; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg21822 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg21822
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionF-box/kelch-repeat protein At1g23390-like
Genome locationCarg_Chr05:123744..124922
RNA-Seq ExpressionCarg21822
SyntenyCarg21822
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR015915 - Kelch-type beta propeller


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7029207.1 F-box/kelch-repeat protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.3e-222100Show/hide
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XP_022962360.1 F-box/kelch-repeat protein At1g23390-like isoform X1 [Cucurbita moschata]1.2e-21397.7Show/hide
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XP_022962361.1 F-box/kelch-repeat protein At1g23390-like isoform X2 [Cucurbita moschata]1.2e-21196.43Show/hide
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XP_022996915.1 F-box/kelch-repeat protein At1g23390-like [Cucurbita maxima]8.9e-21295.92Show/hide
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XP_023547142.1 F-box/kelch-repeat protein At1g23390-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.6e-21396.94Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2N9IQU5 F-box domain-containing protein4.8e-9450.79Show/hide
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        I Y S LRSS SSLLYM S  RF FS DPLHL W  A   + WRPDP+VA VG  +++A  G  C   DD     +E YD  T  W+ CDSMP  L DSA
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        ASTWLSVA D+ +MYV+ K SGV +SFDP TKTW GPY++R    ++VF SVIG     MIVVGL GEAE+V+SV +WE+   ++E +   +  EMP +L
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        + K KG+S  + SI +N MG+FVF+HNP +  EV+VCEV  GA  WGSV    ++  S   ++LV +C+NV L DL +A  S
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A0A6J1BSR4 F-box/kelch-repeat protein At1g233908.1e-11058.02Show/hide
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        SE      IGGD+LEEI+  + LVDLV AN V+S+WRSAISTSL RLNT+KPWL++HSQ + + +    +AYDPRSHLWME+++P   +           
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           YFS LRSS SSLLYM+S+SRFA+S+DPLHL+W E   PP+G   WRPDPVVAAVG H+++  +G    + DD T+PP++IYDTTT TWE  CDSMPT
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        +LMDS ASTWLS    VAA+++ MYVSVK SGVT+SFDPR+++W G Y+VR   G   ESVF+S I  C G G+I VGL GEAE V SVVMWE  VE EG
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            W MP +L+EKLKG+S  YMPSI +NVM DFVF+HNPL+ REV+VC +     RWGSV    AA D D+C FR+LV + S VTLP LE A
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A0A6J1HCW8 F-box/kelch-repeat protein At1g23390-like isoform X25.6e-21296.43Show/hide
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A0A6J1HEU1 F-box/kelch-repeat protein At1g23390-like isoform X16.0e-21497.7Show/hide
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A0A6J1K837 F-box/kelch-repeat protein At1g23390-like4.3e-21295.92Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9LDE3 F-box/kelch-repeat protein At1g233907.4e-6038.66Show/hide
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        EE +I GDILE I+S++PL+DL SA  V+ SW  A+  SL RL T+ PWL +++Q    P  + T  +AYDP+S  W+E+             +++SS +
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         + S+ RSS S+LLY LS +RF+FS D  HL W+  APP  WR DP+VA VG  +I+A  G  C  ++D     L   ++  G WE C+SMP  L +SA+
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        STWLSVA    KMYV+ KRSGVT SF+P T++W    ++   +  S++   IG     +I+ G+ G+  +   + +WE++   E          MP   +
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        EKL+G +   P  SI LN +GD V+VH   E   E+V  E++ G   +W ++  A A  + S     ++V+CSNV   DL+ A  + L
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G23390.1 Kelch repeat-containing F-box family protein5.3e-6138.66Show/hide
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        EE +I GDILE I+S++PL+DL SA  V+ SW  A+  SL RL T+ PWL +++Q    P  + T  +AYDP+S  W+E+             +++SS +
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Query:  HYFSLLRSSPSSLLYMLSASRFAFSMDPLHLNWEVAAPPIGWRPDPVVAAVGNHIIVAGSGACCGIQDDDTIPPLEIYDTTTGTWEWCDSMPTELMDSAA
         + S+ RSS S+LLY LS +RF+FS D  HL W+  APP  WR DP+VA VG  +I+A  G  C  ++D     L   ++  G WE C+SMP  L +SA+
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Query:  STWLSVAADQNKMYVSVKRSGVTYSFDPRTKTWCGPYNVRGDDVESVFFSVIGCGGKGMIVVGLRGEAEDVRSVVMWELLVETEGR---RDEWEMPFQLV
        STWLSVA    KMYV+ KRSGVT SF+P T++W    ++   +  S++   IG     +I+ G+ G+  +   + +WE++   E          MP   +
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Query:  EKLKGESEYMP--SIHLNVMGDFVFVHNPLE-AREVVVCEVKEGAY-RWGSV-TAAALDRDSCRFRNLVVSCSNVTLPDLERARNSTL
        EKL+G +   P  SI LN +GD V+VH   E   E+V  E++ G   +W ++  A A  + S     ++V+CSNV   DL+ A  + L
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GCGCTCTGCAATCTCCACCTCCCTCCTTCGTCTCAACACTGTAAAGCCATGGCTGATGCTTCACTCCCAGTCCACTCGCTCTCCATCCGCTGTCACCACACTCGCCTATG
ATCCACGGTCCCACCTCTGGATGGAGGTCCAACAACCCTCCTCCTCCTCCTCCAACTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCAATCCATTACTTCTCTCTTCTTAGA
TCCTCCCCCTCCTCCCTCCTCTACATGCTCTCCGCCTCCAGATTTGCCTTCTCCATGGATCCACTCCACCTCAACTGGGAAGTAGCCGCCCCACCCATCGGGTGGCGCCC
CGACCCTGTGGTTGCCGCTGTGGGCAACCATATAATTGTGGCCGGTTCTGGAGCCTGCTGCGGCATACAAGATGATGACACCATTCCTCCCCTAGAAATCTACGACACCA
CCACTGGCACGTGGGAGTGGTGCGACTCCATGCCCACGGAGCTCATGGACTCGGCGGCCTCCACTTGGCTGTCAGTTGCGGCGGACCAGAACAAAATGTACGTGAGCGTG
AAAAGGTCGGGCGTAACGTACTCGTTTGATCCTCGGACAAAAACTTGGTGCGGACCGTACAACGTGCGTGGAGATGATGTGGAAAGCGTGTTCTTCTCGGTGATTGGTTG
TGGTGGAAAGGGTATGATAGTGGTGGGTTTGAGGGGAGAGGCGGAGGACGTGAGGAGCGTAGTGATGTGGGAATTATTAGTGGAAACGGAGGGGCGGAGAGATGAGTGGG
AGATGCCATTCCAGCTGGTGGAGAAGCTGAAGGGCGAGAGTGAGTATATGCCCTCCATTCACTTGAATGTGATGGGAGATTTTGTTTTTGTGCACAACCCTTTGGAGGCC
AGGGAGGTCGTTGTGTGCGAGGTGAAGGAGGGAGCATACCGCTGGGGAAGCGTGACAGCGGCCGCCTTGGACCGCGACTCTTGCCGCTTCCGGAACCTGGTGGTGTCCTG
CTCCAACGTAACCCTCCCAGACTTGGAACGCGCCCGGAACTCCACGCTTCTCACTCGGAACAAAACCCATGCATTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGTGAGAGGGCGGAGGAATGTGCAATTGGCGGAGATATTTTGGAAGAGATAATAAGCCACGTGCCGTTGGTGGATCTTGTTTCCGCCAACAGCGTGGCGTCCTCGTG
GCGCTCTGCAATCTCCACCTCCCTCCTTCGTCTCAACACTGTAAAGCCATGGCTGATGCTTCACTCCCAGTCCACTCGCTCTCCATCCGCTGTCACCACACTCGCCTATG
ATCCACGGTCCCACCTCTGGATGGAGGTCCAACAACCCTCCTCCTCCTCCTCCAACTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCAATCCATTACTTCTCTCTTCTTAGA
TCCTCCCCCTCCTCCCTCCTCTACATGCTCTCCGCCTCCAGATTTGCCTTCTCCATGGATCCACTCCACCTCAACTGGGAAGTAGCCGCCCCACCCATCGGGTGGCGCCC
CGACCCTGTGGTTGCCGCTGTGGGCAACCATATAATTGTGGCCGGTTCTGGAGCCTGCTGCGGCATACAAGATGATGACACCATTCCTCCCCTAGAAATCTACGACACCA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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REVVVCEVKEGAYRWGSVTAAALDRDSCRFRNLVVSCSNVTLPDLERARNSTLLTRNKTHAF