; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg20061 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg20061
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionSerine/arginine repetitive matrix-like protein
Genome locationCarg_Chr09:3832384..3833607
RNA-Seq ExpressionCarg20061
SyntenyCarg20061
Gene Ontology termsGO:0016310 - phosphorylation (biological process)
GO:0016301 - kinase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6591844.1 hypothetical protein SDJN03_14190, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.6e-217100Show/hide
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XP_023521988.1 probable membrane-associated kinase regulator 3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.1e-20896.56Show/hide
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XP_023536161.1 probable membrane-associated kinase regulator 3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-20996.81Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1FD24 probable membrane-associated kinase regulator 38.2e-21498.53Show/hide
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A0A6J1FNE5 uncharacterized protein LOC1114458382.1e-16981.71Show/hide
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A0A6J1IF15 uncharacterized protein LOC1114759924.5e-21297.79Show/hide
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A0A6J1J120 uncharacterized protein LOC1114803534.7e-16981.46Show/hide
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A0A6P3Z940 Uncharacterized protein1.1e-10958.18Show/hide
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         +GKLVPL L S+K S+ E          +++E E RSP+T   RR TEI   D Y FSP+APRCSSRWRE+LGLKK +       +KNE+ KT   SSS
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        S    KSLK FLHR+SK  SS SSD +L+ PLLKD DCESVSISSSRLSLSSSSSG   +DLPRLSLDSDKP+          N  +  R+  VKP A+ 
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        +  +          R+GRSP+RRP GES  V SR VS+DSPRMNSSGKIVFQSLERSSSSPSSFNGGPR KH  +ERSYSANVR+ PVLNVP+ SLRGSS
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        K    F F QLFSSPQKR  +  GG    G GQ  + RNR
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G56020.1 unknown protein4.8e-5742.55Show/hide
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        MASAC+ + G+ PE F        SSYGW SPR+S +R   DD+  +        SS+        P     +++    DFEF LE PVT++ A+ELF +
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Query:  GKLVPLQLPSLK---SSVKEELSATEIESR-SPDTTTLRRVTEIGNADPYSFSPRAPRCSSRWREILGLKKANQMTSSIAAKNENQKTDLSSSSS----R
        GKLVPL+    K   ++    ++ T  E R SP+     R  E+  +D   FSP+APRC++RWRE+LGLK+       + AK + +    SSSSS    +
Subjt:  GKLVPLQLPSLK---SSVKEELSATEIESR-SPDTTTLRRVTEIGNADPYSFSPRAPRCSSRWREILGLKKANQMTSSIAAKNENQKTDLSSSSS----R

Query:  MKSLKQFLHRNSKLVSSESSDTLNHPLLKDLD-CESVSISSSRLSLSSSSSGL-SLDDLPRLSLDSDKPSKF----NRESKNRLNTVKPIASRSEAKRVG
          S KQFLHR SK     SS   + PL K+ D  ES+S++SSRLSLSSSSS    +DDLPRLSLD DKPS      +R     LN  +   ++       
Subjt:  MKSLKQFLHRNSKLVSSESSDTLNHPLLKDLD-CESVSISSSRLSLSSSSSGL-SLDDLPRLSLDSDKPSKF----NRESKNRLNTVKPIASRSEAKRVG

Query:  RSP-VRRPPGESGRVKSR--EVSMDSPRMNSSGKIVFQSLERSSSSPSSFNGGPRLK-HSSIERSYSANVRVPPVLNVPMSSLRGSSKFAFSQLFSSPQK
         +P V      S  ++SR   V+ DSPR+N+SGKIVF  LERSSSSP SF GGPR+K H  + RSYSANVR+ PVLNVP+ SL+  S   F QLFSS   
Subjt:  RSP-VRRPPGESGRVKSR--EVSMDSPRMNSSGKIVFQSLERSSSSPSSFNGGPRLK-HSSIERSYSANVRVPPVLNVPMSSLRGSSKFAFSQLFSSPQK

Query:  RTEATYG-GGGGKGQTRHCRNRI
         + ++   G   + Q+   +NRI
Subjt:  RTEATYG-GGGGKGQTRHCRNRI

AT1G79060.1 unknown protein7.4e-6643.71Show/hide
Query:  MASACINNVGIPPENFLDGSRATYSSYGWLSPRVSFSREFPDDSSANLSGFELSPSSITDTSHASKPAISGTDLEGSASDFEFRLEH-PVTLIPANELFF
        MAS C+NNV +  +         + +YG  +PR SFSR+    SS +++                   I   +    A DFEFRLE  PV ++PA+ELF 
Subjt:  MASACINNVGIPPENFLDGSRATYSSYGWLSPRVSFSREFPDDSSANLSGFELSPSSITDTSHASKPAISGTDLEGSASDFEFRLEH-PVTLIPANELFF

Query:  NGKLVPLQLPSLKSSVKEELSATEIESRSPDTTTLRRVTEIGNADPYSFSPRAPRCSSRWREILGLKKANQMTSSIAAKNENQKTDLSSSSSRMKSLKQF
        +GKLV  Q         ++   TEI  +      +  +   G  D  SFSP+APRCSSRWR++LGLK+ +Q +S  A+      T+  SS+S   SLKQF
Subjt:  NGKLVPLQLPSLKSSVKEELSATEIESRSPDTTTLRRVTEIGNADPYSFSPRAPRCSSRWREILGLKKANQMTSSIAAKNENQKTDLSSSSSRMKSLKQF

Query:  LHRNSKLVSSESSDTL--NHPLLKDLDCESVSISSSRLSLSSSSSGLSLDDLPRLSLDSDKPSKFNRESKNRLNTVKPIA-------------------S
        LHR+S+  SS S  +L  + PLLKD D ESVSISSSR+SLSSSSSG   +DLPRLSLD+++P++ +  + N   T  P A                   S
Subjt:  LHRNSKLVSSESSDTL--NHPLLKDLDCESVSISSSRLSLSSSSSGLSLDDLPRLSLDSDKPSKFNRESKNRLNTVKPIA-------------------S

Query:  RSEAKRVGRSPVRRPPGESGRVKSREVSMDSPRMNSSGKIVFQSLERSSSSPSSFNGGPR-LKHSSIERSYSANVRVPPVLNVPMSSLRGSSKFAFSQLF
         +   RVGRSP+RR  GE+  + +R VS+DSPR+NSSGKIVFQ+LERSSSSPSSFNGG    +H  +ERSYS+NVRV PVLNVP+ S+RG S   F Q F
Subjt:  RSEAKRVGRSPVRRPPGESGRVKSREVSMDSPRMNSSGKIVFQSLERSSSSPSSFNGGPR-LKHSSIERSYSANVRVPPVLNVPMSSLRGSSKFAFSQLF

Query:  SSPQKRTEATYGGGGGKGQTR
        SS    + +     G     R
Subjt:  SSPQKRTEATYGGGGGKGQTR

AT3G05980.1 unknown protein1.0e-0629.32Show/hide
Query:  LSPRVSFSREFPDDSSANLSGFELSPSSITDTSHASKPAISGTDLEGSASDFEFRLEH---PVTLIPANELFFNGKLVP---------LQLPSLKSSVKE
        L PR+SFS +  D       G  +  + +       K ++         SDFEF       P  ++ A+ELF  GKL+P         L+  +LK++ +E
Subjt:  LSPRVSFSREFPDDSSANLSGFELSPSSITDTSHASKPAISGTDLEGSASDFEFRLEH---PVTLIPANELFFNGKLVP---------LQLPSLKSSVKE

Query:  ELSATEIESRSPD---TTTLRRVTEIGNADPYSFSPRAPRCSSRWREILGLKKANQMTSSIAAKNENQKTDLSSSSSRMKSLKQFLHRNSK
        E    ++E +  D        RVT   + DP   SPR P+C+  W+E+L LKK    +SS            SSS+S   SL+    R  K
Subjt:  ELSATEIESRSPD---TTTLRRVTEIGNADPYSFSPRAPRCSSRWREILGLKKANQMTSSIAAKNENQKTDLSSSSSRMKSLKQFLHRNSK

AT3G12970.1 unknown protein4.9e-5439.71Show/hide
Query:  MASACINNVGIPPENFLDGSRATYSSYGWLSPRVSFSREFPDDSSANLSGFELSPSSITDTSHASKPAISGTDLEGSASDFEFRLEHPVTLIPANELFFN
        MAS C+ NVG  P            S+ W S ++S +RE                         S+P     + E    DFEF LE PVT++ A+ELF +
Subjt:  MASACINNVGIPPENFLDGSRATYSSYGWLSPRVSFSREFPDDSSANLSGFELSPSSITDTSHASKPAISGTDLEGSASDFEFRLEHPVTLIPANELFFN

Query:  GKLVPLQLPSLKSSVKEELSATEIESRSPDTTTLRRVTEIGNADPYSFSPRAPRCSSRWREILGLKKANQMTSSIAAKNENQKTDLSSSSSRMKSLKQFL
        GKLVPL+   +  +  EE   T +   +        +   G  DPY FSPRAPRC+ RWRE+LGLK+  + T   A+ + + +   SS + +  S + FL
Subjt:  GKLVPLQLPSLKSSVKEELSATEIESRSPDTTTLRRVTEIGNADPYSFSPRAPRCSSRWREILGLKKANQMTSSIAAKNENQKTDLSSSSSRMKSLKQFL

Query:  HRNSKLVSSESSDTLNHPLLKD---LDCESVSISSSRLSL-SSSSSGLSLDDLPRLSLDSD-KPSKFNRESKNRLNTVKPIASRSEAKRVGRSPVRRPPG
        +R+SK  + + S   + P  KD   L+  S SISSSRLSL SSSSSG  LDDLPRLSLD D KP   N  +++R +    + ++++ ++  R        
Subjt:  HRNSKLVSSESSDTLNHPLLKD---LDCESVSISSSRLSL-SSSSSGLSLDDLPRLSLDSD-KPSKFNRESKNRLNTVKPIASRSEAKRVGRSPVRRPPG

Query:  ESGRVKSR--EVSMDSPRMNSSGKIVFQSLERSSSSPSSFNGGPRLK-HSSIERSYSANVRVPPVLNVPMSSLRGSSK--FAFSQLFSSPQKRTEATYGG
        ES  ++SR   V+ DSPR+N+SGKIVF  LERSSSSP +F GGPR+K H  + RS+SANVR+ PVLNVP+SSLR   K    F QLF+S    + ++  G
Subjt:  ESGRVKSR--EVSMDSPRMNSSGKIVFQSLERSSSSPSSFNGGPRLK-HSSIERSYSANVRVPPVLNVPMSSLRGSSK--FAFSQLFSSPQKRTEATYGG

Query:  GGGKGQTRHCRNR
           + Q+ + +NR
Subjt:  GGGKGQTRHCRNR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCCGCGTGCATCAATAACGTCGGAATTCCGCCGGAGAACTTCCTCGACGGCTCACGGGCCACCTACAGTTCTTACGGTTGGTTGAGCCCTCGCGTATCCTTCAG
TCGCGAGTTTCCCGACGACTCGTCCGCCAATCTCTCCGGCTTTGAACTTAGTCCTTCCTCCATTACTGATACTTCTCATGCGAGTAAGCCGGCGATTTCAGGTACGGATC
TGGAAGGTTCGGCTAGTGATTTTGAGTTTAGGCTGGAACATCCGGTTACTCTGATTCCTGCTAACGAACTCTTCTTCAACGGAAAACTCGTGCCGCTGCAGCTTCCGTCG
TTGAAATCGTCGGTCAAGGAAGAACTCTCCGCGACGGAGATTGAATCGCGGTCGCCTGATACAACGACGCTGCGGAGAGTGACGGAAATTGGTAATGCGGATCCGTACTC
TTTCTCTCCTCGTGCTCCAAGGTGCTCGAGTCGGTGGAGGGAGATTCTAGGGCTGAAGAAGGCTAATCAGATGACCAGTTCTATAGCCGCGAAGAACGAAAATCAGAAGA
CGGATTTGTCTTCATCGAGCTCACGAATGAAATCTCTGAAGCAATTTCTCCACAGGAATTCCAAGCTAGTGTCCTCCGAGTCTTCGGATACTCTAAATCATCCATTATTG
AAAGATTTGGACTGCGAGTCAGTTTCCATATCCTCTTCTCGCCTCTCTCTTTCTTCCTCATCCTCTGGTCTTTCACTCGACGATCTCCCTAGACTCTCACTCGATTCGGA
CAAGCCATCAAAGTTCAATCGTGAATCAAAGAATCGGTTAAATACGGTGAAGCCGATAGCATCGCGATCAGAAGCGAAGAGAGTAGGGCGTAGCCCGGTTCGTCGGCCGC
CAGGGGAATCAGGTAGAGTGAAAAGCAGAGAAGTATCCATGGATAGTCCGAGAATGAACTCCTCAGGGAAAATAGTGTTTCAGAGTCTGGAAAGGAGTTCGAGTAGTCCG
AGCAGCTTCAATGGCGGACCGAGATTGAAGCACAGCAGTATCGAAAGGTCATACTCCGCGAATGTAAGAGTGCCGCCGGTGCTGAACGTTCCGATGAGCTCGCTGAGGGG
GTCATCAAAGTTCGCGTTCAGCCAGCTGTTTTCCTCGCCGCAGAAAAGAACCGAAGCGACTTACGGTGGCGGTGGAGGCAAAGGCCAGACGAGACACTGCAGAAACCGGA
TCGCTGGAGCCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCCGCGTGCATCAATAACGTCGGAATTCCGCCGGAGAACTTCCTCGACGGCTCACGGGCCACCTACAGTTCTTACGGTTGGTTGAGCCCTCGCGTATCCTTCAG
TCGCGAGTTTCCCGACGACTCGTCCGCCAATCTCTCCGGCTTTGAACTTAGTCCTTCCTCCATTACTGATACTTCTCATGCGAGTAAGCCGGCGATTTCAGGTACGGATC
TGGAAGGTTCGGCTAGTGATTTTGAGTTTAGGCTGGAACATCCGGTTACTCTGATTCCTGCTAACGAACTCTTCTTCAACGGAAAACTCGTGCCGCTGCAGCTTCCGTCG
TTGAAATCGTCGGTCAAGGAAGAACTCTCCGCGACGGAGATTGAATCGCGGTCGCCTGATACAACGACGCTGCGGAGAGTGACGGAAATTGGTAATGCGGATCCGTACTC
TTTCTCTCCTCGTGCTCCAAGGTGCTCGAGTCGGTGGAGGGAGATTCTAGGGCTGAAGAAGGCTAATCAGATGACCAGTTCTATAGCCGCGAAGAACGAAAATCAGAAGA
CGGATTTGTCTTCATCGAGCTCACGAATGAAATCTCTGAAGCAATTTCTCCACAGGAATTCCAAGCTAGTGTCCTCCGAGTCTTCGGATACTCTAAATCATCCATTATTG
AAAGATTTGGACTGCGAGTCAGTTTCCATATCCTCTTCTCGCCTCTCTCTTTCTTCCTCATCCTCTGGTCTTTCACTCGACGATCTCCCTAGACTCTCACTCGATTCGGA
CAAGCCATCAAAGTTCAATCGTGAATCAAAGAATCGGTTAAATACGGTGAAGCCGATAGCATCGCGATCAGAAGCGAAGAGAGTAGGGCGTAGCCCGGTTCGTCGGCCGC
CAGGGGAATCAGGTAGAGTGAAAAGCAGAGAAGTATCCATGGATAGTCCGAGAATGAACTCCTCAGGGAAAATAGTGTTTCAGAGTCTGGAAAGGAGTTCGAGTAGTCCG
AGCAGCTTCAATGGCGGACCGAGATTGAAGCACAGCAGTATCGAAAGGTCATACTCCGCGAATGTAAGAGTGCCGCCGGTGCTGAACGTTCCGATGAGCTCGCTGAGGGG
GTCATCAAAGTTCGCGTTCAGCCAGCTGTTTTCCTCGCCGCAGAAAAGAACCGAAGCGACTTACGGTGGCGGTGGAGGCAAAGGCCAGACGAGACACTGCAGAAACCGGA
TCGCTGGAGCCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASACINNVGIPPENFLDGSRATYSSYGWLSPRVSFSREFPDDSSANLSGFELSPSSITDTSHASKPAISGTDLEGSASDFEFRLEHPVTLIPANELFFNGKLVPLQLPS
LKSSVKEELSATEIESRSPDTTTLRRVTEIGNADPYSFSPRAPRCSSRWREILGLKKANQMTSSIAAKNENQKTDLSSSSSRMKSLKQFLHRNSKLVSSESSDTLNHPLL
KDLDCESVSISSSRLSLSSSSSGLSLDDLPRLSLDSDKPSKFNRESKNRLNTVKPIASRSEAKRVGRSPVRRPPGESGRVKSREVSMDSPRMNSSGKIVFQSLERSSSSP
SSFNGGPRLKHSSIERSYSANVRVPPVLNVPMSSLRGSSKFAFSQLFSSPQKRTEATYGGGGGKGQTRHCRNRIAGA