; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg21006 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg21006
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCarg_Chr14:14291653..14293154
RNA-Seq ExpressionCarg21006
SyntenyCarg21006
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6582609.1 hypothetical protein SDJN03_22611, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.7e-79100Show/hide
Query:  MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHE
        MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHE
Subjt:  MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHE

Query:  EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS
        EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS
Subjt:  EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS

XP_022924543.1 uncharacterized protein LOC111431995 isoform X1 [Cucurbita moschata]9.4e-7295.54Show/hide
Query:  MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHE
        MSP NPGEDAGVSGFESQETEP YEVEELELEVNQIA RIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEG V   HE
Subjt:  MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHE

Query:  EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS
        EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS
Subjt:  EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS

XP_022980439.1 uncharacterized protein LOC111479807 [Cucurbita maxima]7.7e-7496.18Show/hide
Query:  MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHE
        MSPDNPGEDAGVSGFESQ+TEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLP+GASELGTSAA PDHEDDEQTTTRGEGTV   HE
Subjt:  MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHE

Query:  EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS
        EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS
Subjt:  EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS

XP_023529149.1 uncharacterized protein LOC111791880 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.4e-6783.71Show/hide
Query:  MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHED-----------------
        MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRS+LSAQLKSS FSLLESSRPLPIGAS L TSA+RPDHED                 
Subjt:  MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHED-----------------

Query:  ----DEQTTTRGEGTVHHHHEEGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS
            DEQTTTRGEGTV   HEEGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS
Subjt:  ----DEQTTTRGEGTVHHHHEEGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS

XP_023529150.1 uncharacterized protein LOC111791880 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.0e-7094.9Show/hide
Query:  MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHE
        MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRS+LSAQLKSS FSLLESSRPLPIGAS L TSA+RPDHEDDEQTTTRGEGTV   HE
Subjt:  MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHE

Query:  EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS
        EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS
Subjt:  EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L8X5 Uncharacterized protein3.3e-5481.53Show/hide
Query:  MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHE
        MSPD PGEDAGVSGFE +ETEP  E+EELELEV Q+AQRI HYRSTLSAQ+KSSF SLLESSRPL I ASE G S ARPDHEDDEQ TTRGE T  + HE
Subjt:  MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHE

Query:  EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS
        EGLETAKKIQL++DKISSN  +IPTVLKRMKDCISTID L SYNGVIHPAFKRKKTS
Subjt:  EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS

A0A6J1ECS3 uncharacterized protein LOC111431995 isoform X14.6e-7295.54Show/hide
Query:  MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHE
        MSP NPGEDAGVSGFESQETEP YEVEELELEVNQIA RIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEG V   HE
Subjt:  MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHE

Query:  EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS
        EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS
Subjt:  EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS

A0A6J1FKW2 uncharacterized protein LOC111444897 isoform X16.9e-5275.8Show/hide
Query:  MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHE
        MS D PGED GVSGFES+E EP  E+EELELEVNQ+AQRI HYRSTLSAQLKSSF SLLES+RP+  G SE G S   P+HEDDEQ  TRGEGTV   H+
Subjt:  MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHE

Query:  EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS
        EGLE  KKIQLL+DKISSNI +IP VLKRMKDCISTIDNL SYNG IHPAFKR+K S
Subjt:  EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS

A0A6J1IGZ6 uncharacterized protein LOC111473350 isoform X11.4e-5277.07Show/hide
Query:  MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHE
        MS D PGED GVSGFES+E EP  E EELELEVNQ+AQRI HYRSTLSAQLKSSF SLLES+RP+  GASE G S   P+HEDDEQ  TRGEGTV   H+
Subjt:  MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHE

Query:  EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS
        EGLET KKIQLL+DKISSNI +IP VLKRMKDCISTIDNL SYNG IHPAFKR+K S
Subjt:  EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS

A0A6J1IZA2 uncharacterized protein LOC1114798073.7e-7496.18Show/hide
Query:  MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHE
        MSPDNPGEDAGVSGFESQ+TEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLP+GASELGTSAA PDHEDDEQTTTRGEGTV   HE
Subjt:  MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHE

Query:  EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS
        EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS
Subjt:  EGLETAKKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G00525.1 unknown protein4.9e-1034.9Show/hide
Query:  ESQETEPHYEVEE-----LELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRP----LPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHEEGLETA
        ES  ++P  +++E     LE +V Q+A++I  YR TL   L+++  S L S  P    +  G+  L +S             T  E  V    EE     
Subjt:  ESQETEPHYEVEE-----LELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRP----LPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHEEGLETA

Query:  KKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKK
        K IQ L++++S N   IP V+KRM++CI +ID L S    IHPAFKR++
Subjt:  KKIQLLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCCCAGACAATCCCGGTGAAGACGCCGGTGTTTCTGGATTTGAATCCCAAGAAACGGAGCCTCACTATGAGGTTGAAGAGCTGGAGCTTGAAGTGAATCAAATAGC
TCAGAGGATTCATCACTACAGATCCACTCTGTCGGCTCAGCTGAAGTCCTCCTTCTTTTCGTTACTCGAGTCCTCGAGGCCTCTCCCCATTGGAGCCTCGGAGCTGGGAA
CATCTGCTGCTCGTCCGGATCATGAAGATGATGAACAAACCACCACAAGAGGTGAAGGCACAGTCCATCATCATCATGAAGAGGGATTAGAAACTGCGAAGAAGATACAG
TTGCTTGAAGATAAAATATCAAGTAATATCATCCTGATCCCTACAGTTCTTAAGAGGATGAAAGACTGTATTTCAACTATTGACAATTTGGCTTCTTATAATGGGGTCAT
TCATCCTGCATTCAAAAGGAAAAAAACTAGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCCCCAGACAATCCCGGTGAAGACGCCGGTGTTTCTGGATTTGAATCCCAAGAAACGGAGCCTCACTATGAGGTTGAAGAGCTGGAGCTTGAAGTGAATCAAATAGC
TCAGAGGATTCATCACTACAGATCCACTCTGTCGGCTCAGCTGAAGTCCTCCTTCTTTTCGTTACTCGAGTCCTCGAGGCCTCTCCCCATTGGAGCCTCGGAGCTGGGAA
CATCTGCTGCTCGTCCGGATCATGAAGATGATGAACAAACCACCACAAGAGGTGAAGGCACAGTCCATCATCATCATGAAGAGGGATTAGAAACTGCGAAGAAGATACAG
TTGCTTGAAGATAAAATATCAAGTAATATCATCCTGATCCCTACAGTTCTTAAGAGGATGAAAGACTGTATTTCAACTATTGACAATTTGGCTTCTTATAATGGGGTCAT
TCATCCTGCATTCAAAAGGAAAAAAACTAGCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSPDNPGEDAGVSGFESQETEPHYEVEELELEVNQIAQRIHHYRSTLSAQLKSSFFSLLESSRPLPIGASELGTSAARPDHEDDEQTTTRGEGTVHHHHEEGLETAKKIQ
LLEDKISSNIILIPTVLKRMKDCISTIDNLASYNGVIHPAFKRKKTS