; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg21327 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg21327
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCarg_Chr15:9352389..9352619
RNA-Seq ExpressionCarg21327
SyntenyCarg21327
Gene Ontology termsGO:0016874 - ligase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7017064.1 hypothetical protein SDJN02_22176, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.9e-26100Show/hide
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A0A6J1DZC9 uncharacterized protein LOC1110259991.3e-1174.19Show/hide
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A0A6J1EQP1 uncharacterized protein LOC1114357156.5e-2496.05Show/hide
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A0A6J1I1Z0 uncharacterized protein LOC1114691091.8e-2188.16Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G33055.1 unknown protein8.5e-0850.98Show/hide
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        M+LV+++AE+++EYTV+L  V+  LF  APFPRR+R  IL++LPF ++++S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGCTCGTGTCGGTACTAGCGGAGATTCTGGAGGAGTACACGGTGTTGCTTACGGAGGTGCTCCGGCAGCTCTTCCATTCCGCGCCATTTCCTCGCCGAGTCCGATT
TCTCATCCTTCACAATCTTCCTTTCGCCAACAACTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTGCCCTAATTCACTCCAATCGACCTAGCGGCG
CAGTTGCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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