CuGenDBv2

Gene ID	Carg22169
Organism	Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description	Shikimate_dh_N domain-containing protein
Genome location	Carg_Chr08:2198710..2201391
RNA-Seq Expression	Carg22169
Synteny	Carg22169
Gene Ontology terms	GO:0003855 - 3-dehydroquinate dehydratase activity (molecular function) GO:0004764 - shikimate 3-dehydrogenase (NADP+) activity (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG7025555.1 hypothetical protein SDJN02_12051 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

4.5e-94

100

Show/hide

Query:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCNVFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
        MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCNVFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
Subjt:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCNVFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL

Query:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
        RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

XP_022959936.1 uncharacterized protein LOC111460840 [Cucurbita moschata]

2.8e-91

97.24

Show/hide

Query:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCNVFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
        MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDF VQFTSRKRA+NFRASSP ILPCNV L+RLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
Subjt:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCNVFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL

Query:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
        RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

XP_023004672.1 uncharacterized protein LOC111497897 [Cucurbita maxima]

4.3e-92

97.79

Show/hide

Query:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCNVFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
        MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKR +NFRASSP ILPCNVFL+RLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
Subjt:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCNVFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL

Query:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
        RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

XP_023515033.1 uncharacterized protein LOC111779179 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

9.5e-92

97.79

Show/hide

Query:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCNVFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
        MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRA+NFRASSP ILPCNV L+RLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
Subjt:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCNVFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL

Query:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
        RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

XP_038896861.1 uncharacterized protein LOC120085084 [Benincasa hispida]

1.5e-73

81.32

Show/hide

Query:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCNVFLD-RLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEW
        MESLIL+P+S+HV ITNSS F S FS+ FTSRKRAINF+   P IL CN     + TPRSYI  GPPYG++DDDPE QVESLRVPD WSVPSKALEESEW
Subjt:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCNVFLD-RLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
        LR TLHKWLD+EYCPEETNVEISKVAA SYYNSLL+KRT+L DILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  LRVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3BS97 uncharacterized protein LOC103492727

5.8e-71

80.22

Show/hide

Query:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCN-VFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEW
        MESLIL+P S+HVSITNSSAFS  FS QF+SRKRAINF    P  L  N  +  + T RSYIR GPPYG++DDDPE +VESLRVPD WSVPSKALEESEW
Subjt:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCN-VFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
        LRVTLHKWLD+EYCPEETNVEISKVAA SYYNSLL+K T+L +ILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  LRVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

A0A5D3D403 Uncharacterized protein

5.8e-71

80.22

Show/hide

Query:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCN-VFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEW
        MESLIL+P S+HVSITNSSAFS  FS QF+SRKRAINF    P  L  N  +  + T RSYIR GPPYG++DDDPE +VESLRVPD WSVPSKALEESEW
Subjt:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCN-VFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
        LRVTLHKWLD+EYCPEETNVEISKVAA SYYNSLL+K T+L +ILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  LRVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

A0A6J1D9Y8 uncharacterized protein LOC111018405

7.4e-74

80.77

Show/hide

Query:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCN-VFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEW
        MESLIL+P+SRHVS++NSS F SDF V FT+ KRAINFRAS P IL  N +   + TPRSY RYGPPYG++DDDPE QVESLRVPD WSVP+KALEESEW
Subjt:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCN-VFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
        LRVTLHKWLD+EYCPEETNVEIS+VAA SYYNSLLEKRT+L DILL MARELESISYKESFHGAF SANAAVNLIAQ+IELS
Subjt:  LRVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

A0A6J1H695 uncharacterized protein LOC111460840

1.3e-91

97.24

Show/hide

Query:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCNVFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
        MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDF VQFTSRKRA+NFRASSP ILPCNV L+RLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
Subjt:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCNVFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL

Query:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
        RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

A0A6J1KR31 uncharacterized protein LOC111497897

2.1e-92

97.79

Show/hide

Query:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCNVFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
        MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKR +NFRASSP ILPCNVFL+RLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
Subjt:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCNVFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL

Query:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
        RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G03150.1 unknown protein

1.1e-40

52.25

Show/hide

Query:  VPSSRHVSITNSSAFSSDF---SVQF--TSRKRAINFRASSPLILPCNVFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWLR
        V  S  +S+T    F +     SV F  T R+R+++F  +S    P    L     +S I  G      ++D E  V++L +P+ W +PS+A+EESEWLR
Subjt:  VPSSRHVSITNSSAFSSDF---SVQF--TSRKRAINFRASSPLILPCNVFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWLR

Query:  VTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIE
        VTLHKWLD+EYCPE TNVEIS+VAAKSYY+SLLEK +++ +ILL MA++L SISY+ESFHGAF+SANAA+NLI  RIE
Subjt:  VTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIE

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGTCTCTGATTTTGGTTCCATCTAGTAGGCACGTTTCAATCACTAATTCTTCTGCGTTTTCCTCCGATTTTTCGGTTCAATTCACTTCTAGAAAGCGCGCCATCAA
CTTCCGAGCTTCTTCTCCGCTGATTCTCCCTTGCAATGTCTTTCTGGACCGATTAACTCCGAGGTCTTATATTCGGTACGGACCACCGTATGGTGATCAAGATGACGATC
CTGAAGAGCAGGTTGAAAGCCTCAGGGTTCCTGATGCTTGGTCGGTTCCTTCCAAGGCATTGGAGGAATCAGAATGGCTTAGGGTTACCCTGCACAAATGGCTGGACGAA
GAGTACTGTCCAGAGGAAACTAATGTAGAGATAAGCAAGGTTGCTGCAAAATCATACTACAATTCTTTGTTAGAGAAGAGGACAGAGCTAGCCGATATTTTATTGAATAT
GGCAAGAGAATTGGAATCTATTTCATATAAGGAAAGTTTTCATGGTGCATTCTCTTCTGCCAATGCAGCAGTGAACTTAATTGCTCAAAGAATAGAGCTGTCTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CATCAACTGGTTGGGATCTCGGAGAATCACAGAAAACAGAGCGAAAATGGAGTCTCTGATTTTGGTTCCATCTAGTAGGCACGTTTCAATCACTAATTCTTCTGCGTTTT
CCTCCGATTTTTCGGTTCAATTCACTTCTAGAAAGCGCGCCATCAACTTCCGAGCTTCTTCTCCGCTGATTCTCCCTTGCAATGTCTTTCTGGACCGATTAACTCCGAGG
TCTTATATTCGGTACGGACCACCGTATGGTGATCAAGATGACGATCCTGAAGAGCAGGTTGAAAGCCTCAGGGTTCCTGATGCTTGGTCGGTTCCTTCCAAGGCATTGGA
GGAATCAGAATGGCTTAGGGTTACCCTGCACAAATGGCTGGACGAAGAGTACTGTCCAGAGGAAACTAATGTAGAGATAAGCAAGGTTGCTGCAAAATCATACTACAATT
CTTTGTTAGAGAAGAGGACAGAGCTAGCCGATATTTTATTGAATATGGCAAGAGAATTGGAATCTATTTCATATAAGGAAAGTTTTCATGGTGCATTCTCTTCTGCCAAT
GCAGCAGTGAACTTAATTGCTCAAAGAATAGAGCTGTCTTAACTGTTCATCCACTTCATTTTTCAAAGTAACAGGCTAATTTATCTCTTCACTTTTCTTTCTTATGAGTA
GCTCATCTGATGTCAGATCAGATCTATATTTATGGACAAACAATTCTTGTATTACTTTTTGTTCTTCAATGTCAAAGCAACTTTCTGTGACTGAGTATGGATGTTCTTAA
ACCAGATCCTACAAGTTTGACTCCAAGACCTCAACTCTTGCTCTGAAAGGCATAGCACTTTCAGAAATGCGTTCAAATGGTGGCTCGAAGGCAAAGCTAGAATTTGTAAG
TACTATTAGCTAAGGCATCTATTTGGTCCTTCAAAGATACTCGAGTAGGTTTTTCAAGTCTTTTGAGGAGGATTGAATCTATGATATTTTGATTCATGATATATTGTTTT
AATGAGTTGTGGTATGGTTAAGCTAGCACAACCTCGAATTAGAGCACCAATCTTAGGGACTGCAAGTACAACAGCGAACTTGGATTAGAGAAGTTTTTTTGATCAAATTG
TAAATTTAGTCGAGTTAAAAAGAAAGTTAGAATTTAGTTCTTATAGTTAAATATATCTTCCATCACTTATTATCTAATCAATTTTTTCCTGTAGGAAGAAGATCTCTCTT
CCCTCTGACCTATGGGTTGTATTCCATTCTTTCTTTATTGGAAGTTTGTTTCTTATACATGTACAAGACAGAAAATCAAGAGCGAGTGCTGTTAGGGTTTGCCATTCGTG
CAAGTTTAGTTTGGAGTAGGAACAATAAGGTCGTTATGTTCATTACTAAACTTATCCTAGAGATGATATAGACGTGAATACAAATAAAAAAACATCTC

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFSVQFTSRKRAINFRASSPLILPCNVFLDRLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWLRVTLHKWLDE
EYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

Carg22169 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome