CuGenDBv2

Gene ID	Carg21868
Organism	Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description	50S ribosomal protein L2, chloroplastic
Genome location	Carg_Chr05:8511089..8512630
RNA-Seq Expression	Carg21868
Synteny	Carg21868
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0009507 - chloroplast (cellular component) GO:0015934 - large ribosomal subunit (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function) GO:0016740 - transferase activity (molecular function) GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domains	IPR002171 - Ribosomal protein L2 IPR008991 - Translation protein SH3-like domain superfamily IPR014722 - Ribosomal protein L2, domain 2 IPR022669 - Ribosomal protein L2, C-terminal

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG7030047.1 50S ribosomal protein L2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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100

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QVV96734.1 ribosomal protein L2 [Illigera grandiflora]

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TYI93527.1 hypothetical protein E1A91_D02G141400v1 [Gossypium mustelinum]

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YP_009307607.1 ribosomal protein L2 [Taraxacum mongolicum]

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YP_009769796.1 ribosomal protein L2 [Templetonia retusa]

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A0A1B1W563 50S ribosomal protein L2, chloroplastic

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A0A342YTZ2 50S ribosomal protein L2, chloroplastic

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A0A342YU79 50S ribosomal protein L2, chloroplastic

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A0A6H0EDS3 Ribosomal protein L2

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A0A7U0IVH1 Ribosomal protein L2

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A0A377 50S ribosomal protein L2-A, chloroplastic

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A6MMG4 50S ribosomal protein L2-A, chloroplastic

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B1NWJ1 50S ribosomal protein L2, chloroplastic

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Q06GJ5 50S ribosomal protein L2, chloroplastic

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Q8S8V3 50S ribosomal protein L2-A, chloroplastic

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Arabidopsis top hits

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ATCG00830.1 ribosomal protein L2

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Sequences

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CDS sequence

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ATGCCCTTAGGCTCGACCATACATAACATAAAAATCACACTTAGGAAGGCGGGACAATTAGCTAGAGCAGAAGGTGCAGTAACGAAACTGATGGCAAGAGATGGGAAATC
GGCTACATTACCTTATGGGGAGATCCATTTGATATCCAAAAATTGCTCAGCAACAGTCGGACAAGTGGGGAATACTCGATCCCATAGCTCTGACCATAAACTATAG

mRNA sequence

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Protein sequence

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MPLGSTIHNIKITLRKAGQLARAEGAVTKLMARDGKSATLPYGEIHLISKNCSATVGQVGNTRSHSSDHKL

Carg21868 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome