; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg19841 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg19841
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionPSI subunit V
Genome locationCarg_Chr05:4900007..4901989
RNA-Seq ExpressionCarg19841
SyntenyCarg19841
Gene Ontology termsGO:0015979 - photosynthesis (biological process)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0009538 - photosystem I reaction center (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR003757 - Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI
IPR022980 - Photosystem I, reaction centre subunit XI
IPR036592 - Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI superfamily


Homology Show/hide homology
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A0A6J1D7U0 PSI subunit V2.0e-11094.93Show/hide
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A0A6J1ET47 PSI subunit V1.0e-114100Show/hide
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A0A6J1FBZ4 PSI subunit V1.2e-11095.39Show/hide
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A0A6J1HKH3 PSI subunit V1.5e-11094.93Show/hide
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A0A6J1KBZ8 PSI subunit V3.9e-11499.54Show/hide
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O78469 Photosystem I reaction center subunit XI2.8e-3246.67Show/hide
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P23993 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic2.7e-8070.64Show/hide
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Q39654 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic5.1e-11193.09Show/hide
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Q41385 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic8.2e-9379.45Show/hide
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Q9SUI4 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic8.2e-9379.45Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G12800.1 photosystem I subunit l5.8e-9479.45Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CATCCCTGCAAGAACACACTCCTTCACTATCAGAGCCATCCAAGCTGATAAGCCAACTTACCAAGTGATCCAGCCAATCAATGGAGACCCATTCATTGGAAGCCTCGAGA
CTCCAGTAACCTCAAGCCCACTGATAGCATGGTACCTCTCAAACCTCCCAGCCTACAGAACAGCAGTCAACCCATTGCTGAGGGGAATTGAAGTAGGTCTGGCACATGGT
TTTCTTCTGGTCGGTCCATTTGTCAAAGCTGGCCCTCTAAGGAACACAGCCTACGCCGGAGGAGCTGGCTCACTGGCCGCCGGTGGTCTCATTGCCATTTTGAGCATCTG
CTTGACAATGTATGGCATTGCATCCTTCAATGAAGGAGAGCCATCCACTGCACCATCATTGACCTTGACCGGCAGGAAAAAGACCCCTGATCAGCTGCAAACCGCTGACG
GGTGGGCGAAATTCACTGGCGGGTTCTTCTTCGGCGGGATCTCCGGCGTGATCTGGGCATACTTCCTCCTCTATGTCTTGGACCTCCCTTACTTTGTCAAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGAGAGAGATGGATAAGGGATAAGGTTACGTGGCAAGTTCCATCCAATGAGAAGAGAGGGTTGATCAAAGACAGGCTCCCACAAGTTTCCATGGCCAGCAACGACAATAA
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CTCCCCCATTGCCAGTCAGCTCAGTTCCAGCTTTGCTTCTTCCACCACCAGAGCTTTGGTTGCTCCCAAAGGCCTCTCCGTTTCGCCGCTCCGACGCATCCCTGCAAGAA
CACACTCCTTCACTATCAGAGCCATCCAAGCTGATAAGCCAACTTACCAAGTGATCCAGCCAATCAATGGAGACCCATTCATTGGAAGCCTCGAGACTCCAGTAACCTCA
AGCCCACTGATAGCATGGTACCTCTCAAACCTCCCAGCCTACAGAACAGCAGTCAACCCATTGCTGAGGGGAATTGAAGTAGGTCTGGCACATGGTTTTCTTCTGGTCGG
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GCATTGCATCCTTCAATGAAGGAGAGCCATCCACTGCACCATCATTGACCTTGACCGGCAGGAAAAAGACCCCTGATCAGCTGCAAACCGCTGACGGGTGGGCGAAATTC
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CCTGCAATGTAACTTCCATGTCTGTGTTAAGGAAACATAAAATTGTATATTTCATGCCAAACCGCTTTGCTAGATCCTTTGTGATTGCATATTGATTTCCTTTCTAGAAC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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