; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg21688 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg21688
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCarg_Chr01:4506398..4508933
RNA-Seq ExpressionCarg21688
SyntenyCarg21688
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607465.1 hypothetical protein SDJN03_00807, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.9e-11396.89Show/hide
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KAG7037120.1 hypothetical protein SDJN02_00741 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.7e-173100Show/hide
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XP_022948859.1 uncharacterized protein LOC111452392 [Cucurbita moschata]1.3e-11296.44Show/hide
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XP_022997987.1 uncharacterized protein LOC111492777 [Cucurbita maxima]1.8e-10993.86Show/hide
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XP_023524923.1 uncharacterized protein LOC111788705 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.5e-11195.56Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LVK1 Uncharacterized protein8.1e-6868.89Show/hide
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         SDDE SHP SP PSD QI+K M ASRW+  GVQILR RI AM S+IW NA    A WLFSPAGRIGLLVTL WLYKR R+RRLR S+EQLKMMIKEKD+
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        KIS L+QQVAQLNRS+I   QK++P
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A0A1S3BA65 uncharacterized protein LOC1034878351.5e-6970.67Show/hide
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        MA  E+RSVFDW N    NSYQSS             SMV IRDS PKDDFSVFPPS HENL  PSI  +ERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFS
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A0A6J1C560 uncharacterized protein LOC1110085814.4e-8276Show/hide
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         SDDETSH  SP PSDCQIRKSMAASRWM +GVQILR+RI AM S+IW N ARRTA W+FSPAGRI L+VTLWWLYKR RQRRLR S+EQL+M+IKEKDK
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A0A6J1GB64 uncharacterized protein LOC1114523926.3e-11396.44Show/hide
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A0A6J1K6L4 uncharacterized protein LOC1114927778.5e-11093.86Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G61360.1 unknown protein2.4e-0830.93Show/hide
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         +IL +R+ +   ++      R ++  FS   R    ++V   W +KR R RR     E     L+  IKE+D++I+QLL Q+ Q+N  ++++T
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGGTCATGAAGCCAGATCGGTTTTCGACTGGGAAAACTTCCATTCGTTGAATTCCTATCAGTCGTCTTCTTCATCTCAGCAGCCGAAAATCCAACTGAAAGAATG
GTCAATGGTGGGGATTAGGGATTCTCTTCCCAAAGACGATTTCTCCGTCTTCCCACCTTCAAATCACGAGAATCTATGGCTACCATCGATTGAAGGAAACGAACGAGGAA
GCCCAGTTTCATTTCAGTCCAATTCGCCATCCTCATCGTTTAGGTCGTCCCAATCATCTTCCTCCTTCTCATCTTTCTCACTTTCTGATGATGAGACTTCACATCCACAG
TCACCGAGCCCATCTGATTGTCAAATTCGGAAGTCCATGGCGGCTTCTAGATGGATGGCTTTCGGCGTTCAGATTCTTCGCTCCCGGATTGCTGCAATGACTTCCTCAAT
TTGGCCCAATGCTGCGCGTAGAACGGCTGTTTGGTTGTTTTCCCCTGCTGGAAGGATTGGGTTATTGGTAACCCTCTGGTGGCTTTACAAGAGACTTCGTCAGCGCCGTT
TGCGTCATAGTACAGAACAATTAAAGATGATGATCAAGGAGAAAGACAAGAAAATCAGCCAACTACTGCAACAAGTTGCACAATTGAATAGATCAATAATCGAACTGACA
CAGAAGCTCATGCCTTTGCCAGGGGAAGAGTATAAGGCAGGCACCATGTATGTCTCAAAACGACATGAATCTGTTTGTGGCTGCACAAAAACAGATGATCAGCTCAGAGA
TGCAATTAACCGCAAGGCTACAAGGACCTGGTGCAAGCAAATGGTGTCATATAACAGCAGAAATGGGTATCCTGCCGACATTGCCGTGATTGCATACAGTAAATATGCAC
ACTTGCTTGCTTCACTGGATAAACAAGCATTCTTCAATAAATATTCCATCCGGATCCATACAGGAACTGAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGTAGAAATTCTGAAAATTAAAATATTTAAAAGAAAAAGATGGAAGCTAAGAATAAGGAAGTTCAAATTTAAAAGAGAATGAGATGGAGTGTTCGTCATGATGGACCTTC
TTCTTTTGTTTGGGCCTTCTCTCATCTCCTCAAATGGACATCGACATTTAGGGCACCAAAAAGCCTAATTTTTCTAATGGGAATTTCGAATTCCTAATTTTGTTCTATCG
GATAGAATCGATCAATAATCTTCAATGGCAATTACAAGTTCAAACATCCAAGGAAACACGACTCGGTTCCTTCCTGTTGCATGAACGCATCCCAAGGCGTTTTCTTTGGA
TCTCTCAAGCTCAAATTACTCTCCATTTTTTGTTTGTTGCAATTCTTTATGTTGAAAAGGGAATTGGGTCGGCAGGTAAATGGCAGGTCATGAAGCCAGATCGGTTTTCG
ACTGGGAAAACTTCCATTCGTTGAATTCCTATCAGTCGTCTTCTTCATCTCAGCAGCCGAAAATCCAACTGAAAGAATGGTCAATGGTGGGGATTAGGGATTCTCTTCCC
AAAGACGATTTCTCCGTCTTCCCACCTTCAAATCACGAGAATCTATGGCTACCATCGATTGAAGGAAACGAACGAGGAAGCCCAGTTTCATTTCAGTCCAATTCGCCATC
CTCATCGTTTAGGTCGTCCCAATCATCTTCCTCCTTCTCATCTTTCTCACTTTCTGATGATGAGACTTCACATCCACAGTCACCGAGCCCATCTGATTGTCAAATTCGGA
AGTCCATGGCGGCTTCTAGATGGATGGCTTTCGGCGTTCAGATTCTTCGCTCCCGGATTGCTGCAATGACTTCCTCAATTTGGCCCAATGCTGCGCGTAGAACGGCTGTT
TGGTTGTTTTCCCCTGCTGGAAGGATTGGGTTATTGGTAACCCTCTGGTGGCTTTACAAGAGACTTCGTCAGCGCCGTTTGCGTCATAGTACAGAACAATTAAAGATGAT
GATCAAGGAGAAAGACAAGAAAATCAGCCAACTACTGCAACAAGTTGCACAATTGAATAGATCAATAATCGAACTGACACAGAAGCTCATGCCTTTGCCAGGGGAAGAGT
ATAAGGCAGGCACCATGTATGTCTCAAAACGACATGAATCTGTTTGTGGCTGCACAAAAACAGATGATCAGCTCAGAGATGCAATTAACCGCAAGGCTACAAGGACCTGG
TGCAAGCAAATGGTGTCATATAACAGCAGAAATGGGTATCCTGCCGACATTGCCGTGATTGCATACAGTAAATATGCACACTTGCTTGCTTCACTGGATAAACAAGCATT
CTTCAATAAATATTCCATCCGGATCCATACAGGAACTGAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SPSPSDCQIRKSMAASRWMAFGVQILRSRIAAMTSSIWPNAARRTAVWLFSPAGRIGLLVTLWWLYKRLRQRRLRHSTEQLKMMIKEKDKKISQLLQQVAQLNRSIIELT
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