; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg21963 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg21963
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionGATA transcription factor 21-like
Genome locationCarg_Chr11:3088937..3090202
RNA-Seq ExpressionCarg21963
SyntenyCarg21963
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000679 - Zinc finger, GATA-type
IPR013088 - Zinc finger, NHR/GATA-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6588037.1 GATA transcription factor 21, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.8e-168100Show/hide
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XP_022926635.1 GATA transcription factor 21-like [Cucurbita moschata]8.9e-16799.35Show/hide
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XP_022967871.1 GATA transcription factor 21-like isoform X1 [Cucurbita maxima]4.2e-15692.72Show/hide
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XP_022967879.1 GATA transcription factor 21-like isoform X2 [Cucurbita maxima]9.9e-15894.81Show/hide
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XP_023530322.1 GATA transcription factor 21-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.1e-16097.39Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LZE4 GATA-type domain-containing protein3.6e-8160.88Show/hide
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        K           E ++ND  HNDSVKW  SSSSSSSKI+ +IN NQTET  T+TI++ RN QDLN    SPSPS  +QTNKR    TL+D GGAIIRTCS
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        DCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAE AA   N  AVV+KTNK +      KPA T+KRK+K+ V              GGGR+KLC E
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        ++KMG RLSEISS+YQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
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A0A1S3BPL1 GATA transcription factor 211.9e-8261.38Show/hide
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        MAPPYRDSFPS+HDDL  L Y SSS  HLFFP  TP  +S SS  S       H    D P S+   H+        +DQ    HE + E ETGL FTIW
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        K           E ++ND+ HNDSVKW SSSSSSSSKI+ +IN N QTE TPT+TID+ RN QDLNP  PSPSPS  +QTNKR    TL++ GGAIIRTC
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        SDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAA    N  AVVLKTNKA+      KPA TM      KRK+K+ V     +       GGG 
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        + KLC E++KMG RLSEISS+YQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
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A0A6J1ELP1 GATA transcription factor 21-like4.3e-16799.35Show/hide
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A0A6J1HT96 GATA transcription factor 21-like isoform X12.0e-15692.72Show/hide
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A0A6J1HXZ7 GATA transcription factor 21-like isoform X24.8e-15894.81Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5HZ36 GATA transcription factor 211.0e-2736.9Show/hide
Query:  ETGLSFTIWKSETSSNDHN-HNDSVKWSSSSSS--SSSKIRLV--------------INYNQTETPTKTIDAHRNF-----QDLNPMSPSPSPSPSDQT-
        ET L  TI K +     H  H +  K  S S     S K+RL+               N N  E+    ++   NF     +DLN  +     + +  T 
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Query:  NKRNTLNDGG----GAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR-AMAEAA-----------------------------NGG----NS
        N+ NT+N+ G      +IR CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR AMA AA                             NGG    +S
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Query:  TAVVLKTNKAIIKPAATMKRKHKEVVAATTTTAAAASAAGGGGRRKLCVEDVKMGRRLSEISSTYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
          +V K  K  IK     + + + V   +  + +  S+       K C +D+ +   +   SS YQ+VFPQDE+EAA+LLM LSYG++HG
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Q6YW48 Protein CYTOKININ-RESPONSIVE GATA TRANSCRIPTION FACTOR 13.8e-1933.33Show/hide
Query:  SFTIWKSETSSNDHNHNDSVKWSSSSSSSSSKIRLVINYNQTETPTKTIDAHRNFQDLNPMSPSPSPSPSDQTNKRNTLNDGGGAIIRTCSDCNTTKTPL
        S+  +  E+++  H +  + KW    S+   K+R++     T+     +   R              + + Q   +  L    G ++R CSDCNTTKTPL
Subjt:  SFTIWKSETSSNDHNHNDSVKWSSSSSSSSSKIRLVINYNQTETPTKTIDAHRNFQDLNPMSPSPSPSPSDQTNKRNTLNDGGGAIIRTCSDCNTTKTPL

Query:  WRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAANGGNSTAVVLKTNKAII--KPAATMKRKHKEV-------------------VAATTTTAAAASAAGGG--
        WRSGP GPKSLCNACGIRQRKARRAMA AANGG + A       A +  KPAA  +++  +V                   VAAT  TAA    A     
Subjt:  WRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAANGGNSTAVVLKTNKAII--KPAATMKRKHKEV-------------------VAATTTTAAAASAAGGG--

Query:  -------GRRKLCVEDVKMGRRLSEISST---------YQRVFPQDE-REAAILLMTLSYGLLH
               G        +     +S+ ++T         +    P+DE  +AA+LLMTLS GL+H
Subjt:  -------GRRKLCVEDVKMGRRLSEISST---------YQRVFPQDE-REAAILLMTLSYGLLH

Q9FJ10 GATA transcription factor 164.1e-1338.03Show/hide
Query:  RTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAANGGNSTAVVLKTNKAIIKPAATMKRKHKEVVAATTTTAAAASAAGGGGRR-----KL
        +TC+DC T+KTPLWR GP GPKSLCNACGIR RK RR       GG       + NK + K                       S++GGG R+     K 
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Query:  CVEDVKMGRRLSEISSTYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLH
         + D+ + R+ S +    Q++   +E +AA+LLM LSYG ++
Subjt:  CVEDVKMGRRLSEISSTYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLH

Q9SZI6 Putative GATA transcription factor 223.7e-2234.65Show/hide
Query:  PYRDSFPSNHDDLLRYSSSSDRHLFFPTTPLDSSPSSPLSFPLFPDLHRSNPDHPH----SLGFHHQEDDQVHE---------------SNQEV---ETG
        P+  S  S+    L+      +H     +   SS  SP S   FP L  S  D  +    +  FH   D  + +               S+Q V   ET 
Subjt:  PYRDSFPSNHDDLLRYSSSSDRHLFFPTTPLDSSPSSPLSFPLFPDLHRSNPDHPH----SLGFHHQEDDQVHE---------------SNQEV---ETG

Query:  LSFTIWKSETSSN----------DHNHNDSVKWSSSSSSSSSKIRLVINYNQTETPTKTIDAHRNFQDLNPMSPSPSPSPSDQTNKRNTLNDGGGAIIRT
        L  TI K +   +          D    +S+KW       SSK+RL+       T + +   H N         S + S S++ N  N  ND    +IR 
Subjt:  LSFTIWKSETSSN----------DHNHNDSVKWSSSSSSSSSKIRLVINYNQTETPTKTIDAHRNFQDLNPMSPSPSPSPSDQTNKRNTLNDGGGAIIRT

Query:  CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR-AMAEA---ANGGNSTAVVLK----TNK------AIIKPAATMKRKHKEVVAATTTTAA-----A
        CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR AMA A   A  G S  V+ K     NK       I+ P        K ++    T  A      
Subjt:  CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR-AMAEA---ANGGNSTAVVLK----TNK------AIIKPAATMKRKHKEVVAATTTTAA-----A

Query:  ASAAGGGGRRKLCVEDVKMGRRLSEISSTYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
        +++        +  +D+ +   L   SS YQ+VFPQDE+EAAILLM LS+G++HG
Subjt:  ASAAGGGGRRKLCVEDVKMGRRLSEISSTYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG

Q9ZPX0 GATA transcription factor 202.6e-1236.91Show/hide
Query:  ETGLSFTIWKSETSSNDHNHNDSVKWSSSSSSSSSKIRLVINYNQTETPTKTIDAHRNFQDLNPMSPSPSPSPSDQTNKRNTLNDGGGA--IIRTCSDCN
        +T  +F+++ S + ++D NH++   +++ SSS+S    L +      TP+  +D H  F   N  + S          K ++   GG A  + R C+ C+
Subjt:  ETGLSFTIWKSETSSNDHNHNDSVKWSSSSSSSSSKIRLVINYNQTETPTKTIDAHRNFQDLNPMSPSPSPSPSDQTNKRNTLNDGGGA--IIRTCSDCN

Query:  TTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIR-QRKARRAMAE---AANGGNSTAVV
        TT TPLWR+GP+GPKSLCNACGIR +++ RRA A     + GG+S A V
Subjt:  TTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIR-QRKARRAMAE---AANGGNSTAVV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G18380.1 GATA transcription factor 201.9e-1336.91Show/hide
Query:  ETGLSFTIWKSETSSNDHNHNDSVKWSSSSSSSSSKIRLVINYNQTETPTKTIDAHRNFQDLNPMSPSPSPSPSDQTNKRNTLNDGGGA--IIRTCSDCN
        +T  +F+++ S + ++D NH++   +++ SSS+S    L +      TP+  +D H  F   N  + S          K ++   GG A  + R C+ C+
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Query:  TTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIR-QRKARRAMAE---AANGGNSTAVV
        TT TPLWR+GP+GPKSLCNACGIR +++ RRA A     + GG+S A V
Subjt:  TTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIR-QRKARRAMAE---AANGGNSTAVV

AT4G26150.1 cytokinin-responsive gata factor 12.6e-2334.65Show/hide
Query:  PYRDSFPSNHDDLLRYSSSSDRHLFFPTTPLDSSPSSPLSFPLFPDLHRSNPDHPH----SLGFHHQEDDQVHE---------------SNQEV---ETG
        P+  S  S+    L+      +H     +   SS  SP S   FP L  S  D  +    +  FH   D  + +               S+Q V   ET 
Subjt:  PYRDSFPSNHDDLLRYSSSSDRHLFFPTTPLDSSPSSPLSFPLFPDLHRSNPDHPH----SLGFHHQEDDQVHE---------------SNQEV---ETG

Query:  LSFTIWKSETSSN----------DHNHNDSVKWSSSSSSSSSKIRLVINYNQTETPTKTIDAHRNFQDLNPMSPSPSPSPSDQTNKRNTLNDGGGAIIRT
        L  TI K +   +          D    +S+KW       SSK+RL+       T + +   H N         S + S S++ N  N  ND    +IR 
Subjt:  LSFTIWKSETSSN----------DHNHNDSVKWSSSSSSSSSKIRLVINYNQTETPTKTIDAHRNFQDLNPMSPSPSPSPSDQTNKRNTLNDGGGAIIRT

Query:  CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR-AMAEA---ANGGNSTAVVLK----TNK------AIIKPAATMKRKHKEVVAATTTTAA-----A
        CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR AMA A   A  G S  V+ K     NK       I+ P        K ++    T  A      
Subjt:  CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR-AMAEA---ANGGNSTAVVLK----TNK------AIIKPAATMKRKHKEVVAATTTTAA-----A

Query:  ASAAGGGGRRKLCVEDVKMGRRLSEISSTYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
        +++        +  +D+ +   L   SS YQ+VFPQDE+EAAILLM LS+G++HG
Subjt:  ASAAGGGGRRKLCVEDVKMGRRLSEISSTYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG

AT4G36620.1 GATA transcription factor 192.4e-1351.39Show/hide
Query:  NKRNTLNDGGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAAN---GGNSTAVVLKT
        +K+     G   + R C++C+TT TPLWR+GPRGPKSLCNACGIR +K  R  + A N   GG STA  + T
Subjt:  NKRNTLNDGGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAAN---GGNSTAVVLKT

AT5G49300.1 GATA transcription factor 162.9e-1438.03Show/hide
Query:  RTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAANGGNSTAVVLKTNKAIIKPAATMKRKHKEVVAATTTTAAAASAAGGGGRR-----KL
        +TC+DC T+KTPLWR GP GPKSLCNACGIR RK RR       GG       + NK + K                       S++GGG R+     K 
Subjt:  RTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAMAEAANGGNSTAVVLKTNKAIIKPAATMKRKHKEVVAATTTTAAAASAAGGGGRR-----KL

Query:  CVEDVKMGRRLSEISSTYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLH
         + D+ + R+ S +    Q++   +E +AA+LLM LSYG ++
Subjt:  CVEDVKMGRRLSEISSTYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLH

AT5G56860.1 GATA type zinc finger transcription factor family protein7.1e-2936.9Show/hide
Query:  ETGLSFTIWKSETSSNDHN-HNDSVKWSSSSSS--SSSKIRLV--------------INYNQTETPTKTIDAHRNF-----QDLNPMSPSPSPSPSDQT-
        ET L  TI K +     H  H +  K  S S     S K+RL+               N N  E+    ++   NF     +DLN  +     + +  T 
Subjt:  ETGLSFTIWKSETSSNDHN-HNDSVKWSSSSSS--SSSKIRLV--------------INYNQTETPTKTIDAHRNF-----QDLNPMSPSPSPSPSDQT-

Query:  NKRNTLNDGG----GAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR-AMAEAA-----------------------------NGG----NS
        N+ NT+N+ G      +IR CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR AMA AA                             NGG    +S
Subjt:  NKRNTLNDGG----GAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR-AMAEAA-----------------------------NGG----NS

Query:  TAVVLKTNKAIIKPAATMKRKHKEVVAATTTTAAAASAAGGGGRRKLCVEDVKMGRRLSEISSTYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
          +V K  K  IK     + + + V   +  + +  S+       K C +D+ +   +   SS YQ+VFPQDE+EAA+LLM LSYG++HG
Subjt:  TAVVLKTNKAIIKPAATMKRKHKEVVAATTTTAAAASAAGGGGRRKLCVEDVKMGRRLSEISSTYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCCGCCTTATCGAGACTCGTTTCCCTCCAATCACGACGATCTTCTTCGCTACTCTTCCTCCTCCGATCGTCATCTCTTCTTCCCTACCACCCCGCTCGACTCTTC
TCCCTCCTCTCCGCTTTCTTTCCCGCTCTTTCCCGATCTCCATCGTTCCAACCCTGATCATCCTCACTCGTTAGGGTTCCATCACCAGGAGGATGATCAAGTTCATGAAA
GCAATCAAGAAGTGGAAACTGGCCTAAGCTTTACAATTTGGAAGAGTGAAACTTCAAGCAATGATCATAACCATAACGATTCGGTCAAGTGGTCGTCTTCTTCCTCTTCT
TCGTCTTCCAAGATCAGGTTGGTTATAAATTATAACCAAACCGAGACACCCACCAAGACGATCGATGCCCACCGGAATTTCCAAGATCTCAACCCGATGTCACCCTCACC
ATCACCATCCCCGTCTGATCAGACCAACAAACGAAACACGTTAAACGACGGTGGTGGCGCAATTATCAGAACCTGTTCCGATTGCAACACCACAAAAACTCCTCTTTGGA
GAAGCGGCCCAAGAGGTCCCAAGTCACTATGTAACGCCTGCGGAATCCGGCAGAGAAAAGCAAGACGAGCAATGGCGGAAGCGGCGAACGGCGGAAACTCGACGGCGGTA
GTTTTAAAAACAAACAAGGCGATAATAAAACCAGCGGCGACAATGAAGAGAAAACACAAAGAAGTGGTCGCCGCCACCACCACCACCGCCGCCGCCGCTTCCGCCGCTGG
GGGTGGCGGAAGAAGGAAGCTTTGTGTTGAAGATGTGAAAATGGGGAGGCGATTGAGCGAGATTTCTTCAACTTACCAACGAGTTTTCCCGCAGGATGAAAGAGAAGCTG
CCATTTTGCTTATGACTCTATCTTATGGGCTTCTTCATGGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GGGTGGCGGAAGAAGGAAGCTTTGTGTTGAAGATGTGAAAATGGGGAGGCGATTGAGCGAGATTTCTTCAACTTACCAACGAGTTTTCCCGCAGGATGAAAGAGAAGCTG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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VLKTNKAIIKPAATMKRKHKEVVAATTTTAAAASAAGGGGRRKLCVEDVKMGRRLSEISSTYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG