; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg21505 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg21505
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionVQ motif-containing protein 4-like
Genome locationCarg_Chr13:7260019..7260783
RNA-Seq ExpressionCarg21505
SyntenyCarg21505
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039611 - VQ motif-containing protein 4/11/13/19/31/33
IPR039827 - VQ motif-containing protein 4/13


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6583990.1 VQ motif-containing protein 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.7e-135100Show/hide
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XP_022927619.1 VQ motif-containing protein 4-like [Cucurbita moschata]4.8e-13499.21Show/hide
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XP_023001738.1 VQ motif-containing protein 4-like [Cucurbita maxima]5.3e-13398.05Show/hide
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XP_023520333.1 VQ motif-containing protein 4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.4e-13599.61Show/hide
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XP_038876999.1 VQ motif-containing protein 4 [Benincasa hispida]4.7e-11388.54Show/hide
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         PA    NSDS SKTHIPPIKSLP+RQQSGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGS  HSGFSPRK EILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCS
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV54 VQ domain-containing protein6.4e-10885.94Show/hide
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        ME+SS+ Q+NP P  SSLLPSPS+R+++STT+S+STS GL    P  +HLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASV  A 
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        GN KLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFP+TSPRVPG
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A0A5A7UQT0 VQ motif-containing protein 4 isoform X26.8e-11085.83Show/hide
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        ME+SS+ Q+NP P  SSLLPSP++R+++STT+S+STS GL    P  +HLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASV  A 
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        GN KLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFP+TSPRVPGSSS S
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A0A6J1CGC6 VQ motif-containing protein 4-like isoform X11.1e-10783.78Show/hide
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        ME+SS  QEN  PS SSLLPSPSSR+T++++ S+STS G+Q + PPP        HLHSPK ITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQ
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        AS  PAA A  NS+SVSK+HIPPIKSLP+RQQSGFKLYERRNSLNKL+INP+ PVFGS  +SGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGL
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        ANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPGS+
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A0A6J1EII3 VQ motif-containing protein 4-like2.3e-13499.21Show/hide
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A0A6J1KRE6 VQ motif-containing protein 4-like2.6e-13398.05Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23660 VQ motif-containing protein 131.1e-3246.95Show/hide
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        + L+P P    +    TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P+       +P   P +S       IPPIK++  K+Q S F+L ERRNS+ + 
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Query:  LKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLP
        L INP        THSG     PEIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + +E++IKEKGFYL PSP+TTPRD+EPRLL 
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Query:  LFPMTSPRVPGSS
        LFPMT    P  S
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Q5M750 VQ motif-containing protein 43.0e-6258.23Show/hide
Query:  SSSLLPSPSSRMTHSTTSSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQAS---VNPA-AAPSNSDSVSK
        +++L+PSP    ++++   SS+S   +    P  H+      TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  S    NP    P    + S 
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Query:  THIPPIKSLPKRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKL
          IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINP+ PVF +  +S FSPRKPEILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFDRSG +N        +  
Subjt:  THIPPIKSLPKRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKL

Query:  DAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPGSSSIS
        +  AEEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV GSSS S
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Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 336.1e-3143.58Show/hide
Query:  SSSLLPSPSSRMTHSTTSSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAP-SNSDSVSKTHI
        S+S + S   +M +     SS  +  Q + P  H  H           NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS         + A +P +N++  S   I
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Query:  PPIKSLPKRQQSGFKLYERRN------SLNKLKINP---------VFPVFGSTTHSG--FSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFD
        PPIK     + + FKLYERR       + N L IN          +F    S+ H    FSPR        +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF+
Subjt:  PPIKSLPKRQQSGFKLYERRN------SLNKLKINP---------VFPVFGSTTHSG--FSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFD

Query:  RSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP
        +S     S L  GN    +  E+KAI +KGFYLHPSP +TPRDS+P LLPLFP+ SP
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Q9FNP0 VQ motif-containing protein 319.8e-1337.43Show/hide
Query:  TTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSKTHIPPIKSLPKRQQSGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSP
        TTFVQ DT++F+++VQ LTG  E       N AAA +   +V KT      ++ KR  S  KL+ERR  + + K+  V P             KP   +P
Subjt:  TTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSKTHIPPIKSLPKRQQSGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSP

Query:  SILDFPALALSPVTPLIPDPF--DRSGLANCSYLKN--GNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPG
        S       + S  T L+  P     S  +N S ++    +   + E EEKAIKE+ FYLHPSP + P  +EP LL LFP+TSP   G
Subjt:  SILDFPALALSPVTPLIPDPF--DRSGLANCSYLKN--GNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPG

Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 193.1e-3547.62Show/hide
Query:  SSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSKTHIPPIKSLPKRQQSGFKLYE
        SSSS+S     +    HH      ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S  P   PS   +     IPPIK+   ++ SG KLYE
Subjt:  SSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSKTHIPPIKSLPKRQQSGFKLYE

Query:  RR-------NSLNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKE
        RR       N  N L IN +    G      FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+                    EE+ I +
Subjt:  RR-------NSLNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKE

Query:  KGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
        KG+YLH SP +TPRDSEP+LLPLFP+TSPR+
Subjt:  KGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein2.1e-6358.23Show/hide
Query:  SSSLLPSPSSRMTHSTTSSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQAS---VNPA-AAPSNSDSVSK
        +++L+PSP    ++++   SS+S   +    P  H+      TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  S    NP    P    + S 
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Query:  THIPPIKSLPKRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKL
          IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINP+ PVF +  +S FSPRKPEILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFDRSG +N        +  
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Query:  DAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPGSSSIS
        +  AEEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV GSSS S
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AT1G28280.2 VQ motif-containing protein3.4e-6157.85Show/hide
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        +++L+PSP    ++++   SS+S   +    P  H+      TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  S    NP    P    + S 
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Query:  THIPPIKSLPKRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKL
          IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINP+ PVF +  +S FSPRKPEILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFDRSG +N        +  
Subjt:  THIPPIKSLPKRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKL

Query:  DAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
        +  AEEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV
Subjt:  DAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV

AT2G33780.1 VQ motif-containing protein7.9e-3446.95Show/hide
Query:  QQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSKTHIPPIKSLP-KRQQSGFKLYERRNSL-NK
        + L+P P    +    TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P+       +P   P +S       IPPIK++  K+Q S F+L ERRNS+ + 
Subjt:  QQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSKTHIPPIKSLP-KRQQSGFKLYERRNSL-NK

Query:  LKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLP
        L INP        THSG     PEIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + +E++IKEKGFYL PSP+TTPRD+EPRLL 
Subjt:  LKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLP

Query:  LFPMTSPRVPGSS
        LFPMT    P  S
Subjt:  LFPMTSPRVPGSS

AT3G15300.1 VQ motif-containing protein2.2e-3647.62Show/hide
Query:  SSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSKTHIPPIKSLPKRQQSGFKLYE
        SSSS+S     +    HH      ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S  P   PS   +     IPPIK+   ++ SG KLYE
Subjt:  SSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSKTHIPPIKSLPKRQQSGFKLYE

Query:  RR-------NSLNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKE
        RR       N  N L IN +    G      FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+                    EE+ I +
Subjt:  RR-------NSLNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKE

Query:  KGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
        KG+YLH SP +TPRDSEP+LLPLFP+TSPR+
Subjt:  KGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV

AT5G53830.1 VQ motif-containing protein4.3e-3243.58Show/hide
Query:  SSSLLPSPSSRMTHSTTSSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAP-SNSDSVSKTHI
        S+S + S   +M +     SS  +  Q + P  H  H           NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS         + A +P +N++  S   I
Subjt:  SSSLLPSPSSRMTHSTTSSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAP-SNSDSVSKTHI

Query:  PPIKSLPKRQQSGFKLYERRN------SLNKLKINP---------VFPVFGSTTHSG--FSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFD
        PPIK     + + FKLYERR       + N L IN          +F    S+ H    FSPR        +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF+
Subjt:  PPIKSLPKRQQSGFKLYERRN------SLNKLKINP---------VFPVFGSTTHSG--FSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFD

Query:  RSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP
        +S     S L  GN    +  E+KAI +KGFYLHPSP +TPRDS+P LLPLFP+ SP
Subjt:  RSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAATCCTCTTCAGTTTTACAAGAAAACCCATGTCCTTCTTCTTCTTCTCTCCTTCCTTCTCCAAGTAGCCGCATGACTCACAGTACTACCAGCAGTAGCAGCACCAG
CTATGGACTCCAACAACTCATGCCTCCACCGCATCACTTGCACTCGCCTAAACCCATCACTCGATCCGAATCTGTTAACCCTTACCCCACTACCTTTGTTCAAGCTGATA
CCTCTTCTTTCAAGCAAGTAGTTCAAATGCTCACTGGATCCCCTGAAACCGCCAAGCAAGCCTCTGTTAACCCTGCTGCTGCGCCTTCCAACTCTGATTCTGTGTCCAAA
ACGCACATTCCGCCTATTAAATCTTTACCCAAAAGGCAGCAATCTGGATTCAAGCTCTACGAGCGTAGGAACTCTTTGAATAAACTTAAAATTAACCCGGTGTTTCCCGT
TTTCGGTTCCACTACTCATTCGGGGTTTTCTCCGAGGAAACCTGAAATTCTTTCTCCGAGTATTCTGGACTTTCCGGCGCTCGCTCTCAGTCCTGTCACGCCGCTGATTC
CCGACCCGTTTGATCGATCTGGGTTGGCGAATTGTAGCTACTTGAAGAATGGGAACGCCAAGTTGGATGCAGAGGCGGAAGAGAAAGCGATTAAAGAAAAGGGGTTTTAC
TTGCATCCATCGCCGACCACCACTCCTCGTGACTCCGAGCCTCGGTTGTTGCCGCTGTTCCCAATGACATCTCCTAGAGTGCCAGGTTCATCATCCATTTCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAATCCTCTTCAGTTTTACAAGAAAACCCATGTCCTTCTTCTTCTTCTCTCCTTCCTTCTCCAAGTAGCCGCATGACTCACAGTACTACCAGCAGTAGCAGCACCAG
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CCTCTTCTTTCAAGCAAGTAGTTCAAATGCTCACTGGATCCCCTGAAACCGCCAAGCAAGCCTCTGTTAACCCTGCTGCTGCGCCTTCCAACTCTGATTCTGTGTCCAAA
ACGCACATTCCGCCTATTAAATCTTTACCCAAAAGGCAGCAATCTGGATTCAAGCTCTACGAGCGTAGGAACTCTTTGAATAAACTTAAAATTAACCCGGTGTTTCCCGT
TTTCGGTTCCACTACTCATTCGGGGTTTTCTCCGAGGAAACCTGAAATTCTTTCTCCGAGTATTCTGGACTTTCCGGCGCTCGCTCTCAGTCCTGTCACGCCGCTGATTC
CCGACCCGTTTGATCGATCTGGGTTGGCGAATTGTAGCTACTTGAAGAATGGGAACGCCAAGTTGGATGCAGAGGCGGAAGAGAAAGCGATTAAAGAAAAGGGGTTTTAC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MESSSVLQENPCPSSSSLLPSPSSRMTHSTTSSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSK
THIPPIKSLPKRQQSGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFY
LHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPGSSSIS