; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg19722 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg19722
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionMADS-box transcription factor 23-like isoform X2
Genome locationCarg_Chr16:1590857..1600105
RNA-Seq ExpressionCarg19722
SyntenyCarg19722
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7014908.1 Agamous-like MADS-box protein AGL21, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.5e-112100Show/hide
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A0A6J1E420 MADS-box transcription factor 23-like isoform X23.4e-10286.61Show/hide
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A0A6J1E7G6 MADS-box transcription factor 23-like isoform X15.9e-10285.89Show/hide
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A0A6J1E7H4 MADS-box transcription factor 23-like isoform X51.2e-10288.09Show/hide
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A0A6J1E9F1 MADS-box transcription factor 23-like isoform X32.0e-10287.34Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2RVQ5 Agamous-like MADS-box protein AGL169.1e-5268.39Show/hide
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Q6EP49 MADS-box transcription factor 275.2e-5570.32Show/hide
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Q6VAM4 MADS-box transcription factor 231.8e-5266.03Show/hide
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Q9SI38 MADS-box transcription factor ANR17.2e-5772.44Show/hide
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Q9SZJ6 Agamous-like MADS-box protein AGL218.0e-5669.68Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
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AT2G22630.1 AGAMOUS-like 172.5e-5266.45Show/hide
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AT3G57230.1 AGAMOUS-like 166.5e-5368.39Show/hide
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        H +QE HRQ+MGE+L+GLSV +L +LE+Q+E+SL+G+R++KE++L++EI +L QK
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CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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