; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg19911 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg19911
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionAWPM-19-like family protein
Genome locationCarg_Chr13:6915252..6916082
RNA-Seq ExpressionCarg19911
SyntenyCarg19911
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008390 - AWPM-19-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008443837.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487332 [Cucumis melo]7.6e-6687.01Show/hide
Query:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV
        MK +ATLLLLLNFCMY +ILGIGGWAMN AIDHGF+IGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLA V GAASAISGLNHIR WS ESLGAASSAAV
Subjt:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVFKR
        FAW+LTILAMGFACKEIALD+RN RL+TMEAFFIILSATQL+YI AIHG +  R
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVFKR

XP_022927469.1 uncharacterized protein LOC111434286 [Cucurbita moschata]1.8e-75100Show/hide
Query:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV
        MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV
Subjt:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVFKR
        FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVFKR
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVFKR

XP_023001482.1 uncharacterized protein LOC111495604 [Cucurbita maxima]1.9e-7296.75Show/hide
Query:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV
        MKPLA+LLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIR WSAESLGAASSAAV
Subjt:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVFKR
        FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQL+YIFAIHGAV  R
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVFKR

XP_023519488.1 membrane protein PM19L-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.5e-7194.81Show/hide
Query:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV
        MKP+ATLLLLLNFCM+AVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAAS+ISGLNHIR WSAESLGAASSAAV
Subjt:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVFKR
         AWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQL+YIFAIHGAV  R
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVFKR

XP_038895378.1 membrane protein PM19L-like [Benincasa hispida]1.5e-6688.96Show/hide
Query:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV
        MK +ATLLLLLNFCMYA+ILGIGGWAMN AIDHGF+IGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLAAV GAASAISGLNHIR WSAESLGAAS+AAV
Subjt:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVFKR
        FAW+LTILAMGFACKEIALD+RN RL+TMEAFFIILSATQL+YI AIHGAV  R
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVFKR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV01 AWPM19-like protein5.0e-6385.06Show/hide
Query:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV
        MK  ATLLLLLNFCMY +ILGIGGWAMN AIDHGF+IGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLA V GAASAISGLNHIR WS ESL AASSAAV
Subjt:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVFKR
        FAW+LTILAMGFA KEIALD+RN RL+TMEAFFIILSATQL+YI AIHG +  R
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVFKR

A0A6J1CEV9 uncharacterized protein LOC1110108601.1e-6590.67Show/hide
Query:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV
        MK +ATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGP  RLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAV GAASAISGLNHIR WS +SLGAASSAAV
Subjt:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGA
        FAW+LTILAMGFACKEI LD+R+TRLITMEAFFIILS TQLLYI AIHGA
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGA

A0A6J1EI31 uncharacterized protein LOC1114342868.7e-76100Show/hide
Query:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV
        MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV
Subjt:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVFKR
        FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVFKR
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVFKR

A0A6J1KGN7 uncharacterized protein LOC1114956049.0e-7396.75Show/hide
Query:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV
        MKPLA+LLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIR WSAESLGAASSAAV
Subjt:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVFKR
        FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQL+YIFAIHGAV  R
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVFKR

A5Y734 AWPM19-like protein3.7e-6687.01Show/hide
Query:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV
        MK +ATLLLLLNFCMY +ILGIGGWAMN AIDHGF+IGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLA V GAASAISGLNHIR WS ESLGAASSAAV
Subjt:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVFKR
        FAW+LTILAMGFACKEIALD+RN RL+TMEAFFIILSATQL+YI AIHG +  R
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVFKR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6L4D2 Membrane protein PM19L4.8e-2344.52Show/hide
Query:  LLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAVFAWSLTI
        LL+LN  MY +++G   W +N  I +G    PG+             GN AT +F+ FA+LA V GAAS ++G++H+R W A SL A +++A+ AW++T 
Subjt:  LLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAVFAWSLTI

Query:  LAMGFACKEIAL-DYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVF
        LA G ACKEI +  YR  RL  +EAF IIL+ TQLLY+  +HG +F
Subjt:  LAMGFACKEIAL-DYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G04560.1 AWPM-19-like family protein2.2e-2345.21Show/hide
Query:  LATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAVFAW
        +A  LL LN  MY ++LG   W +N  I +G    P               GN AT FF+TF++LAAV G AS ++G NHIR W  +SL AA ++++ AW
Subjt:  LATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAVFAW

Query:  SLTILAMGFACKEIAL-DYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIH
        ++T LAMG ACK+I +  +R  RL  +EAF IIL+ TQLLY+  IH
Subjt:  SLTILAMGFACKEIAL-DYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIH

AT1G29520.1 AWPM-19-like family protein1.4e-5472.48Show/hide
Query:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV
        +KP+A+ LL+LNFCMY ++LGIGGWAMN AIDHGF +GP L LPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLA V GAAS ISGL+HIR W+  SL AA++AA 
Subjt:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHG
         AW+LT+LAMGFA KEI L  RN +L TMEAF IILS TQL+YI A+HG
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHG

AT5G18970.1 AWPM-19-like family protein6.7e-2846Show/hide
Query:  KPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAVF
        K  A +LL+LN  +Y VI  I  WA+N  I+        L LPA   PIYFP+GN ATGFFV F L+A V G A++++G+ ++  W + +L +A+++++ 
Subjt:  KPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAVF

Query:  AWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAV
        +WSLT+LAMG ACKEI + +    L T+E   II+SATQLL   AIH  V
Subjt:  AWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAV

AT5G46530.1 AWPM-19-like family protein2.1e-5371.14Show/hide
Query:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV
        MKP+A+ LL+LNFCMYA++LGIG W+MN AI+HGF+IG    LPAHFSPI+FPMGNAATGFF+ FAL+A VAGAAS ISG++H++ W+  SL AA SAA 
Subjt:  MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHG
         AWSLT+LAMGF CKEI L  RN RL TMEAF IILSATQLLYI AI+G
Subjt:  FAWSLTILAMGFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAACCCCTTGCCACTCTGCTTCTGCTGCTTAACTTCTGCATGTATGCAGTCATTTTGGGCATCGGTGGCTGGGCCATGAACACAGCCATCGATCATGGCTTCGTCAT
TGGCCCTGGCTTACGACTACCGGCGCATTTCTCACCAATTTACTTCCCCATGGGGAACGCAGCCACTGGTTTCTTTGTGACATTCGCTTTGTTGGCTGCCGTGGCTGGAG
CTGCCTCTGCAATCTCAGGACTAAACCATATTCGGTTATGGAGTGCTGAAAGCTTAGGCGCAGCATCCTCTGCTGCTGTTTTTGCTTGGTCCCTCACTATCCTTGCCATG
GGCTTTGCTTGCAAAGAGATTGCTCTCGATTACAGAAACACAAGACTGATAACAATGGAGGCGTTCTTCATAATTCTCTCTGCTACACAGCTACTTTACATCTTTGCCAT
CCATGGTGCTGTTTTCAAGAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTCCCTCTTCCAATAACCAGCCGCACAAATGAAACCCCTTGCCACTCTGCTTCTGCTGCTTAACTTCTGCATGTATGCAGTCATTTTGGGCATCGGTGGCTGGGCCATGA
ACACAGCCATCGATCATGGCTTCGTCATTGGCCCTGGCTTACGACTACCGGCGCATTTCTCACCAATTTACTTCCCCATGGGGAACGCAGCCACTGGTTTCTTTGTGACA
TTCGCTTTGTTGGCTGCCGTGGCTGGAGCTGCCTCTGCAATCTCAGGACTAAACCATATTCGGTTATGGAGTGCTGAAAGCTTAGGCGCAGCATCCTCTGCTGCTGTTTT
TGCTTGGTCCCTCACTATCCTTGCCATGGGCTTTGCTTGCAAAGAGATTGCTCTCGATTACAGAAACACAAGACTGATAACAATGGAGGCGTTCTTCATAATTCTCTCTG
CTACACAGCTACTTTACATCTTTGCCATCCATGGTGCTGTTTTCAAGAGATGACAACTGAATCATGGAAACATTCCTTGATATTCATTGCCCATTTTCATCTGTGTTTTG
GTGTCATTTTCCTTGTTTTTTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKPLATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVAGAASAISGLNHIRLWSAESLGAASSAAVFAWSLTILAM
GFACKEIALDYRNTRLITMEAFFIILSATQLLYIFAIHGAVFKR