CuGenDBv2

Gene ID	Carg21728
Organism	Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description	Protein of unknown function (DUF803)
Genome location	Carg_Chr09:1571900..1575382
RNA-Seq Expression	Carg21728
Synteny	Carg21728
Gene Ontology terms	GO:1903830 - magnesium ion transmembrane transport (biological process) GO:0005769 - early endosome (cellular component) GO:0005886 - plasma membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0015095 - magnesium ion transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domains	IPR008521 - Magnesium transporter NIPA

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG7024352.1 putative magnesium transporter NIPA9 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

1.3e-79

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XP_022936425.1 probable magnesium transporter NIPA9 [Cucurbita moschata]

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XP_022977066.1 probable magnesium transporter NIPA9 [Cucurbita maxima]

4.9e-79

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XP_031740158.1 probable magnesium transporter NIPA9 isoform X1 [Cucumis sativus]

8.0e-74

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XP_038896971.1 probable magnesium transporter NIPA9 [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

e value

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Alignment

A0A0A0L5B6 Probable magnesium transporter

3.9e-74

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A0A5A7VA96 Probable magnesium transporter

1.1e-73

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A0A6J1CNG7 Probable magnesium transporter

3.9e-74

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A0A6J1FDL9 Probable magnesium transporter

6.2e-80

100

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A0A6J1IIP5 Probable magnesium transporter

2.4e-79

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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q8RWH8 Probable magnesium transporter NIPA9

4.2e-49

62.35

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        V+S+RL R L   +RR +++ ++R F  R  +S   +D++PSA+IQ  TL +++ S     D
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G11960.1 Protein of unknown function (DUF803)

3.0e-50

62.35

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        V+S+RL R L   +RR +++ ++R F  R  +S   +D++PSA+IQ  TL +++ S     D
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCATCTGTAATATCAAAAATGGGATTCTTATTCTTGGAGCAGGGCTTCCACGAAATATTGGTACCAATATGCATCCTGATAAGTATTTGTTGCAGTGCTACAGGATT
TTACTATCAGACTCGAGGACTAAAACATGGGAGGGCAATTGTGGTGTCTACATGTGCTGCTGTGGCATCTATCGTCACTGGTGTCGTTGCTGGTATGCTTGCTTTGGGTG
AAGAATTGCCCTCGTCACCGACTGCTCGCCTCTTCCTTCTGCTGGGATGGCTGCTAATCATCACAGGTGTTATTCTGCTTGTGAGTTCAGCACGACTGACCCGACGTCTT
ACTTGGCTATACCGACGATTTAAGCGAAGTGGTGTGGATAGGAGCTTTGGGCATAGATCTGGATCATCTGTGCGCCTACGAGATTCAAGCCCCAGTGCAATCATTCAGAC
AACCACATTGCAGAATATGATGTTATCATCAAAAGCAAAGGCTGACGCTTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

TAGAAATGCAAGGGATAGAAACAGGCAAAAGGACAAAGTTCGGTCGTTGGCGCAAAAATTTGGAGGCAATGCTCTGACGTAAATCGCAATTCCCCCTCCAACCATAACCG
TACTCTCCGATTTCTTGATTTATTCTTCCCCGTCTCCTTCGATTCTTCTCCGTGTTTCGATTTTTCGGCTTTCAAGGAAGATATGTGGGAACCCATTTGTTTAACTCTGG
CCGCCGCCGCCGGCAACAATATCGGCAAAATTATTCAGAAGAAGGGCACCGTCATTCTTCCTCCTCTCTCCTTCAAGCTCAAGGTGATAAGGGCTTACGCTTTTAACAAA
ACTTGGATCATAGGTTTTCTGATGGATATATTTGGAGCTGTTCTAATGCTGAGAGCGTTATCTCTCGCCCCTGTAAGTCCTTTATTCAGCTACGTACGCCCTTTTCTTTT
CGGTTTTTGTTCGGCATTGGTTTATTGGATCTTGGCTGATGGAAATATCAATTGCTGTTTTGATGCCTAAGTGACTTCCCTTGTCATTATGTATTGTCTATCACTATGAA
AACAGCATGTAACCTAAATATTTCATCTCTAATTTGATGTTACAAAACCATTTTGTAGATTACTTCTTTCCCAAGAATCCATACCTCACAGGAAAATTCATACAGTTCTG
TCAATGTAGCACGGACTTTCTTCCTCGAAATATGCAATTCTTTTCTAATTTCCGTCTTTCAGGTTTCTATAATTCAACCAGTTTCTGGATGTGGACTTGCCATCCTCTCT
ATTTTTTCACATTTTTATCTGAAGGAAATAATGAATGCTGTCGATTGGATGGGGATTACGCTTGCTGGCATTGGCACCATAGGGGTTGGTGCTGGAGGCGAGGAGCAAAA
GGCGTCTGCGATATCGATTTTCCATTTGCCATGGCTAGCTTTCATCATTACCATCTTGTTTGTTCTTCTTAGCGGATGGCTTCATTTCTACAAACGTCAAAGGAAAGAAC
AAGAGTTGGTAAATTCATTGCTTTAGTATTGACTTTTCACTGGTTTTCTTGTCCTCCCAAAAAATAACATGTTACACATGTATATATGTTGCAGATGGAATTTGAAGTTG
TCGAAGAAATAATATACGGCTTAGAATCTGGCATTTTGTTCGGGTACTGTTCTGGCTTGCACTCTTTTGCTTGATGGAATACATTTCCTGCAATTATTATGGTTGAGGAT
GACTAATAGGTATTAGAACTTTGCTTGACTGTGAGGAATCATGGATCCTGCCCGATCGCGGTGGTATCCTAGTTTGTCTCAAGTTGAATCTTAGCCAGCTTTTCTTTCGA
CGGTCAGGATGGATTAGAAAATGAAAAGAGAAACTTTTAGTAGTTCTATAATTGTTATGGTTGACTGTATACGGTCATGATGTTTTAGGACTGGAGTATACGCATGCTAT
AGAGTTTTTAGTCGTTTACACATCTATGGCTTGCGTCGAACCTGATCGACTCCACTCACATTTTGAAAGGGAAATAATCCAATCAGCTTTTCAGATTCATATCAGCAAAA
TGTTACAATTTAAATCTGCAATTTCAGGATGGCATCTGTAATATCAAAAATGGGATTCTTATTCTTGGAGCAGGGCTTCCACGAAATATTGGTACCAATATGCATCCTGA
TAAGTATTTGTTGCAGTGCTACAGGATTTTACTATCAGACTCGAGGACTAAAACATGGGAGGGCAATTGTGGTGTCTACATGTGCTGCTGTGGCATCTATCGTCACTGGT
GTCGTTGCTGGTATGCTTGCTTTGGGTGAAGAATTGCCCTCGTCACCGACTGCTCGCCTCTTCCTTCTGCTGGGATGGCTGCTAATCATCACAGGTGTTATTCTGCTTGT
GAGTTCAGCACGACTGACCCGACGTCTTACTTGGCTATACCGACGATTTAAGCGAAGTGGTGTGGATAGGAGCTTTGGGCATAGATCTGGATCATCTGTGCGCCTACGAG
ATTCAAGCCCCAGTGCAATCATTCAGACAACCACATTGCAGAATATGATGTTATCATCAAAAGCAAAGGCTGACGCTTGAAGACCGTGAAGACGGTTCATGTGTAGATAT
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CTTGCTTAGGCACCACATGTTTCGAGATCTCCTTTGATTGATAGTTTCAATGTTTGAGGCCATTTCATAATATCCAATTACCCATTATAATGTATGAATTTTTGAAGAAT
GATGATGATCATGATCTTAGTCAATTTATGAAGATTGCATTTTCTTGTGTTATACTCCAAGGTCCTCTTACTCAAGAAATT

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MASVISKMGFLFLEQGFHEILVPICILISICCSATGFYYQTRGLKHGRAIVVSTCAAVASIVTGVVAGMLALGEELPSSPTARLFLLLGWLLIITGVILLVSSARLTRRL
TWLYRRFKRSGVDRSFGHRSGSSVRLRDSSPSAIIQTTTLQNMMLSSKAKADA

Carg21728 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome