; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg20722 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg20722
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionRING-type domain-containing protein
Genome locationCarg_Chr18:9408107..9413266
RNA-Seq ExpressionCarg20722
SyntenyCarg20722
Gene Ontology termsGO:0080115 - myosin XI tail binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7012926.1 hypothetical protein SDJN02_25679 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.6e-267100Show/hide
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        EEERPPSMAASEIVQLQQRHTVSGLREGF SRLENIVRGQADGQSDNATNS MNDSRNDRGQTNGSQNIQQEYVQSQLENQV ETSRLSDQIENMESNSE
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        VENMN
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A0A6J1HYW7 uncharacterized protein LOC111467493 isoform X12.1e-26499.21Show/hide
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        VENMN
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G30860.1 RING/U-box superfamily protein3.3e-0727.88Show/hide
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        G  ES   D    +++R+    SR+  L    GE++  R   V + ++  S +   R       G GGG ++ R  R    +   E  N  +     ++R
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Query:  GRQAILDLLVRIERERQRELQGLLEHRAVSDFAHRNRIQSLLRGRFLRNERTVEEERPPSMAASEIVQLQQRHTVSGLREGFRSRLENIVRGQADGQSDN
        GRQA  D L+++ER+R REL  L E  AVS F  R R+QS+LR R L     +++    +   + + +++    V  LRE F + + N      D + ++
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          +++MN+
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AT2G27950.1 Ring/U-Box superfamily protein9.1e-6643.56Show/hide
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        MA+A L  + ++DSSF R+SE   +RQ+      + +AS++LQMWR LEDDHV+  ARER  ER     SV S +N    N  DS  S +       +  
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Query:  ENDFGAWNHEQ--IASQHVRDENNVSSREQSPDLGEVERERVRQIVRGWMESGITDPSPNVSERSSRSRAEWLGETERERVRIVREWVQMTSQQRGSRGE
        EN+ G W+  Q  + S +  ++      E   DLG  ERERVRQI R W  SG    + + S+ ++ SRAEWLGETE+ERVRI+RE VQM SQQR + G+
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Query:  RREDRGTGGGAQVDRGRDELVAEQDEGQNEHIRRDLLRLRGRQAILDLLVRIERERQRELQGLLEHRAVSDFAHRNRIQSLLRGRFLRNERTVEEERPPS
         RE++   G  Q++R  D +V   +  QNEH RR + +L GRQ  +D+L   E ERQREL+GL++H AVS+FAHRNRIQ+LLRGRFLRN    ++E+P S
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Query:  MAASEIVQLQQRHTVSGLREGFRSRLENIVRGQA-DGQSDNATNSDMNDSRNDRGQTNGSQNIQQEYVQSQLENQVAETSRLSDQIEN
         AA+E+  L++RHTVS LRE F SRL+    GQA    S+ ++N++ + +R ++   N   +I      S    + A+     D+I N
Subjt:  MAASEIVQLQQRHTVSGLREGFRSRLENIVRGQA-DGQSDNATNSDMNDSRNDRGQTNGSQNIQQEYVQSQLENQVAETSRLSDQIEN

AT5G04460.1 RING/U-box superfamily protein4.6e-15063.41Show/hide
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        MT  QPL QK++S    RAE ERGLEE MRGHLDECI F SCSS  N E E+ E DQL+RRRRRS+LEGD+LAESSAARRR S+ILSRWAARQAQEMITT
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        IERRNRESEL+ALA L TVSMLDSSFLRE  S+SP+SR+Q    E P TQAS ILQMWR LED+HVLNRARERVRERLRQQ SV+S+TN+SS+  S+S+ 
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        SEN GSL D+SESENDFG+W+H++  ++H  D NN SSREQSPDLG+ ERERVR I RGWM+S I D S NV +R    R EWLG+TERERVRI+REW+Q
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Query:  LSDQIENMESN
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AT5G04460.2 RING/U-box superfamily protein4.6e-15063.41Show/hide
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AT5G04460.3 RING/U-box superfamily protein4.6e-15063.41Show/hide
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        MTSQQRG          R     DR      QVDR R  L    +EGQ  H+RRDL R+RGRQA+LDLL+R ERERQRELQGLLEHRAVSDFAHRNRIQS
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Query:  LSDQIENMESN
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACGGATTATCAACCGCTACAACAGAAGGCTGATTCTAGTGGTGCCCGAGCGGAATTAGAGCGTGGACTGGAGGAGTTAATGCGTGGGCACCTGGATGAATGTATTCC
ATTTGCTTCATGTAGTTCTGCTGCCAATCATGAAGTTGAGGAAGAAGAAGGTGATCAGCTTCTACGGAGGAGAAGGCGGTCTGATCTTGAGGGTGATGATTTAGCAGAGT
CTTCAGCTGCGCGACGTCGCCACTCTCGTATTTTGAGCCGCTGGGCTGCTCGGCAGGCACAGGAAATGATAACAACAATTGAGAGGAGAAATCGTGAATCTGAGTTGATG
GCACTTGCAAGATTGCATACGGTTTCAATGCTTGATTCATCTTTTTTAAGGGAGTCTGAGTCTCCAACTTCAAGGCAGCAGACTACCGTTGAGACTCCGACCACACAAGC
TTCTGCAATATTACAGATGTGGAGGGGGCTGGAGGATGACCATGTATTAAATCGGGCTCGTGAGAGGGTCAGGGAAAGGTTGAGGCAGCAAACAAGTGTTGATTCTTCTA
CCAATATGTCCAGTACAAATATGTCTGATAGTCGGGCGAGTGAGAATCAGGGAAGCTTGGTGGATGCAAGTGAGAGTGAGAACGATTTTGGGGCATGGAATCATGAACAA
ATTGCATCACAGCATGTGAGGGATGAAAATAATGTTTCTAGCAGAGAACAATCTCCTGATCTTGGTGAAGTTGAGAGGGAGAGAGTGAGGCAAATCGTTCGGGGATGGAT
GGAGAGTGGAATTACGGATCCATCACCAAATGTTTCTGAGAGAAGCTCAAGATCCAGAGCTGAATGGCTTGGGGAAACAGAACGTGAGAGAGTCAGGATTGTTAGGGAAT
GGGTACAAATGACCAGTCAACAAAGAGGAAGTCGTGGTGAAAGGAGGGAAGATCGAGGGACCGGAGGTGGTGCTCAAGTTGATAGAGGCCGTGATGAATTGGTAGCTGAA
CAGGATGAAGGCCAAAATGAACACATCCGCAGGGACTTGTTAAGGCTGCGAGGAAGACAAGCAATACTTGATTTACTTGTAAGGATAGAGAGGGAAAGACAGAGGGAACT
TCAAGGGCTTTTGGAGCATCGAGCTGTTTCGGACTTCGCCCATCGCAACCGCATCCAGTCATTACTTAGAGGTAGATTTTTGAGAAATGAAAGAACTGTTGAAGAGGAGC
GGCCACCTTCCATGGCAGCAAGTGAGATAGTTCAATTACAGCAGCGACACACTGTTTCTGGTTTAAGGGAGGGGTTCCGCTCTAGATTGGAAAATATTGTTCGTGGTCAA
GCAGACGGCCAATCTGATAATGCAACTAACAGCGACATGAATGATTCGAGAAACGATCGAGGTCAAACAAATGGTTCACAGAACATCCAGCAAGAATATGTACAGTCACA
GCTTGAGAATCAGGTAGCCGAAACCAGTCGGTTGTCTGATCAAATTGAAAACATGGAAAGCAACTCAGAGGTTGAGAATATGAATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GATTGTTTGTTGTGGAGCCTGCTGGGATTCAATCCGATTGCGTAGCTTTAGCTCATGTTCATCTATTGGTTGAAGATATTGTTAGGGCTGGTTTTGTGTTGTGGTGATTT
TGTTTGTTTGGGGTGGAAGGGATAAGGATTAATGGTGTTGTTAATTTTGATAGAAGGTTTAAGGTTTTGTTTTGTGCCTGATGGTGGCAGTTGGGTTGGAGATTGCAGAG
CATGACGGATTATCAACCGCTACAACAGAAGGCTGATTCTAGTGGTGCCCGAGCGGAATTAGAGCGTGGACTGGAGGAGTTAATGCGTGGGCACCTGGATGAATGTATTC
CATTTGCTTCATGTAGTTCTGCTGCCAATCATGAAGTTGAGGAAGAAGAAGGTGATCAGCTTCTACGGAGGAGAAGGCGGTCTGATCTTGAGGGTGATGATTTAGCAGAG
TCTTCAGCTGCGCGACGTCGCCACTCTCGTATTTTGAGCCGCTGGGCTGCTCGGCAGGCACAGGAAATGATAACAACAATTGAGAGGAGAAATCGTGAATCTGAGTTGAT
GGCACTTGCAAGATTGCATACGGTTTCAATGCTTGATTCATCTTTTTTAAGGGAGTCTGAGTCTCCAACTTCAAGGCAGCAGACTACCGTTGAGACTCCGACCACACAAG
CTTCTGCAATATTACAGATGTGGAGGGGGCTGGAGGATGACCATGTATTAAATCGGGCTCGTGAGAGGGTCAGGGAAAGGTTGAGGCAGCAAACAAGTGTTGATTCTTCT
ACCAATATGTCCAGTACAAATATGTCTGATAGTCGGGCGAGTGAGAATCAGGGAAGCTTGGTGGATGCAAGTGAGAGTGAGAACGATTTTGGGGCATGGAATCATGAACA
AATTGCATCACAGCATGTGAGGGATGAAAATAATGTTTCTAGCAGAGAACAATCTCCTGATCTTGGTGAAGTTGAGAGGGAGAGAGTGAGGCAAATCGTTCGGGGATGGA
TGGAGAGTGGAATTACGGATCCATCACCAAATGTTTCTGAGAGAAGCTCAAGATCCAGAGCTGAATGGCTTGGGGAAACAGAACGTGAGAGAGTCAGGATTGTTAGGGAA
TGGGTACAAATGACCAGTCAACAAAGAGGAAGTCGTGGTGAAAGGAGGGAAGATCGAGGGACCGGAGGTGGTGCTCAAGTTGATAGAGGCCGTGATGAATTGGTAGCTGA
ACAGGATGAAGGCCAAAATGAACACATCCGCAGGGACTTGTTAAGGCTGCGAGGAAGACAAGCAATACTTGATTTACTTGTAAGGATAGAGAGGGAAAGACAGAGGGAAC
TTCAAGGGCTTTTGGAGCATCGAGCTGTTTCGGACTTCGCCCATCGCAACCGCATCCAGTCATTACTTAGAGGTAGATTTTTGAGAAATGAAAGAACTGTTGAAGAGGAG
CGGCCACCTTCCATGGCAGCAAGTGAGATAGTTCAATTACAGCAGCGACACACTGTTTCTGGTTTAAGGGAGGGGTTCCGCTCTAGATTGGAAAATATTGTTCGTGGTCA
AGCAGACGGCCAATCTGATAATGCAACTAACAGCGACATGAATGATTCGAGAAACGATCGAGGTCAAACAAATGGTTCACAGAACATCCAGCAAGAATATGTACAGTCAC
AGCTTGAGAATCAGGTAGCCGAAACCAGTCGGTTGTCTGATCAAATTGAAAACATGGAAAGCAACTCAGAGGTTGAGAATATGAATTGATGGGGACTGGCACCAGCAAAT
TACTGAAGATAATAGAAGAAACTGGCAAAGGACAACCTTTGGGCCACTCACTGAATGGAGAGATGATAATGCTGAGGATGCGACGACAAACTGGCAGGCAAATTCATCTA
ATGCTTGGTCACCACCCAGCACACAGGGAAATGCAGAAAGAAGAGAAGCTCATCCTGCAGAACCTGCTGCGGTTTGGCAAGAGAGAGGCGCTCGAGAAGCTGCTGGAAAT
TGGTCGGAGGGGCCCTCGGGTCCTTTTAGAAATCGTCGGTCTGCTCCAGTTGGACGGTTCAACAGGTTTCACCCACCTGATGACGATAACGTCTATAGTATGGAACTGAG
GGAGCTCTTAGGCAGGAGAAGTGTTTCGAACCTTCTTCGTAGTGGTTTCCGTGAAAGTTTGGACCAATTAATACAATCGTATGTGGATAGGCGGGGTCGGGCTCCCATAG
ATTGGGATTTGCACAGAACTTTGCCTACACCAACACCTGCTTCTCCACCTCAAGATCAGGACCAACGGAGGGATGAACAGAATGAACAACAAAATGATGCTGGAAATAGA
CCCTCTTTGGTGCTTCCTTCTCCACCAGTTCCTCCACCTCAACCACTTTGGCATCATGACCTGCATCATACCAGCTGGTCTCGCCATACCATGCAGCGTTCAGAAATTCA
GGAATGGGAGTTTATCAACGACCTAAAAGCAGACATGGCAAGACTTCATCAAGGCATGAATCACATGCAGAGGATGTTGGAGGCTTGCATGGACATGCAACTGGAGTTGC
AGCGATCTGTGAGACAAGAAGTCTCTGCAGCATTGAACAGATCTGCTGGTGAAAAAGGTCTAGGTCCCGAGACATCAGAGGATGGTTCTAAATGGTGCCATGTGAGGAAG
GGAACATGTTGCGTTTGCTGCGACAGCCATATCGACTCCCTCCTTTACAGATGTGGACATATGTGCACGTGTTCAAAATGTGCAAATGAGTTAGTCCGTGGAGGGGGCAA
GTGCCCGCTGTGTCGAGCACCAATCGTCGAAGTGATCCGGGCATACTCGATACTGTAGAAGGAAAAAAGGAAGTAACAGTTAATTCAGTAGAGTGTGCAAAATCGGATCC
ATCTTTGGTAAGTTCTTTATGTCATATCACAGATGGGAGCCGGTGAGGTTAGTGTTCAGTAGGTACCGCTGTGTTCTGATAATATGGAACCATTATCTTGCGTTGTATAA
TTGAAATGATAAATTGCGTGGTCGATTCATCATTTTTTACGTAAATAAAAAAGGAAAAATGTAAGTCTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTDYQPLQQKADSSGARAELERGLEELMRGHLDECIPFASCSSAANHEVEEEEGDQLLRRRRRSDLEGDDLAESSAARRRHSRILSRWAARQAQEMITTIERRNRESELM
ALARLHTVSMLDSSFLRESESPTSRQQTTVETPTTQASAILQMWRGLEDDHVLNRARERVRERLRQQTSVDSSTNMSSTNMSDSRASENQGSLVDASESENDFGAWNHEQ
IASQHVRDENNVSSREQSPDLGEVERERVRQIVRGWMESGITDPSPNVSERSSRSRAEWLGETERERVRIVREWVQMTSQQRGSRGERREDRGTGGGAQVDRGRDELVAE
QDEGQNEHIRRDLLRLRGRQAILDLLVRIERERQRELQGLLEHRAVSDFAHRNRIQSLLRGRFLRNERTVEEERPPSMAASEIVQLQQRHTVSGLREGFRSRLENIVRGQ
ADGQSDNATNSDMNDSRNDRGQTNGSQNIQQEYVQSQLENQVAETSRLSDQIENMESNSEVENMN