; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg22138 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg22138
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionPentatricopeptide repeat-containing protein
Genome locationCarg_Chr18:11506780..11509509
RNA-Seq ExpressionCarg22138
SyntenyCarg22138
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002885 - Pentatricopeptide repeat
IPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily
IPR044646 - Pentatricopeptide repeat-containing protein EMB1417-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6574206.1 Pentatricopeptide repeat-containing protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.8e-17999.4Show/hide
Query:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
        MAHSLVPASLSSAL SNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
Subjt:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW

Query:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
        ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
Subjt:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF

Query:  ADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLEDD
        ADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLEDD
Subjt:  ADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLEDD

Query:  EMSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
        EMSE PGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
Subjt:  EMSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL

KAG7013270.1 Pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.0e-180100Show/hide
Query:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
        MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
Subjt:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW

Query:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
        ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
Subjt:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF

Query:  ADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLEDD
        ADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLEDD
Subjt:  ADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLEDD

Query:  EMSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
        EMSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
Subjt:  EMSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL

XP_022945794.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21190 [Cucurbita moschata]9.3e-17898.8Show/hide
Query:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
        MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
Subjt:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW

Query:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
        ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALA DGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
Subjt:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF

Query:  ADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLEDD
        ADMEELGVQPSMAIVT LGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEED+ITSQDSSLEDD
Subjt:  ADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLEDD

Query:  EMSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
        EMSEDP EALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
Subjt:  EMSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL

XP_022968275.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21190 [Cucurbita maxima]1.2e-17296.71Show/hide
Query:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIAS--SSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFI
        MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIAS  SSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFI
Subjt:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIAS--SSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFI

Query:  AWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFE
        AWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFE
Subjt:  AWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFE

Query:  IFADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLE
        IFADMEELGVQPSMAIVTMLG+VFQKLGMLDK EKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKE SSTEELLEED+ TSQDSSLE
Subjt:  IFADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLE

Query:  DDEMSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
        DDEMSED  E LEDESM+LKESTFEHDFMGFGQL
Subjt:  DDEMSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL

XP_023541679.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21190 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.8e-17697.9Show/hide
Query:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLI--ASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFI
        MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLI  ASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFI
Subjt:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLI--ASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFI

Query:  AWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFE
        AWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFE
Subjt:  AWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFE

Query:  IFADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLE
        IFADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSG+ DKKEHSSTEELLEED+ITSQDSSLE
Subjt:  IFADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLE

Query:  DDEMSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
        DDEMSEDP EALEDESM+LKESTFEHDFMGFGQL
Subjt:  DDEMSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6Q9 Uncharacterized protein6.6e-14583.78Show/hide
Query:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
        M HSL  A+LSS LAS RM TL+Y+FPV SK IESV FS   SSSVVCAAKGPRPRYPRVWKT+KRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
Subjt:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW

Query:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
        ELEFPLITVKKALKTLE QREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLES+PRIFFHKMISLYY++ MHDKLFE+F
Subjt:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF

Query:  ADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLEDD
        ADMEELGVQP+MAIVT +GNVFQ+LGMLDKY+KL KKYPPPKWEYRYI+GKRVKIRAK L ENG+SNNG  E  K EHSST   ++E +ITS+DSSLEDD
Subjt:  ADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLEDD

Query:  E-MSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
        E MSEDP E LEDE M  K S FEHDFMG GQL
Subjt:  E-MSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL

A0A5D3DHA7 Pentatricopeptide repeat-containing protein8.9e-14281.98Show/hide
Query:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
        M H L  A+L+S  AS RM TL+Y+FPV SK IESV FS   SSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
Subjt:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW

Query:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
        ELEFPLITVKKALKTLE QREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNAL EDGRLDEAEELWNKLFSQ+LESMPRIFFHKMISLYY+R MHDKLFE+F
Subjt:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF

Query:  ADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLEDD
        ADMEELGVQP+MAIVT +GN+FQ+LGMLDKYEKL KKYPPPKWEYRYI+GKRVKIR K L ENG+S NG  E +K EHSST   L+E +ITS+DSSLEDD
Subjt:  ADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLEDD

Query:  -EMSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
         E+ +DP E LEDE M  K S FEHDFMG GQL
Subjt:  -EMSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL

A0A6J1CI57 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g211901.3e-14583.43Show/hide
Query:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
        MAHS V ASLSS+ ASNRM TLIYSFPVISK IESVKFS  ASS+VVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
Subjt:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW

Query:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
        ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQ+LESMPR+FFHKMISLYY++ MHDKLFE+F
Subjt:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF

Query:  ADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLEDD
        ADMEELGVQP+  IVTM+GNVFQ+LGM DKYEKLKKKYPP KWEYRY++GKRV+IRAK L+E G+SNNGS ELD+K+ SS  +LLEE +  S+DSSLED+
Subjt:  ADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLEDD

Query:  EMSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
        EM EDP E LEDES  L+   FE++FMG+G+L
Subjt:  EMSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL

A0A6J1G1Y3 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g211904.5e-17898.8Show/hide
Query:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
        MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
Subjt:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW

Query:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
        ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALA DGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
Subjt:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF

Query:  ADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLEDD
        ADMEELGVQPSMAIVT LGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEED+ITSQDSSLEDD
Subjt:  ADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLEDD

Query:  EMSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
        EMSEDP EALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
Subjt:  EMSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL

A0A6J1HWS4 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g211905.7e-17396.71Show/hide
Query:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIAS--SSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFI
        MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIAS  SSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFI
Subjt:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIAS--SSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFI

Query:  AWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFE
        AWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFE
Subjt:  AWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFE

Query:  IFADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLE
        IFADMEELGVQPSMAIVTMLG+VFQKLGMLDK EKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKE SSTEELLEED+ TSQDSSLE
Subjt:  IFADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLE

Query:  DDEMSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
        DDEMSED  E LEDESM+LKESTFEHDFMGFGQL
Subjt:  DDEMSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2V3H0 Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g18975, chloroplastic9.1e-4345.18Show/hide
Query:  VWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDE
        +WK     G+  KA  LV  + GL N KE VYGAL+ ++AWE+EFP+I   KAL+ L  + +W R+IQL KWMLSKGQG TMG+Y  LL A   D R DE
Subjt:  VWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDE

Query:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIR
        AE LWN +   H  S+PR  F +MI+LY   D+HDK+ E+FADMEEL V P       +   F++L   +  + + ++Y   +++Y Y  G+RV+++
Subjt:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIR

Q8LG95 Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g211902.0e-9863.91Show/hide
Query:  MHTLIYSFPVI---SKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKT
        M +L YS P +   ++   +  F+   ++ VVCAA+GPRPR PRVWKTRKRIGTISKAAK++ C+KGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPL+ VKKAL  
Subjt:  MHTLIYSFPVI---SKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKT

Query:  LEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIV
        LE ++EWK+IIQ+TKWMLSKGQGRTMG+YF+LLNALAED RLDEAEELWNKLF +HLE  PR FF+KMIS+YY+RDMH KLFE+FADMEELGV+P++AIV
Subjt:  LEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIV

Query:  TMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLEDDEMSEDPGEALEDESM
        +M+G VF KL M DKYEKL KKYPPP+WE+RYI+G+RVK++AK L+E    + G G L            +ED I ++  S E+D   ED  E  EDE  
Subjt:  TMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLEDDEMSEDPGEALEDESM

Query:  ML
        +L
Subjt:  ML

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G18975.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein6.5e-4445.18Show/hide
Query:  VWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDE
        +WK     G+  KA  LV  + GL N KE VYGAL+ ++AWE+EFP+I   KAL+ L  + +W R+IQL KWMLSKGQG TMG+Y  LL A   D R DE
Subjt:  VWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDE

Query:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIR
        AE LWN +   H  S+PR  F +MI+LY   D+HDK+ E+FADMEEL V P       +   F++L   +  + + ++Y   +++Y Y  G+RV+++
Subjt:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIR

AT4G18975.2 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein6.5e-4445.18Show/hide
Query:  VWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDE
        +WK     G+  KA  LV  + GL N KE VYGAL+ ++AWE+EFP+I   KAL+ L  + +W R+IQL KWMLSKGQG TMG+Y  LL A   D R DE
Subjt:  VWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDE

Query:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIR
        AE LWN +   H  S+PR  F +MI+LY   D+HDK+ E+FADMEEL V P       +   F++L   +  + + ++Y   +++Y Y  G+RV+++
Subjt:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIR

AT4G18975.3 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein6.5e-4445.18Show/hide
Query:  VWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDE
        +WK     G+  KA  LV  + GL N KE VYGAL+ ++AWE+EFP+I   KAL+ L  + +W R+IQL KWMLSKGQG TMG+Y  LL A   D R DE
Subjt:  VWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDE

Query:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIR
        AE LWN +   H  S+PR  F +MI+LY   D+HDK+ E+FADMEEL V P       +   F++L   +  + + ++Y   +++Y Y  G+RV+++
Subjt:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIR

AT4G18975.4 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein6.5e-4445.18Show/hide
Query:  VWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDE
        +WK     G+  KA  LV  + GL N KE VYGAL+ ++AWE+EFP+I   KAL+ L  + +W R+IQL KWMLSKGQG TMG+Y  LL A   D R DE
Subjt:  VWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDE

Query:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIR
        AE LWN +   H  S+PR  F +MI+LY   D+HDK+ E+FADMEEL V P       +   F++L   +  + + ++Y   +++Y Y  G+RV+++
Subjt:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIR

AT4G21190.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein1.4e-9963.91Show/hide
Query:  MHTLIYSFPVI---SKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKT
        M +L YS P +   ++   +  F+   ++ VVCAA+GPRPR PRVWKTRKRIGTISKAAK++ C+KGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPL+ VKKAL  
Subjt:  MHTLIYSFPVI---SKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKT

Query:  LEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIV
        LE ++EWK+IIQ+TKWMLSKGQGRTMG+YF+LLNALAED RLDEAEELWNKLF +HLE  PR FF+KMIS+YY+RDMH KLFE+FADMEELGV+P++AIV
Subjt:  LEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIV

Query:  TMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLEDDEMSEDPGEALEDESM
        +M+G VF KL M DKYEKL KKYPPP+WE+RYI+G+RVK++AK L+E    + G G L            +ED I ++  S E+D   ED  E  EDE  
Subjt:  TMLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLEDDEMSEDPGEALEDESM

Query:  ML
        +L
Subjt:  ML


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGCACTCTCTTGTTCCAGCATCGCTCTCGTCCGCCTTGGCTTCCAACCGGATGCATACTTTGATTTACTCTTTCCCAGTCATATCCAAAGGCATTGAATCTGTTAA
ATTTTCGTTGATTGCAAGCAGTTCAGTGGTATGCGCTGCAAAAGGTCCACGGCCGAGATATCCTCGGGTCTGGAAAACCAGGAAGAGGATTGGGACCATATCCAAGGCAG
CAAAGCTCGTTGATTGTGTCAAGGGACTGTCTAACGTGAAAGAGGAAGTCTATGGGGCTCTTGATTCCTTCATTGCCTGGGAACTAGAGTTTCCTCTTATTACTGTAAAA
AAGGCCCTGAAGACCTTAGAGATCCAAAGAGAATGGAAGAGGATAATTCAGTTGACGAAATGGATGTTAAGTAAAGGCCAAGGAAGAACAATGGGTAGCTATTTCACATT
ATTAAATGCCTTAGCTGAAGATGGAAGACTTGATGAAGCTGAAGAGCTTTGGAACAAATTATTTTCTCAGCATCTGGAGAGCATGCCTCGCATATTCTTCCATAAAATGA
TATCCCTTTACTATGAACGGGATATGCACGACAAGTTATTTGAGATATTTGCTGATATGGAGGAACTTGGAGTTCAACCAAGTATGGCGATTGTCACTATGCTTGGAAAT
GTCTTCCAAAAGTTGGGTATGTTAGATAAATATGAAAAATTGAAGAAGAAATATCCCCCACCGAAATGGGAATATCGTTACATAAGAGGAAAGCGTGTAAAAATACGAGC
AAAGAATCTGCACGAAAATGGTAGTTCCAACAATGGTTCAGGTGAACTCGACAAAAAGGAGCATAGTTCAACAGAAGAACTGTTGGAGGAAGATGATATAACTTCCCAAG
ATTCGAGTCTTGAAGATGATGAAATGAGTGAAGACCCAGGTGAAGCCTTGGAAGATGAAAGTATGATGTTGAAAGAATCCACTTTTGAGCACGATTTCATGGGATTTGGA
CAATTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGGACAATATCGACTAAGGATGAAAAGAAGAAATATGGGAAATTGAAGACATTCTTACACATTTCTTCAATGGCGCACTCTCTTGTTCCAGCATCGCTCTCGTCCGCCTT
GGCTTCCAACCGGATGCATACTTTGATTTACTCTTTCCCAGTCATATCCAAAGGCATTGAATCTGTTAAATTTTCGTTGATTGCAAGCAGTTCAGTGGTATGCGCTGCAA
AAGGTCCACGGCCGAGATATCCTCGGGTCTGGAAAACCAGGAAGAGGATTGGGACCATATCCAAGGCAGCAAAGCTCGTTGATTGTGTCAAGGGACTGTCTAACGTGAAA
GAGGAAGTCTATGGGGCTCTTGATTCCTTCATTGCCTGGGAACTAGAGTTTCCTCTTATTACTGTAAAAAAGGCCCTGAAGACCTTAGAGATCCAAAGAGAATGGAAGAG
GATAATTCAGTTGACGAAATGGATGTTAAGTAAAGGCCAAGGAAGAACAATGGGTAGCTATTTCACATTATTAAATGCCTTAGCTGAAGATGGAAGACTTGATGAAGCTG
AAGAGCTTTGGAACAAATTATTTTCTCAGCATCTGGAGAGCATGCCTCGCATATTCTTCCATAAAATGATATCCCTTTACTATGAACGGGATATGCACGACAAGTTATTT
GAGATATTTGCTGATATGGAGGAACTTGGAGTTCAACCAAGTATGGCGATTGTCACTATGCTTGGAAATGTCTTCCAAAAGTTGGGTATGTTAGATAAATATGAAAAATT
GAAGAAGAAATATCCCCCACCGAAATGGGAATATCGTTACATAAGAGGAAAGCGTGTAAAAATACGAGCAAAGAATCTGCACGAAAATGGTAGTTCCAACAATGGTTCAG
GTGAACTCGACAAAAAGGAGCATAGTTCAACAGAAGAACTGTTGGAGGAAGATGATATAACTTCCCAAGATTCGAGTCTTGAAGATGATGAAATGAGTGAAGACCCAGGT
GAAGCCTTGGAAGATGAAAGTATGATGTTGAAAGAATCCACTTTTGAGCACGATTTCATGGGATTTGGACAATTGTAAGTTCAAGATATAGATAATGTATTCCCCATTTC
AAGTTCGTCAAAATTCTCTCCCTTCTTTCTGTAATTTTGATCATACGGGATCACCAGTAGCATTGTGATCATAGAGCCAATTCCCTCAATATTATAATGCCCGACCTAAA
ATATATTTTTGTTATTGAGAGTAAATGAAAGAAAATGAAAATTTTCTTAATAAGTCGTAGAAGTCAATTTCATCATCTGAGTGTGAGATAGCTGAATGTGGTGAACTAAT
TGCCTTCAAAAAAGGATAATAAATATGGATCCGAAACTCGTGCATATTCTGTATTAAAGTCAATCTCATTACCGTAAAACTTCTAAAGTGGTATATAGAGAACAAAATTC
TAATGCACTATCATGTGGTAGGGCAGGGAGGGGAAAGGGGTTTGGGTTGTTGTCTCACTAAAAGAAAACAGAATTGTTTTTCATTCATCATCAGAACCAGAGCCTTCTGA
ACTTGAACTCTGCTGTTTATGTGCTTTTCCATTGGCAACAGGGCCCTTCTTTTTCACATTTTGTTCATCAGCTTCGTCTTCGCTGTACTCGCTCTCGTAATCATCATATT
CTTCTTCGTCATTTTCCTCTTCCTCTTCAATT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVK
KALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTMLGN
VFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDDITSQDSSLEDDEMSEDPGEALEDESMMLKESTFEHDFMGFG
QL