; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg22312 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg22312
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionhomeobox protein knotted-1-like 1
Genome locationCarg_Chr06:5903329..5904622
RNA-Seq ExpressionCarg22312
SyntenyCarg22312
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR005540 - KNOX1
IPR005541 - KNOX2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6596993.1 Homeobox protein knotted-1-like 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.4e-7498.68Show/hide
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KAG7028461.1 Homeobox protein knotted-1-like 2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.7e-75100Show/hide
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XP_022945492.1 homeobox protein KNOX3 [Cucurbita moschata]2.8e-7398.01Show/hide
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XP_022974318.1 homeobox protein KNOX3-like [Cucurbita maxima]2.7e-6895.39Show/hide
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XP_023539616.1 homeobox protein KNOX3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.4e-7498.68Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A151REB8 Homeobox protein knotted-1-like 11.6e-2653.38Show/hide
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        M+S   +T+  + +    Q QL+ E++D+  + E+L+RRIS+HPLYGLL+E HL+CLKVG I  L+R  L +D M+ RE +   +   +QSELD FME+Y
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        C AL KLKEAM E Q KSMAFIN+M+SQLRELT AT  A  +P A+SS
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A0A444Z1E2 Uncharacterized protein1.9e-2757.14Show/hide
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        + E++DD  + E+L+RRIS+HPLYGLL+E HL CLKVG I  LDR  L +D M+  + +   LN  +QSELD FME+YC AL KLKEAMEE Q KSMAFI
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        N+M+SQLRELT    A   P+ AS ++++SD K
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A0A6J1C8K6 protein KNATM1.7e-4776.92Show/hide
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        Q  L+ EEE +G +GE+LRRRISSHPLYGLL+ETHLNCLKVGGIG++DRGYLA D+++ ++N IRCLNTLNQSELDRFME+YC+ALSKLKEAMEESQ+KS
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        MAFINSM+SQLRE+ AT AAA KPT +SSS
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A0A6J1G133 homeobox protein KNOX31.4e-7398.01Show/hide
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A0A6J1IFV6 homeobox protein KNOX3-like1.3e-6895.39Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4HXU3 Protein KNATM2.0e-0563.16Show/hide
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        LK E ++   + E+L++RISSHPLYGLLL +HLNCLKV
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O65034 Homeobox protein knotted-1-like 121.2e-0530.84Show/hide
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        E    + E ++ +I +HP Y  LL  +L+C KVG   E+     A    +D      ++ R        ELD+FME+YC  L+K +E +     ++M F+
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          + SQL
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O80416 Homeobox protein knotted-1-like 121.2e-0530.84Show/hide
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        E    + E ++ +I +HP Y  LL  +L+C KVG   E+     A    +D      ++ R        ELD+FME+YC  L+K +E +     ++M F+
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Query:  NSMNSQL
          + SQL
Subjt:  NSMNSQL

P46640 Homeobox protein knotted-1-like 29.0e-0632.89Show/hide
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        G+      L  +L  +  + +D     +++ +I+SHPLY  LL+T+++C KVG   E     +A  L E  REN +  R +  L+      ELD FME+Y
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        C  L K K  +     ++  FIN +  QL+ L    A+A   TA S   A S
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Q84JS6 Homeobox protein knotted-1-like 64.0e-0631.19Show/hide
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        DD V   +++ +I+ HP Y  LL+ +++C KVG   E    L+      D+ +       C       ELD FME+YC  L K K  +     ++  F+N
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Query:  SMNSQLREL
         +  QLR L
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G14760.1 KNOX Arabidopsis thaliana meinox1.4e-0663.16Show/hide
Query:  LKHEEEDDGVDGEMLRRRISSHPLYGLLLETHLNCLKV
        LK E ++   + E+L++RISSHPLYGLLL +HLNCLKV
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AT1G14760.2 KNOX Arabidopsis thaliana meinox4.1e-1441.74Show/hide
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        LK E ++   + E+L++RISSHPLYGLLL +HLNCLKV   G+ D   +   A DL +          +    SELD+FME+YC  L +LKEAME+   +
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Query:  SMAFINSMNSQLREL
        +  F++++ +QL ++
Subjt:  SMAFINSMNSQLREL

AT1G14760.3 KNOX Arabidopsis thaliana meinox5.8e-0832.43Show/hide
Query:  LKHEEEDDGVDGEMLRRRISSHPLYGLLLETHLNCLKVGGIGELDRGYLAMDLMEHRENEIRCLNTLNQSELDRFMESYCYALSKLKEAMEESQLKSMAF
        LK E ++   + E+L++RISSHPLYGLLL +HLNCLK                                       E+YC  L +LKEAME+   ++  F
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Query:  INSMNSQLREL
        ++++ +QL ++
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AT1G23380.1 KNOTTED1-like homeobox gene 62.9e-0731.19Show/hide
Query:  DDGVDGEMLRRRISSHPLYGLLLETHLNCLKVGGIGE----LDRGYLAMDLMEHRENEIRCLNTLNQSELDRFMESYCYALSKLKEAMEESQLKSMAFIN
        DD V   +++ +I+ HP Y  LL+ +++C KVG   E    L+      D+ +       C       ELD FME+YC  L K K  +     ++  F+N
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Query:  SMNSQLREL
         +  QLR L
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AT1G70510.1 KNOTTED-like from Arabidopsis thaliana 26.4e-0732.89Show/hide
Query:  GNHSTDQPLRVQLQLKHEEEDDGVDGEMLRRRISSHPLYGLLLETHLNCLKVGGIGELDRGYLAMDLME-HRENEI--RCLNTLN----QSELDRFMESY
        G+      L  +L  +  + +D     +++ +I+SHPLY  LL+T+++C KVG   E     +A  L E  REN +  R +  L+      ELD FME+Y
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Query:  CYALSKLKEAMEESQLKSMAFINSMNSQLRELTATGAAAKKPTAASSSAATS
        C  L K K  +     ++  FIN +  QL+ L    A+A   TA S   A S
Subjt:  CYALSKLKEAMEESQLKSMAFINSMNSQLRELTATGAAAKKPTAASSSAATS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACTCTGGGAACCATTCTACAGACCAACCACTTCGTGTCCAACTCCAACTAAAACACGAGGAAGAAGACGATGGCGTGGATGGAGAAATGCTGCGTAGGAGAATTTC
TAGCCACCCCTTATATGGCCTCTTACTTGAGACTCATCTCAACTGTTTGAAGGTTGGAGGAATTGGTGAATTGGACCGAGGTTATTTAGCTATGGATTTGATGGAACACC
GAGAAAACGAGATCAGATGCTTGAATACGCTTAACCAATCGGAGCTCGATCGCTTCATGGAAAGCTATTGCTATGCATTGAGCAAGCTGAAAGAAGCAATGGAGGAATCT
CAGTTAAAATCGATGGCATTCATAAACAGCATGAACTCGCAACTAAGGGAGCTGACGGCGACGGGTGCGGCAGCCAAGAAACCCACCGCCGCCTCATCTTCTGCTGCTAC
TAGCGACACAAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATATATGCATTTTTGCATGGGTCACTTATTTTGGGCATCTCCCAAATAAATATGCAACTCCCTTCTAATGCTTTAATCACCTTTCTTTCTACTTTCGGCTGCTTTACCA
ACCTCCAATGGACTCTGGGAACCATTCTACAGACCAACCACTTCGTGTCCAACTCCAACTAAAACACGAGGAAGAAGACGATGGCGTGGATGGAGAAATGCTGCGTAGGA
GAATTTCTAGCCACCCCTTATATGGCCTCTTACTTGAGACTCATCTCAACTGTTTGAAGGTTGGAGGAATTGGTGAATTGGACCGAGGTTATTTAGCTATGGATTTGATG
GAACACCGAGAAAACGAGATCAGATGCTTGAATACGCTTAACCAATCGGAGCTCGATCGCTTCATGGAAAGCTATTGCTATGCATTGAGCAAGCTGAAAGAAGCAATGGA
GGAATCTCAGTTAAAATCGATGGCATTCATAAACAGCATGAACTCGCAACTAAGGGAGCTGACGGCGACGGGTGCGGCAGCCAAGAAACCCACCGCCGCCTCATCTTCTG
CTGCTACTAGCGACACAAAGTGAAGGCAATTAGGAAGTGTAGAGTACATAACGGACATGAGTTGTTCTCTAACCCACCCTACCTACTTGTGGAGTACGGACCCAGGTCTC
TAACAGGGATATGTAAGAACGGCTGTAATATGATCAGTAGCTTCTGTTTTTCACATTTAAGTAGGCTAATTTGGCTGCGTATCTAGACCATATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDSGNHSTDQPLRVQLQLKHEEEDDGVDGEMLRRRISSHPLYGLLLETHLNCLKVGGIGELDRGYLAMDLMEHRENEIRCLNTLNQSELDRFMESYCYALSKLKEAMEES
QLKSMAFINSMNSQLRELTATGAAAKKPTAASSSAATSDTK