induced protein 16.1e-0837.04Show/hide
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        +KH++IT S TE R     A    LYKSLAAGRT    V       + W    P H       LTGESSH EF     SI  +   ++  +   G+    
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                GL+    +             PAWEE+RHD   V    P DLFHRSLPAI+LAL
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A0A5D3CHY0 Wound-induced protein 16.1e-0837.04Show/hide
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        +KH++IT S TE R     A    LYKSLAAGRT    V       + W    P H       LTGESSH EF     SI  +   ++  +   G+    
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                GL+    +             PAWEE+RHD   V    P DLFHRSLPAI+LAL
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A0A6J1GE13 wound-induced protein 12.4e-1239.75Show/hide
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                             ++     PAWEEVRHD   V +  P DLFHRSLP IM AL
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A0A6J1IMA8 wound-induced protein 18.2e-1340.37Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
CTTTCAGCTCAAATTCCTCTTCCAAAACACGACCCTTTTGCTCAAACAACATGGATTCCATTCCACGTCAACCCATACCTTAAACATTCCGAAATCACCCACTCCACTGA
GTCCAGAGCCATCAAAACAGAAGCCAACCGCCGATGCCTCTATAAATCCCTCGCCGCCGGCCGGACCGACCGTGGCGAAGTTCCTGCACGACCTCGAGTGGTGGTTCCAT
GGCCCACCTCATTGCCAGTACATGATGCGGGTCTGACCGGCGAGTCCAGCCACGCCGAGTTTTCGGTTCGAGCCGAGAGCATACAGAGATTGGCGACTCTGTTATTGTGG
CGGAAGGCTGGGAGGGGCTCAGGTCTATTGGGTTCATGTTTGGACCCGGCTTGGGAGGAGGTCCGTCATGATGCTGACGGTGTGGCAGAGCCACCCTCGGATCTGTTTCA
CCGCTCGCTGCCAGCGATTATGTTGGCTCTGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTTCAGCTCAAATTCCTCTTCCAAAACACGACCCTTTTGCTCAAACAACATGGATTCCATTCCACGTCAACCCATACCTTAAACATTCCGAAATCACCCACTCCACTGA
GTCCAGAGCCATCAAAACAGAAGCCAACCGCCGATGCCTCTATAAATCCCTCGCCGCCGGCCGGACCGACCGTGGCGAAGTTCCTGCACGACCTCGAGTGGTGGTTCCAT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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RKAGRGSGLLGSCLDPAWEEVRHDADGVAEPPSDLFHRSLPAIMLAL