; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg21478 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg21478
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionAspergillus nuclease S(1)
Genome locationCarg_Chr13:7423555..7425134
RNA-Seq ExpressionCarg21478
SyntenyCarg21478
Gene Ontology termsGO:0006308 - DNA catabolic process (biological process)
GO:0006413 - translational initiation (biological process)
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GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
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GO:0003743 - translation initiation factor activity (molecular function)
GO:0004521 - endoribonuclease activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR003154 - S1/P1 nuclease
IPR008947 - Phospholipase C/P1 nuclease domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6584021.1 Endonuclease 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.3e-177100Show/hide
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XP_023519979.1 endonuclease 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.0e-17296.99Show/hide
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A0A1S3B4B0 Aspergillus nuclease S(1)4.8e-13981.14Show/hide
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A0A5D3DSP7 Aspergillus nuclease S(1)4.8e-13981.14Show/hide
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A0A6J1ENU3 Aspergillus nuclease S(1)6.5e-17699.33Show/hide
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A0A6J1KL07 Aspergillus nuclease S(1)1.0e-17398.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4JJL0 Endonuclease 41.9e-8754.27Show/hide
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F4JJL3 Endonuclease 51.0e-7748.14Show/hide
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Q8LDW6 Endonuclease 36.9e-7447.62Show/hide
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Q9C9G4 Endonuclease 24.3e-8452.63Show/hide
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        + L++N+T   W+D V  WE C    +C + +A E I+ AC WAY+GV  G TL ++YF SRLPIV +RLA+GGVRLA  LNR+F
Subjt:  EDLQRNLTHGIWSDDVPTWERCVNVNSCINNWAEESIKLACTWAYEGVEAGMTLSEDYFDSRLPIVMERLAKGGVRLAMLLNRVF

Q9SXA6 Endonuclease 11.2e-10561.62Show/hide
Query:  LVLLCFTFLLLPSAQGWSKEGHVLTCQIAQELLNPEATEAVQALLPESAGGNLSAMCVWADQIRRSSKYRWTSPLHYINTPDNACSFLYKRDCHNTAAQL
        LVL       + S + WSKEGH+LTC+IAQ LL       V+ LLP+   G+LSA+CVW DQIR   KYRWTS LHYI+TPD ACS+ Y RDCH+     
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Query:  NMCVAGAIRNFTTQLTAFPKQGPDAKNNLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFTSDEGGNTIELRWYRHKSNLHHVWDREIILTALADYYDKDTDLLLEDLQ
        +MCV GAI+NFT+QL  + +   D + N+TEALLFLSHF+GDIHQP+HVGFTSDEGGNTI+LRWY+HKSNLHHVWDREIILTAL + YDK+ DLL EDL+
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        +N+T+G+W DD+ +W  C ++ +C + +A ESIKLAC W Y+GV++G TLSE+YF++RLPIVM+R+ +GGVRLAM+LNRVFS++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G11190.1 bifunctional nuclease i8.2e-10761.62Show/hide
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        LVL       + S + WSKEGH+LTC+IAQ LL       V+ LLP+   G+LSA+CVW DQIR   KYRWTS LHYI+TPD ACS+ Y RDCH+     
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Query:  NMCVAGAIRNFTTQLTAFPKQGPDAKNNLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFTSDEGGNTIELRWYRHKSNLHHVWDREIILTALADYYDKDTDLLLEDLQ
        +MCV GAI+NFT+QL  + +   D + N+TEALLFLSHF+GDIHQP+HVGFTSDEGGNTI+LRWY+HKSNLHHVWDREIILTAL + YDK+ DLL EDL+
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Query:  RNLTHGIWSDDVPTWERCVNVNSCINNWAEESIKLACTWAYEGVEAGMTLSEDYFDSRLPIVMERLAKGGVRLAMLLNRVFSEN
        +N+T+G+W DD+ +W  C ++ +C + +A ESIKLAC W Y+GV++G TLSE+YF++RLPIVM+R+ +GGVRLAM+LNRVFS++
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AT1G68290.1 endonuclease 23.0e-8552.63Show/hide
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        +V++  T  LL   P+  GW KEGH + C+IAQ  L+  A +AV+ LLPESA G+LS++C+WAD+++   +Y W+SPLHYINTPD ACS+ Y RDC + +
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Query:  AQLNMCVAGAIRNFTTQLTAF-PKQGPDAKNNLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFTSDEGGNTIELRWYRHKSNLHHVWDREIILTALADYYDKDTDLLL
         +   CVAGAI N+TTQL ++       ++ NLTEALLF+SHF+GDIHQPLHV + SD+GGNTIE+ WY  K+NLHH+WD  II TA AD Y+   + ++
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Query:  EDLQRNLTHGIWSDDVPTWERCVNVNSCINNWAEESIKLACTWAYEGVEAGMTLSEDYFDSRLPIVMERLAKGGVRLAMLLNRVF
        + L++N+T   W+D V  WE C    +C + +A E I+ AC WAY+GV  G TL ++YF SRLPIV +RLA+GGVRLA  LNR+F
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AT4G21585.1 endonuclease 41.3e-8854.27Show/hide
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        W  R LVL      L+  A  W KEGH   C+IA+     E   AV+ LLP+SA G+L+++C W D+I+   ++RWTSPLHY++TPD  C++ Y RDCH+
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Query:  TAAQLNMCVAGAIRNFTTQL-TAFPKQGPDAKNNLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFTSDEGGNTIELRWYRHKSNLHHVWDREIILTALADYYDKDTDL
        T    + CV GAI N+T QL +A          NLTEAL+FLSHF+GDIHQPLHVGF  DEGGNTI +RWYR K+NLHHVWD  II +AL  YY+K   L
Subjt:  TAAQLNMCVAGAIRNFTTQL-TAFPKQGPDAKNNLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFTSDEGGNTIELRWYRHKSNLHHVWDREIILTALADYYDKDTDL

Query:  LLEDLQRNLTHGIWSDDVPTWERC-VNVNSCINNWAEESIKLACTWAYEGVEAGMTLSEDYFDSRLPIVMERLAKGGVRLAMLLNRVFSENPK
        ++E LQ NLT+  WS+DVP WE C +N  +C N +A ESI LAC +AY     G TL +DYF SRLPIV +RLA+GG+RLA  LNR+FS  PK
Subjt:  LLEDLQRNLTHGIWSDDVPTWERC-VNVNSCINNWAEESIKLACTWAYEGVEAGMTLSEDYFDSRLPIVMERLAKGGVRLAMLLNRVFSENPK

AT4G21590.1 endonuclease 34.9e-7547.62Show/hide
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        MW+   LVL      L+  A  W   GH   C+IAQ     +   AV+ LLPESA G L+A+C W D+I++  ++RWTS LH+ +TPD  C++ Y RDC 
Subjt:  MWVFRFLVLLCFTFLLLPSAQGWSKEGHVLTCQIAQELLNPEATEAVQALLPESAGGNLSAMCVWADQIRRSSKYRWTSPLHYINTPDNACSFLYKRDCH

Query:  NTAAQLNMCVAGAIRNFTTQLTAFPKQGPDAKN-NLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFTSDEGGNTIELRWYRHKSNLHHVWDREIILTALADYYDKDTD
              + CV GAI N+T QL +  +      + NLTEAL+FLSH++GDIHQPLH GF  D GGN I++ WY  ++NLH VWD  II +AL  YY+    
Subjt:  NTAAQLNMCVAGAIRNFTTQLTAFPKQGPDAKN-NLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFTSDEGGNTIELRWYRHKSNLHHVWDREIILTALADYYDKDTD

Query:  LLLEDLQRNLTHGIWSDDVPTWERC-VNVNSCINNWAEESIKLACTWAYEGVEAGMTLSEDYFDSRLPIVMERLAKGGVRLAMLLNRVFSENPK
         ++ +LQ  L +G WS+DVP+WE C +N  +C N +A ESI LAC +AY    AG TL + YF SRLP+V +RLA+GG+RLA  LNR+FS   K
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AT4G21600.1 endonuclease 57.3e-7948.14Show/hide
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        +W+   LVL      L+  A  W K+GH   C++A+     +   AV+ LLPES  GG L+  C W D+I++ S+++WTS LHY+NTP+  C++ Y RDC
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Query:  HNTAAQLNMCVAGAIRNFTTQLTAFPKQGPDAKN-NLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFTSDEGGNTIELRWYRHKSNLHHVWDREIILTALADYYDKDT
        H+T    + CV GAI N+T QL +  +   +  + NLTEALLFLSH++GD+HQPLH GF  D GGNTI + WY +KSNLHHVWD  II +AL  YY+   
Subjt:  HNTAAQLNMCVAGAIRNFTTQLTAFPKQGPDAKN-NLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFTSDEGGNTIELRWYRHKSNLHHVWDREIILTALADYYDKDT

Query:  DLLLEDLQRNLTHGIWSDDVPTWERC-VNVNSCINNWAEESIKLACTWAYEGVEAGMTLSEDYFDSRLPIVMERLAKGGVRLAMLLNRVFSENPK
          +++ LQ  L +G WS+DVP+W+ C  +  +C N +A ESI LAC +AY     G TL ++YF SRLP+V +RLA+GG+RLA  LNR+FS  PK
Subjt:  DLLLEDLQRNLTHGIWSDDVPTWERC-VNVNSCINNWAEESIKLACTWAYEGVEAGMTLSEDYFDSRLPIVMERLAKGGVRLAMLLNRVFSENPK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GCTCCTGAATCCAGAGGCAACAGAGGCAGTTCAAGCTCTGCTACCAGAAAGCGCCGGCGGGAATCTCTCGGCGATGTGTGTATGGGCTGACCAAATCCGACGCTCGTCTA
AATACCGGTGGACCAGTCCCCTTCACTACATCAACACGCCGGACAATGCCTGTTCTTTCCTCTACAAAAGGGATTGCCATAACACTGCCGCCCAGCTCAACATGTGCGTC
GCCGGTGCCATTCGGAATTTCACCACTCAGCTCACTGCCTTCCCAAAACAAGGCCCCGACGCTAAAAATAACTTGACGGAAGCATTACTGTTTTTATCGCACTTCGTTGG
GGATATTCATCAGCCACTGCACGTGGGATTCACGAGCGATGAGGGAGGGAACACCATAGAGTTACGGTGGTACCGCCACAAGTCCAACCTGCACCATGTATGGGATAGGG
AAATTATTCTTACAGCCCTGGCAGATTACTACGACAAGGATACAGACCTCCTTCTAGAAGACCTACAAAGGAATTTAACCCATGGAATTTGGAGCGATGATGTTCCGACA
TGGGAGCGTTGTGTTAATGTTAATTCATGCATAAACAATTGGGCTGAGGAGAGTATAAAATTAGCTTGCACGTGGGCATACGAAGGAGTTGAAGCTGGCATGACTTTGTC
AGAGGATTACTTCGATTCAAGGTTGCCAATTGTAATGGAACGATTGGCCAAAGGTGGGGTCCGGTTGGCCATGCTTTTGAACCGGGTTTTTTCTGAAAACCCTAAAGGAG
GATTCCGCTCCTCAATTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTGGGTGTTTAGATTTCTGGTTTTGCTCTGTTTTACCTTCCTTCTCCTGCCTAGTGCTCAAGGATGGAGCAAAGAAGGCCATGTCCTAACATGTCAAATTGCCCAGGA
GCTCCTGAATCCAGAGGCAACAGAGGCAGTTCAAGCTCTGCTACCAGAAAGCGCCGGCGGGAATCTCTCGGCGATGTGTGTATGGGCTGACCAAATCCGACGCTCGTCTA
AATACCGGTGGACCAGTCCCCTTCACTACATCAACACGCCGGACAATGCCTGTTCTTTCCTCTACAAAAGGGATTGCCATAACACTGCCGCCCAGCTCAACATGTGCGTC
GCCGGTGCCATTCGGAATTTCACCACTCAGCTCACTGCCTTCCCAAAACAAGGCCCCGACGCTAAAAATAACTTGACGGAAGCATTACTGTTTTTATCGCACTTCGTTGG
GGATATTCATCAGCCACTGCACGTGGGATTCACGAGCGATGAGGGAGGGAACACCATAGAGTTACGGTGGTACCGCCACAAGTCCAACCTGCACCATGTATGGGATAGGG
AAATTATTCTTACAGCCCTGGCAGATTACTACGACAAGGATACAGACCTCCTTCTAGAAGACCTACAAAGGAATTTAACCCATGGAATTTGGAGCGATGATGTTCCGACA
TGGGAGCGTTGTGTTAATGTTAATTCATGCATAAACAATTGGGCTGAGGAGAGTATAAAATTAGCTTGCACGTGGGCATACGAAGGAGTTGAAGCTGGCATGACTTTGTC
AGAGGATTACTTCGATTCAAGGTTGCCAATTGTAATGGAACGATTGGCCAAAGGTGGGGTCCGGTTGGCCATGCTTTTGAACCGGGTTTTTTCTGAAAACCCTAAAGGAG
GATTCCGCTCCTCAATTTGATTAATTTGACAACGCATTTTAATATTAGCCAATAATTGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MWVFRFLVLLCFTFLLLPSAQGWSKEGHVLTCQIAQELLNPEATEAVQALLPESAGGNLSAMCVWADQIRRSSKYRWTSPLHYINTPDNACSFLYKRDCHNTAAQLNMCV
AGAIRNFTTQLTAFPKQGPDAKNNLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFTSDEGGNTIELRWYRHKSNLHHVWDREIILTALADYYDKDTDLLLEDLQRNLTHGIWSDDVPT
WERCVNVNSCINNWAEESIKLACTWAYEGVEAGMTLSEDYFDSRLPIVMERLAKGGVRLAMLLNRVFSENPKGGFRSSI