; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg21032 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg21032
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description40S ribosomal protein S15a
Genome locationCarg_Chr13:1106560..1108085
RNA-Seq ExpressionCarg21032
SyntenyCarg21032
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000630 - Ribosomal protein S8
IPR035987 - Ribosomal protein S8 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAB1217918.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Morella rubra]7.6e-6798.46Show/hide
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MBA0576079.1 hypothetical protein [Gossypium lobatum]9.9e-6797.69Show/hide
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XP_013457334.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Medicago truncatula]4.4e-6798.46Show/hide
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XP_022134546.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Momordica charantia]4.4e-6798.46Show/hide
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XP_022949003.1 40S ribosomal protein S15a-1-like [Cucurbita moschata]1.5e-67100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1BY30 40S ribosomal protein S15a-12.2e-6798.46Show/hide
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A0A6J1FJB0 40S ribosomal protein S15a-12.2e-6798.46Show/hide
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A0A6J1GAW0 40S ribosomal protein S15a-1-like7.4e-68100Show/hide
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A0A6J1I5M1 40S ribosomal protein S15a-1-like7.4e-68100Show/hide
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I3SJY8 Putative ribosomal protein S82.2e-6798.46Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80646 40S ribosomal protein S15a-33.7e-6490.77Show/hide
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P42798 40S ribosomal protein S15a-11.3e-6998.46Show/hide
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Q00332 40S ribosomal protein S15a3.8e-6997.69Show/hide
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Q9AT34 40S ribosomal protein S15a1.9e-6896.15Show/hide
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Q9LX88 40S ribosomal protein S15a-41.7e-6998.46Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07770.1 ribosomal protein S15A9.2e-7198.46Show/hide
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AT1G07770.2 ribosomal protein S15A9.2e-7198.46Show/hide
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AT2G39590.1 Ribosomal protein S8 family protein2.6e-6590.77Show/hide
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AT3G46040.1 ribosomal protein S15A D1.2e-7098.46Show/hide
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AT5G59850.1 Ribosomal protein S8 family protein9.2e-7198.46Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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ACTACTCTACATTTTGTCGGTAAAGAATGATGTTATTCTGTAATGATTAGATCTTGCTCTTCTCTTAAGTTAATTCCAAGAGAATTTTTATTGTTTTGGTGAAGACATTT
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