; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg20390 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg20390
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description50S ribosomal protein L7/L12
Genome locationCarg_Chr01:2297393..2300236
RNA-Seq ExpressionCarg20390
SyntenyCarg20390
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000206 - Ribosomal protein L7/L12
IPR013823 - Ribosomal protein L7/L12, C-terminal
IPR014719 - Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607092.1 50S ribosomal protein L7/L12, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.4e-152100Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMDFLFRTRH
        GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMDFLFRTRH
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMDFLFRTRH

Query:  YKTNNRWSKFRSSAHKGEVLPVIITQIEGRGGTRAETLRGRTFSSVPAKACRDRDGFLVIDVGHRQWLLAMGVSDNCM
        YKTNNRWSKFRSSAHKGEVLPVIITQIEGRGGTRAETLRGRTFSSVPAKACRDRDGFLVIDVGHRQWLLAMGVSDNCM
Subjt:  YKTNNRWSKFRSSAHKGEVLPVIITQIEGRGGTRAETLRGRTFSSVPAKACRDRDGFLVIDVGHRQWLLAMGVSDNCM

KAG7036781.1 50S ribosomal protein L7/L12, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.0e-157100Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMDFLFRTRH
        GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMDFLFRTRH
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMDFLFRTRH

Query:  YKTNNRWSKFRSSAHKGEVLPVIITQIEGRGGTRAETLRGRTFSSVPAKACRDRDGFLVIDVGHRQWLLAMGVSDNCMVVTYDERQ
        YKTNNRWSKFRSSAHKGEVLPVIITQIEGRGGTRAETLRGRTFSSVPAKACRDRDGFLVIDVGHRQWLLAMGVSDNCMVVTYDERQ
Subjt:  YKTNNRWSKFRSSAHKGEVLPVIITQIEGRGGTRAETLRGRTFSSVPAKACRDRDGFLVIDVGHRQWLLAMGVSDNCMVVTYDERQ

XP_022949504.1 uncharacterized protein LOC111452831 [Cucurbita moschata]4.1e-9798.45Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MKMIAVAQSLQARSTLPKIIG LQVRFFQPDFTPRDPNAKPK+YKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD
        GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVM+
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD

XP_022998047.1 uncharacterized protein LOC111492812 [Cucurbita maxima]8.5e-9596.37Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MKMI VAQSLQARS LPKIIG LQVRFFQPDFTPRDPNAKPK+YKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD
        GMD+GS GGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVM+
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD

XP_023525921.1 uncharacterized protein LOC111789392 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-9798.96Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGP LTERLKHPKLEQISVD
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD
        GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVM+
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BPI3 50S ribosomal protein L7/L121.6e-8386.01Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MK+  VA+SLQARSTL KIIG  QVRFFQPDFTPRDP AKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPS+KII LAERIAALP  ER QIGP L E+L+HPKL++ISVD
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD
        G+DMGS GGAA GSS VEEKKEKTAFDVKLEKF+AA+KIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEKIKAAGGVAVM+
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD

A0A5A7U2A3 50S ribosomal protein L7/L121.6e-8386.01Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MK+  VA+SLQARSTL KIIG  QVRFFQPDFTPRDP AKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPS+KII LAERIAALP  ER QIGP L E+L+HPKL++ISVD
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD
        G+DMGS GGAA GSS VEEKKEKTAFDVKLEKF+AA+KIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEKIKAAGGVAVM+
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD

A0A6J1DM08 uncharacterized protein LOC1110222074.1e-8787.05Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MK++AVA+SLQ  STLPK+IGS QVRFFQPDF PRD  AKPK+YKYPPFYDPYGPRPPPS+KIIQLAE+I ALPVDERCQIGPALTERL+HPKL+ ISVD
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD
        G+DMGS GGA  GSSKVEEKKEKTAFDVKLEKF+AAAKIKVIKEVR+FTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEKIKAAGGVAVM+
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD

A0A6J1GD07 uncharacterized protein LOC1114528312.0e-9798.45Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MKMIAVAQSLQARSTLPKIIG LQVRFFQPDFTPRDPNAKPK+YKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD
        GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVM+
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD

A0A6J1K6S5 uncharacterized protein LOC1114928124.1e-9596.37Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MKMI VAQSLQARS LPKIIG LQVRFFQPDFTPRDPNAKPK+YKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD
        GMD+GS GGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVM+
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2C031 50S ribosomal protein L7/L122.9e-1352.5Show/hide
Query:  GAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGG
        GAA G    +  +EKT F+V LE F+A++KIKV+KEVR  T LGL EAK LVE  P  +K+G TKE+A ++ + I+A GG
Subjt:  GAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGG

A9BDG4 50S ribosomal protein L7/L122.6e-1440.31Show/hide
Query:  SNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVDGMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDL
        S K  ++ + + +L + E  ++   + E           V     G+GGGA   S+  E  +EKT FDV LE F+AAAKIKV+KEVR  T LGL EAK +
Subjt:  SNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVDGMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDL

Query:  VEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGG
        VE  P  +K+G +KE+A ++ + I+A GG
Subjt:  VEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGG

B3PW58 50S ribosomal protein L7/L122.9e-1341.41Show/hide
Query:  IIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVDGMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEK
        + ++ E +++L V E  ++   L E+        ++V  +  G+GG AA        ++EKT FDV L     A KI VIKEVRA T LGLKEAKDLVE 
Subjt:  IIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVDGMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEK

Query:  VPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVA
         P  +K+GV+K EA  I +K++ AG  A
Subjt:  VPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVA

P41189 50S ribosomal protein L7/L124.5e-1437.12Show/hide
Query:  NKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVDGMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLV
        + I  + E++++L + +  ++   L E         ++V     G    A           EKT F+V LE F+A  KI VIKEVRA T LGLKEAKD V
Subjt:  NKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVDGMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLV

Query:  EKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVM
        E  P  LK GV+K+EA  + +K++AAG   ++
Subjt:  EKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVM

Q46HH2 50S ribosomal protein L7/L121.3e-1353.75Show/hide
Query:  GAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGG
        GAA G    +  +EKT F+V LE FEA++KIKV+KEVR  T LGL EAK LVE  P  +K+G TKE+A ++ + I+A GG
Subjt:  GAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G70190.1 Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation;Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like9.5e-2843.64Show/hide
Query:  DPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISV------DGMDMGSGGGAATGSSKVEEKK-EKTAFDV
        D    P  Y  P  +DP   R PP++++ +L + I++L + E  ++G  + ++    +L  ++V       G+ +G GGG  + S   EE K EKT F++
Subjt:  DPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISV------DGMDMGSGGGAATGSSKVEEKK-EKTAFDV

Query:  KLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD
        KLE FEA+AKIK+IKE+R+FT+LGLKEAK LVEK PAILK G++KEE   I+EK+KA G   V++
Subjt:  KLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD

AT1G70190.2 Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation;Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like9.5e-2843.64Show/hide
Query:  DPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISV------DGMDMGSGGGAATGSSKVEEKK-EKTAFDV
        D    P  Y  P  +DP   R PP++++ +L + I++L + E  ++G  + ++    +L  ++V       G+ +G GGG  + S   EE K EKT F++
Subjt:  DPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISV------DGMDMGSGGGAATGSSKVEEKK-EKTAFDV

Query:  KLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD
        KLE FEA+AKIK+IKE+R+FT+LGLKEAK LVEK PAILK G++KEE   I+EK+KA G   V++
Subjt:  KLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD

AT3G06040.1 Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein1.5e-6065.8Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MK+I++ +++++R   P++I S+QVRF Q D   +   AKPKKYKYP  YDPYGPRP PS+KI++LAERIAAL  +ER QIGPAL E L+ PK + IS D
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD
        G+    G    TG+  VEEKKEKTAFDVKLEKF A+ KIKVIKEVR FT+LGLKEAK+LVEKVPAILKQGVTKEEAN II KIKA GG+AVM+
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD

AT3G06040.2 Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein1.5e-6065.8Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MK+I++ +++++R   P++I S+QVRF Q D   +   AKPKKYKYP  YDPYGPRP PS+KI++LAERIAAL  +ER QIGPAL E L+ PK + IS D
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD
        G+    G    TG+  VEEKKEKTAFDVKLEKF A+ KIKVIKEVR FT+LGLKEAK+LVEKVPAILKQGVTKEEAN II KIKA GG+AVM+
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD

AT3G06040.3 Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein1.5e-6065.8Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MK+I++ +++++R   P++I S+QVRF Q D   +   AKPKKYKYP  YDPYGPRP PS+KI++LAERIAAL  +ER QIGPAL E L+ PK + IS D
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD
        G+    G    TG+  VEEKKEKTAFDVKLEKF A+ KIKVIKEVR FT+LGLKEAK+LVEKVPAILKQGVTKEEAN II KIKA GG+AVM+
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGATGATTGCAGTTGCACAATCCCTTCAAGCCCGTTCCACACTTCCTAAAATCATCGGGTCGTTGCAGGTCCGCTTCTTCCAGCCTGATTTTACTCCCAGAGACCC
AAATGCCAAGCCAAAAAAATACAAGTATCCACCATTTTATGATCCATATGGCCCTAGGCCCCCACCCTCTAATAAAATCATTCAGCTAGCTGAAAGAATTGCAGCATTGC
CTGTCGATGAGCGTTGCCAAATTGGTCCCGCACTCACTGAAAGGCTTAAACATCCGAAGCTGGAGCAAATTTCAGTTGATGGCATGGACATGGGTTCCGGAGGAGGAGCA
GCCACAGGATCTTCCAAAGTAGAGGAGAAAAAGGAGAAAACCGCTTTCGACGTGAAGTTAGAGAAGTTCGAGGCAGCTGCCAAAATTAAGGTGATTAAAGAAGTGAGGGC
TTTCACTAATTTGGGTCTGAAGGAGGCAAAAGACTTGGTAGAGAAAGTACCTGCAATTCTTAAGCAAGGAGTGACCAAGGAGGAAGCGAACAGCATTATCGAAAAAATCA
AAGCTGCTGGAGGCGTTGCAGTCATGGATTTTCTTTTTAGAACACGACATTACAAAACAAATAATAGGTGGAGTAAATTCAGATCTTCTGCTCATAAAGGTGAGGTGCTG
CCGGTGATAATAACACAAATAGAAGGTCGAGGTGGTACCCGTGCTGAGACTCTCCGCGGTCGCACATTTTCTTCCGTTCCTGCCAAGGCTTGCAGAGACAGAGATGGTTT
CCTGGTCATTGATGTTGGTCATCGACAATGGTTACTAGCAATGGGTGTTAGCGACAATTGTATGGTGGTCACCTACGATGAGCGACAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAGATGATTGCAGTTGCACAATCCCTTCAAGCCCGTTCCACACTTCCTAAAATCATCGGGTCGTTGCAGGTCCGCTTCTTCCAGCCTGATTTTACTCCCAGAGACCC
AAATGCCAAGCCAAAAAAATACAAGTATCCACCATTTTATGATCCATATGGCCCTAGGCCCCCACCCTCTAATAAAATCATTCAGCTAGCTGAAAGAATTGCAGCATTGC
CTGTCGATGAGCGTTGCCAAATTGGTCCCGCACTCACTGAAAGGCTTAAACATCCGAAGCTGGAGCAAATTTCAGTTGATGGCATGGACATGGGTTCCGGAGGAGGAGCA
GCCACAGGATCTTCCAAAGTAGAGGAGAAAAAGGAGAAAACCGCTTTCGACGTGAAGTTAGAGAAGTTCGAGGCAGCTGCCAAAATTAAGGTGATTAAAGAAGTGAGGGC
TTTCACTAATTTGGGTCTGAAGGAGGCAAAAGACTTGGTAGAGAAAGTACCTGCAATTCTTAAGCAAGGAGTGACCAAGGAGGAAGCGAACAGCATTATCGAAAAAATCA
AAGCTGCTGGAGGCGTTGCAGTCATGGATTTTCTTTTTAGAACACGACATTACAAAACAAATAATAGGTGGAGTAAATTCAGATCTTCTGCTCATAAAGGTGAGGTGCTG
CCGGTGATAATAACACAAATAGAAGGTCGAGGTGGTACCCGTGCTGAGACTCTCCGCGGTCGCACATTTTCTTCCGTTCCTGCCAAGGCTTGCAGAGACAGAGATGGTTT
CCTGGTCATTGATGTTGGTCATCGACAATGGTTACTAGCAATGGGTGTTAGCGACAATTGTATGGTGGTCACCTACGATGAGCGACAATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGSLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVDGMDMGSGGGA
ATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVMDFLFRTRHYKTNNRWSKFRSSAHKGEVL
PVIITQIEGRGGTRAETLRGRTFSSVPAKACRDRDGFLVIDVGHRQWLLAMGVSDNCMVVTYDERQ